Cours 2 Flashcards
2 étapes de l’expression génique
- Transcription : ADN matrice est transcrit en ARN
- Traduction
Éléments du gène permettant son expression dans l’ordre (6)
- Promoteur: site d’interaction avec l’ARN polymerase
- Site d’initiation de la transcription (début de l’ARNm)
- Site d’attachement du ribosome à l’ARNm (RBS)
- Début de la traduction (ATG)
- Arrêt de la traduction (codon stop)
- Site de la terminaison de la transcription (fin de l’ARNm)
Vrai ou faux, le promoteur permet à l’ARN polymerase d’initier la transcription
Vrai
Vrai ou faux, le codon ATG précède toujours le site d’attachement au ribosome (RBS)
Faux, c’est l’inverse
Vrai ou faux, le codon stop de traduction précède toujours le site de terminaison de la transcription
Vrai
Vrai ou faux, le site d’initiation de la transcription précède toujours le codon initiateur de la traduction
Vrai
Vrai ou faux, le désoxyribose dans l’ADN ne contient pas d’atome d’oxygène en position 2
Vrai
Vrai ou faux, l’uracile, qu’on retrouve dans l’ARN, est en réalité une thymine avec un groupement méthyle en position 5
Faux, c’est l’inverse
Vrai ou faux, les appariements G:U dans l’ARN sont tolérés mais pas les appariements G:T dans l’ADN
Vrai
Vrai ou faux, les polymérases ADN et ARN arrivent à discriminer entre dNTPs et NTPs via la position 2 du ribosome
Vrai
Vrai ou faux, l’ARN polymérase se déplace dans la direction 3’ vers 5’ par rapport au brin matrice
Vrai
Vrai ou faux, l’ARNm a la même séquence que le brin ADN matrice
Faux, l’ARNm est complémentaire au brin matrice
Vrai ou faux, l’ARN polymérase cœur peut reconnaître les promoteurs
Faux, c’est l’ARN polymérase holoenzyme qui reconnaît un promoteur
Vrai ou faux, l’ARN est synthétisé dans la direction 3’ Vers 5’
Faux, 5’ vers 3’
Vrai ou faux, la première étape de la transcription, la formation du complexe fermé est reconnaissance du promoteur par l’holoenzyme, via un facteur sigma
Vrai
Vrai ou faux, la transcription débute par l’ajout d’un premier nucléotide, généralement un purine
Vrai
Vrai ou faux, la phase d’élongation débute lorsque le facteur sigma a quitté l’ARN polymérase
Vrai
Vrai ou faux, durant la transcription, un hybride ADN-ARN d’environ 8 nucléotides stabilise l’ARN polymérase
Vrai
Vrai ou faux, dans le complexe fermé au promoteur, sigma 4 interagit avec le -35 et sigma 2 avec le -10
Vrai
Vrai ou faux, la formation du complexe ouvert nécessite l’interaction de sigma 2 avec le brin matrice de l’ADN
Faux, c’est avec le brin codant de l’ADN
Vrai ou faux, la rifampicine bloque la formation du complexe ouvert
Faux, la rifampicine bloque la synthèse de l’ARN et trappe l’ARN polymérase dans le complexe d’initiation
Vrai ou faux, la transcription abortive est due à la présence du facteur oméga dans l’ARN polymérase
Faux, c’est le facteur sigma
Comment le complexe fermé devient ouvert
Par isomérisation, la pince bêta se ferme autour de l’ADN pour créer le canal du site actif autour du brin matrice de l’ADN. Ça permet à sigma2 de séparer les brins de l’ADN dans la région -10 et d’interagir avec le brin codant.
