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S1 Diversite De La Biologie > Cours LE BLAY > Flashcards

Cours LE BLAY Flashcards

1
Q

Lacrèce

A

Organismes vivants= maladies

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Q

Redi

A

1668

Asticots proviennent des mouches

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3
Q

Antoni van Leeuwenhoeck

A

Premières observations en 1676

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4
Q

Génération spontanée

A

Apparition d’un ev de la matiere non vivante

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5
Q

Microorganismes

A

Organisme vivant invisible a l’oeil nu

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6
Q

Procaryotes

A

Organisme unicellulaire dépourvu de noyau

Bactéries Archees

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7
Q

Eucaryotes

A

Organisme unicellulaire ou pluricellulaire ayant un noyau et des organites intracellulaires

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8
Q

Virus

A

Incapacité à se multiplier seul par division

Parasite intracellulaire obligatoire

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9
Q

Quels sont les deux types de virus ?

Les décrire

A

Extra cellulaire : objets particulaires :virion

Intracellulaire : réplication indépendante des chromosomes mais non indépendamment de la cellule hôte

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10
Q

Virion

A

Particule contenant de l’acide nucléique entouré de protéines appelées capside

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11
Q

Quel est le mode de réplication d’un virus

A

Internet

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12
Q

Quelles sont les deux types de génomes du virus possibles?

A

ADN

ARN

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13
Q

Comment classifier un virus?

A 
Nature de l’hôte
Caractéristiques de l’acide nucléique
Symétrie de la capside
Présence d’enveloppes 
Absence de virion/ nucléocapside 
Propriétés immunologiques
Effet sur l’organisme 
Site intracellulaire de réplication
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14
Q

Quelles sont les différentes caractéristiques d’un virus?

Les 4

A
  • Enveloppes
  • Capside
  • Enzymes
  • Taille
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15
Q

Quelles sont les différentes formes de capside et leurs particularités ?

A
  • Icosaédrique
  • Hélicoïdales
  • Enveloppes
  • Complexes
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16
Q

Définir le type de capside isocaédrique et complexes

A

Isocaédrique: faces triangulaires, structure sphérique

Complexes: mélange de différents types de capside

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17
Q

Définir le type de capside héliocoïdale et à enveloppes

A
  • Héliocoïdale: cylindre protéiques

- À enveloppe: couche membranaire extérieur entourant la nucleocapsule

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18
Q

Quelles ont les 6 caractéristiques d’un organisme«vivant»

A 
Métabolisme
Reproduction
Différenciation 
Communication
Mouvement
Évolution
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19
Q

Définition de cellule ?

A

Entité isolée des autres par un membrane avec de nombreuses structures internes et composé chimiques qui communique et échange avec l’environnement.

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20
Q

Quelles sont les deux grandes familles des procaryotes?

A

Archéens et bactéries

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21
Q

Qu’est-ce que la coloration gram en quelques mots?

A

Déterminer le type de paroi bactérienne du procaryotes Grace a l’épaisseur de la couche peptidoglycan

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22
Q

A quoi servent les flagelles

A

Permet le déplacement des bactéries

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23
Q

Quelles sont les 4 types de flagelles?

A

Mono triche: un flagelle sur un côté
Lophotriche: plusieurs flagelles sur un coté
Amphitriche: un de chaque coté
Péritriche: entourant la cellule

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24
Q

Quelles sont les 4 constituants cellulaires de la cellule?

Leurs proportions dans le poids sec ?

A

Lipides 9%
Glucides 5%
Acides nucléiques 24%
Protéines 55%

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25
Q

Quelles sont les deux types de lipides selon leurs famille respectives ?

A

Archéens=> Phytanyl

bactéries => acide gras

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26
Q

Particularités des acides gras ?

Les deux types ?

A

Amphipathiques

  • simple: lié par du glycérol
  • complexe : simple avec un élément
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27
Q

Ou retrouve-on les phospholipides?

A

Dans la membrane du procaryotes

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28
Q

Quelles sont les différents types de glucides?

A

Monosaccharides/oses
Polysaccharaides/ polyosides
Autres=> glycoprotéines,glycolipides

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29
Q

Que sont les monosaccharides/ oses ?

Les deux plus populaires ?

