Cours 3 Flashcards
Quels sont les constituants du noyau cellulaire?
- Enveloppe nucléaire (membrane interne + externe)
=> Couche laminaire dans la face interne de l’enveloppe nucléaire - Nucléoplasme
- Chromatine
- Nucléole
Enveloppe nucléaire (noyau)
Composée de deux membranes de bicouches lipidiques. Cette enveloppe est perforée par des structure appelées pores nucléaires, qui régulent le transport des molécules entre le noyau et le cytoplasme
Nucléoplasme (noyau)
Contenu visqueux du noyau, similaire au cytoplasme.
Chromatine (noyau)
l’ADN condensée ou relâchée par des protéines nommés histones pour réguler l’expression des gènes.
Nucléole (noyau)
Structure non membranaire présente dans le noyau où la synthèse et l’assemblage des sous-unités ribosomales ont lieu (Généralement il s’agit de la région plus sombre quand on observe le noyau)
De quoi est composé l’enveloppe nucléaire?
- La membrane externe
- La membrane interne
- Les 2 membranes sont rejointes et traversées par les pore nucléaires
Caractéristiques des 2 membranes de l’enveloppe nucléaire (noyau)
Membrane externe
- Composé de phospholipides
- En contact avec le cytoplasme
- Est en continuité avec le système endomembranaire, plus particulièrement avec le RE rugueux
Membrane interne
- Composé de phospholipides et de la couche laminaire
- Est en contact avec le nucléoplasme (similaire au cytosol, mais à l’intérieur du noyau).
Couche laminaire (noyau)
Structure dense de filaments protéiques située à la face interne de l’enveloppe nucléaire des cellules eucaryotes. Cette couche est principalement composée de lamines, des protéines de type filament intermédiaire
Fonction de la couche laminaire?
- Support structural
- Organisation de la chromatine
- Rôle dans la signalisation nucléocytoplasmique
Pore nucléaire (noyau)
Les pores nucléaires, sont de vastes assemblages multiprotéiques situés à travers l’enveloppe nucléaire, formant des canaux qui permettent le transport de molécule entre le noyau et le cytoplasme.
Structure pores nucléaires?
- Chaque pore nucléaire est composé de plus d’une trentaine de protéines différentes, appelées nucléoporines
- Ces nucléoporines sont organisées en sous-complexes qui forment la structure annulaire du pore, les filaments cytoplasmique et le “panier” nucléaire.
Fonction des pores nucléaires
- Transport sélectif et bidirectionnel
- Régulation de la signalisation et de l’expression génique
Qu’est-ce que la chromatine?
Complexe d’ADN, de protéines et d’ARN qui constitue la structure des chromosomes à l’intérieur du noyau.
Différence entre euchromatine et hétérochromatine?
- Chromatine euchromatique : Elle est moins compacte et est
généralement active transcriptionnellement. - Chromatine hétérochromatique : Plus dense et généralement
moins active transcriptionnellement.
fonction de la chromatine?
- Permet de condenser l’ADN afin qu’il puisse tenir dans le
noyau. - Permet également de donner l’accès aux enzymes
nécessaires pour la transcription, la réparation de l’ADN, et la réplication.
Qu’est-ce qui fait varier la condensation de la chromatine?
Cette condensation de la chromatine varie en fonction du cycle cellulaire et du niveau d’activité transcriptionnelle :
- Chromatine Euchromatique : transcriptionnellement ou Chromatine Hétérochromatique
Qu’est-ce qui permet la condensation de la chromatine?
Cette condensation est possible grâce aux histones.
* Octamère de protéines chargées positivement, qui facilitent la compaction de l’ADN (chargé négativement) en formant un complexe ADN-histone.
Pourquoi est-ce que les modifications post-traductionnelle des histones sont nécessaires?
- Le code génétique complet est présent dans chaque cellule d’un organisme eucaryote qui possède un noyau.
- Toutefois, l’ensemble du matériel génétique n’est pas disponible pour la transcription à tout moment ou pour toutes les cellules.
