Cours 1 Flashcards
Nomme une caractéristique impérative de l’eau
Polaire
Dans l’eau, O est légèrement ____
Négatif
Dans l’eau, H est légèrement _____
Positif
Quelle est la molécule la plus abondante?
L’eau
L’eau correspond à __% de la masse cellulaire
70
Quels sont les liens les plus forts de l’eau?
Liens H
V ou F: les ions sont insolubles dans l’eau
V: solubles
Ce sont les molécules polaires ou hydrophiles qui sont solubles dans l’eau?
Une molécule polaire est une molécule hydrophile et sont aussi solubles
Est-ce que les molécules hydrophobes sont solubles dans l’eau?
non
La ____ joue un rôle dans l’organisation des structures biologiques
polarité
Les molécules amphipatiques ont une extrémité polaire =
glycérol qui est aussi hydrophile
Les molécules amphipatiques ont une extrémité non polaire =
acides gras qui sont aussi hydrophobes
Les ions inorganiques correspondent à moins de __% de la masse caire
1
V ou F: les ions inorganiques ne sont pas vrm essentiels
F
Donne un exemple qui montre que les ions inorganiques sont essentiels à plusieurs aspects du métabolisme caire
Si pas d’ion –> pas de dépolarisation –> pas d’influx nerveux, alors essentiels
Donne 7 exemples d’ions inorganiques
- Sodium –> Na+
- Potassium –> K+
- Magnésium –> Mg2+
- Calcium –> Ca2+
- Phosphate –> HPO4 2-
- Chlore –> Cl-
- Bicarbonate –> HCO3-
Quelle est la base des molécules organiques?
C
Les molécules organiques ont souvent __ et ___ comme atomes
O et N
Combien de liens peut faire un C?
4
Que donne la forme à la majorité des molécules organiques?
tétraèdre
Quelles sont les 4 classes principales des molécules organiques?
sucres, lipides, aa, acides nucléique
Quelles classes de molécules organiques sont souvent sous forme de polymères?
sucres, aa et acides nucléiques
Hydrate de C =
glucide
Les glucides comprennent les ___ et les ____
sucres simples et les polysacc
Quels sont les 4 rôles des glucides?
- Source et réserve d’E
- Marqueurs pr le transport et le repliement des prots
- Marqueurs de la surface caire
- Reconnaissance et interactions entre les c des tissus
Donne un exemples commun de sucre
D-ribose
Donne un exemples commun de lipide
Acide palmitique
Donne un exemples commun d’acides nucléiques
ATP
Donne un exemples commun d’aa
Glutamate (Glu)
Quel est le principal nutriments des c?
Monosacc
Donne un exemple de monosacc
Glucose
Donne les 2 principales fonctions des monosacc
- Fournit de l’énergie et des matériaux de base pour la synthèse de la plupart des composés caires
- Marqueurs pr l’adhésion à la matrice extracaire et le transport des prots vers l’int de la c
Quelles sont les 3 formes les plus communes de monosacc?
Hexoses, pentoses, trioses
Les monosacc sont reliés ensemble par des liens ___
Glycosidiques
Qqs monosacc =
Oligosacc
Plusieurs monosacc =
Polysacc
Quelles sont les 2 formes plus communes de polysacc?
Amidon et glycogène
Où retrouve-t-on l’amidon?
Plantes
Où retrouve-t-on le glycogène?
Animaux
Quel est le principal rôle de l’amidon et du glycogène?
Réserve
Quel est le type de configuration de l’amidon et du glycogène?
Alpha
Quel est le type de liaison glycosidique dans l’amidon et le glycogène?
Alpha (1 → 4)
Quelle est la configuration de la cellulose?
Beta
Quel est le type de liaison glycosidique dans la cellulose?
Beta (1 → 4)
Que forme la cellulose?
Des fibres végétales très résistantes
Pourquoi l’amidon et le glycogène sont digérés par les animaux, mais pas la cellulose?
Parce que la cellulose a une conformation diff, alors pas de reconnaissance par l’organismes
Quels sont les 5 principaux rôles des lipides?
