cours2: les microorganismes océanique

Question 1

Quel est l’écosysteme le plus large

Answer 1

Les océans occupent 71% de la surface Terrestre

Question 2

La moitié de la production primaire (PP) planétaire se fait ou

Answer 2

Océan dont 90% par microbe

Question 3

Comment se fait la formation de la matière organique océanique

Answer 3

Le carbone nécessaire pour les bactéries et le réseau trophique vient du CO2 atmosphérique

Question 4

Par quoi est fixé le CO2 atmosphérique dans l’océan

Answer 4

il est fixé grâce à la
photosynthèse (95-98%, algues + bactéries) et chimiosynthèse (2-5%, bactéries).

Question 5

Qu’est ce qui représente la
biomasse des producteurs
primaires dans l’océan (un indice de la
richesse en éléments nutritifs

Answer 5

Chlorophylle-a

Question 6

C’est quoi le PPN

Answer 6

La production totale moins la
respiration (C utilisé uniquement
pour l’accroissement de la biomasse)

Question 7

Quel est le milieu de :Gyre, haute mer

Answer 7

Milieu oligotrophe= pauvre

Question 8

Quel est le milieu de :Régions côtières

Answer 8

milieu eutrophe ou copiotrohpe

Question 9

Quel est le milieu de :Zones de remontée

Answer 9

les eaux profondes
montent en surface
et apportent des
éléments nutritifs
(très eutrophe)

Question 10

Quel est le milieu de :Zone euphotique

Answer 10

où la photosynthèse a lieu:
haute mer jusqu’à 200 m,
région côtière ~10-40

Question 11

Quel est le milieu de: Zone mésopélagique

Answer 11

200-1000m

Question 12

Expliquer la stratification de la colonne d’eau:
Thermocline et Halocline

Answer 12

Thermocline: détermine la stratification en fonction de la température
(en surface l’eau est plus chaude, elle s’approche de 4˚C en descendant)

Halocline: stratification d’eau en fonction de sa salinité.

Question 13

Quel est le réservoirs de carbone océanique

Answer 13

90% de toute la biomasse océanique est microbienne donc produisant le plus de carbone océanique

Question 14

Quel est la méthode pour Déterminer la richesse totale qui n’est pas faisable avec certitude( boite noir:ouverture)

Answer 14

identifier les groupes dominants et
d’identifier qui fait les trans-formations biogéochimiques

Question 15

Que faire avec Les taxons abondants des bactéries

Answer 15

Les regroupées par: leur voie métabolique, leur phylotype (groupe
phylogénétique), leur ribotype (différence dans les séquence 16S rRNA), leur écotype (défini
par l’environnement)

Question 16

que se passe t-il quand les bactéries abondantes sont actives

Answer 16

elles se divisent et ↑ la biomasse

Question 17

Quel est l’état de dormance

Answer 17

Les bactéries rares ne croissant pas,
car leurs conditions optimales ne sont
pas réunies

Question 18

Que permet maintenance de la diversité (‘seed bank’)

Answer 18

Permet une recolonisation de l’environnement
après un changement majeur dans les conditions

Question 19

A quoi sert le séquençage à haut débit highthroughput sequencing (HTS) → ‘biosphère rare

Answer 19

Beaucoup d’analyses
bioinformatiques pour lier
quelle séquence va à quel
organisme et produit
quelle protéine

Question 20

Identifier une bactérie rare SANS HTS?

Answer 20

Oui, si elle a réussi à trouver un milieu de
croissance optimale et est devenue abondante

Question 21

V ou F: Partout ailleurs dans l’océan, Halomonas titanicae
fait partie du ‘seed bank’

Answer 21

Vrai

Question 22

C,est quoi une Approche métagénomique

Answer 22

C’est l’étude de l’ensemble des génomes de tous les organismes prélevés dans un milieu donné. Elle permet de travailler sur des organismes non cultivables et rares.

Question 23

Une des études pionières: Venter, 2004

Answer 23

L’étude de Venter
montre le contenu
génétique, la diversité
et l’abondance relative
des microoganismes

Question 24

Les voies métaboliques principales:

Answer 24

Photoautotrophe, Phototrophe,
chimioautotrophe (méthanogenese, oxydation de soufre, nitrification), Chimiotrophe
Hétérotrophe aérobique, Hétérotrophe anaérobique (respiration avec nitrates/sulfates, fermentation)

Question 25

Les ARN, les protéines et les métabolites suivent des changements…

Answer 25

des changements diurnes périodiques

Question 26

Quel est la cause principal des changements diurnes périodiques concernant les ARN, les protéines et les métabolites

Answer 26

La cause principale: la production primaire par la photosynthèse.
Les photoautotrophes doivent réguler leur métabolisme en
fonction du soleil.
Vue que la PP est la source de nourriture pour les hétérotrophes,
eux aussi changent en conséquence (la nourriture apparait le
jour et s’épuise le soir).

Question 27

Besoins de base pour tous les organismes:

Answer 27

1) Production d’ATP à partir de ADP+P
2) Une source d’éléments pour la biosynthèse (C, H, O, N, P, S, Fe, Mn …)
3) Une source d’électrons pour produire des molécules et polymères
organiques à partir de composantes plus oxydées

Question 28

différence en terme de croissance optimal,taille(rapport S/V),adn,métabolisme entre Les copiotrophes vs les oligotrophes

Answer 28

Copiotrophe: bcp de nutriment, gros, bcp,diversifié
Oligotrophe: peu de nutriment, petit,peu, économique

Question 29

Définir La photohétérotrophie

Answer 29

L’énergie vient du soleil ET
de la matière organique

Question 30

Définir La lithohétérotrophie!

Answer 30

L’énergie vient de la matière
inorganique ET de l’organique

Question 31

D’ou provient le carbone dans la photohétérotrophie

Answer 31

Le C vient de la matière org. :
protéorhodopsines et bactériorhodopsines
Le C vient de la matière org. ET du CO2: aérobique (hétérotrophie respiration)
anoxygénique(photosynthese pas production O2)
photosynthèse (AAP)

Question 32

Comparaison entre la phototrophie et la photosynthèse

Answer 32

Phototrophie: une conversion de l’énergie lumineuse en énergie chimique utilisée pour la
croissance ou le métabolisme

Photosynthese: une réduction de CO2 en biomasse à l’aide de la lumière

Question 33

Cest quoi la carboxydotrophie

Answer 33

capacité de transformer CO en CO2