COURS 6 Noyau Flashcards by Lysa Bergeron

Est-ce qu’un gène non-transcrit sera digéré par DNAse ?

Non - parce qu’il est condensé

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Pourquoi les gènes transcrits sont plus sensibles que les non-transcrits aux DNAse ?

Parce qu’ils sont + déballés

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Est-ce qu’il y a seulement les histones qui comptactent l’ADN ?

NON - d’autres prot s’ajoutent > HP1 (condensation chromatine)

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La membrane nucléaire est simple ?

NON - c’est une membrane double

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V/F

Le chromosome en interphase est plus structuré qu’en métaphase

FAUX

Il est moins structuré en interphase

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V/F

Les chromosomes sont n’importe où dans le noyau

FAUX

Ils sont par territoire > pas de chevauchement

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Qu’est-ce qui forme le squelette du chromosome ?

SAR et MAR > attachés à la chromatine

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Quelles régions de la chromatine sont attaché au squelette du chromosome ?

régions attachées au squelette de protéines se retrouvent entre les unités de transcription

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est-ce que le squelette du chromosome est important ?

organisation de la chromatine par les S/MAR est cruciale dans la régulation de l’expression des gènes

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Comment se nomme les régions attachées au squelette du chromo ?

Non-transcrite ou constitutive ou facultative

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Nomme un maladie de l’enveloppe nucléaire

Progéria - dysfonction lamine A = mutée/immature

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Quelle est la conclusion de l’étude de la progéria ?

lamines associées à la membrane nucléaires = rôle important dans l’organisation de la chromatine

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Est-ce que la région de l’ADN qui contrôle l’expression du gène fait partie du gène?

OUI

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Est-ce que le produit ultime d’un gène est

nécessairement une protéine ?

NON

Peut être un ARNr; ARNt; miARN; snARN

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Qu’est-ce que l’analyse des bandes sur les chromosomes ou l’analyse des chromosomes peinturés permettent de voir ?

Translocation des chromosomes (ex)

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Qu’est-ce que la leucémie myélogénique ?

fusion du chromosome 9 avec le chromosome 22 entraine la fusion de deux gènes BCR-ABL qui donneront une protéine de fusion possédant une activité tyrosine kinase non contrôlée

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Est-ce qu’il y a moins de régions non-codante dans le génome humain ?

NON

présence d’une proportion plus importante de régions non codantes dans l’ADN humain que dans l’ADN de levure

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Qu’est-ce que des gènes en tandem ?

gènes répétés qui se retrouvent les uns à la suite des autres

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Pourquoi y’a-t-il des gènes en tandem ?

Pour pouvoir être exprimés en grande quantité pour satisfaire aux besoins de la cellule

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Dans quel cas les gènes en tandem sont utiles ?

Quand cellule doit se dupliquer rapidement

Quand cellule doit synthétiser une grande quantité de protéines

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Pourquoi l’ARN naissant (ARNm) doit s’associer à des protéines?

1) l’ARN = fragile = sensibles à la présence d’ENZYMES comme la RNase > doit être protégée par des protéines
2) l’ARN doit être protégée pour lui permettre d’avoir la bonne conformation lorsque sa synthèse est terminée

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Qu’est-ce que les hnRNP ?

ARNm naissants + protéines

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Qu’est-ce qui empêche le transport du noyau vers le cytoplasme d’ARN anormaux ?

Processus de surveillance des ARNs

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Quels sont les contrôles post-transcriptionnels de l’expression génétique ?

Cap
Épissage (pendant transcription)
Épissage alternatif (possibilité pour 60% des gènes humains)
Queue (polyadénylation)

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De quoi dépend la qte de protéines produites ?

De la stabilité de l’ARNm + de la vitesse de traduction, peut être influencé par miRNA

Quelle est la particularité de la synthèse des cytokines p/r à leur ARN ?

- protéine qui doivent être synthétisé sur demande, synthèse rapide, ponctuelle et dégradation rapide de l’ARN

Quelle est la particularité de la synthèse de l'actine p/r à leur ARN ?

protéines qui doit se retrouver en grande quantité et constamment dans la cellule, ARNm stable, ARNm utilisé plusieurs fois

Qu'est-ce qu'un gène codant contient à 95 % ?

Introns et paire de bases qui contrôle l'expression

Qu'est-ce qu'une unité de transcription complexe ?

Même séquence d'ADN = peut donner différents ARNm > donc différentes prot **Épissage alternatif donne diff isoformes d'une prot

Qu'est-ce qu'une unité de transcription simple ?

Une seule séquence d'ARN possible

Donne un exemple d'unité de transcription complexe

Tropomyosine

Qu'est-ce qui permet de reconnaitre les sites d'épissage d'introns ?

Séquences consensus**Bien conservées

Par quoi sont reconnues les séquences consensus (épissage) ?

snRNP

Par où passent les ARN (ARNm/r/t) qui quittent le noyau ?

Pores nucléaires | + utilise hnRNP (façon spécifique)

Comment les protéines entrent dans le noyau ?

Par pores nucléaires | **Protéines navettes

Qu'est-ce qu'utilise les protéines qui font cytoplasme vers noyau ?

Importine & utilise NLS

Qu'est-ce qu'utilise les protéines qui font noyau vers cytoplasme ?