- Importante réserve d’E
- Composant principal des membranes plasmiques
- Signalisation caire
- Hormones stéroidiennes
- Messagers intracaires
Les lipides les plus simples sont…
Les ag
Combien de C ont les acides gras?
16-18
Qu’ont les ag à leur extrémité?
COO-
Une chaine d’ag avec juste des C et des H est dite…
Hydrophobe
Les chaines des ag peuvent être ____ ou _____
Saturée ou insaturée
Une chaine d’ag est saturée quand…
Nombre de H maximal
Donne 2 exemples d’ag saturée
Acide palmitique et acide stéarique
Une chaine d’ag est insaturée quand…
Au moins 1 liaison double
Donne un exemple d’une chaine d’ag insaturée
Acide oléique
Quelle est la forme stable des lipides?
Triacylglycérol
Triacylglycérol est formé de quoi?
3 ag et 1 glycérol
Pourquoi le stockage de lipides est plus efficace que le stockage de glucides?
Car pr le même poids, stocke 2x + d’E
Quels sont les principaux constituants de la membrane plasmique?
Phospho
De quoi sont formés les phospho?
2 ag et 1 P reliés par un groupement polaire (glycérol)
Le P des phosphos peut être attaché à quoi? (4 choses)
Choline, sérine, inositol et éthanoalamine
Quel est le seul phospho qui n’a pas de glycérol?
Sphingomyéline
Alors que la Sphingomyéline n’a pas de glycérol, qu’a-t-il à la place?
Sérine
Quel est le principal composant de la gaine de myéline?
Sphingomyéline
Quels sont les composants des glycophospholipides?
Sucres attachés au glycérol ou à la sérine
Les glycophospholipides se trouvent surtout dans la face ____ de la membrane
Externe
Quels sont les 2 principaux rôles des glycophospholipides?
Reconnaissance des c et l’attachement à la matrice cellulaire
Donne un exemple de glycophospholipide
Glycocalyx
Quelle est la composition du cholestérol?
4 cycles de C
Les cycles du cholestérol sont-ils hydrophiles ou hydrophobes?
Hydrophobes
Quelle composante du cholestérol fait que c’est une molécules amphipatique?
OH a une extrémité
Quel est le précurseur des hormones stéroidiennes?
Cholestérol
Donne 2 exemples d’hormones stéroidiennes
Testo et estradiol
Les acides nucléiques sont les principaux constituants de ___ et ___
ADN et ARN
ADN compose le _____ _____ et se trouve dans ____ pr les euc
Matériel génétique ; noyau
Est-ce que les mitos et les chloros ont des acides nucléiques?
Oui
Les acides nucléiques sont formés à partir de _____
Polymères de nucléotides
Quels sont les 3 principaux types d’ARN avec leur fonction?
ARNm : matrice pr la synthèse des prots
ARNr et ARNt : synthèse des prots
Mise à part la synthèse des prots, donne 3 autres fonctions de l’ARN
- Régulation de l’expression des gènes
- Maturation et transport des ARN et des prots
- Catalyser les réactions chimiques
Donne les composantes des nucléotides
Purine ou pyrimidine + sucre + phosphate
Donne les composantes des nucléosides
Purine ou pyrimidine + sucre
Quelles sont les 2 purines?
Adénine et guanine
Quelles sont les 3 pyrimidines?
Thymine, cytosine et uracile
Dans un nucléotide, le groupement phosphate est lié au C__ du ___
5 ; sucre
Dans un nucléotide, la base est liée au C__ du ___
1 ; sucre
ADN ou ARN qui est plus stable? Pourquoi?
ADN, car 1 OH en moins
Comment nomme-t-on le premier phosphate?
Alpha
Comment nomme-t-on le 2e phosphate?
Beta
Comment nomme-t-on le 3e phosphate?
Gamma
La phosporylate kinase utilise quel P de l’ATP?
Gamma
Quel est le type de lien entre les acides nucléiques?
Phosphodiester
Le lien phosphodiester est entre le groupement __ en C__ et le groupement __ en C__
P en C5’ ; OH en 3’
qqs nucléotides =
oligonucléotide
plusieurs nucléotides =
polynucléotide
Polymérisation d’un nucléotide se fait dans quel sens? Et au niveau des phosphates?