A

-Ils sont des glucides
-Ils existe deux types de monosaccharides très utilisés
>Pentose(5C)
>Hexose (6C)

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30
Q

Qu’est ce que le pentose?

En terme de constituants cellulaires

A

C’est un monosaccharide

C’est un des principaux composants des acides nucléiques<=> sucre

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31
Q

Qu’est ce que l’hexose ?
Famille des constituants cellulaires ?
Localisation ?

A

C’est un monosaccharides

C’est un des 1er polymère des parois cellulaires ou de réserve

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32
Q

Que sont les polysaccharides /polyosides ?

Des liaisons particulières ?

A

Ce sont des glucides et notamment une répétition des plusieurs monosaccharides liées par des liaisons covalentes
Deux types de liaisons:
> alpha
> bêta

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33
Q

Que contient le chromosome bactérien ?

Sa localisation ?

A

La quasi totalité de l’information génétique

Il se situe dans le nucleoïde

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34
Q

Définition de nucleoïde?

A

Région à l’intérieur des cellule

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35
Q

Qu’est ce qu’une nucléotide?

A

Groupement phosphate+sucre+base

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36
Q

Qu’est ce que une nucléoside?

A

Sucre + base

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37
Q

Par quelles liaisons sont reliés les nucléotides?

A

Par des liaisons phosphodiester

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38
Q

Qu’est ce que le pentose ?

En terme d’acide nucléique

A

Il correspond au sucre
Selon le type d’acide nucléique celui ci diffère
ADN=> déoxyribose
ARN=> ribose

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39
Q

Particularités des bases azotées/ nucléobases ?
Noms?
Liaisons?

A

Deux types de bases:

  • pyruviques (1 cycle)=> cytosine, thymine, uracile
  • puriques(2 cycles) => thymine, guanine

Reliées par des liaisons hydrogènes

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40
Q

Par combien de liaisons H sont réliées chaqu’une des complémentarités ?

A

A-T lié par 2 H

C-G lié par 3H

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41
Q

Caractéristiques de l’ADN?
Liaisons?
Pentose?
Structure?

A
  • Structure en double hélice avec une direction anti-parallèle
  • Le pentose est un désoxyribose(H)
  • Complémentarités des bases azotées
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42
Q

Caractéristiques de l’ARN?
Sous-section?
Pentose?
Structure?

A
  • Structure en brin simple
  • Une base azotée différente de l’ADN :Uracile <=> Thymine
  • Le pentose dans l’ARN est un ribose(OH)
  • Il en existe trois types différents
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43
Q

Quelles sont les 3 types d’ARN différents?

A
  • ARNt(transfert)
  • ARNm(messager)
  • ARNr(ribosomique)
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44
Q

Quelles sont les caractéristiques de l’ARNm?

A
  • L’unique codant des ARN

- Traduit au niveau des ribosomes, c’est la copie de la séquence codante d’un gène

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45
Q

Quelles sont les caractéristiques de l’ARNt?

A

-fournissent les AA et les outils nécessaires à l’expression des ARNm en protéines

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46
Q

Quelles sont les caractéristiques de l’ARNr?

Utilisation au nombre de deux?

A
  • Se situe à l’intérieur des ribosomes
  • Permet la formation des liaisons peptidiques
  • Catalyseur direct de la synthèse des protéines
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47
Q

Qu’est ce que les ribosomes ?
Leurs compo?
Leurs tailles ?

A

-Permettent la synthése des protéines
-Déchiffre l’ARNm
-Est composée de chaînes d’AA et de protéines
-Existe une différence de taille entre eucaryotes et procaryotes
-Il existe deux tailles:
=> 50S et 30S

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48
Q

Qu’est-ce que les protéines ?

A

c’est un polymères d’AA unis par des liaisons peptidiques

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49
Q

Quelles sont les différentes fonctions des protéines ?

A
  • Structurales:maintien paroi
  • Enzymes: catalyse des réactions
  • Transport
  • Communication: entre bactéries sécrétant des protéines
  • Défense : combattre les ennemies
  • Réserve en cas de «famine»
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50
Q

Comment se passe la formation de la structure des protéines ?
4 points

A

Primaire=>séquence de 20 AA
Secondaire=> contrainte de structures a cause des liaisons H
Tertiaire=>Présence de crevasses qui permettent l’interaction avec les autres protéines
Quatriéme=> Interaction avec d’autres

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51
Q

Quel rôle jouent les enzymes dans le processus moléculaires ?
Leurs appellations ?
Leurs types ?

