Cour 2

Question 1

Qu’est-ce qu’une cellule?

Answer 1

Un gros paquet de molécules et macromolécules associés les unes aux autres dans un réseau complexe et formant parfois des interactions

Question 2

Que représente le delta G?

Answer 2

L’énergie libre. C’est à dire d’énergie capable de former un travail

Question 3

À quelles lois de la thermodynamique obéit delta G?

Answer 3

-Énergie est toujours conservée( rien ne se perd, rien ne se crée)
-L’entropie( le désordre) d’un système isolé augmente ou reste constante; elle ne peut que croître au cours d’une transformation

Question 4

C’est quoi l’entropie ?

Answer 4

Le degré de désordre d’un système. Il ne fait qu’agmenter au cour du temps. Il est souvent associé à la quantité d’énergie inutilisable d’un système. Pour resté ordonné, il faut sans cesse dépenser de l’énergie.

Question 5

Comment les cellules font-elles pour créer de l’ordre dans cet univers qui tend toujours vers le désordre?

Answer 5

Pour maintenir l’ordre, elle doit effectuer un flux constant de réactions chimiques ce qui nécessite beaucoup d’énergie

Question 6

Comment la cellule respecte-t-elle les 2 lois de la thermodynamique?

Answer 6

-l’énergie dégagée dans les réactions de catabolisme est conservée soit dans les molécules synthétysées ou dans la chaleur créée par la cellule
-L’énergie dissipée dans la cellule sous forme de chaleur augmente l’entropie totale du système malgré l’ordre établi à l’intérieur de la cellule

Question 7

La formation d’une molécule à partir d’atomes libère ou nécessite de l’énergie?

Answer 7

Elle en libère. Et inversement.

Question 8

Dans une réaction où molécule W+molécule X –> molécule Y+ molécule Z, qu’arrive-t-il avec l’énergie?

Answer 8

Puisque cette réaction implique le bris de certains liens mais la créations d’autres, un des deux côtés de la réaction entrainera une production d’énergie (généralement besoin de mois dénergie pour aller vers la droite). Bref, la différence entre l’énergie des deux côtés produira de l’énergie libre qui peut alors être utilisée pour accomplir un travail.

Question 9

Par rapport aux différences d’énergie impliqués dans une réaction, il existe 3 cas possible. Lequels sont-ils?

Answer 9

-réaction d’équilibre :l’état dans lequel l’énergie libre de la réaction se rapproche de 0 ( les enthalpies sont très semblables)
-Réaction spontanée : l’énergie nécessitée pour briser les liaisons des réactifs est inférieur à celle produite par la liaison des liens. Il y a donc libération d’énergie et le delta G est nécessairement négatif
-Réaction non-spontanée: nécessite un apport d’énergie pour s’effectuer dans le sens des produits car le bris des liens nécessite plus d’énergie que la création des nouveaux et possède donc un delta G positif

Question 10

Quelle mécanisme permet la réalisation d’une réaction non-spontanée?

Answer 10

Le couplage énergétique. C’est à dire en utilisant l’énergie libérée par les réactions spontanée

Question 11

Comment une enzyme réussi-t-elle à augmenter la vitesse de réaction?

Answer 11

Elle diminue l’énergie d’activation ce qui fait que plus de molécules atteingent l’énergie d’activation

Question 12

Dans une réaction réversible, pour laquelle la réaction vers la droite est spontanée qu’arrives t-il?

Answer 12

Après un certain temps les produits s’accumulent et devient beaucoup plus majoritaires par rapport aux réactifs. Le nombre de molécules ayant l’énergie d’activation est donc égale des deux côtés.

Question 13

Dans la cellule, ΔGrxn dépend de quoi?

Answer 13

-L’énergie intrinsèque des molécules
-Des contrations des produits et des réactifs à un moment précis de la réaction

Question 14

Quelles sont les paramètres qui jouent sur la complémentarité entre deux molécules?

Answer 14

La force de chaque liaisons et le nombre.

Question 15

Dans l’ordre, lauqlle est la liason chimique la moins forte à la plus forte?

Answer 15

-hydrophobes
-ponts H
-ioniques
-covalente

Question 16

Quelles propriétés confèrent les liaisons hydrogènes à un solvant particulier?

