Cours 2 : interactions des microbes

Question 1

Qu’est-ce qu’une interaction intra-spécifique?

Answer 1

Une interaction entre les membres d’une même espèce/population

Question 2

Qu’est-ce qu’une interaction inter-spécifique?

Answer 2

Une interaction entre les membres de différentes espèces

Question 3

Qu’est-ce qu’une corrélation négative?

Answer 3

Quand on a un taxon mais qu’on a pas l’autre

Question 4

Quels sont les 4 points de faire des réseaux d’interactions à partir de matrices d’abondances?

Answer 4

1. Facilement réalisable
2. Donne une idée des taxons/gènes qui sont présents au même instant
3. Ne dépend pas de la culture
4. Ne garantit pas l’interaction

Question 5

Par quelle méthode peut-on observer les interactions physiques entre les microbes ?

Answer 5

Par microscopie électronique

Question 6

Quels sont les 3 points de la microscopie électronique?

Answer 6

1. Permet de déterminer l’interaction physique entre cellules et d’analyser les structures microbiennes
2. Dépend souvent de la culture
3. N’informe pas sur la nature de l’interaction

Question 7

Quels sont les 3 points de l’analyse par Nanosims?

Answer 7

1. Permet de déterminer s’il y a des échanges entre cellules
2. Dépend souvent de la culture
3. Dispendieux

Question 8

Pourquoi faire un taux de croissance?

Answer 8

Permet de déterminer quel est l’effet d’un micro-organisme sur l’autre

Question 9

Quels sont les 3 points d’un taux de croissance?

Answer 9

1. Trouver le bon milieu de culture
2. Permet l’étude du type d’interaction et de quantifier cette interaction
3. Ne peut s’appliquer qu’aux micro-organismes cultivables

Question 10

Quelles sont les 3 interactions positives?

Answer 10

1. Mutualisme
2. Protocoopération
3. Commensalisme

Question 11

Quelles sont les 4 interactions négatives?

Answer 11

1. Prédation
2. Parasitisme
3. Amensalisme
4. Compétition

Question 12

Qu’est-ce que le mutualisme?

Answer 12

Une relation avec un bénéfice réciproque

Question 13

Qu’est-ce que le syntrophisme?

Answer 13

C’est un type spécifique de mutualisme où deux organismes dépendent chacun de nutriments produits par l’autre

Question 14

Qu’est-ce que la protocooperation?

Answer 14

Les organismes améliorent leur croissance par cette coopération mais n’en sont pas dépendants

Question 15

Qu’est-ce que le commensalisme?

Answer 15

Relation dans laquelle 1 organisme est bénéficiaire tandis que l’autre n’est ni favorisé ni défavorisé
– Pas une relation inter-dépendante

Question 16

Quels sont les 3 points d’une prédation?

Answer 16

1. Un organisme prédateur englouti et digère un autre organisme, la proie
2. Un prédateur peut produire une enzyme pour éliminer sa proie
3. Certains prédateurs doivent se fixer à leur proie pour la tuer

Question 17

Quels sont les 2 effets de la prédation dans la communauté bactérienne?

Answer 17

1. Importants déterminants de la structure, diversité et dynamique de la communauté bactérienne
2. Important régulateur

Question 18

Quels sont les 2 points du parasitisme?

Answer 18

1. Un organisme est bénéficiaire et l’autre est endommagé/abimé
2. Un parasite peut être attaché ou dans l’hôte

Question 19

Qu’est-ce que l’amensalisme?

Answer 19

Relation dans laquelle un organisme produit une molécule qui a un effet négatif sur l’autre organisme

Question 20

Qu’est-ce que la compétition?

Answer 20

Quand différents micro-organismes au sein d’une population ou communauté ciblent la même ressource

Question 21

Les facteurs abiotiques (environnementaux) influencent les ___ et les ___ des microbes

Answer 21

1. interactions

2. comportements

Question 22

Donner des exemple de facteurs abiotiques

Answer 22

1. Lumière
2. pH
3. Disponibilité en eau
4. Disponibilité en nutriments
5. Température

Question 23

Qu’est-ce que la tragédie des biens communs?

Answer 23

Les ressources communes sont utilisées pour le bien individuel à court terme, mais mauvais pour le groupe social à long terme

Question 24

Qu’est-ce qu’un sidérophore?

Answer 24

Un peptide capable de fixer/internaliser le fer

Question 25

Un altruiste ___ le fitness d'un ___ à un coût à ___

Answer 25

1. améliore 2. bénéficiaire 3. soi-même

Question 26

Le quorum sensig est un ____ qui se base sur la ___ de petites molécules ou "___" qui sont produites en phase de ____

Answer 26

1. mode de signalisation 2. auto-inducteurs 3. croissance bactérienne

Question 27

Lorsqu'un ____ est atteint, ces auto-inducteurs ___ avec un régulateur transcriptionnel, permettant ___, en réponse à une forte ___ de cet auto-inducteurs, d'un groupe de ___

Answer 27

1. seuil de concentration 2. l'expression spécifique 3. concentration 4. gènes

Question 28

Quel est l'auto-inducteur dans vibrio fischeri impliqué dans la bioluminescence?

Answer 28

AHL

Question 29

Quelle est une des fonctions possibles de AHL?

Answer 29

La réparation de l'ADN via un processus de photo-réactivation

Question 30

Comment les virus contribuent-ils à la disponibilité des composants organiques dissous?

Answer 30

En lysant leur hôte

Question 31

Quelles sont les deux façons dont les phages ont une influence sur la structure et la diversité des communautés aquatiques microbiennes?

Answer 31

1. Prédation régulant certaines populations de bactéries et de phytoplankton 2. Transfert de ènes horizontal

Question 32

Quel mécanisme de transfert de l'information implique qu'une bactérie "compétente" peut intégrer de l'ADN exogène?

Answer 32

La transformation

Question 33

Quel mécanisme de transfert de l'information implique le transfert de plasmide via un pili entre 2 bactéries?

Answer 33

La conjugaison

Question 34

Quel mécanisme de transfert consiste en un transfert de matériel génétique d'une bactérie à l'autre par l'intermédiaire d'un vecteur viral?

Answer 34

La transduction

Question 35

La transduction peut se faire aussi bien dans la phase ___ que dans la phase ___

Answer 35

1. lytique | 2. lysogénique

Question 36

Dans quelle phase le phage est virulent?

Answer 36

La phase lytique

Question 37

Dans quel mécanisme de défense entre CRISPR et le phage-récepteur les phages sont le plus abondants?

Answer 37

Le phage-récepteur

Question 38

Quel mécanisme de défense entre CRISPR et le phage-récepteur a le milieu le plus pauvre en nutriments?

Answer 38

CRISPR