A

-Sont des catalyseurs
-Ont les retrouve sous l’appellation «ose»
-Ils y en a deux types:
Oxydation et réduction

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52
Q

Par quelle enzyme est répliquée l’ADN ?

A

L’ADN polymérase

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53
Q

De quel type de conservation fait preuve l’ADN en matière de réplication?

A

Semi-conservatoire

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54
Q

Quels sont les trois types de réplication?

A
  • Mutation silencieuse
  • Mutation non sens
  • Mutation faux sens
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55
Q

Qu’est ce qu’une la mutation silencieuse ?

A

Le codon code pour le même AA

Protéine normale

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56
Q

Qu’est-ce qu’une mutation non-sens?

A

Plus ou moins longue à cause d’un codon stop

Protéine incompléte

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57
Q

Qu’est-ce qu’une mutation faux sens?

A

Changement de codon

Protéine mutée

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58
Q

Quelles ont les étapes de la transcription ?

A

Transcription : ADN to ARN

  • écartement de des brins par l’enzyme
  • formation de l’ARn a partir du brin transcrit
  • lecture du brin 3’ à 5’
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59
Q

Comment lit-on l’ADN ?

A

De 3’ à 5’

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60
Q

Qu’est ce que la traduction ?

Quelles sont les outils utilisés?

A
  • ARNm à protéines

- Utilisation des ribosomes, ARNt, ARNr, «ARNm»

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61
Q

Comment ce passe la traduction?

A

1- Fixation du ribosome sur un codon de l’ADNm
2-dans le ribosome se trouve des ARNt
3-L’ARNt « fourni» les éléments pour fabriquer l’AA correspondant au codon
4- Passage a l’autre codon

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62
Q

Définition de polypeptide?

A

Chaîne d’AA

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63
Q

Définition de polyribosomes ?

A

Association de ribosome et d’ARNm

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64
Q

Quel est le codon initiateur?

A

La méthionine

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65
Q

Quels sont les 3 codons stop ?

A

UAA
UGA
UAG

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66
Q

Définition de codon ?

A

Triplet de nucléotide de l’ARN codant un acide aminé

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67
Q

Définition génome?

A

Ensemble des chromosomes et gènes d’une espèce ou d’un individu

68
Q

Taille des procaryotes ?

A

1 à 10 micromètre

69
Q

Tailles des eucaryotes ?

A

10 à 100 micromètre

70
Q

Définition de métabolisme ?

A

Processus chimiques intracellulaires

71
Q

Qu’est ce que l’anabolisme?

A

Ensemble des réactions de biosynthése des cellules

72
Q

Qu’est ce que le catabolisme ?

A

Ensemble des réactions produisant de l’énergie

73
Q

A quoi va servir l’énergie produite lors du catabolisme

A

Énergie pour la biosynthèse

Énergie de mobilité

74
Q

Définition de biosynthèse

A

Formation d’un substance organique dans un eV

75
Q

Quelle sont les différentes sources de C ?

Qu’utilise chaque une de ces sources

A

Hétérotrophes :
Source de carbone organique (aliment ….)
Autotrophes
Source inorganique comme le CO2

76
Q

Quels sont les deux grand types de source d’énergie pour les métabolismes ?

A

La lumiére

Et chimiotrophes

77
Q

Définition de chimiotrophes

A

Utilisent un composé chimique comme le H2, NO2-,FE2+….

78
Q

Que sont les phototrophes

A

Utilisent la lumière comme sources d’énergie

79
Q

Quels sont les deux types de chimiotrophes ?

Leurs définitions

A

Chimio-organotrophes = utilise une molécule organique comme le glucose

Chimio-lithotrophes = utilise une molécule inorganique comme le H2

80
Q

Quels sont les deux types de phototrophes ?

Leurs définitions

A

Photo-autotrophes= source de carbone inorganique comme source d’énergie

Photo-hétérotrophes = utilise du carbone organique comme source d’énergie

81
Q

Réaction d’oxydation?