- 5’ –> 3’
2. gamma vers alpha
Combien d’aa diff ds une c?
20
Quels sont les 4 groupes d’aa?
- Pas polaires
- Polaires, mais neutres
- Acides (-)
- Basiques (+)
aa non polaires sont vers int ou ext de la prot?
int
aa neutres polaires et chargés sont vers int ou ext de la prot?
ext
R des aa non polaires est surtout faite de…, alors ils sont…
C et H ; hydrophobes
Donne 2 aa pas polaires qui ont du soufre
Méthionine et cystéine
La polarité de la cystéine dépend de quoi?
Les aa voisins
Donne les 5 aa neutres polaires
- Sérine
- Thréonine
- Tyrosine
- Asparagine
- Glutamine
Quel groupement ont la Sérine, Thréonine et Tyrosine?
OH très réactifs
Quel groupement ont l’Asparagine et la Glutamine?
Amide
V ou F: Cystéine est légèrement polaire à cause du groupement SH
V
Donne les 3 aa chargés et dis si ils sont acides, basiques ou neutres
Lysine et arginine sont basiques
Histidine est neutre
Quel aa chargé est souvent impliqué dans les réactions qui demandent un échange d’ions H+?
Histidine
Donne 2 exemples d’aa acides
acide aspartique et glutamique
Lien peptide est entre les __
aa
Lien peptide est entre le groupement ___ et ____
COOH alpha et amine alpha
Chaque chaine commence par __-terminal et finit par __-terminal
N ; C
Quel type de liaison est forte et dépend du nombre d’é de valence?
Covalente
Quel type de liaison a un nombre variable et des interactions électrostatiques?
Faibles
Les liaisons faibles comprennent…
ponts H, hydrophobes et van der Waals
V ou F: un atome ne peut pas avoir plus de liens covalence que ne lui permettent ses é de valence
V
Faire un lien libère et prend de l’E?
Libère
V ou F: L’E libérée pr faire un lien = E pr le défaire
V
La proportion d’atome libre dépend de quoi?
de la constante d’équilibre Keq
Qd on approche de l’équilibre, qu’arrive-t-il?
Certaine E est libérée = E libre
Selon la 2e loi de la thermodynamique, les réactions spontanées ont un delta G positif ou négatif?
Neg
Selon la 2e loi de la thermodynamique, plus le lien est fort…
plus la variation d’E est grande, alors plus la proportion d’atomes liés est grande
Quelle est la relation entre G et Keq?
Qd G augmente, Keq diminue
Quels sont les 4 principaux liens faibles?
- van der Waals
- Hydrophobes
- Liens H
- Ioniques
Quel est le delta G pr les liens van der Waals et hydrophobes?
1-2 kcal/mol
Quel est le delta G pr les liens H et ioniques?
3-7 kcal/mol
À 25°C, E thermique génère ___ kcal/mol donc les liaisons faibles les plus ____ ont environ __ x + d’E
0,6 ; 10
Mol polaire est une mol avec des atomes ____
de polarité diff
Quel type de liaison faible se retrouve juste chez les atomes polaires?
Liens H
van der Waals se trouve chez…
toutes les mol
van der Waals dépend de quoi?
la distance entre les atomes, donc de la forme de la mol
V ou F: van der Waals nécessite des structures complémentaires
V
Qu’arrive-t-il qd 2 atomes sont à 4A?
Commence à se repousser
Par quoi est formé un dipole?
Charges + et -
V ou F: une mol non polaire peut devenir polaire
V
Comment une mol non polaire peut devenir polaire
faire un dipôle induit
Donne un exemple qui montre que van der Waals nécessite de la complémentarité
Antigène et anticorps
Quels sont les rôles des liens hydrophobes?
- Conformation 3D des prots
- Insertion des prots dans mem
- Formation de complexes protéiques
Est-ce que OH est plus fort que O-O?
oui
Plus un lien est fort, il va libérer plus ou moins d’E?
moins
E d’activation =
E nécessaire pr briser un lien covalent et permettre la création d’un nouveau lien
Hydrolyse d’un lien à grande E = ___kcal/mol
7
Quelle est la molécule la plus Etiquement importante?