- Diverses modifications post-traductionnelles (ajout de
groupement sur la structure protéique) permettent cette
transcription spécifique.
Explique les interactions entre les histones et l’ADN pour décompacter la chromatine
Décompacter la chromatine, la rendant plus accessible à la
machinerie transcriptionnelle.
- Acétylation: Neutralise les charges positives des histones, diminuant ainsi leur affinité pour l’ADN chargé négativement.
- Méthylation: Recrute des protéines effectrices. Selon l’endroit, cette modification peu réguler positivement et négativement la transcription.
Explique les interactions entre les histones et l’ADN pour permettre la condensation du génome en chromatine
Compaction accrue de la chromatine qui empêche
l’accès à la machinerie transcriptionnelle.
* Méthylation.
* SUMOylation.
Quelles sont les parties du nucléole?
- Centre fibrillaire
- Partie fibrillaire dense
- Partie granuleuse
De quoi est composé le ribosome?
Complexes composés d’ARN ribosomique (ARNr) et de protéines.
Qu’est-ce que la traduction?
L’information génétique portée par ARNm est traduite en une séquence d’AA pour former une protéine
Quelles sont les sous-unités de la ribosome et explique ?
La grande (60S) et la petite (40S)
Explique les composantes du ribosome
- ARN ribosomique
- Rôle structurale
- Interaction avec des facteurs de traduction et les ARNt
- Catalyseur (ribozymes) dans la formation des liaison peptidiques des AA - Protéine ribosomique
- Rôle dans la stabilité structurale
- Interaction avec l’ARNm
Fonctions ribosomes
Machinerie essentielle à la traduction de l’ARNm en protéines. Intermédiaire entre l’ARNm (Codon) avec ses ARNt (anti-codon) correspondants et lie les a.a. pour produire une protéine spécifique.
- + fonction des sites plus spécifiques
Fonctions des sites des ribosomes
- Site A (aminoacyl) :
Point d’entrée pour un nouvel ARNt chargé d’un acide aminé
déterminer par l’anticodon correspondant au codon de l’ARNm. - Site P (peptidyl) :
Les a.a. sont ajoutés à la chaîne polypeptidique en croissance. La formation du lien peptidique est catalysée par le centre peptidyl transférase du ribosome, régi par l’ARNr. - Site E (exit) :
l’ARNt déchargé se déplace vers le site E, d’où il sort du ribosome pour être recyclé et à nouveau chargé d’un acide aminé.
Quels sont les types de ribosomes de la cellule eucaryotes?
- Ribosomes libres : dispersés dans le cytoplasme, produisent des protéines
fonctionnant dans la cellule. - Ribosomes liés:
Attachés au RER et sont impliqués synthèse de protéines destinés à être sécrétées hors cellule, incorporées dans la membrane cellulaire
ou envoyées vers les lysosomes. - Ribosomes mitochondriques (plus petit)
Importance de la compartimentalisation dans les cellules eucaryotes?
Compartimentation des différents processus biologiques essentiels à la vie.
* Rends possible la coexistence de réactions biochimiques souvent incompatibles au sein d’une même cellule.
Distinguer réticulum endoplasmique lisse et rugueux.
Fonction du RER
- Synthèse, signalisation et translocation des protéines
- Synthèse des protéines membranaires
- Modifications post-traductionnelles dans le RER
❖ Processus modifiant les protéines après leur synthèse - Pliage des protéines dans le RER
- Contrôle qualité des protéines dans le RER
❖ Mécanisme essentiel qui s’assure que les protéines mal
repliées ou mal assemblées sont retenues et dégradées. - Exportation des protéines vers l’appareil de Golgi (grâce à la COPII)
Fonction du REL
- Synthèse lipides et production de lipoprotéines (cholestérol et phospholipides)
- Biotransformation ou détoxification: modification des substances chimiques pour le rendre plus soluble dans l’eau et faciliter l’excrétion
- Relâche du glucose dans la circulation sanguine (ex: hypoglycémie)
- Entrepôt de calcium (surtout dans les cellules musculaires)
Qu’est-ce que le transport vésiculaire?
