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Biodiversité Theorie > Cours 3: protistes et champignons/lichens > Flashcards

Cours 3: protistes et champignons/lichens Flashcards

1
Q

qu’est-ce que apicomplexa?

A

une protiste

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2
Q

Quelles sont les caractéristiques des protistes apicomplexa?

A

ce sont des protistes non photosynthétiques

ce sont des parasites obligatoires

  • ils sont hétérotrophes
  • Ils ont évolué à partir d’un flagellé photosynthétique: possède un ancêtre de plaste nommé apicoplaste d’où le nom apicomplexa.
  • Ils ont un complexe apical: assemblage d’organites sécrétoires (sécrète ext. cellule et permet le glissement) et contient un microtubule qui permet de s’attacher aux cellules hôtes infectées.
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3
Q

Quels sont deux grands groupes des apiomplexa qui sont très importants?

A

Les coccidies: très problématique en production animalière (surtout volaille) + 20% pop. humaine infectée (asymptomatique)

les Hématozoaires (malaria): maladie pantropicale qui tue annuellement des milliers de personne.
mammifères: piroplasmes en forme de poire=transmis par tiques.

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4
Q

à quoi sert le vestige photosynthétique des apicomplexa, l’apicoplaste?

A

synthèse de lipides et du groupement hème (entre autre dans chlorophylle)

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5
Q

Qu’est ce que les ciliés ?

A

protiste faisant partie du groupe des alvéolés (PAS AMIBES!)

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6
Q

Quelles sont les caractéristiques des ciliés?

A

ils sont majoritairement hétérotrophes

quelques mixotrophes (ceux qui font de la kleptoplastidie donc ceux qui ont “volé”/intégrer un produit de la photosynthèse) + 1 autotrophe connu

habite dans toutes les latitudes, du sol jusqu’au fond des océans.

*ont des relations endosymbiotiques importantes avec les termites et les ruminants et d’autres portent des endosymbiote (protistest autotrophe)

paramécie: modèle en biologie cellulaire car il est facile à multiplier.

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7
Q

quelles sont les particularités morphologiques des ciliés?

A

Elles possèdent un cytostome qui permet la phagocytose (genre de bouche)

des cils qui permettent la locomotion.

pellicule: memb. plasmique avec alvéoles qui portent la base des cils. + squelette ayant des microtubules pour locomotion
cytoprocte: (pore anal) déchets éjectés après digestion dans vacuoles digestives.

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8
Q

Quels sont les 4 grands habitats des ciliés?

A
  1. Benthos: microprédateurs zone à faibles pression en O2 (sédiments profonds, craques roches océaniques)
  2. Sols: sols humides
  3. Plancton: prédateurs suivant les éclosion de protistes photosynthétiques
  4. Association symbiotiques: intestins de plusieurs vertébrés (ruminants) et invertébrés + hôte pour certaines bactéries endosymbiotiques.
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9
Q

Quelle est l’importance des ciliés?

A

symbiotes importants du bétails (chevaux, boeufs, chèvres, moutons, cochons)

ciliés parasitent des poissons: problème en aquaculture

infection humaine dans pays en voie de dev. Balantidium coli : crée gastro etc…

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10
Q

Qu’est ce que les amibes?

A

protiste qui font partie du phylum: Amoebozoa dans le sous domaine des unikonte (avec les champignons et nous!)

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11
Q

Quelles sont les caractéristiques des amibes?

A

très généralement des organismes qui se déplacent par des pseudopodes (permet parfois la phagocytose)

peuvent être nus OU recouvert d’une thèque (contient souvent une ouverture pour l’alimentation)

organismes hétérotrophes (absolument ubiquiste, donc présent partout à la fois dans les sols, l’eau douce ou salée, profondeur et température différentes…)

parfois parasites

amibes nues très abondantes dans la rhizosphère des plantes (prédateurs des pop. microbienne, en mangeant les pop. microbienne= trop d’azote dans son corps, rejet dans la terre, fertilise le sol et devient dispo pour les plantes= croissance!)

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12
Q

Qu’est ce que les oomycètes? et quelles sont leurs caractéristiques?

A

protiste non photosynthétiques
longtemps considérés comme champignons

paroi cellulaire de CELLULOSE! pas de chitine ni de glucans comme champignons!

reproduction asexuée par zoospores flagellés hétérokontes

reproduction sexuée par cycle diplophasique donnant oospores: structure de résistance/dormance

ils sont des moisissures aquatiques, des sapotrophes ou des parasites.

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13
Q

décrit le cycle de vie des oomycètes suivant!

PHOTO!

A

Bravo!