Action rifampicine
La rifampicine interagit avec la sous-unité bêta dans le canal du site actif pour que l’ARN naissant (2-3nt) se rencontre. Ça bloque la synthèse de l’ARN et trappe l’ARN polymérase dans le complexe d’initiation
Vrai ou faux, un haut taux de transcription abortive décrit un promoteur fort
Faux, une promoteur fort a un faible taux de transcription abortive
Comment se forme le complexe d’élongation
Lorsque l’ARN est entré dans la canal de sortie
Que signifie une transcription processive obligatoire
Une fois que l’ARN polymérase a débuté l’élongation, elle ne peut pas quitter la matrice ADN, sans que ça n’interrompe irréversiblement la transcription (formation ARN tronqué)
À quoi est due la grande stabilité du complexe d’élongation
À la présence d’un hybride ARN:ADN de 8-9 nucléotides dans la bulle de transcription
Vitesse d’élongation
50nt/s
Vrai ou faux, contrairement à la réplication, la transcription est processive obligatoire
Vrai
Vrai ou faux, le canal de sortie permet à l’ARN de se libérer du brin matrice
Vrai
Vrai ou faux, la stabilité du complexe d’élongation est due à l’hybride ADN-ARN
Vrai
Vrai ou faux, une pause de transcription est due au fait que À:U est plus stable que À:T
Faux
Vrai ou faux, la terminaison de la transcription est précédée d’une pause due à une suite de Us dans l’ARN
Vrai
Vrai ou faux, dans la terminaison facteur-indépendant, la formation d’une épingle à cheveux déstabilise l’hybride ADN-ARN
Vrai
Vrai ou faux, dans la terminaison rho-dépendante, rho interagit avec une séquence riche en Cs (rut)
Vrai
Vrai ou faux, rho possède une activité helicase ARN-ADN
Vrai
Ils font le lien entre les séquences nucleotidiques des ARNm et les acides aminés
Les ARNts
Vrai ou faux, dans la polarité, la terminaison prématurée de la transcription cause la terminaison prématurée de la traduction
Faux, c’est la terminaison prématurée de la traduction qui cause la terminaison prématurée de la transcription
Vrai ou faux, la protéine rho est impliqué dans le phénomène de polarité
Vrai
Pourquoi est-il rare d’avoir des mutants constitutifs dans la régulation positive
Car il faut une mutation dans la protéine régulatrice qui la rende indépendante de l’inducteur pour son activité
Vrai ou faux, en général, les sites de régulation positive sont plus éloignées des promoteurs que les sites de régulation négative
Vrai
Vrai ou faux, l’opérateur contient les sites de régulateur transcriptionnelle d’un gène
Vrai
Vrai ou faux, la protéine régulatrice agit en trans
Vrai
Vrai ou faux, le phénotype Oc est cis-dominant car il ne peut être complémenté et agit seulement sur l’opéron ou la mutation est présente
Vrai
Vrai ou faux, LacIs a un phénotype de super-represseur et est trans-dominant
Vrai
Vrai ou faux, la majorité des mutations lacP sont des mutations polaires et non pas des mutations dans le promoteur
Vrai ou faux, il y a plus qu’un opérateur pour contrôler l’expression de l’éperon lac
Vrai
Vrai ou faux, l’attachement de GalR aux opérateurs Oe et Oi permet la formation d’une boucle de répression
Vrai
Vrai ou faux, dans une souche diploïde pour galRs il est plus facile d’obtenir une mutation constitutive dans GalR que dans Oe ou Oi
Faux, c’est le contraire
Vrai ou faux, l’attachement de GalR à la séquence Oe sur un plasmide multicopie permet la répression de l’operon gal
Faux
Vrai ou faux, dans la régulation négative impliquant un operon de biosynthèse, la molécule effectrice agit comme co-répresseur
Vrai
Vrai ou faux, le tryptophane agit comme co-répresseur pour TrpR
Vrai
Vrai ou faux, l’utilisation du 5-méthyltryptophane permet l’isolement de mutant TrpR-
Vrai
Vrai ou faux, le D- fucose permet d’isoler des mutants qui inactivent complètement AraC
Faux, AraC est fonctionnel mais indépendant de l’inducteur
Vrai ou faux, AraC agit comme activateur en présence d’arabinose et comme anti-activateur en son absence
Vrai
Vrai ou faux, une mutation inactivant AraC confère un phénotype constitutif
Faux, c’est un phénotype de super-represseur
Vrai ou faux, une mutation de super-répresseur est plus difficile à isoler pour AraC que pour LacI
Faux, c’est l’inverse
