cours 12 mcb2979 Flashcards
quelles sont les géométries des voies anaboliques de synthèse d’a.a.
linéaire ou bifurquée (2 précurseurs ou 2 a.a. produits)
quels sont les précurseurs essentiels à la synthèse des a.a.
3-phosphoglycérate
PEP
pyruvate
acétyl-CoA
oxaloacétate
alpha-cétoglutarate
ribose-5-P
erythrose 4-P
quelle est la demande énergétique d’une enzyme synthase
demande pas ATP
quelle est la demande énergétique d’une enzyme synthétase
hydrolyse d’ATP
comment ajouté groupe P pour former a.a.
- ajout NH4 libre pour synthèse de glutamine et glutamate
- transamination à partir glutamine/glutamate pour les autres a.a.
quels a.a. sont formés à partir du 3-phosphoglycérate
sérine et cystéine
quels a.a. sont formés à partir d’oxaloacétate
aspartate le précurseur de : asparagine, thréonine, lysine, méthionine, acide diaminopimélique
quels a.a sont formés à partir de pyruvate seulement
alanine, valine
leucine: a aussi besoin d’acétyl-CoA
comment est formé de l’isoleucine
à partir de la thréonine formée par asparate formée par oxaloacétate
à quoi sert le chorismate
- quinone
- entérobactine chélateur de fer
- acide folique: permet former purine, pyrimidines glycine et méthionine
- tryptophane: protéines, NAD, NADP
qu’est-ce que l’auxotrophie
incapacité à synthétiser composés nécessaires
quels sont les 2 types de lipides bactériens
phospholipides: formant membrane int et ext
undécaprényl-phosphate: transport polysaccharides au travers membrane int
quel est le phospholipide principal chez eucaryotes et ses caractéristiques
phosphatidylcholine
AG 16C avec 1 insaturation
AG 18C saturé
glycérol lié phosphate lié choline
phospholipides des membranes bactériennes et leur caractéristiques
phosphatidylglycérol: 2 chaines AG, 2 glycérol et groupe P
cardiolipine: 2 phosphatidylglycérol connecté par glycérol
phosphatidyléthanolamine: comme phosphatidylglycérol avec groupe éthanolamine
de quoi sont fait les acides gras
acétyl-CoA et malonyl-CoA
quelle enzyme forme le malonyl-CoA
acétyl-CoA carboxylase dépendante de la biotine (vitamine B8 fait à partir d’alanine et d’acétyl- CoA)
utilisation ATP
différence entre acide gras synthase I et II
I moins efficace que II
I plus grande variété
réaction de acide gras synthase II
demande 2 NADPH
réaction de réduction
quel type de réaction est nécessaire pour désaturer des AG
oxydation
quelle voie pour la désaturation des acides gras est utilisée chez bactéries vs eucaryotes
bactéries: anaérobique
eucaryotes: aérobique
par quelles enzymes est fait la désaturation anaérobique
FAbA et B
à partir de quand ecq FabA forme le double lien lors de la désaturation anaérobique
reconnait intermédiare de 10C
comment se fait la désaturation aérobique
par acide gras-CoA désaturase
quels sont les précurseurs des peptidoglycanes
UDP-GlcNac
D-Glu
L-Ala
DAP ou L-Lysine
D-Ala-D-Ala
comment former UDP-GlcNac
à partir F6P, glutamine, acétyl-CoA et UTP
comment changer conformation de L-Glu par D-Glu
glutamate racémase
comment former D-Ala-D-Ala
alanine racémase pour changer la conformation
D-Ala-D-Ala ligase
ordre des peptides du peptidoglycane
L-Ala-D-Glu-(L-Lys/DAP)-D-Ala-D-Ala
quand ecq L-Lys vs DAP utilisé dans peptidoglycane
Gram-: DAP
Gram+: L-Lys
quelle enzyme permet de flip de l’autre bord de membrane le peptidoglycane
undecaprenyl-P
puis glycosylation
quelles sont les enzymes responsables de la synthèse du peptidoglycane
MurA à F
quelles sont les 2 étapes de synthèse de purines
formation IMP puis formatin AMP/GMP à partir IMP
qu’est-ce qui est nécessaire pour former IMP
ribose-5-P, 5 ATP, glutamine, asparate et acide folique
qu’est-ce qui est nécessaire pour former AMP et GMP
AMP: asparate et GTP
GMP: NAD+, glutamine et ATP
qu’est-ce qui est nécessaire pour former UMP
commence avec glutamine, 3 ATP, ribose-5-P, asparate, NAD+
comment UMP transformé en UTP
par nucléotide diphosphate kinase qui a besoin de 2 ATP
comment former CTP
demande UTP, glutamine et ATP
transformé par CTP synthétase
comment former dTMP
UMP -> dUMP par nucléotide réductase nécessistant NADH
dUMP en dTMP par méthylène-THF
charge membrane bactérienne vs eucaryote
bactérienne: toujours chargé négativement
eucaryote: neutre