A

Red——> Ox + ne-

82
Q

Réaction de réduction ?

A

Ox + ne- ———> Red

83
Q

Définition d’oxydation

Son nom biologique

A

Réducteur perd des électron

=> donneur d’é-

84
Q

Définition de réduction

Son nom biologique

A

Oxydant qui va gagné des électron

=> accepteur d’e-

85
Q

Qu’est ce que le potentiel redox

A

Tendance d’une substance a etre oxydé ou réduite

86
Q

Comment varie le potentiel redox

A

Libération d’énergie lors de transfert d’énergie
Plus la différence entre le potentiel du donneur et celui de l’accepteur est grand alors la quantité d’en-négrier disponible sera grande

87
Q

Quelle est le nom de la «monnaie» énergétique ?

A

ATP

88
Q

Quelles sont les trois types de phosphorylation ?

A

Au niveau du substrat
Oxydative
Et photophosphuorylation

89
Q

Que signifie phosphorylation

A

Production d’ATP

90
Q

En quoi consiste la phosphorylation du substrat

A

Phosphorylation directe de l’ATP avec un groupe phosphate

ADP + Pi + énergie => ATP

91
Q

A quoi correspond la phosphorylation oxydative

A

C’est le respiration avec:
Glycolyse
Cycle de Krebs
Crêtes des membranes interne des mitochondries

92
Q

En quoi consiste la photo phosphorylation ?

3 points

A

Utilisation de la lumière pour produire de l’ATP
Production d’une force motrice du proton entraînant le transfert d’un H+ a travers la membrane
A lieur lors de la PS

93
Q

Quelles sont les deux types de photosynthèse ?

A

Oxygénique

Anoxygénique

94
Q

Comment se passe la PS oxygénique ?
Et qui la fait ?
Qui est le donneur d’e-?

A

EV faisant la PS O=> algues cyanobactéries, plantes

Donneur d’e- est l’eau
Tous les deux réduisent le CO2 en sucre et l’NADH en NADHP

95
Q

Comment se passe la PS anoxygénique ?
Qui l’a fait?
Donneur d’e-?

A

Producteur=> bactéries violettes et vertes
Donneur d’e- => molécule inorganique
Tous les deux réduisent le CO2 en sucre et l’NADH en NADHP

96
Q

Ou suppose t-on le début de la vie

A

Dans les océans

97
Q

Comment était la vie au départ

A

Anoxygénique avec les bactéries puis oxygénique avec les EV

98
Q

Évolution de l’Arn
4 étapes
Comment se comporte t-il avec de la chaleur

A

-Issu de l’adénine monophosphate de la soupe primitive
-Puis formation d’ATP puis d’un poly A puni d’insertion des bases azotées dans ce polyA
=> création d’un ARN primitif

Capacité à se multiplier seul

Incompatible avec les fortes températures

99
Q

Évolution de l’ADN

2 étapes

A

-Formation à partir d’arn + long et de peptides + long également
-Apparition de la transcription inversé
=> adn a double brins

100
Q

Quel était le premier métabolisme?

A

Un chimiolithotrophe simple

Mais également de la fermentation simple

101
Q

Quelle est le métabolisme d’un chimio-lithotrophes ?

Qu’est ce qu’il oxyde? Réduit?

A

Métabolisme anoxique
Oxydation de l’H2
Réduction de S-

102
Q

Comment se nomme les premières protéines membranaires?

A

Cytochrones

103
Q

Définition de cytochrones?

Qu’est ce qu’ils constituent?

A

Protéines transmembranaires composées de porphyrie et d’un atome de fer

Constituants des chaines de transfert d’e-

104
Q

Qu’on permis les cytochrones?

A

Le développement des deux respirations

105
Q

A partir de quel produit de la fermentation le développement de la PS a pu voir le jour

A

La porphyrine

106
Q

Photosynthése anoxygénique et évolution
Par qui?
De quoi ils sont composés ?

A

Grace aux bactéries

Elles sont composées de bactériochlorophylle type alpha

107
Q

Qu’est ce que la bactériochlorophylle?

A

Un pigment photosynthétique qui permet de faire la PS

108
Q

Photosynthése oxygénique et évolution
Par qui?
De quoi ils sont composés ?

