cours 4 Flashcards

1
Q

Classification des microorganismes selon leurs besoins nutritifs

A

Source de carbone
Source d’énergie
Source d’électrons

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Q

Hétérotrophes

A

Molécules organiques préformées (Ex. glucide, lipide …)

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Q

Autotrophes

A

CO2 seul ou principale source

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3
Q

Chimiotrophes

A

Oxydation des composés organiques (Ex. glucose)
et inorganiques (Ex. H2S, NH4+, Fe2+,…)

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4
Q

Lithotrophes

A

Molécules inorganiques réduites (H2S, NH4+, Fe2+,…)

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5
Q

Organotrophes

A

Molécules organiques réduites (Ex. glucose)

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6
Q

Source de carbone

A

Autotrophe
Hétérotrophe

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7
Q

Source d’énergie

A

Phototrophe
Chimiotrophe

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8
Q

Source d’électrons (H/e-)

A

Lithotrophes
Organotrophes

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9
Q

Minimale vs optimale vs maximal

A

Température minimale: Température la plus basse à laquelle un microorganisme peut croître
Température optimale: Température idéale permettant aux microorganismes un taux de croissance maximal
Température maximale: Température la plus élevée à laquelle un microorganisme peut croître

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10
Q

Nom des microorganismes selon T optimale

A
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11
Q

Noms microorganismes selon pH

A

1) Acidophiles : pH 0-5.5
2) Neutrophiles : pH 5.5-8.0
3) Alcalophiles : pH 8.5-11,5

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12
Q

Bactéries vs mycètes

A

ph back = 6-7
ph Myc = 5-6

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13
Q

hypotonique

A

l’eau entre dans la cellule mais la paroi oppose une certaine résistance mécanique à la pression osmotique

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14
Q

hypertonique

A

l’eau quitte la cellule au profit du milieu ambiant (déshydratation)
- Plasmolyse (la membrane se rétracte de la paroi) - Faible disponibilité en eau libre

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15
Q

Types de microorganismes pression osmotique

A

Osmotolérants = peut deal avec une pression osmotique élevé
Osmophiles = Veut une pression osmotique élevé pour croitre
Halophile = Nécessite NaCl au dessus de 0.2 M

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16
Q

Macroéléments role

A

éléments nécessaires en grandes quantité pour la synthèse de macromolécules (CHONPS) et Ca, Mg, K
Carbone, Hydrogène, Oxygène, Azote, Phosphore, Soufre Calcium, Magnésium, potassium
- C : Carbone: nécessité d’une source de carbone - H2O (eau): indispensable

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17
Q

Oligoéléments

A

besoin en petite quantité (trace): Fer, cuivre, molybdène, zinc …

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18
Q

Facteurs de croissance

A

facteurs organiques: vitamines, acides aminés, et bases azotés

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19
Q

Pas de chimiotrophe capable de dégrader la molécule = ?

A

non biodégradable

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20
Q

Azote = ?%

A

14% de la matière sèche,

21
Q

soufre et phosphore = ?%

A

4%.

22
Q

Source d’azote:

A
  • La majorité vont utiliser une forme organique ou d’ammonium (NH4+).
  • La fixation de l’azote : utilisation direct de l’azote atmosphérique (N2),
23
Q

Prototrophe

A

microorganisme de type sauvage du point de vue nutritionnel. Autonome, pouvant croître sur un milieu défini (synthétique)

24
Q

Auxotrophe:

A

Perte de capacité à synthétiser certains métabolites essentiels
(comparé au type sauvage)
- Incapable de croître sur un milieu synthétique (il faut l’enrichir)

25
Q

Eau liée

A

liée aux macromolécules, ions ou toute surface hydrophile

26
Q

Eau libre

A

Seule l’eau libre du milieu est disponible pour les microorganismes

-uffisamment éloignée d’une surface chargée et libre de ses mouvements, propriétés physico-chimiques normales

27
Q

Activité de l’eau libre

A

indice de la disponibilité de l’eau pour les microorganismes

28
Q

Aw (Activity water)

A

Pression partielle de vapeur d’eau d’une solution
Pression partielle de vapeur de l’eau pure

