Cours 2: Classification et identification des levures Flashcards
Vrai ou faux: les champignons sont des plantes?
Faux, les champignons ne font même pas partie du même règne
Les champignons font partie de quel domaine de l’arbre phylogénétique?
Les eucaryotes
Quel est le mode de nutrition des champignons?
Par absorption
En quoi diffère les champignons par rapport au plant pour ce qui est de leur apport en carbone?
Les champignons sont hétérotrophes donc leur source de carbone est déjà fabriquée et sous forme organique
Les plantes sont autotrophes donc elles fixent le carbone atmosphérique par photosynthèse
Pourquoi peut-on dire que les champignons partagent un point en commun avec les insects et les crustacés plus qu’avec les autres animaux?
Les champignons au même titre que les insects et les crustacés possède de la chitine au niveau de leur paroi en opposition aux autres animaux
Vrai ou faux, les animaux sont plus proches des animaux que des plantes?
Vrai
Pourquoi les champignons sont-ils plus proches des animaux que des plantes (2 énoncés de réponse)?
- Ils sont d’une grande ressemblance génétique
2. Le glycogène est leur substance de réserve
Sur quel critère se base la classification des champignons parmis les basidiomycètes, les ascomycètes ou les deutéromycètes?
Sur la structure sexuée que présente l’organisme sous sa forme diploïde
Qu”insinue le terme: “vraies levures”?
Les vraies levures sont des levures figurant parmis les ascomycètes qui possèdent un ancêtre commun et sont strictement unicellulaires
Vrai ou faux, le groupe taxonomique des levures est monophylétique et se compose uniquement des “vraies” levures?
Faux, le groupe taxonomique des levures comporte aussi les organismes dit levuriforme qui ne sont pas de “vraies” levures
Vrai ou faux, le groupe des basidiomycètes possède un ancêtre commun?
Faux, le groupe des basidiomycètes n’a aucun ancêtre commun
Le groupe des levures est polyphylétique qu’est-ce que cela signifit?
Le groupe des levures ne comporte pas d’ancêtre commu, mais bien plusieurs taxons qui empruntent des solutions similaires pour survivre et partagent des caractéristiques communes
vrai ou faux, les basidiomycètes sont des “vraies” levures?
Faux, les basidiomycètes sont généralement dimorphes et donc sortent des critères d’une “vraies” levure par leur pluricellularité.
Quelles caractéristiques englobe le terme ascomycota:
A) Production d’asques contenant des ascospores
B) prodction d’un ascoma sous-tenant les asques
C) “vraies” levures
D) généralement dimorphe
A et C
Les levures ne font pas d’organe de fructification soit l’ascoma, mais se reproduisent, en ce qui a trait à la reproduction sexuée par l’entremise d’asques
Les levures ascomycètes sont généralement monomorphes et donc unicellulaires
Quelle(s) caractéristique(s) ne décrit PAS le taxon des levures?
A) Les “vraies” levures–>ascomycètes
B) Les levures dans leur ensemble constitue un groupe monophylétique
C) La reproduction asexuée des levures fait référence au bourgeonnement ou à la fission binaire
D) La forme sexuée est caractérisée par l’absence d’organe de fructification
B) le groupe des levure est un groupe polyphylétique, soit un regroupement artificiel sans partage d’un ancêtre commun
Associez le terme à sa définition:
A) Forme sexuéee de la levure
B) Forme asexuée de la levure
C) Reproduction asexuée employée par Schizosaccharomyces sp.
D)Reproduction asexuéee employée par Malassezia sp.
E) Reproduction asexuée employée par Hanseniaspora sp.
1) Bourgeonnement bipolaire
2) Bourgeonnement unipolaire
3) fission binaire
4) anamorphe
5) téléomorphe
A) 5 B) 4 C) 3 D) 2 E) 1
Décrivez la reproduction asexuée par bourgeonnement (1) multilatéral, (2) bipolaire, (3) unipolaire
1) Le bourgeonnement multilatéral consiste en la formation de bourgeons se formant successivement chacun à partir d’un site différent à la surface de la cellule mère.
