COURS 6 Noyau Flashcards
Est-ce qu’un gène non-transcrit sera digéré par DNAse ?
Non - parce qu’il est condensé
Pourquoi les gènes transcrits sont plus sensibles que les non-transcrits aux DNAse ?
Parce qu’ils sont + déballés
Est-ce qu’il y a seulement les histones qui comptactent l’ADN ?
NON - d’autres prot s’ajoutent > HP1 (condensation chromatine)
La membrane nucléaire est simple ?
NON - c’est une membrane double
V/F
Le chromosome en interphase est plus structuré qu’en métaphase
FAUX
Il est moins structuré en interphase
V/F
Les chromosomes sont n’importe où dans le noyau
FAUX
Ils sont par territoire > pas de chevauchement
Qu’est-ce qui forme le squelette du chromosome ?
SAR et MAR > attachés à la chromatine
Quelles régions de la chromatine sont attaché au squelette du chromosome ?
régions attachées au squelette de protéines se retrouvent entre les unités de transcription
est-ce que le squelette du chromosome est important ?
organisation de la chromatine par les S/MAR est cruciale dans la régulation de l’expression des gènes
Comment se nomme les régions attachées au squelette du chromo ?
Non-transcrite ou constitutive ou facultative
Nomme un maladie de l’enveloppe nucléaire
Progéria - dysfonction lamine A = mutée/immature
Quelle est la conclusion de l’étude de la progéria ?
lamines associées à la membrane nucléaires = rôle important dans l’organisation de la chromatine
Est-ce que la région de l’ADN qui contrôle l’expression du gène fait partie du gène?
OUI
Est-ce que le produit ultime d’un gène est
nécessairement une protéine ?
NON
Peut être un ARNr; ARNt; miARN; snARN
Qu’est-ce que l’analyse des bandes sur les chromosomes ou l’analyse des chromosomes peinturés permettent de voir ?
Translocation des chromosomes (ex)
Qu’est-ce que la leucémie myélogénique ?
fusion du chromosome 9 avec le chromosome 22 entraine la fusion de deux gènes BCR-ABL qui donneront une protéine de fusion possédant une activité tyrosine kinase non contrôlée
Est-ce qu’il y a moins de régions non-codante dans le génome humain ?
NON
présence d’une proportion plus importante de régions non codantes dans l’ADN humain que dans l’ADN de levure
Qu’est-ce que des gènes en tandem ?
gènes répétés qui se retrouvent les uns à la suite des autres
Pourquoi y’a-t-il des gènes en tandem ?
Pour pouvoir être exprimés en grande quantité pour satisfaire aux besoins de la cellule
Dans quel cas les gènes en tandem sont utiles ?
Quand cellule doit se dupliquer rapidement
Quand cellule doit synthétiser une grande quantité de protéines
Pourquoi l’ARN naissant (ARNm) doit s’associer à des protéines?
1) l’ARN = fragile = sensibles à la présence d’ENZYMES comme la RNase > doit être protégée par des protéines
2) l’ARN doit être protégée pour lui permettre d’avoir la bonne conformation lorsque sa synthèse est terminée
Qu’est-ce que les hnRNP ?
ARNm naissants + protéines
Qu’est-ce qui empêche le transport du noyau vers le cytoplasme d’ARN anormaux ?
Processus de surveillance des ARNs
Quels sont les contrôles post-transcriptionnels de l’expression génétique ?
- Cap
- Épissage (pendant transcription)
- Épissage alternatif (possibilité pour 60% des gènes humains)
- Queue (polyadénylation)
De quoi dépend la qte de protéines produites ?
De la stabilité de l’ARNm + de la vitesse de traduction, peut être influencé par miRNA
Quelle est la particularité de la synthèse des cytokines p/r à leur ARN ?
- protéine qui doivent être synthétisé sur demande, synthèse rapide, ponctuelle et dégradation rapide de l’ARN
Quelle est la particularité de la synthèse de l’actine p/r à leur ARN ?
protéines qui doit se retrouver en grande quantité et constamment dans la cellule, ARNm stable, ARNm utilisé plusieurs fois
Qu’est-ce qu’un gène codant contient à 95 % ?
Introns et paire de bases qui contrôle l’expression
Qu’est-ce qu’une unité de transcription complexe ?
Même séquence d’ADN = peut donner différents ARNm > donc différentes prot
**Épissage alternatif donne diff isoformes d’une prot
Qu’est-ce qu’une unité de transcription simple ?
Une seule séquence d’ARN possible
Donne un exemple d’unité de transcription complexe
Tropomyosine
Qu’est-ce qui permet de reconnaitre les sites d’épissage d’introns ?
Séquences consensus**Bien conservées
Par quoi sont reconnues les séquences consensus (épissage) ?
snRNP
Par où passent les ARN (ARNm/r/t) qui quittent le noyau ?
Pores nucléaires
+ utilise hnRNP (façon spécifique)
Comment les protéines entrent dans le noyau ?
Par pores nucléaires
**Protéines navettes
Qu’est-ce qu’utilise les protéines qui font cytoplasme vers noyau ?
Importine & utilise NLS
Qu’est-ce qu’utilise les protéines qui font noyau vers cytoplasme ?