A

Par les cyanobactéries

Composés de chlorophylle type alpha

109
Q

Qu’est ce que là chlorophylle ?

A

Un pigment photosynthétique qui permet de faire la PS

110
Q

Quel est la derniermétabolisme à se mettre en place

A

La respiration

111
Q

Quels sont les autres métabolismes qui se sont créés grâce à la porphyrine?

A

La méthanogénèse => prod de méthane

Acéthogénèse=> prod d’acétone

112
Q

Qu’est ce que la théorie de l’endosymbiose ?

A

Deux phagocyte de cellule procaryote

  • la première aérobie (mitochondries)
  • la seconde anaérobie (chlorophastes)
113
Q

Définition de symbiose

A

Association a bénéfice mutuel dans le sens strict de type obligatoire
Les symbions ou symbiotes ne peuvent vivre séparément

114
Q

Définition d’histones?

A

Pièces maîtresses de la composition de l’ADN et règle majeur dans la régulation des fonctions du génome

115
Q

Qu’est ce que les prochloroplastes ?

A

Organismes possèdent deux types de chloroplastes (alpha et bêta )

116
Q

Qu’est ce qu’un chronomètre moléculaire?

4 caractères

A

Molécule dont la séquence peut-être utilisée comme mesure comparatives de divergences évolutives

Universelle dans le groupe étudié
Un max de correspondance de base en face
Fonctionnement homologue
Change mtn a un taux compatible avec la distance phylogénétique mesurée

117
Q

Quels sont les chronométrés moléculaires?

A
  • Procaryotes = 16S (ARN)
  • Eucaryotes= 18S (ARN)
  • Rec A
  • ATPase
118
Q

Quels sont les caractéristique de l’ARN 16S ?

7 points

A

Ubiquitaires
Stable
Conservation fonctionnelle
Sequencage rapide
Régions variables et d’autres de conserves
Peu de transfert latéraux
Milliers de séquence dans les bases de données

119
Q

Qui est Carl WOESE?

A

Il est a l’origine de la représentation en trois domaines et non pas deux (Archées en plus)

120
Q

Quels sont les trois domaine du vivants ?

A

Eucaryotes
Bactéries
Archées

121
Q

Définition de chitine ?

A

Composant des coquilles des crevettes et paroi des champignons

122
Q

Qu’est-ce que la bactériostatiques ?

A

Paralyse des bactéries en inhibant leur multiplication

123
Q

Qu’est ce que la fission binaire ?

A

Une cellule mère donne deux cellules filles identiques entre les deux autrement appelés scissiparite

124
Q

Qu’est ce que les introns?

A

Partie non codante d’un gène

125
Q

Qu’est ce que les exons?

A

Partie codante d’un gène

126
Q

Possession d’une enveloppe nucléaire pour les trois domaines ?

A

B=non
A=non
E=oui

127
Q

Types de division cellulaire pour les trois domaines ?

A 
B= fission binaire 
A= fission binaire 
E = méiose mitose
128
Q

Possession d’un chromosome circulaire pour les trois domaines

A

B=oui (non rare)
A= oui
E=non

129
Q

Possession d’histones pour les trois domaines

A

B= absent
A=oui
E=oui

130
Q

Présence d’introns pour les trois domaines

A

B=absent
A=parfois
E=oui

131
Q

Présence d’arn polymérisé pour les trois domaines

A

B= une sorte
A= une aussi
E=oui

132
Q

Quel type de ribosomes pour les trois domaines

A

B= 70S
A=70S
E=80S

133
Q

Quel est l’AA initiateur de la synthèse de protéine pour les trois domaines du vivants

A

B=formylméthionine
A=Méthionine
E=méthionine

134
Q

Sensibilité a la streptomycine et chloramphénicol pour les trois domaines?

A

B= oui
A=non
E=non

135
Q

Quel type de lipide memebranaires pour elles trois domaines

A 
B= acides gras et liaison Ester
A= phytanyl et liaison ether
E= acides gras et liaison ester
136
Q

Quel type de paroi pour les trois domaines

A

B= peptidoglycane
A=compo diverse
E= cellulose chitine si présente

137
Q

Croissance a T>1000° pour les trois domaines du vivant

A

B=non
A=quleques espèces
E=non

138
Q

Quel est le but de la systématique ?

