Cours LE BLAY Flashcards
1
Q
Lacrèce
A
Organismes vivants= maladies
2
Q
Redi
A
1668
Asticots proviennent des mouches
3
Q
Antoni van Leeuwenhoeck
A
Premières observations en 1676
4
Q
Génération spontanée
A
Apparition d’un ev de la matiere non vivante
5
Q
Microorganismes
A
Organisme vivant invisible a l’oeil nu
6
Q
Procaryotes
A
Organisme unicellulaire dépourvu de noyau
Bactéries Archees
7
Q
Eucaryotes
A
Organisme unicellulaire ou pluricellulaire ayant un noyau et des organites intracellulaires
8
Q
Virus
A
Incapacité à se multiplier seul par division
Parasite intracellulaire obligatoire
9
Q
Quels sont les deux types de virus ?
Les décrire
A
Extra cellulaire : objets particulaires :virion
Intracellulaire : réplication indépendante des chromosomes mais non indépendamment de la cellule hôte
10
Q
Virion
A
Particule contenant de l’acide nucléique entouré de protéines appelées capside
11
Q
Quel est le mode de réplication d’un virus
A
Internet
12
Q
Quelles sont les deux types de génomes du virus possibles?
A
ADN
ARN
13
Q
Comment classifier un virus?
A
Nature de l’hôte Caractéristiques de l’acide nucléique Symétrie de la capside Présence d’enveloppes Absence de virion/ nucléocapside Propriétés immunologiques Effet sur l’organisme Site intracellulaire de réplication
14
Q
Quelles sont les différentes caractéristiques d’un virus?
Les 4
A
- Enveloppes
- Capside
- Enzymes
- Taille
15
Q
Quelles sont les différentes formes de capside et leurs particularités ?
A
- Icosaédrique
- Hélicoïdales
- Enveloppes
- Complexes
16
Q
Définir le type de capside isocaédrique et complexes
A
Isocaédrique: faces triangulaires, structure sphérique
Complexes: mélange de différents types de capside
17
Q
Définir le type de capside héliocoïdale et à enveloppes
A
- Héliocoïdale: cylindre protéiques
- À enveloppe: couche membranaire extérieur entourant la nucleocapsule
18
Q
Quelles ont les 6 caractéristiques d’un organisme«vivant»
A
Métabolisme Reproduction Différenciation Communication Mouvement Évolution
19
Q
Définition de cellule ?
A
Entité isolée des autres par un membrane avec de nombreuses structures internes et composé chimiques qui communique et échange avec l’environnement.
20
Q
Quelles sont les deux grandes familles des procaryotes?
A
Archéens et bactéries
21
Q
Qu’est-ce que la coloration gram en quelques mots?
A
Déterminer le type de paroi bactérienne du procaryotes Grace a l’épaisseur de la couche peptidoglycan
22
Q
A quoi servent les flagelles
A
Permet le déplacement des bactéries
23
Q
Quelles sont les 4 types de flagelles?
A
Mono triche: un flagelle sur un côté
Lophotriche: plusieurs flagelles sur un coté
Amphitriche: un de chaque coté
Péritriche: entourant la cellule
24
Q
Quelles sont les 4 constituants cellulaires de la cellule?
Leurs proportions dans le poids sec ?
A
Lipides 9%
Glucides 5%
Acides nucléiques 24%
Protéines 55%
25
Quelles sont les deux types de lipides selon leurs famille respectives ?
Archéens=> Phytanyl
| bactéries => acide gras
26
Particularités des acides gras ?
| Les deux types ?
Amphipathiques
- simple: lié par du glycérol
- complexe : simple avec un élément
27
Ou retrouve-on les phospholipides?
Dans la membrane du procaryotes
28
Quelles sont les différents types de glucides?
Monosaccharides/oses
Polysaccharaides/ polyosides
Autres=> glycoprotéines,glycolipides
29
Que sont les monosaccharides/ oses ?
| Les deux plus populaires ?
