Cours 7: Bactériophage Flashcards
Définition bactériophage
matériel génétique encapsidé par protéine, infecte les bactéries
Donner deux types de bactériophages existants ainsi qu’une courte description de ceux-ci
- Virulent: Il tue la bactérie après l’avoir infectée
- Tempéré: Un certain pourcentage ne tue pas la bactérie et s’intègrent dans le génome bactérien afin de former des bactéries lysogènes
Nommer une particularité structurale du phage lamda
Il n’a pas de fibres
Nommer des caractéristiques du phage T4
- ADN bicaténaire
- ADN linéaire
- Protéine pilote: empêche la sortie de l’ADN de la tête. Aide à l’entrée d’ADN dans la membrane interne de la bactérie
- Gaine contractile grâce à une rotation pour percer la membrane externe
- Fibres courtes
- Fibres de la queue longues
- Enzymes capables de dégrader le peptidoglycane
Qu’est-ce qu’un phage filamenteux?
Un phage qui emballe de longues molécules d’ADN avec des protéines qui sortent
Nommer des exemples de phage à ADN
monocaténaire et circulaire
- M13
- phiX174
Donner des exemples de phage à ADN
linéaire et bicaténaire
- T7,
- phi29,
- T4
Donner un exemple de phage à ADN
linéaire/circulaire et bicaténaire
Lambda
Donner des exemples de phage avec des génomes linéaires
- Télomères (eucaryotes)
- T7 (séquence répétée aux extrémités)
- phi29 (protéine terminale servant d’amorce)
- Recombinaison (T4)
Nommer les éléments nécessaires à la réplication du génome phagique du phage T4
- Protéines précoces (polymérases phage spécifique)
- Protéines dégradant le chromosome bactérien
Expliquer brièvement les grandes étapes de la réplication du génome du phage T4
1) Entrée de l’ADN
2) Synthèse des protéines précoces de l’ARNm précoce
3) Réplication du génome phagique
4) Synthèse des protéines tardives et assemblage des autres parties structurales
5) Incorporation de l’ADN dans capside
6) Lyse de la cellule et libération des phages
Nommer les éléments nécessaires à la réplication de M13
- ADN doit être sous forme bicaténaire circularisée
- ADN polymérase de l’hôte pour faire l’extension de l’amorce
- Endonucléase du gène II pour clivage
- Extrémité 3’OH servant d’amorce
- Gène V se lie au brin + synthétisé
Est-ce qu’une cellule infectée par M13 est tuée
Non, mais sa croissance est ralentie
Nommer les particularités du phage phiX174 et de son processus de réplication
- phage virulent
- pas de queue associée
- réplication nécessite un surenroulement pour permettre un clivage par la protéine A
- l’ADN est entouré de la protéine SSB
- Réplication à cercle roulant
Comment est répliquée l’extrémité du brin supérieur des phages à génome linéaire (3’ vers 5’)
- Télomères (eukaryotes)
- Séquences répétées aux extrémités (T7)
- Protéine terminale qui sert comme une amorce (phi-29)
- Recombinaison (T4)
Quelles sont les caractéristiques du génome du phage T4
-Linéaire bicatenaire
-Redondant aux extrémités
-Permutation circulaire
Quelles sont les caractéristiques du phage T7?
-Phage virulent linéaire
-Origine de réplication est une protéine initiatrice et des protéines
-Machinerie nécessaire à la réplication est encodée par le phage
-Réplication bidirectionnelle
-Formation de concatémères pour compléter la réplication aux extrémités
Nommer les caractéristiques du phage phi29
-Protéine terminale qui s’attache aux extrémités 5’ des séquences
-Génome ADN linéaire bicaténaire
-Séquences répétées aux extrémités
-Formation d’une structure en boucle pour répliquer la molécule monocaténaire
-Séquences en T à l’extrémité du génome
-Permutation circulaire
À quoi correspondent les 3 classes d’ARN pouvant être transcrites par les bactériophages comme le phage T7
-Classe I: Utilise ARN polymérase de l’hôte, gènes précoces
-Classe II: Utilise l’ARN polymérase de T7, gènes impliqués dans le métabolisme d’ADN
-Classe III: Utilise l’ARN polymérase de T7, gènes tardifs impliqués dans la biosynthèse des composants structurales (têtes, queues, etc.)
Nommer les éléments nécessaires pour permettre une infection par un phage lambda
-Protéines J et LamB
-Extrémités cos
-ADN ligase de l’hôte
-Séquence Ori pour amorcer réplication
-Endonucléase et ADN polymérase
-Enzyme terminase
Sous quelle forme se trouve le génome du phage lambda dans les particules phagiques vs dans le cytoplasme
- Dans les particules phagiques: Génome linéaire
- Dans cytoplasme: Génome circulaire (circularisation via sites cos)
Après l’infection par lambda, quel pourcentage des cellules entrent dans un cycle lytique
90%
Dans de bonnes conditions de croissance (bcp d’éléments nutritifs)
Quelles sont les fonctions de la protéine N
Activité anti-terminaison. Lorsqu’elle est présente, L’ARN polymérase «évite» les séquences de terminaison t et l’enzyme continue sont travail vers la gauche et vers la droite
-À droite: Expression de CII, O et P
-À gauche: Protéine N permet la transcription des gènes impliqués dans l’intégration/excision du phage du chromosome
Pour le phage lambda, comment on détermine si un cycle lytique ou un cycle lysogénique est entamé?
Compétition établie entre les répresseurs C1 et Cro
Si C1 gagne: cycle lysogénique
Si Cro gagne: cycle lytique