A

Classer les EV de manière rationnelle en groupe d’affinités et de leur attribuer un nom

139
Q

Comment classe t’on la systématique,

Avec quelles disciplines?

A

Avec la taxonomie et la nomenclature

140
Q

Qu’est ce que la taxonomie pour la systématique ?

A

Science qui décrit et étudie les organismes

141
Q

Qu’est ce que la nomenclature pour la systématique ?

A

Ensemble des règles gouvernant l’attribution d’un nom a un taxons

Nom de genre et nom d’espèce

142
Q

Rangs hiérarchiques de la systématique

15 points comprenant les sous

A 
Domaine ou empire
Phylum ou division
Classe
Sous classe
Ordre 
Sous ordre
Famille 
Sous famille
Tribu
Sous tribu
Genre
Sous genre
Espéce 
Sous-espèce
Rang inférieur a la sous espèce
143
Q

Comment classifie-on le agents pathogénes ?

A

En fonction de groupe selon leurs dangers
De groupe 1 =>sans risque
A groupe 4=>maladies graves, propagation collectivité élevée, traitements inexistants

144
Q

Comment mesure t-on le trouble ou turbidité ?

A

Avec un spectrophotomètre

145
Q

Dans des conditions de systèmes fermés, quels sont 4 noms des phases de la courbe ?

A

1-Latence
2- Exponentielle
3- Stationnaire
4- Déclin

146
Q

Définition de population

A

Ensemble d’individus d d’la même espece

147
Q

Comment se multiplient les bactéries (le nom)?

A

Par scissiparité ou fission binaire

148
Q

Définition de cycle cellulaire ?

A

Ensemble des étapes entre la cellule mère et les cellules filles, les phases de croissance et division

149
Q

Définition de colonie bactérienne?

A

Ensemble des cellules filles issus d’une cellule mère

150
Q

Qu’est ce que le temps de réaction ?

Quelle est la formule?

A

Le temps nécessaire au doublement de la population

G (temps de réaction)= t / n (nombre de génération)

151
Q

Qu’est ce que le taux de croissance?

A

Nombre de génération par unité de temps

152
Q

Nommez quelques facteurs pouvant faire varier la croissance bactérienne ?

A 
Température
Pression
Nutriments
Luminosité
pH
Concentration en oxygène
Salinité 
Source de carbone organique ou inorganique
153
Q

Définition de abiotique

A

Paramètres physiques

154
Q

Quelles sont les principales formes de bactéries ?

MIN 2

A 
Bacille 
Coque
Spirille
Filamenteuse
Pédonculé
155
Q

Donnez le protocole Gram

En 5 points

A 
1- Fixation des cellules
2- Coloration au Crystal violet 
3-Passage au lugol ou iode
4-Décoloration à l’éthanol (pour les + pas d’effets )
5-Coloration à la saframine
156
Q

Pourquoi les bactéries a gram - sont-elles plus dangereuses que les gram +?

A

Libération d’une toxine => LPS ou Lipopolysaccharides résistante aux antibiotiques

157
Q

Donnez l’éthymologie de chimiolithotrophes

A

Chimio=> chimiques

Lithotrophes => inorganiques réduits

158
Q

Qu’est ce que le plasmide chez les bactéries ?

A

Région extrachromosomique de l’ADN

159
Q

Quels sont les constituants d’un peptides ?

A

Des AA

160
Q

Qu’est ce que la cyanine?

A

Fluorochrome => marqueur de fluorescence

161
Q

Qu’est ce que l’adénosine?

A

Résultat de la combinaison de l’adénine avec un ribose

162
Q

Qu’est ce que l’albumine ?

A

C’est une protéine présente dans le blanc d’œuf, lait et plasma sanguin

163
Q

Qu’est ce que la thyminine

A

C’est la combinaison d’une thymine avec un désoxyribose

164
Q

Qu’est ce que la tyrosine ?

A

Un AA

165
Q

Qu’est ce que la thréonine

A

Un AA

166
Q

Qu’est ce que la guanosine ?

A

C’est une combinaison de guanine et de ribose

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