-Ils sont des glucides
-Ils existe deux types de monosaccharides très utilisés
>Pentose(5C)
>Hexose (6C)
30
Qu’est ce que le pentose?
| En terme de constituants cellulaires
C’est un monosaccharide
| C’est un des principaux composants des acides nucléiques<=> sucre
31
Qu’est ce que l’hexose ?
Famille des constituants cellulaires ?
Localisation ?
C’est un monosaccharides
| C’est un des 1er polymère des parois cellulaires ou de réserve
32
Que sont les polysaccharides /polyosides ?
Des liaisons particulières ?
Ce sont des glucides et notamment une répétition des plusieurs monosaccharides liées par des liaisons covalentes
Deux types de liaisons:
> alpha
> bêta
33
Que contient le chromosome bactérien ?
| Sa localisation ?
La quasi totalité de l’information génétique
| Il se situe dans le nucleoïde
34
Définition de nucleoïde?
Région à l’intérieur des cellule
35
Qu’est ce qu’une nucléotide?
Groupement phosphate+sucre+base
36
Qu’est ce que une nucléoside?
Sucre + base
37
Par quelles liaisons sont reliés les nucléotides?
Par des liaisons phosphodiester
38
Qu’est ce que le pentose ?
| En terme d’acide nucléique
Il correspond au sucre
Selon le type d’acide nucléique celui ci diffère
ADN=> déoxyribose
ARN=> ribose
39
Particularités des bases azotées/ nucléobases ?
Noms?
Liaisons?
Deux types de bases:
- pyruviques (1 cycle)=> cytosine, thymine, uracile
- puriques(2 cycles) => thymine, guanine
Reliées par des liaisons hydrogènes
40
Par combien de liaisons H sont réliées chaqu’une des complémentarités ?
A-T lié par 2 H
| C-G lié par 3H
41
Caractéristiques de l’ADN?
Liaisons?
Pentose?
Structure?
- Structure en double hélice avec une direction anti-parallèle
- Le pentose est un désoxyribose(H)
- Complémentarités des bases azotées
42
Caractéristiques de l’ARN?
Sous-section?
Pentose?
Structure?
- Structure en brin simple
- Une base azotée différente de l’ADN :Uracile <=> Thymine
- Le pentose dans l’ARN est un ribose(OH)
- Il en existe trois types différents
43
Quelles sont les 3 types d’ARN différents?
- ARNt(transfert)
- ARNm(messager)
- ARNr(ribosomique)
44
Quelles sont les caractéristiques de l’ARNm?
- L’unique codant des ARN
| - Traduit au niveau des ribosomes, c’est la copie de la séquence codante d’un gène
45
Quelles sont les caractéristiques de l’ARNt?
-fournissent les AA et les outils nécessaires à l’expression des ARNm en protéines
46
Quelles sont les caractéristiques de l’ARNr?
| Utilisation au nombre de deux?
- Se situe à l’intérieur des ribosomes
- Permet la formation des liaisons peptidiques
- Catalyseur direct de la synthèse des protéines
47
Qu’est ce que les ribosomes ?
Leurs compo?
Leurs tailles ?
-Permettent la synthése des protéines
-Déchiffre l’ARNm
-Est composée de chaînes d’AA et de protéines
-Existe une différence de taille entre eucaryotes et procaryotes
-Il existe deux tailles:
=> 50S et 30S
48
Qu’est-ce que les protéines ?
c’est un polymères d’AA unis par des liaisons peptidiques
49
Quelles sont les différentes fonctions des protéines ?
- Structurales:maintien paroi
- Enzymes: catalyse des réactions
- Transport
- Communication: entre bactéries sécrétant des protéines
- Défense : combattre les ennemies
- Réserve en cas de « famine »
50
Comment se passe la formation de la structure des protéines ?
