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Biochimie 2 > Cours 1 > Flashcards

Cours 1 Flashcards

1
Q

Quels sont les éléments qui constituent jusqu’à plus de 95% de la masse corporelle des mammifères

A

C, O, H et N

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2
Q

Carbone représente combien pour-cent matière sèche des substances organiques

A

50%

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3
Q

Quels sont les éléments qui constituent environ 3 % de la masse corporelle

A

Na, K, Mg, Ca, Cl, S et P

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4
Q

Les oligo éléments représentent combien de pourcentage de la biomasse indispensable aux organismes

A

<0,01%

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5
Q

Carences en fer entraîne quoi

A

Anémie

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6
Q

Carence en iode entraîne quoi

A

Perturbation du développement

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7
Q

Constitution fer

A

4 chaînes polypeptidiques qui possède chacune un heme associé à un ion Fe2+

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8
Q

Chaque heme peut fixer quoi

A

1 molécule d’O2

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9
Q

Chaque partie protéique peut s’associer à quoi

A

Au CO2

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10
Q

Symptômes anémie

A

Pâleur muqueuse
État fatigué
Baisse appétit
Détérioration qualité vie

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11
Q

Carence en iode effets :

A

Production hormones T3 et T4 par la thyroïde repose sur utilisation iode > carence iode entraîne désordres hormonaux

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12
Q

Carence en iode plus grande cause évitable de quoi

A

Retard mental

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13
Q

Qu’est ce qui a favorisé le dev cérébral humain

A

Conso aliments iodés (produits mer)

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14
Q

Carbone de Valence : caractéristiques

A

La Valence d’un élément chimique est le nombre maximal de laissions qu’il peut former avec d’autres éléments

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15
Q

Atome C tetravalent

A

Peut établir au max 4 liaisons avec d’autres atomes

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16
Q

Liaison simple du carbone

A

Lié à 4 autres atomes
- 4 liaisons vers les 4 sommets d’un tétraèdre régulier
- libre rotation des groupes d’atomes reliés aux 2 carbones
- représentation de cram

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17
Q

Représentation de cram

A

Liaisons des atomes situés dans le plan de la feuille sont indiqués par un trait fin
Liaisons des atomes qui sont au dessus du plan sont représentés par un trait épais
Liaisons au dessous du plan sont représentés par un trait hachuré

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18
Q

Carbone double liaison

A

Atome carbone lié à 3 autres atomes
- structure plane : tous les atomes de la molécule sont dans le même plan
- Angle entre les liaisons est le même pour toutes les liaisons : 120°C
- liaison double peut pas tourner librement (ça empêche rotation des groupes d’atomes reliés aux 2 carbones)

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19
Q

LIASION triple du carbone

A

Atome C lié à 2 autres atomes
- structure plane contenant les 3 atomes
- les 3 atomes sont alignés (angle de 180°)

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20
Q

Exemple de composé carbone

A

Hydrocarbure

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21
Q

Hydrocarbures

A

Molécules uniquement formés de H et de C
Peuvent être linéaires, ramifiés ou cycliques

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22
Q

Hydrocarbures ont ils un intérêt pour la biochimie ?

A

Non car participent pas volontiers à de nombreuses réactions chimiques
C’est quand d’autres atomes remplacent les H > des molécules plus réactives apparaissent = substituants

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23
Q

Les substituants les plus courants dans les cellules

A

Oxygène
Azote

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24
Q

Substituants plus rare dans les cellules

A

Souffre
Phosphore

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25
Q

Groupe fonctionnel confère quoi à une molécule

A

Propriétés et des réactivités particulières

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26
Q

Plupart molécules possèdent plusieurs groupes fonctionnels : nom ?