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14
Q

quel ordre faisant partie des oomycètes est particulièrement problématiques? Quels sont ses deux genres?

A

Pythiales
genres:
phytophtora (destructeur de plante-à créé la famine en irlande avec les pommes de terre.)

pythium: agents causant la fonte de semis, surtout dans les serres, où il y a de l’arrosage abondant= humide crée de la pourriture

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15
Q

Qu’est-ce qui différencie les oomycètes des champignons?

A

la croissance par HYPHES n’est coenocytiques ont une origine POLYPHYLÉTIQUE ne définit PAS un groupe NATUREL!

ils sont hétérotrophes par perte de plastes photosynthétiques, pas absence de gain.
différence voies de synthèse d’A.A
pas de chitines ni de glucans comme les champignons, ils sont composé de cellulose.

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16
Q

Qu’est ce que les myxomycètes et quelles sont ses caractéristiques?

A

un protiste qui se rapproche des champignons mais qui n’est pas un champignon.
il est une classe à l’int. du phylum des Amoeboza

il a deux stades de vie:

cryptique: sous forme de plasmode (phagotrophe-nutritionnel)
fructification: pour relâcher spores haploïdes qui donne lieu a des amibes ou formes flagellés qui les deux joints par syngamie donne un plasmode (2n) dans l’air-a permis de conquérir le milieu terrestre.

habitats les plus fréquents: débris ligneux, litière et tronc vivants

certains groupe ont perdu la capacité de faire de la fructificatin: plasmode.

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17
Q

Qu’est ce qu’un champignon?

A
  • organisme hétérotrophe (plus précisément chimiotrophe) (besoin d’une source de carbone organique pour vivre, pas de co2)
  • n’a pas de chloroplastes

-Appartient au règne des mycota (mycètes)
dans le sous domaine des opisthokonta qui englobent également les animaux.

-paroi n’ont pas de cellulose, mais du beta glucane

trois catégories imp:
saprophytes
symbiotes
pathogènes/parasites

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18
Q

quels sont les groupes qui fait partie des Dikarya?

A

les ascomycètes et les basidomycètes, qui ont une phase dicaryotique.

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19
Q

Quels sont les trois sous-embranchements des basidiomycètes?

A

puccinomycotina: pathogène. rouille, infecte les plantes vivantes
ustilagino: pathogène. charbons=épaisses téliospores noires sur les organisme ex: maïs
agarico: Les plus connus, inclue champignon à chapeau

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20
Q

Quels sont les trois sous-embranchement des ascomycètes?

A

taphrino: levures se divisant par fission. parasites de mammifère et plantes.
saccharino: levures se divisant par bourgeonnement.

pezizo: (plus gros groupe d’ascomycètes)
très variés: pathogènes des plantes et des animaux, lichens, décomposeurs…

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21
Q

Qu’est ce que les mucoromycota?

A

ils sont des sapotrophes: opportunistes, reproduction surtout asexuée (ex, moisissure sur tranche de pain)

ils sont des sapotrophes du sol

ils sont des mychorizes arbusculaire: les plus anciens végétaux, probablement présent dans la transition aquatique/terrestre. continue symbiose avec plante depuis 450 millions d’années

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22
Q

Nomme des lignées ancestrales autres que mucoromycota, ascomycètes et basidiomycètes.

A
  • zoopagomycota: terrestres et dispersés dans l’air. souvent parasites animaux
  • blastocladiomycota: souvent parasites animaux ou végé ou décomposeurs
  • chytridiomycota: aquatiques, zoospores flagellés, maladie des amphibiens.
  • microsporidia: parasites unicellulaires, intracellulaires n’ayant pas de mitochondrie=génome réduit (perte d’autonomie oxydation mol)
  • cryptomycota: parasites sans chitine.
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23
Q

Nomme moi ce qui est particulier de l’anatomie des champignons:

A
  • paroi cellulaire: les champignons poussent par des mycelliums. croissance par invasion du substrat. grande pression! il ne faut pas que la cellule explose. Composée de mannoprotéines, béta glucans et chitine.
  • possède membrane plasmique composée de protéines membranaires+ pompes à protons.
  • ils n’ont pas de méristème apical. donc la croissance se fait par élongation d’hyphes.
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24
Q

Quelles sont les similaritudes entre la paroi cellulaires des plantes et des animaux?

A

structures différentes, mais semblables dans la paroi cellulaire:

fibrilles de sucres (glucan pour champignon vs cellulose pour animaux)

Matrice extracellulaire de protéines (glycoprot champignons vs collagène animaux)

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25
Q

chez les animaux, la membrane plasmique est faite de chlorestérol alors que chez les champignon elle est faite d’_______

A

ergostérol

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26
Q

Quelles sont les différences entre ascomycètes et basidiomycètes?

