cours 1 : historique de la microbiologie et classification et nomenclature Flashcards
Quelle est la définition de la microbiologie?
la science qui étudie les organismes vivants.
Que veut dire quelque chose de microscopique?
qui n’est pas visible à l’oeil nu.
Quels sont les impacts positifs des microorganisme chez les humains (4)?
- microbiote
- source de nourriture
- antibiotiques et autres molécules
- biotechnologie.
Qu’est-ce que le microbiote, définition et utilité?
un collection de microbe qui vivent avec les humains et peuvent coloniser l’organisme.
- protègent l’humain contre l’environnement et les infections, très important pour la santé.
- environ 10x plus de microorganismes que de cellules humaines.
Quels sont les impacts positifs des microorganismes dans la nature (4)?
- décomposition (recyclage)
- balance écologique
- biodégradation
- bioremédiation
Quels sont les impacts négatifs des microorganismes chez l’homme et dans la nature (4)?
- infection
- détérioration des aliments
- Corrosion
- Mauvaise odeur
Quelles sont les 6 types de microorganismes et explication?
- algues (unicellulaire)
- protozoaires (unicellulaire)
- mycètes (unicellulaire)
- bactéries
- virus (on ne sait pas si c’est vivants ou non)
- prion (protéine capable de causer certaines maladies chez l’homme).
Définition simple de la cellule.
le plus petit commun dénominateur de la matière vivante.
Quelles sont les 6 propriétés des cellules (autant eucaryotes que procaryotes) et leurs définitions?
- métabolismes: La cellule est un système ouvert permettant de prélevés des nutriments dans l’environnement et de la transformés pour ensuite éliminée les déchets dans l’environnement.
- reproduction: Les éléments chimiques de l’environnement se transforment en de nouvelles cellules sous la conduite de cellules préexistantes.
- différentiation: La formation d’une nouvelle structure dure cellulaire selon l’environnement dans laquelle elle se trouve. ex: cellules souches sont capables de se convertir.
- communication: les cellules communiquent par des échanges de molécules chimiques ex: hormone.
- mouvement: diverses formes de motilité (déplacement des cellules et mouvements internes).
- évolution: les cellules contiennent des gènes et évoluent, présentant de nouvelles propriétés biologiques ex: acquisition de gènes de résistance chez les bactéries.
Décrit la classification et ses difficultés de Carl von Linné.
Première classification:
- seulement 2 règnes, les plantes (immobile et photosynthétiques) et les animaux (mobiles et non-photosynthétiques).
difficultés suite à la découverte du monde microscopique:
- les algues (photosynthétiques) et les champignons (non-photosynthétique) sont classé parmi les plantes parce qu’ils sont immobiles.
- L’euglène possède des flagelles et utilise la photosynthèse. classé comme animal par les zoologistes et comme plante par les botanistes.
- les bactéries étaient considérés comme des plantes parce qu’elle possède une paroi cellulaire rigide.
Décrit la classification de Haeckel.
3 règnes
- plantes
- animaux (vertébré et invertébré)
- protistes (algues champignons, bactéries, protozoaires)
fondé sur l’organisation biologique (unicellulaire, pluricellulaire, différentiation tissulaire, etc).
Décrit la classification de Whittaker.
5 règnes:
- monères (bactéries)
- protistes (algues, protozoaires)
- mycètes ( champignons, levures)
- plantes
- animaux
fondé sur:
- le type de cellule (procaryotes ou eucaryotes)
- l’organisation biologique
- le type de nutrition
–> problème: on ne sait pas ou classer les virus parce qu’ils ne sont pas métaboliquement actif seul, c’est des parasites intracellulaires.
Qu’est-ce qu’un microorganismes autotrophe?
un organisme capable de fixer le CO2 pour son apport en carbone.
Qu’est-ce qu’un microorganisme hétérotrophe?
doit avoir des molécules organismes pour son apport en carbone comme les acides aminés.
Quels sont les 5 règnes de Whittaker, le type cellulaire, le niveau d’organisation et leur type de nutrition?
- monères : procaryotes, unicellulaire, autotrophe ou hétérotrophe
- protistes: eucaryotes, unicellulaires (quelques pluricellulaires), autotrophe ou hétérotrophe
- mycètes: eucaryotes, pluricellulaire (quelques unicellulaires), hétérotrophe.
- plantes: eucaryote, pluricellulaire, autotrophe
- animaux: eucaryotes, pluricellulaires, hétérotrophe.
La découverte du séquençage de l’ADN amène une nouvelle classification, qui et explique.
Par Woese
en faisant le séquençage de l’ADN, on trouve des similarité entre différents organismes, permettant de faire l’Arbre généalogique de ceux-ci. On trouve un progéniture commun nommée progénote.
on se retrouve avec 3 règnes:
- les eubactéries les archéobactéries et les eucaryotes.
La classification de Woese trouve des similitudes entre les organelles des eucaryotes et des bactéries, comment c’est expliqué?
les organelles similaires sont les chloroplastes et les mitochondries. On suppose que ces structures étaient incorporer par des cellules eucaryotes par endosymbiose et sont restés.
Selon la classification de Woese, quels 2 domaines seraient phylogénétiquement plus proches (explique dont aussi c’est quoi phylogénétiquement).
phylogénétiquement = plus proches du point de vue de l’évolution.
les archéa et les eucaryotes.
Quels types de microorganismes se trouvent dans des environnement à haute concentration de sel et de source chaude?
les halophiles extrêmes ou les hyperthermophiles = Archaes.
Quels sont les 3 domaines primaires et compare leur dimension, la paroi cellulaire, les organelles et l’ADN.
- bactérie: 1 à 10 micron de longueur , paroi cellulaire peptidoglycane, peu d’organelle, mais des pilis, un ADN bicaténaire circulaire et dans le nucléotides. Exception: certaines bactéries ont des ADN linéaires et certaines on plus d’un chromosomes bicaténaire circulaire, ADN lié à des protéines ressemblant peu aux histones. très peu d’introns.
- Archae: 1 à 10 micron de longueur, paroi cellulaire pseudopeptidoglycane, peu d’organelles, ADN bicaténaire circulaire dans le nucléotides, généralement 1 seul chromosome, ADN lié à des protéines ressemblant aux histones.peu d’introns
- eucaryotes : 10 à 100 micron de longueur, paroi cellulaire polysaccarides ou chitine pour les mycètes, beaucoup d’organelle dont un noyau, ADN bicaténaire très long et linéaire avec beaucoup d’introns, ADN associé aux histones, génome important.
Qu’est-ce que fait Robert Hooke?
décrit les moisissures et invente le mot cellule grâce à l’invention du premier microscope en 1600.
Qu’est-ce que fait Anton van Leeuwenhoek?
le premier à décrire les bactéries.
Qu’est-ce que la génération spontanée?
Un groupe de scientifiques qui pensait que la réactions de transformation des aliments se faisait de façon spontané en présence d’oxygène.
Qu’est-ce que fait Louis Pasteur?
Il réfute la théorie de la génération spontanée en ce qui concerne les microorganismes. il découvre que les microorganismes sont la cause de la transformation des aliments.