Cours 3 - Analyse en morphométrique IRM T1 Flashcards
Lorsque le liquide cépahlo rachidien est blanc cela veut dire que nous somme en T…
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Vrai ou faux, IRM T1 a un mauvais contraste entre la matière blanche, matière grise et le liquide céphalo rachidien
Faux, c’est un bon contraste
Morphologie définition
une technique utilisée pour mesurer et analyser la forme/taille/structure des différentes régions du cerveau qui exploite les images de haute résolution pour extraire des volumes ou des formes d’organes, de structures spécifiques.
Hippocampe sert à quoi majoritairement ?
la mémoire
Est ce que c’est correct d’utiliser T2 pour faire un contraste anatomique?
OUI
c’est quoi la segmentation manuelle en volumétrie?
un médecin trace manuellement les contours des structures d’intérêt sur chaque coupe (ou image 2D) d’un ensemble d’images 3D (volumétrie), comme des coupes d’IRM. Ce processus est répété sur plusieurs coupes pour créer un modèle volumétrique complet de la structure.
Quelles sont les 2 limites de la segmentation manuelle ?
- elle est subjective (il y a des choix arbitraire qui doivent être prisent)
- Dépend de l’habileté de la personne qui l’effectue
est ce que faire une coupe vertical peut compter comme une coupe vertical ?
oui sa compte!
Vrai ou faux. c’est vraiment rapide et efficace faire une segmentation manuelle
faux, c’est long et difficile obtenir une de haute qualité
Une fois qu’on a effectuer une segmentation manuelle, on fait quoi?
On peut mesurer le volume des structures évalué en comptant le nombre de voxel qui sont dedans. Et on pourra comparé entre les populations.
Dans les fins années 90, ils étaient tannés de la SM et voulait que sa se fasse automatiquement. Qu’est qu’ils ont développé?
ils ont développé des algorithmes pour pouvoir aligner tous les cerveaux dans un espace stéréotaxique dans lequel ils pourraient automatiquement identifier les structures clés.
C’est quoi le recalage?
on va trouver des points similaire dans les scans et on va trouver comment transformer ces points de repère d’un individu à l’autre pour les mettre en correspondance.
3 types de translation
haut en bas
droite à gauche
avant à arrière
3 types de rotations
oui
non
head tilt
3 types de mise à l’échelle
Est-ce qu’on peut combiner des rotations?
oui !
Le recalage non linéaire fait quoi?
il va venir modifier la forme de chaque petite partie du cerveau
Quelle est la différence entre les images recalées de manière affine et ceux recalées non linéairement ?
Dans le recalage affine, il y a des petites différences au niveau des positions des structures. Cependant dans le recalage non linéaire, il vient ajuster la taille des différentes régions localisé
c’est quoi l’espace stéréotaxique non linéaire?
C’est une image de référence qui est un scan représentant la moyenne de 150 cerveaux utilisé par 99% des laboratoires
au lieu de recaler 2 IRM de 2 personnes…
Ils vont recaler l’IRM de leur participant avec cette (IRM des 150 cerveaux moyenner) IRM de référence (ex: colin 27)
Si on prend l’espace stéréotaxique et on peint chaque aire, on fait quoi ?
volumétrie (atlas harvard oxford)
Vrai ou faux: la segmentation ne demeure plus arbitraire
faux, même si ce n’est plus une personne qui le fait, un algorithme l’effectue quand même
Donnez un exemple d’application de la volumétrie
Trouver la différence de volume de l’hippocampe entre des participants cognitivement sains or not.
vrai ou faux: les opérations de recalage et de segmentation ne peuvent jamais échouer
faux, il peuvent et des fois de manière majeure
Nomme les contrôles de qualité de la volumétrie(2)
- échec de recalage
- artefact
But du Voxel Based Morphometry (VBM) ?
quantification de la densité locale de matière grise
Dès que l’on bouge la tête ça…
diminue la qualité de l’image (cause du bruit)
c’est quoi la VBM ? (breakdown)
- on prend un point (voxel)
- on fait une petite boule autour
- compte la quantité de matière grise qui se retrouve
- le quantifié en % de mg
densité haute en matière grise veux dire
que le voxel se trouve ENTOURRÉ de m.g.
vrai ou faux. la VBM dépend d’un structure particulière
faux, elle ne dépend pas, elle couvre toute la matière grise.
Quelles sont les 4 étapes du VBM?
- segmentation
- lissage spatial
- recalage dans un espace stéréotaxique de référence
- analyse statistique
C’est quoi les étapes de la segmentation (VBM)
- déterminer quel tissue est le cerveau
- différencier 3 tissues (mb, mg, liqcfl)
C’est quoi le lissage spatial (VBM) ?
compter la proportion de voxel autour dans un voisinage
C’est quoi le recalage dans un espace stéréotaxique de référence ?
Décider voxel X chez personne 1 correspond au voxel Y chez personne 2 afin de faire une statistique
L’effet de volume partiel est
lorsque deux tissus moyennés peuvent se faire prendre pour de la matière grise
Plus on fait confiance à notre recalage
Plus on se permet d’avoir de sphère petite
C’est quoi l’analyse de surface ?
quantification des propriétés géométriques locales de la matière grise (épaisseur & surface)
l’analyse de surface fait une estimation de la surface ______________ et de la surface ______________
piale, intérieur
surface piale couvre quelle matière?
mg, liq cfl
surface intérieure couvre quoi?
mg, mb
il y aussi une estimation de l’_________________ et de la surface _________________
épaisseur corticale, locale
