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Microbiologie environnementale > Cours 2 : interactions des microbes > Flashcards

Cours 2 : interactions des microbes Flashcards

1
Q

Qu’est-ce qu’une interaction intra-spécifique?

A

Une interaction entre les membres d’une même espèce/population

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Q

Qu’est-ce qu’une interaction inter-spécifique?

A

Une interaction entre les membres de différentes espèces

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3
Q

Qu’est-ce qu’une corrélation négative?

A

Quand on a un taxon mais qu’on a pas l’autre

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4
Q

Quels sont les 4 points de faire des réseaux d’interactions à partir de matrices d’abondances?

A
  1. Facilement réalisable
  2. Donne une idée des taxons/gènes qui sont présents au même instant
  3. Ne dépend pas de la culture
  4. Ne garantit pas l’interaction
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5
Q

Par quelle méthode peut-on observer les interactions physiques entre les microbes ?

A

Par microscopie électronique

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6
Q

Quels sont les 3 points de la microscopie électronique?

A
  1. Permet de déterminer l’interaction physique entre cellules et d’analyser les structures microbiennes
  2. Dépend souvent de la culture
  3. N’informe pas sur la nature de l’interaction
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7
Q

Quels sont les 3 points de l’analyse par Nanosims?

A
  1. Permet de déterminer s’il y a des échanges entre cellules
  2. Dépend souvent de la culture
  3. Dispendieux
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8
Q

Pourquoi faire un taux de croissance?

A

Permet de déterminer quel est l’effet d’un micro-organisme sur l’autre

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9
Q

Quels sont les 3 points d’un taux de croissance?

A
  1. Trouver le bon milieu de culture
  2. Permet l’étude du type d’interaction et de quantifier cette interaction
  3. Ne peut s’appliquer qu’aux micro-organismes cultivables
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10
Q

Quelles sont les 3 interactions positives?

A
  1. Mutualisme
  2. Protocoopération
  3. Commensalisme
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11
Q

Quelles sont les 4 interactions négatives?

A
  1. Prédation
  2. Parasitisme
  3. Amensalisme
  4. Compétition
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12
Q

Qu’est-ce que le mutualisme?

A

Une relation avec un bénéfice réciproque

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13
Q

Qu’est-ce que le syntrophisme?

A

C’est un type spécifique de mutualisme où deux organismes dépendent chacun de nutriments produits par l’autre

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14
Q

Qu’est-ce que la protocooperation?

A

Les organismes améliorent leur croissance par cette coopération mais n’en sont pas dépendants

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15
Q

Qu’est-ce que le commensalisme?

A

Relation dans laquelle 1 organisme est bénéficiaire tandis que l’autre n’est ni favorisé ni défavorisé
– Pas une relation inter-dépendante

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16
Q

Quels sont les 3 points d’une prédation?

A
  1. Un organisme prédateur englouti et digère un autre organisme, la proie
  2. Un prédateur peut produire une enzyme pour éliminer sa proie
  3. Certains prédateurs doivent se fixer à leur proie pour la tuer
17
Q

Quels sont les 2 effets de la prédation dans la communauté bactérienne?

A
  1. Importants déterminants de la structure, diversité et dynamique de la communauté bactérienne
  2. Important régulateur
18
Q

Quels sont les 2 points du parasitisme?

A
  1. Un organisme est bénéficiaire et l’autre est endommagé/abimé
  2. Un parasite peut être attaché ou dans l’hôte
19
Q

Qu’est-ce que l’amensalisme?

A

Relation dans laquelle un organisme produit une molécule qui a un effet négatif sur l’autre organisme

20
Q

Qu’est-ce que la compétition?

A

Quand différents micro-organismes au sein d’une population ou communauté ciblent la même ressource

21
Q

Les facteurs abiotiques (environnementaux) influencent les ___ et les ___ des microbes

A
  1. interactions

2. comportements

22
Q

Donner des exemple de facteurs abiotiques

A
  1. Lumière
  2. pH
  3. Disponibilité en eau
  4. Disponibilité en nutriments
  5. Température
23
Q

Qu’est-ce que la tragédie des biens communs?

A

Les ressources communes sont utilisées pour le bien individuel à court terme, mais mauvais pour le groupe social à long terme

24
Q

Qu’est-ce qu’un sidérophore?

A

Un peptide capable de fixer/internaliser le fer

25
Q

Un altruiste ___ le fitness d’un ___ à un coût à ___

A
  1. améliore
  2. bénéficiaire
  3. soi-même
26
Q

Le quorum sensig est un ____ qui se base sur la ___ de petites molécules ou “___” qui sont produites en phase de ____

A
  1. mode de signalisation
  2. auto-inducteurs
  3. croissance bactérienne
27
Q

Lorsqu’un ____ est atteint, ces auto-inducteurs ___ avec un régulateur transcriptionnel, permettant ___, en réponse à une forte ___ de cet auto-inducteurs, d’un groupe de ___

A
  1. seuil de concentration
  2. l’expression spécifique
  3. concentration
  4. gènes
28
Q

Quel est l’auto-inducteur dans vibrio fischeri impliqué dans la bioluminescence?

A

AHL

29
Q

Quelle est une des fonctions possibles de AHL?

A

La réparation de l’ADN via un processus de photo-réactivation

30
Q

Comment les virus contribuent-ils à la disponibilité des composants organiques dissous?

A

En lysant leur hôte

31
Q

Quelles sont les deux façons dont les phages ont une influence sur la structure et la diversité des communautés aquatiques microbiennes?

A
  1. Prédation régulant certaines populations de bactéries et de phytoplankton
  2. Transfert de ènes horizontal
32
Q

Quel mécanisme de transfert de l’information implique qu’une bactérie “compétente” peut intégrer de l’ADN exogène?

A

La transformation

33
Q

Quel mécanisme de transfert de l’information implique le transfert de plasmide via un pili entre 2 bactéries?

A

La conjugaison

34
Q

Quel mécanisme de transfert consiste en un transfert de matériel génétique d’une bactérie à l’autre par l’intermédiaire d’un vecteur viral?

A

La transduction

35
Q

La transduction peut se faire aussi bien dans la phase ___ que dans la phase ___

A
  1. lytique

2. lysogénique

36
Q

Dans quelle phase le phage est virulent?

A

La phase lytique

37
Q

Dans quel mécanisme de défense entre CRISPR et le phage-récepteur les phages sont le plus abondants?

A

Le phage-récepteur

38
Q

Quel mécanisme de défense entre CRISPR et le phage-récepteur a le milieu le plus pauvre en nutriments?

A

CRISPR

Microbiologie environnementale (10 decks)

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