4 points
Primaire=>séquence de 20 AA
Secondaire=> contrainte de structures a cause des liaisons H
Tertiaire=>Présence de crevasses qui permettent l’interaction avec les autres protéines
Quatriéme=> Interaction avec d’autres
51
Quel rôle jouent les enzymes dans le processus moléculaires ?
Leurs appellations ?
Leurs types ?
-Sont des catalyseurs
-Ont les retrouve sous l’appellation « ose »
-Ils y en a deux types:
Oxydation et réduction
52
Par quelle enzyme est répliquée l’ADN ?
L’ADN polymérase
53
De quel type de conservation fait preuve l’ADN en matière de réplication?
Semi-conservatoire
54
Quels sont les trois types de réplication?
- Mutation silencieuse
- Mutation non sens
- Mutation faux sens
55
Qu’est ce qu’une la mutation silencieuse ?
Le codon code pour le même AA
| Protéine normale
56
Qu’est-ce qu’une mutation non-sens?
Plus ou moins longue à cause d’un codon stop
| Protéine incompléte
57
Qu’est-ce qu’une mutation faux sens?
Changement de codon
| Protéine mutée
58
Quelles ont les étapes de la transcription ?
Transcription : ADN to ARN
- écartement de des brins par l’enzyme
- formation de l’ARn a partir du brin transcrit
- lecture du brin 3’ à 5’
59
Comment lit-on l’ADN ?
De 3’ à 5’
60
Qu’est ce que la traduction ?
| Quelles sont les outils utilisés?
- ARNm à protéines
| - Utilisation des ribosomes, ARNt, ARNr, « ARNm »
61
Comment ce passe la traduction?
1- Fixation du ribosome sur un codon de l’ADNm
2-dans le ribosome se trouve des ARNt
3-L’ARNt « fourni » les éléments pour fabriquer l’AA correspondant au codon
4- Passage a l’autre codon
62
Définition de polypeptide?
Chaîne d’AA
63
Définition de polyribosomes ?
Association de ribosome et d’ARNm
64
Quel est le codon initiateur?
La méthionine
65
Quels sont les 3 codons stop ?
UAA
UGA
UAG
66
Définition de codon ?
Triplet de nucléotide de l’ARN codant un acide aminé
67
Définition génome?
Ensemble des chromosomes et gènes d’une espèce ou d’un individu
68
Taille des procaryotes ?
1 à 10 micromètre
69
Tailles des eucaryotes ?
10 à 100 micromètre
70
Définition de métabolisme ?
Processus chimiques intracellulaires
71
Qu’est ce que l’anabolisme?
Ensemble des réactions de biosynthése des cellules
72
Qu’est ce que le catabolisme ?
Ensemble des réactions produisant de l’énergie
73
A quoi va servir l’énergie produite lors du catabolisme
Énergie pour la biosynthèse
| Énergie de mobilité
74
Définition de biosynthèse
Formation d’un substance organique dans un eV
75
Quelle sont les différentes sources de C ?
| Qu’utilise chaque une de ces sources
Hétérotrophes :
Source de carbone organique (aliment ….)
Autotrophes
Source inorganique comme le CO2
76
Quels sont les deux grand types de source d’énergie pour les métabolismes ?
La lumiére
| Et chimiotrophes
77
Définition de chimiotrophes
Utilisent un composé chimique comme le H2, NO2-,FE2+….
78
Que sont les phototrophes
Utilisent la lumière comme sources d’énergie
79
Quels sont les deux types de chimiotrophes ?
| Leurs définitions
Chimio-organotrophes = utilise une molécule organique comme le glucose
Chimio-lithotrophes = utilise une molécule inorganique comme le H2
80
Quels sont les deux types de phototrophes ?
| Leurs définitions
Photo-autotrophes= source de carbone inorganique comme source d’énergie
Photo-hétérotrophes = utilise du carbone organique comme source d’énergie
81
Réaction d’oxydation?