A

Molécule multi-fonctionnelle

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27
Q

Versatilité du carbone

A

Combinatoire chimique très riche
Permet au C d’occuper une place très importantes dans substances organiques
Permet construction molécules aux géométries diff

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28
Q

Propriétés molécule déterminées par

A

Nb et nature atomes qui les constituent
Arrangement atomes en groupes fonctionnels
Géométrie des liaisons
Géométrie 3D des molécules

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29
Q

Importance géométrie moléculaire pour les prot

A

Permet interaction avec leur ligand
Modèle clé serrure : structure tridimensionnelle enzyme permet formation surface complémentaire avec substrat

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30
Q

Isomère

A

Molécule avec même formule brute mais structure diff

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31
Q

Isomères de constitutions

A

Se distinguent par leur connectivité (succession atomes et liaisons)
(Même formule brute mais demi dev diff)

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32
Q

Stereoisomeres

A

Même connectivité mais organisation spatiale diff

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33
Q

Isomère de configuration (classe de stereoisomere)

A

Organisation 3D diff (non réversible)

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34
Q

Isomère de confirmation (classe de stereoisomere)

A

Organisation 3D diff (réversible)

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35
Q

Stereoisomere de conformation

A

Même formule brute et demi dev
Même connectivité
Mais pas même organisation 3 D (réversible)
= confomeres

Rotation autour liaison simples possible
Atomes peuvent pivoter les uns par rapport aux autres et adopter conformations diff

Lors changement conformation : pas de rupture de liaison

Fonction prot peut être modif par changement conformation

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36
Q

Stereoisomere de configuration : configuration Cis-Trans

A

Même formule brute et demi dev et connectivité
Mais organisation spatiale diff (non réversibles)

Pas de rotation autour double liaisons donc pas passage config à l’autre sans rupture liaison

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37
Q

Exemples de cis transomeres

A

Configuration Cis : substituants des atomes voisins de C se trouvent du même côté de la double liaison

Configuration Trans : substituant des atomes voisins de C se trouvent de part et d’autre de la double liaison

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38
Q

Les réactions chimiques dans la cellule

A

Oxydo réduction
Formation et rupture de liaisons
Transfert de groupes

39
Q

Réaction d’oxydo réduction permet quoi

A

Synthèse atp

40
Q

C’est quoi réaction oxydo réduction

A

Réaction chimique au cours de laquelle il se produit un échange d’électrons entre 2 molécules

41
Q

Oxydation c’est quoi

A

Libération électrons (libération énergie)

42
Q

Réduction c’est quoi

A

Consommation électron

43
Q

Électrons peuvent se balader dans le milieu ?

A

Non
Oxydation s’accompagne tjs réduction : électrons peuvent pas circuler seuls et transfères molécule à autre

44
Q

Forme réduite ou oxydée ?
NAD+

A

Oxydée

45
Q

Forme réduite ou oxydée ?
NADH

A

Réduite

46
Q

Réaction oxydo réduction entraîne passage de ions quoi ?vers quoi ? Entraîne quoi ?

A

Ions H+ contre leur gradient
Retour ions H+ dans matrice mitochondrie est couplée avec synthèse atp

47
Q

Simple liaison convalente correspond à quoi

A

Mise en commun de 2 électrons entre ces 2 atomes

48
Q

Façons rompre liaison convalente

A
  • homolyse
  • hétérolyse
49
Q

Homolyse

A

Rupture liaison convalente chaque atome retient l’un des deux électrons du doublet d’électrons liants

50
Q

Heterolyse

A

Rupture liaison convalente générant un anion et un cation. Les 2 électrons qui formait la liaison sont réassignés à un seul atome

51
Q

Nucleophile

A

Aime les charges positives

52
Q

Condensation

A

À l’origine de la formation de macromolécules

53
Q

Hydrolyse

A

À l’origine de la dégradation des macromolécules

54
Q

Phosphorylation

A

Transfert de groupes entre molécules distinctes

55
Q

Réarrangement : transfert d’un groupe au sein d’une molécule

A

Déplacement d’un substituant

56
Q

Enzymes

A

Catalysent réactions cellulaires

57
Q

Liaisons faibles

A

Forces électrostatiques généralement de faible force

58
Q

Liaison convalente facile à rompre ?

