Cours 1 - Introduction Flashcards
Défintion d’un virus
Agent infectieux très simple, dont la structure se résume à 2 ou 3 éléments : un génome, une capside et +/- une enveloppe
Différence entre les virus à ADN et les virus à ARN
- Fidélité de la réplication : moindre pour les virus à ARN comparé aux virus à ADN
- Taille du génome : plus importante pour les virus à ADN que les virus à ARN
Qu’est-ce que la capside d’un virus
Une structure protéique stable, ayant pour rôle de protéger le génome du virus
Qu’est-ce qu’une nucléocapside
L’ensemble formé par le génome et la capside
2 conformations possibles d’une nucléocapside
- Hélicoïdale tubulaire
- Polyédrique (icosaédrique)
De quoi dérive l’enveloppe des virus ?
Des membranes cellulaires
Inconvénients de l’enveloppe pour un virus
- Fragilité vis-à-vis du monde extérieur (température) et du système digestif (pH, enzymes)
- Pas de transmission indirecte car le virus ne survit pas longtemps à l’extérieur
Caractéristique de l’herpès virus (génome, conformation, présence d’enveloppe)
- Génome : ADN
- Conformation : Icosaédrique
- Présence d’enveloppe : oui
Condition INDISPENSABLE à la survie/multiplication d’un virus
Infecter une cellule dite hôte
Pourquoi un virus doit-il infecter une cellule pour se multiplier ?
Etant donnée sa simplicité de structure, un virus n’a pas de
- d’acides aminés, acides gras, nucléotides, …
- d’énergie
- d’enzymes
Tout ces produits, retrouvés dans les cellules, sont indispensable à la multiplication du virus
De quoi dépend la multiplication d’un virus dans une cellule ?
De la sensibilité et de la permissivité de la cellule
Définition de sensibilité et permissivité
- Sensibilité : capacité d’une cellules à être infectée
- Permissivité : capacité d’une cellule à fabriquer des virions
De quoi dépend la sensibilité d’une cellule
De la présence de récepteurs et co-récepteurs viraux à sa surface
De quoi dépend la permissivité d’une cellules
- De la machinerie cellulaire
- De la présence d’enzymes virales
Quelles sont les étapes du cycle cellulaire viral ?
- L’attachement
- La pénétration
- Décapsidation
- Réplication
- Synthèse des ARNm
- Synthèse des enzymes et protéines virales
- Assemblage
- Libération
Décrire l’étape de l’attachement d’un virus dans le cycle cellulaire viral
Les protéines de la capside/de l’enveloppe interagissent avec les protéines de la membrane de la cellule hôte spécifique : un virus donné ne peut infecter qu’un nombre restreint d’espèces et de tissus
Décrire l’étape de la pénétration d’un virus dans le cycle cellulaire viral
Le virus rentre dans la cellule par endocytose pour les virus nus ou endocytose/fusion-lyse pour les virus enveloppés
Le processus du fusion-lyse implique une glycoprotéine fusogène et permet la formation d’un trou dans la membrane, permettant l’entrée du virus
Décrire l’étape de décapsidation d’un virus dans le cycle cellulaire viral
Toute le virus est détruit, sauf le génome pour que ce dernier puisse interagir avec la machinerie cellulaire
Décrire l’étape de la réplication d’un virus dans le cycle cellulaire viral
Le génome viral s’incorpore dans le génome cellulaire pour qu’il soit copié par la machinerie cellulaire.
