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micro environnemental > cours 7 > Flashcards

cours 7 Flashcards

1
Q

quelles sont les 2 formes d’organisation spatiales des microbes unicellulaires

A
  1. Forme libre en suspension dans milieu liquide, forme planctonique moins fréquente
  2. Forme communauté microbienne, sédentaire dans biofilm, forme la plus abondante
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2
Q

qu’est-ce qu’une communauté microbienne

A

ensemble de microorganismes (différentes espèces et souches) qui vivent ensemble en communauté sur un support

souvent des biofilms

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3
Q

caractéristiques/définition biofilm

A
  • communauté microbienne fixée sur support et maintenue par sécrétion matrice adhésive et protectrice
  • très répandu
  • structure vivante et dynamique
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4
Q

de quoi est fait le biofilm

A

couche de EPS (exopolysaccharides, extracellular polymeric substances) fait de polyoside et ADN

sécrétion EPS protège congre stress environnemental

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5
Q

où se forme les biofilm

A

toute surface avec un environnement humide et nutritifs

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6
Q

exemples de supports des biofilms

A
  • corps humain (plaque dentaire)
  • plantes
    -roches
    -oeufs
    -plastiques
    -métal
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7
Q

quelles sont les 5 étapes de la formation d’un biofilm

A
  1. attachement et conditionnement du support
  2. mouvement vers le support conditionné
  3. adhérence au support
  4. maturation
  5. dispersion
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8
Q

en quoi consiste étape 1 de formation biofilm

A
  • formation film de conditionnement

-attachement rapide et efficace sur surfaces hydrophobes

-molécules organiques du film de conditionnement utilisées par bactéries pionnières

  • attachement réversible
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9
Q

en quoi consiste étape 2 de formation biofilm

A
  • mouvement des microorganismes vers support conditionné par chimiotaxie et motilité
  • sédimentation, mouvement, transport converti, organisation
  • attachement irréversible
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10
Q

en quoi consiste étape 3 de formation biofilm

A
  • adhésion spécifique grâce sécrétion molécules matricielle
  • production matrice contrôlé par quorum sentine
  • multiplication et croissance du biofilm
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11
Q

en quoi consiste étape 4 de formation biofilm

A
  • croissance biofilm continue
  • sécrétion EPS continue
  • biofilm grandit et atteint maturité
  • taille devient macroscopique
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12
Q

en quoi consiste étape 5 de formation biofilm

A
  • dispersion induite par: vieillissement biofilm, stress, carence de nutriments
  • microbes peuvent se nourrir de la matrice

cellules planctoniques libérées: colonise d’autres surfaces

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13
Q

quelle est la structure d’un biofilm mature

A

20% masse microbienne
80% matrice EPS et ADN
canaux circulation eau, nutriments, signaux
canaux rejets déchets
gradients pH et O2

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14
Q

exemple application biofilm (positif)

A
  • traitement eaux usées
  • assainissement sols contaminés
  • protège cultures/fruits contre pathogènes
  • assimilation minéraux par plantes
  • kombucha, préservation aliments
  • médicaments
  • agents nettoyant
    biocarburants 2-3e gen
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15
Q

problèmes causés par biofilms

A
  • caries
  • contamination surfaces
  • résistance antibiotiques
  • infections nosocomiales
  • contamination eau/aliments
  • corrosion
  • obturation canalisation
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16
Q

quels sont les 3 cas de contaminations médiatisés

A
  1. Contamination eau potable Walkerton
  2. Contamination hôpital Sainte-Justine (eau)
  3. Contamination par Listeria chez Maple Leaf
17
Q

caractéristiques/définition chimiotaxie

A

mouvement directionnel des cellules par rapport aux molécules dans environnement

besoin d’un gradient

types: attractive, répulsive

rôle dans fonctionnement physiologique des microorganismes

18
Q

comment les microorganismes se déplacent

A
  • flagelle
    pseudopodes ou plasmodes
19
Q

sens rotation pour nage vs culbute

A

aiguille montre: culbute
sens contraire aiguille montre: nage

20
Q

comment se font les mouvements sans gradient

A

aléatoire

21
Q

quels sont les étapes de régulation de chimiotaxie

A
  1. transmission des signaux
  2. régulation flagelles
  3. régulation récepteurs
22
Q

comment se fait la détection et transmission du signal lors de la régulation de chimiotaxie

A

gradient perçu par MCPs (méthylène acceptant chemotaxis protéines)

MCPs interagit avec CheW et CheA

sans molécule de signal fixé à MCPs: CheA s’autophosphoryle (his kinase)

23
Q

comment se fait la régulation des flagelles dans régulation chimiotaxie

A

sans stimuli:
CheA-P transmet P à CheY (médiateur)
CheY-P se fixe sur flagelle: mouvement sens aiguille montre: culbute

CheZ enlève P de CheY: rotation sens inverse aiguille montre: nage

avec stimuli:
CheA pas P -> moins de CheY-P -> plus nage

24
Q

comment se fait la régulation du récepteur dans régulation chimiotaxie

A

sans stimuli:
Che A phosphoryle CheB
CheB-P enlève CH3
permet comparer gradient (mémoire)

avec stimuli:
MCP régulé par CH3 avec CheR
CheR ajoute CH3, rend plus sensible, + désactivation CheA donc plus de nage

25
Q

comment se fait les étapes de vie importantes de Dictyostelium discoideum

A

carence: pas nourriture dans milieu
agrégation: rassemblement par chimiotaxie
limax: au lieu de rester cellules individuelles -> limax ou pseudoplasma : peut se déplacer
sorocarpes: limax peut sporuler

26
Q

quelles sont les 2 voies de régulation de chimiotaxie de Dictyostelium

A

PLA2 et PI3K

27
Q

autoinducteurs AHL utilisé par qui

A

Gram- pour communication intraspécifique

28
Q

autoinducteurs PAI utilisé par qui

A

Gram+ pour communication intraspécifique

29
Q

exemple AI interspécifique

A

AI-2

30
Q

mécanisme QS chez V. fischeri

A

lorsque seuil atteint: bioluminescence

31
Q

mécanismes QS type 1chez Gram-

A

AHL activé par enzyme codé par luxl
faible densité AHL: LuxR (récepteur/FT) pas activé
à forte concentration: AHL entre dans cellule et lie LuxR
LuxR-AHL lie promoteur

32
Q

mécanisme QS chez Gram+

A

PAI sécrété par transporteur actif vers ext
PAI lie récepteur
phosphorylation FT et liaison promoteur

33
Q

comment est-ce que QS affecte virulence

A

si atteint seuil de densité: virulence turned on
haute densité: virulence complète expression gènes

34
Q

applications découlant du QS

A

analogues AI
- interférer communication
- empêcher formation biofilm
- empêcher/réduire virulence

35
Q

combien de temps dure un cycle circadien

A

24h

36
Q

mécanisme rythme circadien N. crassa

A

photorécepteur WC
gènes WC1-2 et FRQ
FRQ désactive WC

micro environnemental (5 decks)

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