29
Q

Oxygène Eucaryote

A

Presque tjrs essentiel

30
Q

Oxygène procaryotes

A

Essentiel, toléré ou toxique

31
Q

Types de demande d’oxygène

A

Aérobie stricte
Anaérobie facultative
Anaérobie stricte
Anaérobie aérotolérant
Microaérophile

32
Q

microaérophile

A

pression d’o2 faible (2-10%)

33
Q

anaérobie aâérotolérant

A

oxygène les tue pas, mais se développe sans

34
Q

SOD pour

A

Dismutation

35
Q

Catalse fait quoi

A

transforme 2 peroxyde en 2 h2o + o2

36
Q

Comment faire anaerobie

A

1) Bouillon au thioglycolate
2) Jarre anaérobie (Systèmes ‘GasPak’)
3) Chambre anaérobique

37
Q

phases de croissance

A

Latence
exponentielle
stationnaire
mortalité

38
Q

Latence

A

Pas de division cellulaire
Temps dépend de : -age bactérie + milieu

39
Q

Exponentielle

A

-Logarithmique
-Developpement vitesse max
-Population uniforme
-Court moment
-+ de nutriments, mieux c’est

40
Q

Stationnaire

A

causes : limitation de nutriments
-conditions défavorables à la reproduction

41
Q

Mortalité

A

Causes : Préparé par génétique
dégâts irréparables
formation de cellules viables non cultivables (VNC) (dormance)

42
Q

La culture continue (ouvert)

A
  • Apport de nutriments
  • Elimination des déchets
  • La phase de croissance exponentielle est maintenue sur une longue période
  • Concentration constante de la biomasse
  • Il y a 2 types: Chémostat et turbidostat
    – Chémostat : Apport constant de nutriments à la même vitesse que le milieu est éliminé
    – Turbidostat: vitesse de dilution déterminée par la densité
43
Q

Mesure de la croissance des microorganismes

A

1) Méthodes directes:
A) Décompte total des microorganismes
B) Décompte des unités viables (UFC, filtre)
2) Méthodes indirectes:
A) Mesure de l’activité
B) Mesure de la masse cellulaire C) Turbidité

44
Q

A) Décompte total des microorganismes

A
  • Compteur Coulter et Cytomètre de flux (protistes, levures et cellules
    mammifères)
  • Chambre de comptage observée au microscope
  • Hémocytomètre: Les levures et cellules mammifères
  • Cellule de Petroff-Hausser: Les bactéries
    Avantages: - facile à utiliser, rapide et peu coûteux
  • informations sur la taille/morphologie des microorganismes
    Désavantages: - densité microbienne élevée (petit volume) - décompte des cellules mortes et vivantes
45
Q

Hémocytomètre:

A

Dimensions:
0.1cm x 0.1cm x 0.01cm = 1/10000 cm3
Cellules/ml: 10000 x cellules comptées x facteur de dilution

46
Q

Cellule de Petroff-Hausser:

A

Dimensions : 10 fois plus petit que l’hémocytomètre
Cellules/ml: 100000 x cellules comptées x facteur de dilution

47
Q

Décompte unité viable

A

Nombre de colonies * dilution = ufc

48
Q

Méthode des filtres de cellulose

A

L’échantillon est passé sur un filtre de cellulose dont la porosité retient les microorganismes

49
Q

Mesure de l’activité

A
  • En mesurant la consommation de substrats (C, N2, O2 ou un facteur spécifique de croissance), la concentration des constituants cellulaires (ATP, FAD ou FMN, ADN, protéines) ou l’excrétion de certains produits (CO2 ou NH3), il est possible d’évaluer la concentration microbienne d’un échantillon
50
Q

Mesure de la masse cellulaire

A
  • Poids sec
  • Récolte des microorganismes (filtration sur membrane)
  • Lavage + dessiccation (100 à 110oC)
  • Pesée (toutes les bactéries, mortes ou vivantes sont pesées)
  • Valeurs exprimées en g/L
  • Turbidité par la densité optique (D.O.): Turbidimétrie
51
Q

Turbidimétrie

A

Évaluation de la concentration cellulaire à l’aide de sa densité optique [D.O.] (absorption lumineuse) à une certaine longueur d’onde (Ex 600 nm)

-Dans une certaine limite (106/ml < [ ] < 108/ml), la D.O. d’une suspension microbienne est directement proportionnelle à sa concentration cellulaire