2) Le bourgeonnement bipolaire consiste en la formation de bourgeons uniquement à partir de deux sites spéficiques aux deux extrémités de la cellule-mère.
3) Le bourgeonnement unilapolaire consiste en la formation de bourgeon à partir d’un seul site, à une extrémité seulement de la cellule-mère
Quelle coloration permet de voir l’emplacement des cicatrices de bourgeonnement lors d’une bourgeonnement multilatéral et quel utilité cela peut-il avoir?
La coloration au calcofluor permet de voir les cicatrice et donc permet d’estimer l’âge de la levure
Quel mode de bourgeonnement est emprunté par la majorité des levure?
Le bourgeonnement multilatéral
Quel bourgeonnement donne une forme de citron à la cellule-mère?
La bourgeonnement bipolaire
La technique de Dalmau permet de mettre en évidence... (plusieurs énoncés de réponse) A) Le hyphes des levures B) la nature ascomycète ou basidiomycète C) les ballistoconidies D) les chlamydospores E) les arthroconidies
A, D et E
Vrai ou faux, les ballistoconidies sont une structure asexuée qui consiste en un mode de reproduction végétative?
Vrai
En quoi consistent les arthroconidies?
Les arthroconidies sont des conidies formées par désarticulation des cellules d’un hyphe, caractéristique du genre trichosporon
La présence de chlamydospore oriente le diagnostic vers quelles levures?
1) Candida albicans
2) Candida dubliniensis
Les ballistoconidies sont caractéristiques de quel genre?
Sporobolomyces
Vrai ou faux; il existe deux sorte d’hyphe soit les hyphes segmentés et les pseudohyphes?
Faux, les deux sortes d’hyphes sont les hyphes segmentés et les hyphes cloisonnés. Les pseudohyphes sont des faux hyphes
Qu’est-ce qu’une ballistoconidie?
Une conidie propulsée à distance
Qu’est-ce que le terme homothallisme signifie?
Le terme homothallisme fait référence au mode de reproduction sexuée qui implique que leslevures ont la capacité de changer de sexe, elles sont donc hermaphrodites. Une même souche à la capacité de s’autofertiliser
Mise en situation: Martine doit identifier une levure faisant partie des ascomycètes qui a été ensemencée sur gélose. Cette dernière lorsqu’observée au microscope à la suite d’une coloration au vert de malachite ne révèle aucun ascospore. Sachant que la levure est apte à faire de la reproduction sexuée, quelle conclusion martine peut-elle tirer quant au mode de reproduction sexuée de son inconnu?
La levure inconnue est hétérothallique. Autrement dit, la levure, lorsqu’en culture pure ne peut générer de souche haploïde de sexe complémentaire et donc ne peut guère former des ascospores.
En quoi consiste la caryogamie?
La caryogamie consiste en la fusion de deux noyaux suite à la fusion de deux cellules
Vrai ou faux; une levure dont la reproduction sexuée est de nature homothallisme est apte à former des spore, même en culture pure?
Vrai, la levure homothallique peut changer de sexe et donc procéder à la reproduction sexuée même lorsqu’en culture pure
Nommez l’un des avantages de la reproduction sexuée homothallique?
La reproduction sexuée homothallique permet de s’assurer que les deux sexes sont toujours retrouvés même après plusieurs générations
Quelle tendance suit l’alternance de sexe?
A) la cellule-mère peut changer de sexe à sa guise
B) la cellule-mère peut changer de sexe seulement après avoir bourgeonner une première fois
C) Seul le bourgeon peut changer de sexe
D) Le changement de sexe est purement aléatoire et aucun tendance n’est observée
B) la cellule-mère peut changer de sexe seulement après avoir bourgeonner une première fois
En milieu riche et en conditions normale quel type de reproduction est favorisée?