Déplacement d’une vésicule entre les différents compartiments de la cellule
Quelles sont les étapes du transport vésiculaire?
Provient du RE, Golgi, MP vers une seconde membrane
1. Reconnaissance et concentration: Molécules qui doivent être transportées sont reconnues er concentrées dans des domaines spécifiques de la membrane
- Formation du manteau: protéines recrutées pour recouvrir la membrane aidant à courber la membrane et sélectionner les
cargos appropriés. - Bourgeonnement: membrane forme une vésicule bourgeonnante. protéine ATP dépendante peuvent pincer la vésicule pour la séparer de la membrane d’origine (un peu).
- Libération: vésicule libérée de la membrane. Protéine dissociées rapidement et recyclé
- Transport: vésicule transportée vers sa destination pas protéines motrices (se déplace sur cytosquelette)
- Ancrage: Vésicule ancrée par des protéines
- Fusion: Fusion de la vésicule avec la membrane cible médiée par protéines (SNAREs)
- Libération du cargo: Cargo libéré dans compartiment cible (dans membrane ou extérieur de la cellule)
Quels sont les types de vésicules?
➢ Vésicules revêtus de clathrine (rôle dans endocytose)
➢ Vésicules revêtus de COP I (transport entre golgi/RE et Tran/Cis du golgi)
➢ Vésicule revêtus de COP II (transport antérograde: entre RE/Golgi)
Types de voies de sécrétions?
➢ Constitutive :
❖ pas de signal particulier
❖ utilisée pour la sécrétion de molécule nécessaire en continue
➢ Régulée :
❖ Activé en réponse à un stimulus
❖ SNAREs interagissent avec d’autres protéines régulatrices qui détectent les
signaux déclencheurs et déclenche la fusion
Types d’endosomes?
- Endosomes précoces
- Endosomes tardifs
Quelles sont les 3 régions fonctionnelles de l’appareil de Golgi?
- Réseau cis-Golgi
- Golgi médian
- Réseau trans-Golgi
Réseau cis-Golgi: Fonction
Centre de tri des protéines entrantes
Golgi médian ou citerne de Golgi: Fonction
- Constitue la plus grande portion du Golgi
- Maturation et modification des protéines
Réseau trans-Golgi: Fonction
C’est à ce niveau que les protéines et les lipides sont triés et emballés pour être envoyés vers leur destination finale.
Quelles sont les 3 différentes voies de sortie de l’appareil de Golgi (endroit où il
envoie ses vésicules)?
- Intégration dans la membrane plasmique
- Exocytose de la cellule
- Lysosome
Quelles sont les fonctions de l’appareil de Golgi?
➢ Modification biochimiques finales (activation des protéines bien repliées)
➢ Récupération des protéines
❖ renvoi des protéines mal configurées vers le RER grâce au COPI)
➢ déterminer la destination des protéines actives (centre de tri de la cellule)
Qu’est-ce qu’un lysosomes?
- Petits organites membranaires digestifs (contient plusieurs types d’enzymes) qui dégradent n’importe qu’elle
macromolécules. - Intérieur acide. Acidité maintenu par ATPase.
Fonctions des lysosomes
➢ Dégradation endocytique (dégradent endosome provenant de l’extérieur de la cellule)
➢ Autophagie
➢ Rôle dans la mort cellulaire (lysosome libère contenue dans cytoplasme pour tuer)
➢ Exocytose
Peroxysomes: Fonction
Organites membraneux permettant d’oxyder et d’éliminer des molécules
toxiques (production de peroxyde d’hydrogène)
➢ Détoxification
❖ Production et neutralisation du peroxyde d’hydrogène
❖ Détoxification des composés exogènes
➢ Oxydation des acides gras
➢ Biosynthèse des lipides
➢ Protection contre le stress oxydatif
