Cours 1 Flashcards
Est-ce que le séquençage seul du génome peut nous permettre de comprendre un organisme
Non, puisqu’on doit encore trouver la fonction des gènes potentiels
À quoi sert le séquençage de l’ADN
Structure génome (donc gène et possiblement fonction) + phylogénie ; détecter polymorphisme ; analyse variation génétique ; prédire produit possible de fragments ADN
Nomme deux banque de gènes/séquence
NCBI et BLAST
Quelles sont les caractéristiques de bases d’un gène dans sa structure
Commence par codon d’initiation ATG (méthionine), puis reste ouvert pour minimalment 100 aa et se termine par codon de terminaison (TAA, TAG, TGA)
Quelle logiciel peut-on utilisé pour traduire une séquence d’ADN et qu’est-ce que ça peut te donner
EXPASY, te donne les séquence codante avec les différents cadres de lecture
Quand son apparu les premières technique de séquençage
Année 70
Avec quelle molécules fait-on le marquage radioactif dans la méthode de séquançage chimique et à quelle extrémité
le gamma P32 à l’extrémité 5’
Avec quelle gel purifie-t-on le fragment radioactif lors de la méthode chimique de séquençage
un gel de polyacrylamide
Quel est le principe du séquençage chimique de Maxam-Gilbert
Clivage suite à une méthylation de la base sélectionné
Quelle sont les 4 éprouvettes pour le séquençage chimique
G, A+G, C+T, C
Quels sont les étapes du séquençage chimique
Isooler ADN, déphsophorylation (5’), marquage avec kinase +ATP radioactif, digestion avec enzyme restriction, réaction de modification clivage base azoté
Quelle modifiaction a été apporté à la technique de séquançage chimique de Maxam-Gilbert
Maintenant, 3 réaction seulement : G+A, T+C, A+C
Pourquoi cette technique a été abandonné
Très capricieuse (sensibilité à la fraicheur et pureté réactif), dangereuse (radioactif, produit toxique/mutagène/explosif), doit migrer sur 2 gels diff et peut pas aller plus que 300 nt
Quelle est le principe de séquençage enzymatique
Arrêt de l’élongation de la polymérase dû à l’ajout d’un ddNTP
Quelle molécule radioactive utilise-t-on pour faire le séquençage enzymatique de sanger
Le alpha 35 souffre