Answer 16

-propriétés de cohésion
-solvant pratiquement universel

Question 17

Quel est le principe des interactions hydrophobes?

Answer 17

L’esclusion de l’eau. En effet, les chaînes non-polaires de la molécule restent à l’intérieur de la molécule afin de minimiser ses intéractions avec l’eau

Question 18

Quels sont les groupements d’atomes qui participent le plus aux réactions chimiques des molécules organiques?

Answer 18

les groupements fonctionnels

Question 19

Qules sont les avantage de posséder des liaisons covalentes polaires par rapport aux non-polaires?(3)

Answer 19

-solubilité dams l’eau
-capacité de faire des ponts H
-Plus de réactivité chimique

Question 20

Ultimement, la forme d’une macromolécule est déterminée par quoi?

Answer 20

Par une séquence

Question 21

Donne deux exemples de molécules utilisant les intéractions intermoléculaires pour assurer leur complimentarité.

Answer 21

-ADN
-interaction antigène et anticorps

Question 22

Les chaînes d’ADN sont-elles dans le même sens ou dans le sens opposé?

Answer 22

Opposé (5’-3’ / 3’-5’)

Question 23

Qu’est-ce qu’une macromolécule?

Answer 23

assemblage de monomère ou de sous-unités plus simples.

Question 24

fini l’énoncé:
Sucres–
Acide gras–
acides aminés–
nucléotides–

Answer 24

–polysaccharides
–lipides
–protéines
–acides nucléiques

Question 25

Qu’est-ce qui permet aux structures secondaires de se créer spontanément dans l’eau?

Answer 25

Les liaisons hydrogènes qui se créent facilement entre les acides aminés

Question 26

Qu’est-ce qu’un domaine fonctionnel?

Answer 26

Une région d’une molécule ayant une activité enzymatique et/ou des sites de liaison pour d’autres molécules

Question 27

Un domaine se replie-t-il toujours de la même façon peu-importe le contexte dans lequel il se trouve?

Answer 27

oui

Question 28

q’est-ce qui détermine la fonction d’un domaine?

Answer 28

Sa forme

Question 29

Nomme 3 domaines qui font partis de plusieurs protéines

Answer 29

-kinase
-SH2
SH1

Question 30

Pourquoi dit-on de l’hémoglobine qu’il est hétérotétramère?

Answer 30

Car il possède 4 chaînes peptidiques différents mais seulement 2 sortes de ces chaînes.

Question 31

Comment est appelé le type de domaine qui utilise l’ATP comme source d’énergie?

Answer 31

ATPase

Question 32

Comment est appelé le domaine qui rompt la liaison entre 2 nucléotides?

Answer 32

endonucléase et dimérisation

Question 33

Comment est appelé le domaine qui permet l’intéraction entre 2 protéines?

Answer 33

dimerisation

Question 34

Explique la technique d’électrophorèse sur gel d’agarose.

Answer 34

Ça permet de séparer les fragments d’ADN en fonction de leur taille. En effet, puisque la molécule d’ADN est chargée négativement à notre pH, l’utilisation d’une charge négative va venir entrainé les fragments vers le cotépositif mais la migration dans le gel d’agarose influencera la vitesse de migration selon la taill des protéines.

Question 35

Quelle est la différence entre l’électrophorèse sur gel d’agarose et de polyacrymalide?

Answer 35

Le gel de polyacrymalide permet de faire migrer les protéines selon leur taille lorsquelles sont dénaturées ce qui permet une migration plutot axée sur leur poid moléculaire et non avec la forme 3D.

Question 36

Explique la technique de purification d’une protéine.

Answer 36

Extraire une protéine précise de cellules. La méthode la plus utilisée pour ce faire est celle de chromatographie sur colonne. Elle consiste à faire passer l’extrait de protéines d’une cellules sur plusieurs colones contenant une matrice solide poreuse. Celles-ci seront alors plus ou moins retardées selon leur intéraction avec la matrice poreuse.

Question 37

La technique de purification d’une protéine par chromatographie sur colone peut utiliser plusieurs types de colones selon(4):

Answer 37

-Leur charge
-Leurs tailles
-degré d’hydrophobicité
-capacité à se fixer à d’autres molécules(chromatographie d’affinité)
Cette dernière est la plus spécifique mais normalement il faut combiner plusieurs types de chromatographie.