Red——> Ox + ne-
82
Réaction de réduction ?
Ox + ne- ———> Red
83
Définition d’oxydation
| Son nom biologique
Réducteur perd des électron
| => donneur d’é-
84
Définition de réduction
| Son nom biologique
Oxydant qui va gagné des électron
| => accepteur d’e-
85
Qu’est ce que le potentiel redox
Tendance d’une substance a etre oxydé ou réduite
86
Comment varie le potentiel redox
Libération d’énergie lors de transfert d’énergie
Plus la différence entre le potentiel du donneur et celui de l’accepteur est grand alors la quantité d’en-négrier disponible sera grande
87
Quelle est le nom de la « monnaie » énergétique ?
ATP
88
Quelles sont les trois types de phosphorylation ?
Au niveau du substrat
Oxydative
Et photophosphuorylation
89
Que signifie phosphorylation
Production d’ATP
90
En quoi consiste la phosphorylation du substrat
Phosphorylation directe de l’ATP avec un groupe phosphate
| ADP + Pi + énergie => ATP
91
A quoi correspond la phosphorylation oxydative
C’est le respiration avec:
Glycolyse
Cycle de Krebs
Crêtes des membranes interne des mitochondries
92
En quoi consiste la photo phosphorylation ?
| 3 points
Utilisation de la lumière pour produire de l’ATP
Production d’une force motrice du proton entraînant le transfert d’un H+ a travers la membrane
A lieur lors de la PS
93
Quelles sont les deux types de photosynthèse ?
Oxygénique
| Anoxygénique
94
Comment se passe la PS oxygénique ?
Et qui la fait ?
Qui est le donneur d’e-?
EV faisant la PS O=> algues cyanobactéries, plantes
Donneur d’e- est l’eau
Tous les deux réduisent le CO2 en sucre et l’NADH en NADHP
95
Comment se passe la PS anoxygénique ?
Qui l’a fait?
Donneur d’e-?
Producteur=> bactéries violettes et vertes
Donneur d’e- => molécule inorganique
Tous les deux réduisent le CO2 en sucre et l’NADH en NADHP
96
Ou suppose t-on le début de la vie
Dans les océans
97
Comment était la vie au départ
Anoxygénique avec les bactéries puis oxygénique avec les EV
98
Évolution de l’Arn
4 étapes
Comment se comporte t-il avec de la chaleur
-Issu de l’adénine monophosphate de la soupe primitive
-Puis formation d’ATP puis d’un poly A puni d’insertion des bases azotées dans ce polyA
=> création d’un ARN primitif
Capacité à se multiplier seul
Incompatible avec les fortes températures
99
Évolution de l’ADN
| 2 étapes
-Formation à partir d’arn + long et de peptides + long également
-Apparition de la transcription inversé
=> adn a double brins
100
Quel était le premier métabolisme?
Un chimiolithotrophe simple
| Mais également de la fermentation simple
101
Quelle est le métabolisme d’un chimio-lithotrophes ?
| Qu’est ce qu’il oxyde? Réduit?
Métabolisme anoxique
Oxydation de l’H2
Réduction de S-
102
Comment se nomme les premières protéines membranaires?
Cytochrones
103
Définition de cytochrones?
| Qu’est ce qu’ils constituent?
Protéines transmembranaires composées de porphyrie et d’un atome de fer
Constituants des chaines de transfert d’e-
104
Qu’on permis les cytochrones?
Le développement des deux respirations
105
A partir de quel produit de la fermentation le développement de la PS a pu voir le jour
La porphyrine
106
Photosynthése anoxygénique et évolution
Par qui?
De quoi ils sont composés ?
Grace aux bactéries
| Elles sont composées de bactériochlorophylle type alpha
107
Qu’est ce que la bactériochlorophylle?
Un pigment photosynthétique qui permet de faire la PS
108
Photosynthése oxygénique et évolution
Par qui?