La reproduction asexuée (mitose), car elle requiert moins de ressource et d’énergie
Qu’est-ce qui peut inciter une levure à employer la reproduction sexuée, soit la méiose?
Un changement dans l’environnement ou un milieu pauvre
Comment se déroule la reproduction sexuée chez les ascomycètes?
- Deux cellules haploïdes de sexe opposé se rencontrent, puis s’unissent pour que leur noyaux s’unissent à leur tour (caryogamie). La cellule désormais diploïde procède à la méiose et forme un asque contenant 4 ascospores. Les ascospores sont relachés et germent pour devenir une levure mature
Quelle coloration permet de mettre en évidence les spores?
La coloration au vert de malachite
Le processus de reproduction sexuée est-il le même chez les ascomycètes homothalliques et hétérothalliques?
Oui, il demeure le même seule les chance de rencontre du sexe opposé chez les hétérothalliques est restreint
Vrai ou faux; le cycle de reproduction sexuée chez les basidiomycètes diffère de celui des ascomycète particulièrement parce que l’étape de la cayogamie a tendance à être remplacée par la formation d’un hyphe dicaryote?
Vrai, les basidiomycètes suite à la rencontre du sexe opposé forment un hyphe dicaryote (avec plusieurs noyaux au lieu d’unir leur noyau pour former une cellule diploïde.
Sur quelle structure sont rattachés les basidiospores?
Le baside
Vrai ou faux; certaines levures dont Cryptococcus neoformans changent de nom lorsqu’ils sont sous forme téléomorphe?
Vrai, les noms ne sont pas uniformisés et certaines levures ont été renommées lors de leur découverte sous forme sexuée. Cryptococcus adopte le nom de Filobasidiella neoformans sous forme sexuée
En quoi consiste le cycle de reproduction sexuée par l’entremise de teliospores?
Tout d’abord, les cellules haploïdes de sexes différents se rencontrent et vont se conjuguer pour former un hyphe dicaryote, puis ensuite procéder à la caryogamie et unir leur noyau. La caryogamie est de concert à la formation d’un téliospore, une cellule à paroi épaisse. La formation du téliospore diploïde est suivie de la germination d’un promycélium formé de cellules haploïdes, puis par la méiose et e la mitose pour former des basidiospores.
À quel stade de la reproduction sexuée par l’entremise de teliospores la levure Ustilago maydis (pathogène du maïs) est-elle infectieuse?
Sous la forme d’hyphe dicaryote
Kluyver a formulé 4 lois, laquelle est erronée:
- Une levure qui ne peut fermenter le glucose ne fermente aucun autre sucre
- Une levure qui fermente le lactose ne peut fermenter la maltose et vice versa
- Une levure qui ne peut assimiler une source de carbone peut possiblement la fermenter
- Une levure qui peut fermenter le glucose paut aussi fermenter le fructose et le mannose
- Une levure qui ne peut assimiler une source de carbone, ne peut la fermenter
Le test de l’hydrolyse de l’urée utilise quel indicateur? Et qu’est-ce qu’une couleur rose signifie?
Le rouge de phénol qui vire de jaune à rose lorsque l’urée est hydrolysée par l’uréase provocant l’alcalinisation du milieu d’où la couleur rose
Qu’est-e que la cycloheximide?
C’est un antifongique qui inhibe la croissance de certaines levures
Qu’est-ce qu’une coloration rouge à mauve du réactif bleu de diazonium B signifit quant au taxon d’une levure?
La levure appartient au groupe des basidiomycètes
Vrai ou faux; toutes les levures ont le même coenzyme Q, mais avec des unités isoprènes différentes?
Vrai, seules les unités isoprènes varient de 6 à 10
Quel rôle joue le coezyme Q?
Le coenzyme Q est impliqué dans le transport d’électrons dans le mitochondrie
Une levure comportant une coenzyme à 7 unités isoprène fait partie de quel taxon?