Exportine & utilise les NES)
Comment nomme-t-on les protéines des pores nucléaires ?
Nucléoporines
Avec quelle partie des nucléoporines les protéines de transport nucléaire interagissent ?
Partie hydrophobe
Que font les pores nucléaires ?
Contrôlent entrée/sortie du matériel dans le noyau
Comment assurer la spécificité pour l’exportation des ARNm ?
hnRNP spécifiques - font la navette entre noyau/cytoplasme (existence de NES sur certains hnRNP)
Qu’est-ce qui participe à l’exportation des ARNm du noyau vers le cytoplasme (spécificité) ?
hnRNP
*existence de NES sur certains hnRNP
Quel % occupe les exons dans le génome ?
3%
Qu’est-ce que l’ADN poubelle ?
c’est «faux»
C’est de l’ADN non-codant > mais permet de maintenir l’identité cellulaire et tissulaire
Combien y’a-t-il d’ADN non-codant pour l’ARNr ?
Environ 300
Combien y’a-t-il d’ADN non-codant pour l’ARNt ?
Environ 500
Qu’est-ce que ENCODE ?
Encyclopédie des éléments d’ADN *pour déterminer tous les éléments fonctionnels du génome
Quelle est la similarité dans le génome chimpanzé vs humain ?
98.8%
Où est la grande différence entre les espèces ?
Au niveau de l’expression des gènes - donc de la régulation
*Épigénétique + raffinement des mécanismes entourant ADN non-codant
À quoi sont nécessaires les gènes d’ARN répétés en tandem ?
Pour répondre à l’importante demande cellulaire pour leurs transcrits (protéines ou ARN)
Que fait l’ARNmi ?
Régule la traduction et stabilise l’ARNm
Que fait l’ARNsn?
Intervient dans l’épissage de l’ARN
Quel ARN contient le plus de gène dans le génome humain ?
ARNmi (pour régulation expression des gène - traduction)
Comment se nomme les répétitions de gènes en tandem au bout des chromosomes ?
Télomères
Aujourd’hui quelle technique utilise-t-on pour les tests génétiques de prise d’empeintes ?
PCR
Qu’est-ce qui diffère chez chaque individu et permet la prise d’empreinte comme reconnaissance ? Pourquoi ?
Le nombre de répétition des séquence sur les régions en tandem d’ADN de séquence simple (qui contiennent la même unité répété) = très variable
*Parce qu’il y a eu crossing over inégal
L’ADN intercalaire non classifié est très rare dans le génome - vrai ou faux ?
FAUX
il occupe une partie importante du génome
De quoi sont fait les histones ?
acides aminés basiques chargés positivement
Avec quoi interagissent les histones ?
Groupements phosphates chargés négativement de l’ADN
Quand est-ce que la chromatine ressemble à un collier de perles ?
Faible [] saline et absence de cations divalents (Magnésium)
Qu’est-ce qui contrôle la condensation de la chromatine p/r aux histones ?
Modifications des queues d’histones
Qu’est-ce qui semblait constituer un code des histones ?
Combinaison des modifications post-transcriptionnelles dans la chromatine
Quelles sont les modifications post-transcriptionnelles possibles ?
- Acétylation
- Ubiquitination
- Méthylation
- Phosphorylation
Qu’est-ce que fait l’acétylation ?
Rend neutre la charge + des histones = relachement = collier de perle = accessible pour transcription
Qu’Est-ce que fait la méthylation ?
Protège les histones de l’acétylation (reste condensé)
Quelle peut être la conséquence de l’ubiquitination ?
Marquage pour destruction
Qu’est-ce que l’hétérochromatine ?
Chromatine condensé
Qu’est-ce que l’euchromatine ?
Chromatine décondensée
Où sont la majorité des régions transcrites de l’ADN hétéro/euchromatine?
Euchromatine
Est-ce que le caryotype est représentatif de chaque espèce ?
OUI
Au cours de quelle phase on peut distinguer les chromosomes par leur profil de bandes et leur coloration ?
Métaphase
Pourquoi l’ADN à évolué en chromosome ?
Compacité
distribution efficace (division cellulaire)
élément de régulation (épigénétique)
Quelles sont les 2 sortes d’hétérochromatines ?
- Facultative
- Obligatoire
Qu’est-ce que l’hétérochromatine obligatoire ?
Toujours condensée
- Télomères
- centromères
- ADN sans gènes
De quoi résulte l’hétérochromatine facultative ?
Régulation épigénétique
Quel est le niveau de raffinement le plus élevé de la régulation de l’ADN ?
Régulation épigénétique (changer de forme)
Quel est le ration de la masse d’un chromosome ? (ADN vs protéine)
50% ADN
50% protéines
Est-ce qu’on nucléosome est immobile obligatoirement ?
NON
Nommez une manière pour que la cellule module la co paction de son ADN (pour le rendre accessible) ?
Acetylation par HAT (histone Acetyl transferase)
Est ce que l’enzyme qui acétyle les histone de l’ADN est la même qui la desacetyl?
NON
HAT ET HDAC
Quel est l’effet sur la chromatine si l’on augmente l’activité de l’enzyme HAT (Acetylattion) ?
Les histones vont s’éloigner = euchromatine
