Cours 3 - Analyse en morphométrique IRM T1

Question 1

Lorsque le liquide cépahlo rachidien est blanc cela veut dire que nous somme en T…

Answer 1

2

Question 2

Vrai ou faux, IRM T1 a un mauvais contraste entre la matière blanche, matière grise et le liquide céphalo rachidien

Answer 2

Faux, c’est un bon contraste

Question 3

Morphologie définition

Answer 3

une technique utilisée pour mesurer et analyser la forme/taille/structure des différentes régions du cerveau qui exploite les images de haute résolution pour extraire des volumes ou des formes d’organes, de structures spécifiques.

Question 4

Hippocampe sert à quoi majoritairement ?

Answer 4

la mémoire

Question 5

Est ce que c’est correct d’utiliser T2 pour faire un contraste anatomique?

Answer 5

OUI

Question 6

c’est quoi la segmentation manuelle en volumétrie?

Answer 6

un médecin trace manuellement les contours des structures d’intérêt sur chaque coupe (ou image 2D) d’un ensemble d’images 3D (volumétrie), comme des coupes d’IRM. Ce processus est répété sur plusieurs coupes pour créer un modèle volumétrique complet de la structure.

Question 7

Quelles sont les 2 limites de la segmentation manuelle ?

Answer 7

1. elle est subjective (il y a des choix arbitraire qui doivent être prisent)
2. Dépend de l’habileté de la personne qui l’effectue

Question 8

est ce que faire une coupe vertical peut compter comme une coupe vertical ?

Answer 8

oui sa compte!

Question 9

Vrai ou faux. c’est vraiment rapide et efficace faire une segmentation manuelle

Answer 9

faux, c’est long et difficile obtenir une de haute qualité

Question 10

Une fois qu’on a effectuer une segmentation manuelle, on fait quoi?

Answer 10

On peut mesurer le volume des structures évalué en comptant le nombre de voxel qui sont dedans. Et on pourra comparé entre les populations.

Question 11

Dans les fins années 90, ils étaient tannés de la SM et voulait que sa se fasse automatiquement. Qu’est qu’ils ont développé?

Answer 11

ils ont développé des algorithmes pour pouvoir aligner tous les cerveaux dans un espace stéréotaxique dans lequel ils pourraient automatiquement identifier les structures clés.

Question 12

C’est quoi le recalage?

Answer 12

on va trouver des points similaire dans les scans et on va trouver comment transformer ces points de repère d’un individu à l’autre pour les mettre en correspondance.

Question 13

3 types de translation

Answer 13

haut en bas
droite à gauche
avant à arrière

Question 14

3 types de rotations

Answer 14

oui
non
head tilt

Question 15

3 types de mise à l’échelle

Question 16

Est-ce qu’on peut combiner des rotations?

Answer 16

oui !

Question 17

Le recalage non linéaire fait quoi?

Answer 17

il va venir modifier la forme de chaque petite partie du cerveau

Question 18

Quelle est la différence entre les images recalées de manière affine et ceux recalées non linéairement ?

Answer 18

Dans le recalage affine, il y a des petites différences au niveau des positions des structures. Cependant dans le recalage non linéaire, il vient ajuster la taille des différentes régions localisé

Question 19

c’est quoi l’espace stéréotaxique non linéaire?

Answer 19

C’est une image de référence qui est un scan représentant la moyenne de 150 cerveaux utilisé par 99% des laboratoires

Question 20

au lieu de recaler 2 IRM de 2 personnes…

Answer 20

Ils vont recaler l’IRM de leur participant avec cette (IRM des 150 cerveaux moyenner) IRM de référence (ex: colin 27)

Question 21

Si on prend l’espace stéréotaxique et on peint chaque aire, on fait quoi ?

Answer 21

volumétrie (atlas harvard oxford)

Question 22

Vrai ou faux: la segmentation ne demeure plus arbitraire

Answer 22

faux, même si ce n’est plus une personne qui le fait, un algorithme l’effectue quand même

Question 23

Donnez un exemple d’application de la volumétrie

Answer 23

Trouver la différence de volume de l’hippocampe entre des participants cognitivement sains or not.

Question 24

vrai ou faux: les opérations de recalage et de segmentation ne peuvent jamais échouer

Answer 24

faux, il peuvent et des fois de manière majeure

Question 25

Nomme les contrôles de qualité de la volumétrie(2)

Answer 25

1. échec de recalage
2. artefact

Question 26

But du Voxel Based Morphometry (VBM) ?

Answer 26

quantification de la densité locale de matière grise

Question 27

Dès que l’on bouge la tête ça…

Answer 27

diminue la qualité de l’image (cause du bruit)

Question 28

c’est quoi la VBM ? (breakdown)

Answer 28

1. on prend un point (voxel)
2. on fait une petite boule autour
3. compte la quantité de matière grise qui se retrouve
4. le quantifié en % de mg

Question 29

densité haute en matière grise veux dire

Answer 29

que le voxel se trouve ENTOURRÉ de m.g.

Question 30

vrai ou faux. la VBM dépend d’un structure particulière

Answer 30

faux, elle ne dépend pas, elle couvre toute la matière grise.

Question 31

Quelles sont les 4 étapes du VBM?

Answer 31

1. segmentation
2. lissage spatial
3. recalage dans un espace stéréotaxique de référence
4. analyse statistique

Question 32

C’est quoi les étapes de la segmentation (VBM)

Answer 32

1. déterminer quel tissue est le cerveau
2. différencier 3 tissues (mb, mg, liqcfl)

Question 33

C’est quoi le lissage spatial (VBM) ?

Answer 33

compter la proportion de voxel autour dans un voisinage

Question 34

C’est quoi le recalage dans un espace stéréotaxique de référence ?

Answer 34

Décider voxel X chez personne 1 correspond au voxel Y chez personne 2 afin de faire une statistique

Question 35

L’effet de volume partiel est

Answer 35

lorsque deux tissus moyennés peuvent se faire prendre pour de la matière grise

Question 36

Plus on fait confiance à notre recalage

Answer 36

Plus on se permet d’avoir de sphère petite

Question 37

C’est quoi l’analyse de surface ?

Answer 37

quantification des propriétés géométriques locales de la matière grise (épaisseur & surface)

Question 38

l’analyse de surface fait une estimation de la surface ______________ et de la surface ______________

Answer 38

piale, intérieur

Question 39

surface piale couvre quelle matière?

Answer 39

mg, liq cfl

Question 40

surface intérieure couvre quoi?

Answer 40

mg, mb

Question 41

il y aussi une estimation de l’_________________ et de la surface _________________

Answer 41

épaisseur corticale, locale