Cours 1 Flashcards
Did you do your aminoquiz?
If yea…. Noice
If no bitch get your shit together.
Quel est la nomenclature de l’ordre des atomes de la chaine latérale d’une AA? (Lettres grecs)
α (chaine peptidique), β, Ɣ, δ, ε, ζ, η
A quel pH est protoné l’histidine et sur quel atome? Nomme l’atome et sa position.
pH < 6 sur l’azote en epsilon 2. (Le 2 n’est maybe pas a savoir)
Vrai ou Faux les AA avec une ramification carbon sur le carbon bêta fait souvent des hélices alphas.
Faux. Surtout beta.
Entres quelles valeurs se trouvent le pKa du COOH du squelette peptique.
Entre 2,0 et 2,4.
Entres quelles valeurs se trouvent le pKa du NH3 du squelette peptique.
Entre 9,0 et 9,8
Quel est le pKa de l’arginine?
Nomme le groupe chargé.
12,5
Guanidinium
Quel est le pKa de la lysine?
Nomme le groupe chargé.
10,5
Ammonium
Quel est le pKa de la tyrosine?
Nomme le groupe chargé.
10,1
Phénol
Quel est le pKa de la cystéine?
Nomme le groupe chargé.
8,3
Sulfydryl
Quel est le pKa de l’histidine?
6,0
Imidazole
Quel est le pKa de l’acide glutamique?
Nomme le groupe chargé.
4,3
Carboxyl
Quel est le pKa de l’acide aspartique?
Nomme le groupe chargé.
3,9
Carboxyl
Vrai ou Faux:
Tous les AA ont une carbon alpha asymétrique
Faux, la glycine à un carbone alpha achiral. (R2CH2)
Quelle activité optique prédomine dans le nature dans les AA.
L, (-), levrogyre
Pourquoi la liaison C-N est partiellement une liaison double?
À cause de la résonance dans la fonction amide.
Vrai ou Faux:
Les atomes du squelette peptidique sont dans le même plan.
Vrai
Vrai ou Faux:
Généralement les carbones alpha sont en trans l’un par rapport à l’autre.
Vrai
Nomme 3 traits des protéines fibreuses.
- Linéaire
- hydrophobe
- rôle structural
Nomme 5 traits des protéines globulaires.
- sphérique
- compacte
- extérieur hydrophile
- intérieur hydrophobe
- globalement hydrosoluble
Nomme 3 traits des protéines membranaires.
- chaines latérales hydrophobes
- globalement hydrophobe
- retrouvés dans des membranes cellulaires
La myoglobine est une protéine fibreuse, globulaire ou membranaire?
Globulaire
La bactériorhodopsine est une protéine fibreuse, globulaire ou membranaire?
Membranaire
Le collagène est une protéine fibreuse, globulaire ou membranaire?
Fibreuse
Quels sont les 5 déterminants de la conformation des protéines.
- séquence d’AA
- angles de torsions phi et psi
- ponts disulfures
- interactions interatomiques non-covalentes
- propriétés hydrophobes des AA
Énumère les 4 interactions interatomiques non-covalentes.
- interactions de Van der Waals
- ponts H
- interactions ioniques
- Interactions de London (hydrophobe)
Quels sont les deux facteurs majeurs affectant les interactions ioniques?
- la distance entre les charges
- la concentrations en sels
Quel facteur majeur thermodynamique favorise les interactions hydrophobes en solution aqueuses?
L’augmentation de l’entropie
Quels AA sont branchés en bêta?
Valine , isoleucine, thréonine