A

Non difficile

59
Q

Liaisons convalente permettent quoi

A

Association atomes et dc formation bio molécule

60
Q

Comment mesurer force d’une liaison convalente

A

Énergie qu’il faut apporter pour la rompre
Dépend :
- electronegativite
Distance electrons nucléons
Charge nucléaire
Numéro électrons impliqués

61
Q

Liaisons faibles font quoi

A

Stabilisent structure macromolécule et complexes
Permettent asso prot et ligand
Peuvent s’établir spontanément
Conduisent pas liaison durable sauf si nombreuses
Facilement t rompues

62
Q

H2O polaire ou apolaire

A

Polaire

63
Q

Ponts salins

A

Liaison faible qui se forme entre 2 ions chargés de manière opposée

64
Q

Molécules d’eau interagissent entre elles par quoi

A

Liaison hydrogène

65
Q

Liaison hydrogène se forme entre ?

A
  • un H lié à un atome électronégatif (donneur H)
  • un atome accepteur d’H ayant au moins une paire d’électrons non engagés dans une liaison convalente
66
Q

Molecules apolaires hydrophobes ?

A

Oui

67
Q

Quelle situation stable est spontanément adoptée

A

Celle où le plus de liaison faibles sont établies ou préservées

68
Q

Molécule polaires comportement avec eau

A

Liaisons h avec eau + solubles dans eau

69
Q

Molécules apolaires comportement avec eau

A

Insolubles dans eau + regroupement par effet hydrophobe

70
Q

Molécules amphipatiques comportement avec eau

A

Région hydrophile et région hydrophobe
Peuvent établir liaisons avec eau + interagir avec molécules hydrophobes

71
Q

Petites molécules chargées sont polaires ou apolaires

A

Polaires

72
Q

Force de van der waals

A

Entre 2 atomes lorsque ils sont à faible distance
Énergie très faible et diminue quand atomes s’éloignent
Quand très nombreuses

Qd atomes trop proche : répulsion
Qd attraction = répulsion : contact de van der Waals

73
Q

Rayon de van der waals

A

Distance à laquelle 2 atomes sont en contact de van der waals

74
Q

Liaisons faibles importance

A

Structure des grandes molécules (stabilité)
Stabilisé interactions prot avec ligand

75
Q

Structure proteine déterminée par

A

Établissement liaisons faibles entre ses composants
Interactions entre ses composants et le milieu environnant

76
Q

Liaisons convalente peuvent stabiliser structure 3D ?

A

Oui
Ex : pont disulfure

77
Q

Pepsine

A

Enzyme digestive liberee dans estomac
Digéré prot dans intestin grêle

78
Q

Trypsine

A

Enzyme digestive du suc pancréatique
Digére prot dans intestin grêle

79
Q

Phosphatases alcalines

A

Enzymes catalysent dephosphorilisation
Dans tous tissus organismes
Particulier concentrée dans conduits biliaires

80
Q

Estomac pH

A

<2

81
Q

Intestin grêle pH

A

Neutre

82
Q

Conduits biliaires pH

A

Entre 7,6 et 8,6

83
Q

Activité enzymatique dépend pH ?

A

Oui
Permet confiner activité enzymatique dans certaines régions organisme

84
Q

Acides forts

A

Réagissent totalement avec eau

85
Q

Acides faibles

A

En équilibre avec son conjuguée

86
Q

Plus le pka d’un acide est élevée plus l’acide est

A

Faible

87
Q

Formule pka

A

-log ka

88
Q

Quand pH < pka-1 quelle forme majoritaire

A

Acide

89
Q

Qd pH > pka+1 quelle forme majoritaire

A

Base conjuguée

90
Q

Qd pka-1 < pH < pka+1 quelle forme majoritaire

A

Acide et base conjuguée coexistent

91
Q

Calpha asymétrique ?

A

Oui car asso a 4 constituants diff

92
Q

Glycine asymétrique

A

Non

93
Q

Système tampons

A

Acide faible et sa base conjuguée

Provoque changement de ph à l’ajout d’une petite quantité d’acide ou de base

Biochimie 2 (1 decks)

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