Décrire l’étape de synthèse des ARNm d’un virus dans le cycle cellulaire viral
Pour les virus à ARN : les ARN viraux sont directement traduits par les ribosomes cellulaires
Pour les virus à ADN : après la réplication, l’ADN viral doit être transcrit en ARNm
Pour les rétrovirus : il faut d’abord transcrire l’ARN en ADN (transcription inverse) pour que le génome viral soit intégré au génome cellulaire
Décrire l’étape de synthèse des enzymes et protéines virales d’un virus dans le cycle cellulaire viral
Les virus sont capables de faire synthétiser par la cellule un panel de protéines permettant d’optimiser la fabrication de virions :
Enzymes :
- Les virus à ARN font fabriquer une réplicase, une ARN polymérase ARN dépendante pour augmenter le nombre de copie d’ARN
- Protéines transactivatrices : augmente l’activité de transcription
Protéines :
Elles sont d’abord présente sous forme d’un polypeptide géant, qui sera clivé par des protéases en plusieurs protéines virales
Décrire l’étape de l’assemblage d’un virus dans le cycle cellulaire viral
Les nouvelles protéines virale vont empaquetter par encapsidation les nouveaux génome pour former de nouveaux virus
Décrire l’étape de libération des virus dans le cycle cellulaire viral
Virus nus : éclatement de la cellule
Virus enveloppés : bourgeonnement, pour recevoir leur enveloppe
Devenir d’une cellule ayant subi une infection productive/réplicative
Très souvent, cela entraine la mort de la cellule
Devenir d’une cellule ayant subi une infection abortive
Très souvent, la cellule survit car il n’y a pas eu de production virale
Infection abortive : interruption du cycle viral avant sa complétion
Devenir d’une cellule ayant subi une infection latente
Très souvent, la cellule survit car il n’y a pas eu de production virale
Infection latente : infection pas productive, avec seulement l’expression de quelque gènes de latence
Quel(s) phénomène(s) permettent à un virus à infection latente de persister dans une cellule ? Que cela implique-t-il ?
- Evasion immune : le système immunitaire de l’organisme hôte a du mal à reconnaitre le virus
- Insensibilité aux antiviraux : il n’y a pas de réplication donc pas de possibilité d’empêcher cette réplication
Cela implique une possibilité de réactivation virale avec parfois des symptômes cliniques
Quels sont les modes de transmission virale
Horizontale et verticale
Quels sont les modes de transmission horizontale
Directe et Indirecte
De quoi dépend la transmission horizontale directe d’un virus + qques exemples de transmission
Elle dépend de la voie d’excrétion de la production virale
Ex : aérienne, oro-fécale, sexuelle…
De quoi dépend la transmission horizontale indirecte d’un virus + qques exemples de transmission
De la robustesse ou du cycle biologique du virus
Ex : aliments, eau, seringue, animaux…
Voie de transmission des virus nus ? Des virus enveloppés ?
- Virus nus : directe ou indirecte
- Virus enveloppés : directe
Qu’est-ce qu’une infection localisée ?
Une infection dont le virus se multiplie «à la porte d’entrée» (dès l’entrée dans la cellule)
Qu’est-ce qu’une infection généralisée ?
Une infection au cours de laquelle le virus diffuse par voie sanguine/lymphatique/nerveuse et se multiplie dans un organe cible à distance de la porte d’entrée
Caractéristiques d’une infection localisée
- Porte d’entrée et organe cible identique ou proche
- Durée d’incubation courte
- Signes cliniques localisés
Caractéristiques d’une infection généralisée
- Porte d’entrée et organes cibles éloignés
- Durée d’incubation longue
- Signes cliniques dépendent de l’organe cible
Quelle caractéristique de l’hôte peut influencer la multiplication virale ?
Son immunocompétence
Quelles sont les stratégies employées par les virus persistant pour évader l’immunité
- Ne pas se faire reconnaitre
- Perturber les acteurs de l’immunité
3 moyens d’un virus pour ne pas se faire reconnaître
- Exprimer peu/pas d’ag viraux
- Avoir une très grande variabilité génétique et antigénique
- Interférer avec la présentation des ag viraux
4 moyens d’un virus pour perturber l’immunité
- Perturber les cellules NK
- Perturber l’immunité innée
- Intéfere avec les molésules solubles
- Protéger la cellule infectée de la mort cellulaire
Quels sont les principaux modes de persistance virale ?
- Infection chronique : la réplication et la contagiosité est constante, à un niveau variable
- Infection intermittente : la réplication et la contagiosité sont intermittente
3 moyens d’un virus pour ne pas se faire reconnaître
Par détection des ag viraux ou détection et quantification du génome viral
Comment se fait la détection indirecte d’une infection virale ?
Par détection des ac