De quoi ils sont composés ?
Par les cyanobactéries
| Composés de chlorophylle type alpha
109
Qu’est ce que là chlorophylle ?
Un pigment photosynthétique qui permet de faire la PS
110
Quel est la derniermétabolisme à se mettre en place
La respiration
111
Quels sont les autres métabolismes qui se sont créés grâce à la porphyrine?
La méthanogénèse => prod de méthane
Acéthogénèse=> prod d’acétone
112
Qu’est ce que la théorie de l’endosymbiose ?
Deux phagocyte de cellule procaryote
- la première aérobie (mitochondries)
- la seconde anaérobie (chlorophastes)
113
Définition de symbiose
Association a bénéfice mutuel dans le sens strict de type obligatoire
Les symbions ou symbiotes ne peuvent vivre séparément
114
Définition d’histones?
Pièces maîtresses de la composition de l’ADN et règle majeur dans la régulation des fonctions du génome
115
Qu’est ce que les prochloroplastes ?
Organismes possèdent deux types de chloroplastes (alpha et bêta )
116
Qu’est ce qu’un chronomètre moléculaire?
| 4 caractères
Molécule dont la séquence peut-être utilisée comme mesure comparatives de divergences évolutives
Universelle dans le groupe étudié
Un max de correspondance de base en face
Fonctionnement homologue
Change mtn a un taux compatible avec la distance phylogénétique mesurée
117
Quels sont les chronométrés moléculaires?
- Procaryotes = 16S (ARN)
- Eucaryotes= 18S (ARN)
- Rec A
- ATPase
118
Quels sont les caractéristique de l’ARN 16S ?
| 7 points
Ubiquitaires
Stable
Conservation fonctionnelle
Sequencage rapide
Régions variables et d’autres de conserves
Peu de transfert latéraux
Milliers de séquence dans les bases de données
119
Qui est Carl WOESE?
Il est a l’origine de la représentation en trois domaines et non pas deux (Archées en plus)
120
Quels sont les trois domaine du vivants ?
Eucaryotes
Bactéries
Archées
121
Définition de chitine ?
Composant des coquilles des crevettes et paroi des champignons
122
Qu’est-ce que la bactériostatiques ?
Paralyse des bactéries en inhibant leur multiplication
123
Qu’est ce que la fission binaire ?
Une cellule mère donne deux cellules filles identiques entre les deux autrement appelés scissiparite
124
Qu’est ce que les introns?
Partie non codante d’un gène
125
Qu’est ce que les exons?
Partie codante d’un gène
126
Possession d’une enveloppe nucléaire pour les trois domaines ?
B=non
A=non
E=oui
127
Types de division cellulaire pour les trois domaines ?
```
B= fission binaire
A= fission binaire
E = méiose mitose
```
128
Possession d’un chromosome circulaire pour les trois domaines
B=oui (non rare)
A= oui
E=non
129
Possession d’histones pour les trois domaines
B= absent
A=oui
E=oui
130
Présence d’introns pour les trois domaines
B=absent
A=parfois
E=oui
131
Présence d’arn polymérisé pour les trois domaines
B= une sorte
A= une aussi
E=oui
132
Quel type de ribosomes pour les trois domaines
B= 70S
A=70S
E=80S
133
Quel est l’AA initiateur de la synthèse de protéine pour les trois domaines du vivants
B=formylméthionine
A=Méthionine
E=méthionine
134
Sensibilité a la streptomycine et chloramphénicol pour les trois domaines?
B= oui
A=non
E=non
135
Quel type de lipide memebranaires pour elles trois domaines
```
B= acides gras et liaison Ester
A= phytanyl et liaison ether
E= acides gras et liaison ester
```
136
Quel type de paroi pour les trois domaines
B= peptidoglycane
A=compo diverse
E= cellulose chitine si présente
137
Croissance a T>1000° pour les trois domaines du vivant
B=non
A=quleques espèces
E=non
138
Quel est le but de la systématique ?