Exportine & utilise les NES)

Comment nomme-t-on les protéines des pores nucléaires ?

Nucléoporines

Avec quelle partie des nucléoporines les protéines de transport nucléaire interagissent ?

Partie hydrophobe

Que font les pores nucléaires ?

Contrôlent entrée/sortie du matériel dans le noyau

Comment assurer la spécificité pour l'exportation des ARNm ?

hnRNP spécifiques - font la navette entre noyau/cytoplasme (existence de NES sur certains hnRNP)

Qu'est-ce qui participe à l'exportation des ARNm du noyau vers le cytoplasme (spécificité) ?

hnRNP | *existence de NES sur certains hnRNP

Quel % occupe les exons dans le génome ?

Qu'est-ce que l'ADN poubelle ?

c'est «faux» | C'est de l'ADN non-codant > mais permet de maintenir l'identité cellulaire et tissulaire

Combien y'a-t-il d'ADN non-codant pour l'ARNr ?

Environ 300

Combien y'a-t-il d'ADN non-codant pour l'ARNt ?

Environ 500

Qu'est-ce que ENCODE ?

Encyclopédie des éléments d'ADN *pour déterminer tous les éléments fonctionnels du génome

Quelle est la similarité dans le génome chimpanzé vs humain ?

98.8%

Où est la grande différence entre les espèces ?

Au niveau de l'expression des gènes - donc de la régulation | *Épigénétique + raffinement des mécanismes entourant ADN non-codant

À quoi sont nécessaires les gènes d'ARN répétés en tandem ?

Pour répondre à l'importante demande cellulaire pour leurs transcrits (protéines ou ARN)

Que fait l'ARNmi ?

Régule la traduction et stabilise l'ARNm

Que fait l'ARNsn?

Intervient dans l'épissage de l'ARN

Quel ARN contient le plus de gène dans le génome humain ?

ARNmi (pour régulation expression des gène - traduction)

Comment se nomme les répétitions de gènes en tandem au bout des chromosomes ?

Télomères

Aujourd'hui quelle technique utilise-t-on pour les tests génétiques de prise d'empeintes ?

PCR

Qu'est-ce qui diffère chez chaque individu et permet la prise d'empreinte comme reconnaissance ? Pourquoi ?

Le nombre de répétition des séquence sur les régions en tandem d'ADN de séquence simple (qui contiennent la même unité répété) = très variable *Parce qu'il y a eu crossing over inégal

L'ADN intercalaire non classifié est très rare dans le génome - vrai ou faux ?

FAUX | il occupe une partie importante du génome

De quoi sont fait les histones ?

acides aminés basiques chargés positivement

Avec quoi interagissent les histones ?

Groupements phosphates chargés négativement de l'ADN

Quand est-ce que la chromatine ressemble à un collier de perles ?

Faible [] saline et absence de cations divalents (Magnésium)

Qu'est-ce qui contrôle la condensation de la chromatine p/r aux histones ?

Modifications des queues d'histones

Qu'est-ce qui semblait constituer un code des histones ?

Combinaison des modifications post-transcriptionnelles dans la chromatine

Quelles sont les modifications post-transcriptionnelles possibles ?

- Acétylation - Ubiquitination - Méthylation - Phosphorylation

Qu'est-ce que fait l'acétylation ?

Rend neutre la charge + des histones = relachement = collier de perle = accessible pour transcription

Qu'Est-ce que fait la méthylation ?

Protège les histones de l'acétylation (reste condensé)

Quelle peut être la conséquence de l'ubiquitination ?

Marquage pour destruction

Qu'est-ce que l'hétérochromatine ?

Chromatine condensé

Qu'est-ce que l'euchromatine ?

Chromatine décondensée

Où sont la majorité des régions transcrites de l'ADN hétéro/euchromatine?

Euchromatine

Est-ce que le caryotype est représentatif de chaque espèce ?

OUI

Au cours de quelle phase on peut distinguer les chromosomes par leur profil de bandes et leur coloration ?

Métaphase

Pourquoi l'ADN à évolué en chromosome ?

Compacité distribution efficace (division cellulaire) élément de régulation (épigénétique)

Quelles sont les 2 sortes d'hétérochromatines ?

- Facultative | - Obligatoire

Qu'est-ce que l'hétérochromatine obligatoire ?

Toujours condensée - Télomères - centromères - ADN sans gènes

De quoi résulte l'hétérochromatine facultative ?

Régulation épigénétique

Quel est le niveau de raffinement le plus élevé de la régulation de l'ADN ?

Régulation épigénétique (changer de forme)

Quel est le ration de la masse d'un chromosome ? (ADN vs protéine)

50% ADN | 50% protéines

Est-ce qu'on nucléosome est immobile obligatoirement ?

NON

Nommez une manière pour que la cellule module la co paction de son ADN (pour le rendre accessible) ?

Acetylation par HAT (histone Acetyl transferase)

Est ce que l'enzyme qui acétyle les histone de l'ADN est la même qui la desacetyl?

NON | HAT ET HDAC

Quel est l'effet sur la chromatine si l'on augmente l'activité de l'enzyme HAT (Acetylattion) ?

Les histones vont s'éloigner = euchromatine