Cours 3 - Caractères Flashcards
Caractère taxonomique def
Attribut quelconque d’un membre d’un taxon par lequel il diffère ou pourrait différer d’un membre d’un taxon différent.
Prend de la variabilité. Doit permettre de discriminer des taxons entre eux.
De quoi dépend le choix d’un caractère
Dépend de l’information qu’il procure versus sa capacité de résolution (ex; espèces de parulines qu’on peut différencier par la couleur vs familles d’oiseaux qu’on peut pas utiliser couleur pour les différencier) ou sa signification évolutive (cladistique vs phénétique).
Grandes familles de caractères
- Morphologiques
- Écologiques
- Biochimiques et moléculaires
Catégories de caractères morphologiques
- Morphologie et anatomie générale
- Développement embryologique
Catégories de caractères écologiques/éthologiques
- Régime alimentaire
- Niche écologique/habitat
- Mode de reproduction
Catégories de caractères biochimiques et moléculaires
- Structure des molécules (protéines, acides nucléiques…)
- Structure du code génétique
Morphologie et anatomie générale pour donner des infos
- Longueurs morphométriques (donnée quantitative. Longueurs entre genre les nageoires, les yeux et le front, etc.)
- Comparaison de caractères anatomiques (donnée qualitative binaire. Peut être plus adaptés dans certains contestes, ce qui donne la signification évolutive. Ex; présence de tragus oui ou non dans chaque espèce)
Développement embryologique pour donner des infos
Stades précoces du développement; présence de caractères disparus à l’état adulte.
Structure des molécules pour donner des infos
- Structure des protéines (électrophorèse, distance immunologique)
- Structure des acides nucléiques (hydratation ADN-ADN, comparaison séquences d’ADN et protéines)
Majorité de la recherche utilisant le moléculaire (90%) est la comparaison des séquences d’ADN. Les autres sont des méthodes classiques mais beaucoup moins utilisées.
Objectif des séquences moléculaires
Déterminer l’ordre d’enchaînement des nucléotides d’un fragment d’ADN donné. Comparer le % de différence entre taxons.
Est-ce que l’observation de séquences moléculaires est plus appropriée pour l’analyse phénétique ou cladistique? Ou les 2?
Phénétique… je pense.
On connaît pas l’historique des gènes (changements évolutifs)
Propriétés des données moléculaires
- Caractères simples à analyser. ADN = 4 choix possibles (A, C, G, T). Acides aminés = 20 possibilités. (pas subjectif)
- Grande quantité d’informations disponibles (ex; protéine cytochrome c possède 104 aa. Chacun est traité comme un caractère. Une étude morphologique classique utilise rarement autant de caractères)
- Indépendance des caractères
- Poids égal entre les caractères. Mutation d’un nucléotide a le même poids peu importe le site où il se produit. Impossible pour les caractères morphologiques.
Indépendance des caractères décrire
Mutations de l’ADN indépendantes. Chaque site peut évoluer indépendamment des autres. Morphologie = organes séparés constituent une même unité évolutive. Brouille les cartes car trucs évoluent ensemble
Caractère moléculaire meilleur que morphologique?
Pas toujours. Des fois les marqueurs moléculaires pourraient être trop variables et sensibles à l’hybridation donc permet pas de différencier les espèces. Exemple; becs croisés ont une morphologie différente mais génétique permet pas de les séparer.
Aussi, les molécules évoluent à des vitesses différentes
Caractères autres que morphologiques, écologiques, moléculaire pouvant être utilisés
- Chant (grâce à un sonogramme. Représentation graphique des sons)
- Reproduction (appariement reproductif. Individus choisissent normalement ceux de même espèce pour se reproduire préférablement à une autre. Si femelle décide de choisir un mâle d’espèce différente en nature, c’est la divergence de flux génétiques)
Choix du type de données moléculaires
Les molécules évoluent à des vitesses différentes.
Défi: choisir la molécule qui évolue à une vitesse appropriée pour le groupe d’espèces examiné
Notion d’horloge moléculaire
Les molécules sont des horloges, mais dont les aiguilles tournent à des vitesses inégales.
Défi; faire le bon choix d’horloge
- Taxon ancien: ne pas utiliser une molécule à évolution rapide; l’horloge aura fait plusieurs tours au cours de l’histoire qu’on veut retracer
- Taxon récent; ne pas utilise une molécule à évolution lente; l’horloge n’aura pas enregistré assez de changements
ADN mitochondrial avantages en recherche phylogénétique
- Petite molécule
- Transmission maternelle
- Taux de mutation élevé (évolution rapide)