A
  1. les cloisons: septa
    ascomycètes: laissent passer les organelles et les noyaux. Ils sont composés de corps de voronine: colmate la cloison de la cellule voisine d’une cellule touchée par perte turgescence. donc, trou qui laisse passer nutriments= bouché par corps de voronine.

basido: septa DOLIPORE: ne permet pas le passage de noyaux. Il y a donc des ANSES D’ANASTOMOSE qui vont maintenir le stade hétérokaryote. permet donc, d’échanger noyaux entre septum.

  1. couplage mitose-septa:
    ascomycètes: pas forcément couplé, peut avoir des centaines de noyaux par compartiment. mitoses synchrone OU asynchrones.
    basido: 1 NOYAU par compartiment haploïde et deux noyaux pour hétérokaryon diploïde.
  2. spores formés dans l’asque pour les ascomycètes vs
    surface du baside pour les basidiomycètes (basidiospores=renflement/bourgeon à l’ext. du baside).
  3. Le cycle de vie des asco est haplodiplophasique avec haploïde dominant
  4. la forme hétérokaryotique peut durer bcp plus longtemps chez les basidio que chez les asco.
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27
Q

Comment se fait la croissance des champignon ?

A

croissance invasive par élongation d’hyphe.
Régulation de la turgescence pour diriger la croissance des hyphes (même principe que souffler un ballon): ajoute moins de composés dans la paroi sur certaines zones= ramollit la paroi= ces zones s’allongent. très grande pression!

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28
Q

qu’est ce que l’anastomose?

A

Quand les champignons fusionnent avec leurs hyphes.

Il faut qu’ils soient compatibles, sinon mort en 30 minutes.

29
Q

Nomme les organes fongiques du champignon(3)

A
  1. rhizomorphes
  2. sclérotes
  3. fructifications
30
Q

Qu’est ce que les rhizomorphes?

A

système qui permet aux champignons de faire du transport de nutriments sur de longues distances, de redistribuer les ressources.
cordons mycelliens organisés en canaux Canaux composés de: le lumen (int/vide-transport), la médulla (c mortes) et le cortex (ext/c vivantes)

permet aux champignons d’être énormes.

31
Q

Qu’est ce que les sclérotes?

A

masses endurcies d’hyphes compactes. permet de tolérer des cond. défavorables.
au centre: hyphes à paroi fine-réserve lipides et glycogène
ext: paroi épaisses et mélanisé-protège matériel génétique de rayons uv

32
Q

Qu’est ce que les fructifications?

A

voile: qui protège l’hyménium (matériel reproducteur) qui laisse anneau et/ou écailles
début: enveloppe tout le champignon
fin: soit des petites écailles sur le dessus, un anneau au pied, ou volve à la base.

33
Q

qu’est ce que la cortine?

A

voile ayant l’apparence d’une toile d’araignée sur les lamelles.

34
Q

fructification: la croissance est largement hydrostatique. qu’est ce que cela veut dire?

A

l’augmentation du volume de fructification est produit par un phénomène d’osmose et de gonflement des cellules DÉJÀ PRÉSENTES.

35
Q

Les spores fongiques sont ________ ou ________.

A

Asexué ou sexué

36
Q

Qu’est ce que les ascospores?

A

les spores produits par les ascomycètes.

ils sont formé DANS L’ASQUE

37
Q 
que veut dire asques (qui contient 8 spores) portés par: 
apothécie
périthèce
cléistothèce
?
A

apothécie: coupe ouverte
périthèce: flasque avec petite ouverture pour décharger les spores
cléistothèce: structure fermée qui s’ouvre seulement pour libérer les spores

38
Q

Qu’est ce que l’hyménium?

A

tissu fertile qui tapisse la surface des lamelles, où se développe le baside pour les basidomycètes ou l’asque pour les ascomycètes.

39
Q

Quel est l’obstacle des spores?

A

leur legereté. les spores ont besoin d’une force incroyable pour aller loin car elles sont trop légères (inertie faible, viscosité milieu imp.)
mécanisme de décharge souvent ballistique à deux gouttes.

40
Q

quels sont les trois types de dispersion par animaux (zoochorie)?

A
  1. champignons coprophiles: spore sur végétation, mangée et rejetées.
    spores haut sur végétation et se faire manger par herbivore et se disperser.
  2. ectozoochorie: champignons ont une odeur qui attire les mouches qui s’y colle ou lumière qui attire insecte qui s’y colle et le disperse.
  3. endozoochorie: truffles, les animaux les mange et se dispersent…
41
Q

Pourquoi sporuler?