ATP
Dans un lien H, accepteur est souvent positif ou négatif?
neg
Dans un lien H, H est le donneur ou d’accepteur?
Donneur
Quel type de liaison est plus forte de van der waals, mais plus faible que covalente?
Liens H
V ou F: les liens hydrophobes sont des liens directionnels
F: liens H sont des liens directionnels
À partir de __°C d’écart, le lien H est vrm plus faible
30
Dans un lien H, est-ce que l’orientation des atomes est importante? Si oui, qd pas meme direction: fort ou faible?
oui ; faible
Quelle est la longueur du lien O-H-O?
2,7 +/- 0,1
Quelle est la longueur du lien O-H-O^-?
2,63 +/- 0,1
Quelle est la longueur du lien O-H-N-?
2,88 +/- 0,13
Quelle est la longueur du lien N-H-O?
3,04 +/- 0,13
Quelle est la longueur du lien N^+-H-O?
2,93 +/- 0,1
Quelle est la longueur du lien N-H-N?
3,1 +/- 0,13
Chaque mol d’eau peut faire combien liens H?
4
L’eau se distingue des autres mol par…
Le fait qu’elle reste liquide à la T ambiante
V ou F: toutes les subs, sauf les molécules polaires, ont une solubilité limitée
V
Quels sont les 2 principaux rôles de l’ATP?
Transport d’E et stabilité
Quelle est la composition de l’ATP?
Adénine + 3 P + ribose
Augmentation du deltaG lors de l’hydrolyse de l’ATP est utilisé dans:
- Biosynthèse
- Travail mécanique
- Transport actif des molécules
Que font les molécules avec un potentiel de transfert plus fort que celui de l’ATP?
Mettre P sur ADP pr faire ATP
ATP/ADP+AMP = ___ Que cela signifie-t-il?
500 ; ATP est toujours en excès
La liaison de l’enzyme au substrat se fait préférablement pendant…
L’état de transition
Substrat se lie à l’enzyme par liens non covalents, soient:
Liens H, liens ioniques et hydrophobes
Que fait la chymotrypsine?
Capable de couper une prot en hydrolysant le lien peptide entre aa hydrophobe et aa voisin
Que dont les protéases de la famille des séries protéases?
Ont une sérine dans leur site actif et substrat est exposé de manière à ce que le lien à cliver soit à côté de la sérine, puis le OH de la sérine réagit avec le groupement acide (lysine) du substrat, ce qui libère le C-terminal de la prot, alors que le N-terminal est toujours attaché à la sérine du substrat
Les coenzymes fournissent quoi à l’enzyme?
Groupements chimiques
Quelles sont les 2 manières dont les coenzymes peuvent se fixer?
Transitoire et covalente
Décris ce qui se passe dans la fixation transitoire des coenzymes
Donne le groupement actif et libérée
Dans la fixation covalente des coenzymes, parle alors de…
Prosthétique
Donne un exemple de fixation covalente des coenzymes
Groupement heme pr des réactions oxydoréducition
Donne un exemple de fixation transitoire des coenzymes
ATP qui donne P
Souvent, les coenzymes sont des dérivés de ____ synthétisés par des ___
vitamines ; bactéries
Quelles sont les 6 grandes catégories des enzymes du génome humain?
- Oxydoreductase
- Transferase
- Hydrolase
- Lyase
- Isomerase
- Ligase
Que font les Oxydoreductase?
catalysent les réactions d’oxydoréduction où le degré d’oxydation des substrats est modifiés
Que font les Transferase?
Ajoute qqc
Que font les Hydrolase?
Clivage de qqc en libérant de l’eau
Que font les Lyase?
liaison rompue et déplacée r faire une liaison double ou système aromatique
Que font les Isomerase?
réarrangements intramoléculaires
Que font les Ligase?
met ensemble 2 molécules en utilisant de l’ATP
Est-ce que les enzymes modifient Keq?
non
Au début d’une réaction, la vitesse dépend de quoi?
Concentration du substrat
À la fin d’une réaction, la vitesse dépend de quoi?
de la vitesse maximale de l’enzyme
__ est une mesure de l’affinité entre l’enzyme et son substrat
Km
