cours 7 Flashcards
quelles sont les 2 formes d’organisation spatiales des microbes unicellulaires
- Forme libre en suspension dans milieu liquide, forme planctonique moins fréquente
- Forme communauté microbienne, sédentaire dans biofilm, forme la plus abondante
qu’est-ce qu’une communauté microbienne
ensemble de microorganismes (différentes espèces et souches) qui vivent ensemble en communauté sur un support
souvent des biofilms
caractéristiques/définition biofilm
- communauté microbienne fixée sur support et maintenue par sécrétion matrice adhésive et protectrice
- très répandu
- structure vivante et dynamique
de quoi est fait le biofilm
couche de EPS (exopolysaccharides, extracellular polymeric substances) fait de polyoside et ADN
sécrétion EPS protège congre stress environnemental
où se forme les biofilm
toute surface avec un environnement humide et nutritifs
exemples de supports des biofilms
- corps humain (plaque dentaire)
- plantes
-roches
-oeufs
-plastiques
-métal
quelles sont les 5 étapes de la formation d’un biofilm
- attachement et conditionnement du support
- mouvement vers le support conditionné
- adhérence au support
- maturation
- dispersion
en quoi consiste étape 1 de formation biofilm
- formation film de conditionnement
-attachement rapide et efficace sur surfaces hydrophobes
-molécules organiques du film de conditionnement utilisées par bactéries pionnières
- attachement réversible
en quoi consiste étape 2 de formation biofilm
- mouvement des microorganismes vers support conditionné par chimiotaxie et motilité
- sédimentation, mouvement, transport converti, organisation
- attachement irréversible
en quoi consiste étape 3 de formation biofilm
- adhésion spécifique grâce sécrétion molécules matricielle
- production matrice contrôlé par quorum sentine
- multiplication et croissance du biofilm
en quoi consiste étape 4 de formation biofilm
- croissance biofilm continue
- sécrétion EPS continue
- biofilm grandit et atteint maturité
- taille devient macroscopique
en quoi consiste étape 5 de formation biofilm
- dispersion induite par: vieillissement biofilm, stress, carence de nutriments
- microbes peuvent se nourrir de la matrice
cellules planctoniques libérées: colonise d’autres surfaces
quelle est la structure d’un biofilm mature
20% masse microbienne
80% matrice EPS et ADN
canaux circulation eau, nutriments, signaux
canaux rejets déchets
gradients pH et O2
exemple application biofilm (positif)
- traitement eaux usées
- assainissement sols contaminés
- protège cultures/fruits contre pathogènes
- assimilation minéraux par plantes
- kombucha, préservation aliments
- médicaments
- agents nettoyant
biocarburants 2-3e gen
problèmes causés par biofilms
- caries
- contamination surfaces
- résistance antibiotiques
- infections nosocomiales
- contamination eau/aliments
- corrosion
- obturation canalisation
quels sont les 3 cas de contaminations médiatisés
- Contamination eau potable Walkerton
- Contamination hôpital Sainte-Justine (eau)
- Contamination par Listeria chez Maple Leaf
caractéristiques/définition chimiotaxie
mouvement directionnel des cellules par rapport aux molécules dans environnement
besoin d’un gradient
types: attractive, répulsive
rôle dans fonctionnement physiologique des microorganismes
comment les microorganismes se déplacent
- flagelle
pseudopodes ou plasmodes
sens rotation pour nage vs culbute
aiguille montre: culbute
sens contraire aiguille montre: nage
comment se font les mouvements sans gradient
aléatoire
quels sont les étapes de régulation de chimiotaxie
- transmission des signaux
- régulation flagelles
- régulation récepteurs
comment se fait la détection et transmission du signal lors de la régulation de chimiotaxie
gradient perçu par MCPs (méthylène acceptant chemotaxis protéines)
MCPs interagit avec CheW et CheA
sans molécule de signal fixé à MCPs: CheA s’autophosphoryle (his kinase)
comment se fait la régulation des flagelles dans régulation chimiotaxie
sans stimuli:
CheA-P transmet P à CheY (médiateur)
CheY-P se fixe sur flagelle: mouvement sens aiguille montre: culbute
CheZ enlève P de CheY: rotation sens inverse aiguille montre: nage
avec stimuli:
CheA pas P -> moins de CheY-P -> plus nage
comment se fait la régulation du récepteur dans régulation chimiotaxie
sans stimuli:
Che A phosphoryle CheB
CheB-P enlève CH3
permet comparer gradient (mémoire)
avec stimuli:
MCP régulé par CH3 avec CheR
CheR ajoute CH3, rend plus sensible, + désactivation CheA donc plus de nage
comment se fait les étapes de vie importantes de Dictyostelium discoideum
carence: pas nourriture dans milieu
agrégation: rassemblement par chimiotaxie
limax: au lieu de rester cellules individuelles -> limax ou pseudoplasma : peut se déplacer
sorocarpes: limax peut sporuler
quelles sont les 2 voies de régulation de chimiotaxie de Dictyostelium
PLA2 et PI3K
autoinducteurs AHL utilisé par qui
Gram- pour communication intraspécifique
autoinducteurs PAI utilisé par qui
Gram+ pour communication intraspécifique
exemple AI interspécifique
AI-2
mécanisme QS chez V. fischeri
lorsque seuil atteint: bioluminescence
mécanismes QS type 1chez Gram-
AHL activé par enzyme codé par luxl
faible densité AHL: LuxR (récepteur/FT) pas activé
à forte concentration: AHL entre dans cellule et lie LuxR
LuxR-AHL lie promoteur
mécanisme QS chez Gram+
PAI sécrété par transporteur actif vers ext
PAI lie récepteur
phosphorylation FT et liaison promoteur
comment est-ce que QS affecte virulence
si atteint seuil de densité: virulence turned on
haute densité: virulence complète expression gènes
applications découlant du QS
analogues AI
- interférer communication
- empêcher formation biofilm
- empêcher/réduire virulence
combien de temps dure un cycle circadien
24h
mécanisme rythme circadien N. crassa
photorécepteur WC
gènes WC1-2 et FRQ
FRQ désactive WC