A
  1. traverser espace (5% vont au delà de 1m de la fructification mère)
  2. traverser le temps cond. défavorable=libération de spores afin de survivre
  3. générer de la variation par méiose, repord. sexuée, caryogamie…
42
Q

Quelles sont les sources de carbones du champignon?

A

sucres: plus simple favorisé glucose préféré au fructose par exemple.
cellulose: champignon sont les principaux décomposeur de cellulose car très abondant (40-45% du bois).

43
Q

Qui sont les décomposeurs du bois (BASIDIO)

A

les pourritures blanches: dégrade la lignine pour gagner la cellulose= Violent, très énergétique
enzyme (peroxidases) oxydent lignine et lune autre enzyme (laccases) dégradent les fragments relâchés avec O2

les pourritures brunes(+foncé car plus de lignine intacte): cellulose retirée mais lignine légèrement oxydée et dépolymérisée = plus rentable énergétiquement.

44
Q

les champignons font tout à partir de quel composé organique important?

A

Azote minéral!

45
Q

qu’est ce que l’apatite?

A

une source de phosphate qui se retrouvent dans le sol. C’est un minéral qui contient des phosphate.

46
Q

Qu’est ce que la phosphatases?

A

enzymes qui brisent le lien esters du P avec la maj. des mol. bio. comme acides nucléiques, sucres phosphaté, etc.

47
Q

Qu’est ce que l’autophagie chez les champignons?

A

la capacité du champignon à se retracter, en digérer le contenu et le ré-investir ailleurs dans son exploration de l’env.
ex: si un champignon trouve une source de nourriture, il retracte certaines des liaisons qu’il avait faite et en met enormément autour de la source de nourriture.

48
Q

Qu’est ce qu’un guilde fongiques?

quels sont-ils chez les champignons?

A

appartenance à un gr. fonctionnel, regroupe les champignons qui ont un rôle similaire dans l’écosystème.

  • endophytes
  • décomposeurs
  • pathogènes des autotrophes
  • mycorhizes
  • pathogènes humains
  • amis des humains
49
Q

Qu’est ce que les endophytes?

A

colonise les végétaux de manière asymptomatique
la plupart sont des ascomycètes

flore qui héberge:
les pathogènes latents
les saprotrophes (ex:les feuilles mortes se font décomposer en premier par les champignons qui étaient présents dans la feuille avant sa mort)

50
Q

quels sont les trois grands groupes pathogènes des plantes?

A
  1. biotrophes: pathogène qui vise à garder plante hôte en vie pour s’en nourrir le plus lgt possible.
  2. nécrotrophes: pathogène ayant comme but de tuer le tissu et boire le jus du tissu mort
  3. hemi-biotrophes: hybride.
51
Q

Qu’est ce que le triangle de la maladie?PHOTO

A

triangle qui regroupe les facteurs pour l’apparition d’une maladie. La majorité des champignons essaient d’infecter les plantes mais n’auront pas un des facteurs donc ne pourront pas infecter la plante.

facteurs:
- pathogène: 1. si champ. n’arrive pas à infecter peut être que champignon peut ne pas avoir le facteur de virulence de la plante.
2. si champ. n’arrive pas à infecter plante peut être que c’est parce que la plante est résistance.
- environnement: il doit y avoir une certaine T, le vent, la qualité du sol… afin d’infecter.
- les plantes reconnaissent le non-soi: si par exemple, elle retrouve des fragments de chitine, elle sait que ce n’est pas à elle.= réponse hypersensible localisée (enlève carburant autour de la région=crée des tâches (tissu mort) sur la feuille)

52
Q

VRAI ou FAUX: les champignons peuvent aussi être des pathogènes humains

A

VRAI! environ 400 mycoses humaines diff. connues.

autres problèmes relié comme empoisonnement ou allergies.

53
Q

VRAI ou FAUX: il y a plus de pollen que de spores de champignons dans l’air.

A

FAUX! il existe de millions de spores par mètre cube d’air en moyenne! soit 100x a 1000x plus de spores fongiques que de pollen!

54
Q

nomme deux maladies pathogènes liées aux champignons chez les animaux.

A

syndrome du museau blanc de la chauve souris: ascomycètes psychrophile qui infecte les tissus épidermaux et brûle les réserve de gras qui empêche la chauve souris de survivre en hiver, car trop peu de réserves

chytridiomycose chez les amphibiens: champignon chytride (champignon aquatique, zoospores mobiles infecte les grenouilles et salamandre)

55
Q

Nomme un champignon prédateur.

