cours 12 mcb2979 Flashcards

1
Q

quelles sont les géométries des voies anaboliques de synthèse d’a.a.

A

linéaire ou bifurquée (2 précurseurs ou 2 a.a. produits)

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Q

quels sont les précurseurs essentiels à la synthèse des a.a.

A

3-phosphoglycérate
PEP
pyruvate
acétyl-CoA
oxaloacétate
alpha-cétoglutarate
ribose-5-P
erythrose 4-P

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3
Q

quelle est la demande énergétique d’une enzyme synthase

A

demande pas ATP

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4
Q

quelle est la demande énergétique d’une enzyme synthétase

A

hydrolyse d’ATP

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5
Q

comment ajouté groupe P pour former a.a.

A
  • ajout NH4 libre pour synthèse de glutamine et glutamate
  • transamination à partir glutamine/glutamate pour les autres a.a.
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6
Q

quels a.a. sont formés à partir du 3-phosphoglycérate

A

sérine et cystéine

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7
Q

quels a.a. sont formés à partir d’oxaloacétate

A

aspartate le précurseur de : asparagine, thréonine, lysine, méthionine, acide diaminopimélique

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8
Q

quels a.a sont formés à partir de pyruvate seulement

A

alanine, valine
leucine: a aussi besoin d’acétyl-CoA

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9
Q

comment est formé de l’isoleucine

A

à partir de la thréonine formée par asparate formée par oxaloacétate

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10
Q

à quoi sert le chorismate

A
  • quinone
  • entérobactine chélateur de fer
  • acide folique: permet former purine, pyrimidines glycine et méthionine
  • tryptophane: protéines, NAD, NADP
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11
Q

qu’est-ce que l’auxotrophie

A

incapacité à synthétiser composés nécessaires

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12
Q

quels sont les 2 types de lipides bactériens

A

phospholipides: formant membrane int et ext

undécaprényl-phosphate: transport polysaccharides au travers membrane int

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13
Q

quel est le phospholipide principal chez eucaryotes et ses caractéristiques

A

phosphatidylcholine
AG 16C avec 1 insaturation
AG 18C saturé
glycérol lié phosphate lié choline

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14
Q

phospholipides des membranes bactériennes et leur caractéristiques

A

phosphatidylglycérol: 2 chaines AG, 2 glycérol et groupe P

cardiolipine: 2 phosphatidylglycérol connecté par glycérol

phosphatidyléthanolamine: comme phosphatidylglycérol avec groupe éthanolamine

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15
Q

de quoi sont fait les acides gras

A

acétyl-CoA et malonyl-CoA

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16
Q

quelle enzyme forme le malonyl-CoA

A

acétyl-CoA carboxylase dépendante de la biotine (vitamine B8 fait à partir d’alanine et d’acétyl- CoA)

utilisation ATP

17
Q

différence entre acide gras synthase I et II

A

I moins efficace que II
I plus grande variété

18
Q

réaction de acide gras synthase II

A

demande 2 NADPH
réaction de réduction

19
Q

quel type de réaction est nécessaire pour désaturer des AG

20
Q

quelle voie pour la désaturation des acides gras est utilisée chez bactéries vs eucaryotes

A

bactéries: anaérobique
eucaryotes: aérobique

21
Q

par quelles enzymes est fait la désaturation anaérobique

22
Q

à partir de quand ecq FabA forme le double lien lors de la désaturation anaérobique

A

reconnait intermédiare de 10C

23
Q

comment se fait la désaturation aérobique

A

par acide gras-CoA désaturase

24
Q

quels sont les précurseurs des peptidoglycanes

A

UDP-GlcNac
D-Glu
L-Ala
DAP ou L-Lysine
D-Ala-D-Ala

25
comment former UDP-GlcNac
à partir F6P, glutamine, acétyl-CoA et UTP
26
comment changer conformation de L-Glu par D-Glu
glutamate racémase
27
comment former D-Ala-D-Ala
alanine racémase pour changer la conformation D-Ala-D-Ala ligase
28
ordre des peptides du peptidoglycane
L-Ala-D-Glu-(L-Lys/DAP)-D-Ala-D-Ala
29
quand ecq L-Lys vs DAP utilisé dans peptidoglycane
Gram-: DAP Gram+: L-Lys
30
quelle enzyme permet de flip de l'autre bord de membrane le peptidoglycane
undecaprenyl-P puis glycosylation
31
quelles sont les enzymes responsables de la synthèse du peptidoglycane
MurA à F
32
quelles sont les 2 étapes de synthèse de purines
formation IMP puis formatin AMP/GMP à partir IMP
33
qu'est-ce qui est nécessaire pour former IMP
ribose-5-P, 5 ATP, glutamine, asparate et acide folique
34
qu'est-ce qui est nécessaire pour former AMP et GMP
AMP: asparate et GTP GMP: NAD+, glutamine et ATP
35
qu'est-ce qui est nécessaire pour former UMP
commence avec glutamine, 3 ATP, ribose-5-P, asparate, NAD+
36
comment UMP transformé en UTP
par nucléotide diphosphate kinase qui a besoin de 2 ATP
37
comment former CTP
demande UTP, glutamine et ATP transformé par CTP synthétase
38
comment former dTMP
UMP -> dUMP par nucléotide réductase nécessistant NADH dUMP en dTMP par méthylène-THF
39
charge membrane bactérienne vs eucaryote
bactérienne: toujours chargé négativement eucaryote: neutre