Classer les EV de manière rationnelle en groupe d’affinités et de leur attribuer un nom
139
Comment classe t’on la systématique,
| Avec quelles disciplines?
Avec la taxonomie et la nomenclature
140
Qu’est ce que la taxonomie pour la systématique ?
Science qui décrit et étudie les organismes
141
Qu’est ce que la nomenclature pour la systématique ?
Ensemble des règles gouvernant l’attribution d’un nom a un taxons
Nom de genre et nom d’espèce
142
Rangs hiérarchiques de la systématique
| 15 points comprenant les sous
```
Domaine ou empire
Phylum ou division
Classe
Sous classe
Ordre
Sous ordre
Famille
Sous famille
Tribu
Sous tribu
Genre
Sous genre
Espéce
Sous-espèce
Rang inférieur a la sous espèce
```
143
Comment classifie-on le agents pathogénes ?
En fonction de groupe selon leurs dangers
De groupe 1 =>sans risque
A groupe 4=>maladies graves, propagation collectivité élevée, traitements inexistants
144
Comment mesure t-on le trouble ou turbidité ?
Avec un spectrophotomètre
145
Dans des conditions de systèmes fermés, quels sont 4 noms des phases de la courbe ?
1-Latence
2- Exponentielle
3- Stationnaire
4- Déclin
146
Définition de population
Ensemble d’individus d d’la même espece
147
Comment se multiplient les bactéries (le nom)?
Par scissiparité ou fission binaire
148
Définition de cycle cellulaire ?
Ensemble des étapes entre la cellule mère et les cellules filles, les phases de croissance et division
149
Définition de colonie bactérienne?
Ensemble des cellules filles issus d’une cellule mère
150
Qu’est ce que le temps de réaction ?
| Quelle est la formule?
Le temps nécessaire au doublement de la population
G (temps de réaction)= t / n (nombre de génération)
151
Qu’est ce que le taux de croissance?
Nombre de génération par unité de temps
152
Nommez quelques facteurs pouvant faire varier la croissance bactérienne ?
```
Température
Pression
Nutriments
Luminosité
pH
Concentration en oxygène
Salinité
Source de carbone organique ou inorganique
```
153
Définition de abiotique
Paramètres physiques
154
Quelles sont les principales formes de bactéries ?
| MIN 2
```
Bacille
Coque
Spirille
Filamenteuse
Pédonculé
```
155
Donnez le protocole Gram
| En 5 points
```
1- Fixation des cellules
2- Coloration au Crystal violet
3-Passage au lugol ou iode
4-Décoloration à l’éthanol (pour les + pas d’effets )
5-Coloration à la saframine
```
156
Pourquoi les bactéries a gram - sont-elles plus dangereuses que les gram +?
Libération d’une toxine => LPS ou Lipopolysaccharides résistante aux antibiotiques
157
Donnez l’éthymologie de chimiolithotrophes
Chimio=> chimiques
| Lithotrophes => inorganiques réduits
158
Qu’est ce que le plasmide chez les bactéries ?
Région extrachromosomique de l’ADN
159
Quels sont les constituants d’un peptides ?
Des AA
160
Qu’est ce que la cyanine?
Fluorochrome => marqueur de fluorescence
161
Qu’est ce que l’adénosine?
Résultat de la combinaison de l’adénine avec un ribose
162
Qu’est ce que l’albumine ?
C’est une protéine présente dans le blanc d’œuf, lait et plasma sanguin
163
Qu’est ce que la thyminine
C’est la combinaison d’une thymine avec un désoxyribose
164
Qu’est ce que la tyrosine ?
Un AA
165
Qu’est ce que la thréonine
Un AA
166
Qu’est ce que la guanosine ?
C’est une combinaison de guanine et de ribose