A

Nématophages: crée un anneau contractile, et lorsqu’un nématode passe, il sent sa présence et gongle l’anneau qui emprisonne le nématode.
certains seulement quand N basse conc, comme plante carnivores.

il y a également les zoophagus qui attrape les rotifères

56
Q

Qu’est ce que la mycophagie?

A

animaux qui mangent des champignons. (régime alimentaire à base de champignons) = avantageux car ration C/N et C/P moins élevé que le bois. donc mieux pour les insectes par exemple.

57
Q

qu’est ce que le botrytis cinerea?

A

pourriture noble qui permet de rendre un vin plus sucré et d’augmenté le pourcentage d’alcool (augmente qualité)

  1. le champignon infecte le raisin
  2. concentre les sucres = confit le raisin
  3. crée plus d’alcool
58
Q

champignon et l’alimentation…. qu’est ce qu’il fait que nous connaissons bien?

A

la levure!

59
Q

Qu’est ce qu’un lichen?

A

champignon qui s’associe de façon symbiotique avec un algue et/ou cyanobactérie.
= symbiose microbionte+photobionte

la majorité du thalle est de la biomasse fongique.

60
Q

Qu’est ce que des haustoria?

A

zones où les hyphes sont très ramifiées et très collées sur photobionte pour des échanges nutritionnels. permet donc d’entrer en contact.

61
Q

Quels sont les 3 morphologies principales des lichens?

A
  1. crustose (75%): incrusté dans substrat/roches
  2. foliose: comme des feuilles, lobes foliés ex: tronc d’arbres
  3. fruticose: comme des arbustes, penduoille sur branches
62
Q

98% des lichens sont des _______.

A

ascomycètes

63
Q

Comment est la structures des thalles de lichens?

A

le foliose est très bien caractérisé mais ils ne sont pas tous comme ca:

  1. cortex: limite la perte en eau
  2. couche d’algues: photosynthèse
  3. médulla: espaces qui favorises les échanges gazeux
  4. cortex du bas, cellules denses qui empêche fuite d’humidité
  5. rézhine: s’attache au substrat.
64
Q

quels sont les structures des différents groupes de lichens?

A

crustose: avantageux dans env. stressant en eau (résistant aux env. secs, peut sécher et se réhydrater plus tard contrairement aux plantes). Incrusté dans le substrat (ex: roche) profite de toute l’eau par ruissellement+ moins de surface exposée au sèchement.
foliose: forme des lobes à la surface = bénificie pas de l’eau en surface.

Fructicose: symétrie radiale.
avantage: surface:volume élevé= réhumidification rapide ou sèche rapidement dans milieux humides

65
Q

Quelles sont les structures végétatives du lichen et quelles sont les fonctions?

A

cortex: protège photobionte excès de lumière

**Médulla: photobionte, hyphes allongés permettant flux gazeux. espaces dans la médulla qui permet de tolérer de grande diff. de température+sécheresse (tRES chaud ou TRES froid) accumule des cristaux de glace dans les espaces intercellulaires= tolérance congélationé

cortex inf: peut absorber et stocker l’eau, très pigmenté

rhizine: attachement au substrat

66
Q

Qu’est ce que les céphalodies?

A

chez les lichens qui ont des algues ET des cyanobactéries. = lichens tripartites
les cyanobactéries sont stockées dans des petites pochettes appelées céphalodies: la fixation du N atm. se fait dans les céphalodies et les algues s’occupent de la photosynthèse.

67
Q

Quelles sont les structures reproductives des lichens?

A

sexué: ascocarpe= apothécie ou périthèce

végétative: pycnidie sans symbiote doit renouveller nouveau partenaire..

ou propagules symbio:

  • isidies: surface
  • sorédies: photobionte emballé dans boule d’hyphe.
  • soralie (plusieurs sorédies)
68
Q

IMPORTANT: le stress et les lichens.
Quelles parties de la terre sont habitées par les lichens?
qu’ont-ils comme particularités que les autres plantes/champignons n’ont pas?

A

8% terre est habitée par lichens. surtout pôles et hauts sommets.

leur particularité unique est qu’ils tolèrent extrêmement bien le stress
survie à l’N liquide (-196degrés)
survie à T élevée (pas plus de 40 degrés si humides)

69
Q

Quels sont les mécanismes de tolérance au stress des lichens?

A

diminution de ROS (reactive oxygen species) superoxyde dismutase transforme o2- en h202 et catalyse H2o2 en du H2 et du 02
antioxydants (neutralise ROS)
vitrification
viscosité cytoplasme augmente
protéines antigel hydrophiles prevenant from. de cristaux de glace.

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