Les ascomycètes
Combien d’unités isoprènes peuvent comportés les coenzymes Q des basidiomycètes? et celles des ascomycètes?
Les basidiomycètes ont de 6 à 8 unités isoprènes et les ascomycètes de 9 à 10 unités isoprènes
Les espèces de levures varient en fonction de leur pourcentage en nucléotides G:C. Qu’est-ce que cette méthode permet de dire par rapport à deux espèces de levures?
Cette méthode permet de dire que deux levures ne sont pas de la même espèce. C’est une méthode de comparer des espèces étroitement liées
Qu’est-ce que la température de fusion de l’ADN?
La température de fusion de l’ADN consiste en la température où 50% de l’ADN est simple brin et 50% est double brin
Vrai ou faux; La température de fusion est proportionnelle au pourcentage de G:C?
Vrai, plus un organisme à une température de fusion élevée, plus celle-ci comporte un haut pourcentage G:C, car ces nucléotide entretiennent 3 liaisons donc sont plus difficiles à séparer que la liaison A:T
Vrai ou faux; Un simple brin est moins absorbant qu’un double brin?
Faux, le simple brin est plus absorbant que le double brin. Cela vient rejoindre le principe que plus l’ADN est dénaturés, plus celle-ci est absorbante.
Quelle pourcentage de différence en G:C est nécessaire afin d’affirmer que deux espèces sont différentes?
Une différence de 1-2% entre les concentrations de G:C obtenue à partir de l’ADN de deux souches, indique qu’elles appartiennent à deux espèces différentes
Quel pourcentage de G:C possèdent en moyenne les basidiomycètes?
27% à 50%
Quel pourcentage de G:C possèdent en moyenne les ascomycètes?
50% à 70%
Quelle(s) caractéristique(s) correspondent au test de réassociation ADN: ADN?
A) Permet de comparer des espèces étroitement apparentées
B) Le test est effecté sur une partie précise du génome
C) les résultats sont reproductibles entre différentes études antérieures
D) Permet de déterminer si deux organismes sont de la même espèce ou non
A et D
Les tests sont effectués sur l’ensemble du génome
Chaque expérience est unique et ne peut être comparée à des études antérieures
Quelle région est-il judicieux de séquencer lorsu’il est question de différencier deux souches appartenent à la même espèce?
Les ITS (hehehe) pour de vrai c’Est les internal transcribed spacer qui vont varier selon les souches
Vrai ou faux; le séquençage permet d’étudier les liens de parenté proches ou distants des organsimes selon la région qui est séquencée?
Vrai séquencage iz the best
Quels sont les avantages et désavantages de la base de données BLAST?
Avantage: contient un très grand nombre de séquences incluant des séquences d’ADN ribosomal de levure
Désavantage: Contient des erreur de séquencage et d’identification
Quelle séquence est-il possible de séquencer afin d’avoir une idée plus large de la diveristé et des familles présentes?
Le 18S qui donne jusqu’au genre et dans quelques cas l’espèce
Qu’est-ce que la forme imparfaite d’une levure?
La forme asexuée ou anamorphe
Qu’est-ce qu’une coloration jaune ou blanche signifie au test du bleu de diazonium B?
L’appartenance au groupe des ascomycètes
Qu’est-ce que la forme parfaite d’une levure?
La forme sexuée ou téléomorphe
Quels sont les tests les plus fréquemment utilisés pour différencier les basidiomycètes des ascomycètes sous leur forme anamorphe? Quels résultats sont escomptés pour chaque test, pour chaque taxon?
- Le test de l’uréase (B+, A-)
- Le bleu de diazonium B (B: rouge violet, A: blanc jaune)
- Le coenzyme Q (B: 9 à 10 unités, A: 6 à 8 unités)
- Le %G:C (B; 50-70%, A: 27 à 50%)
Quelle levure chez les ascomycètes fait exception à la tendance négative au test de l’hydrolyse de l’urée?
Schizosaccharomycète est l’une des seules levure d’appartenance ascomycète à être uréase+
