Cour 1 biomol Flashcards

1
Q

Qu’est-ce qu’une liaison covalente ?

A

Un partage une ou plusieurs PAIRES d’électrons entre deux atomes

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Q

Qu’est-ce qu’une liaison covalente non polaire, donne moi des exemples

A

Lorsque les paires d’électrons sont réparties également entre les deux atomes comme le CH4 ou le O2

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3
Q

Comment se forme les liaisons hydrogènes ?

A

elle survient lorsqu’un atome d’hydrogène déjà lié par une liaison covalente à un atome plus électronégatif se voit attirer par un autre atome électronégatif

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4
Q

Dit moi du plus grand au plus petit l’énergie libre des différent type de liaisons

A
Covalente non polaire
Covalente polaire
Ionique
Liaison H
Force de van der wall
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5
Q

La liaison phosphodiester est une liaison de quel type ?

A

du type le plus fort, soit une liaison covalente de chaque coté C3’-O-P-O-C5’

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6
Q

Quelles sont les trois composantes d’un nucléotide ?

A

Un sucre de 5 carbone
un groupement phosphate
une base azoté

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7
Q

purine ?

A

Adénine et Guanine

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8
Q

Pyrimidine ?

A

Cytosine et thymine

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9
Q

Qu’est ce que la structure secondaire ?

A

Lorsque les liens hydrogène viennent réunir les deux partie de l’ADN

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10
Q

Qu’est ce qui ets libéré lors de la polymérisation du brin d’ADN ?

A

un pyrophosphate

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11
Q

Pourquoi la libération d’un pyrophosphate est-elle nécessaire pour la polymérisatin d’un brin d’ADN ?

A

Parce que c’est de là que prvient l’énergie nécessaire à l’assemblage des nucléotides

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12
Q

D’où vient L’aspect acide de l’acide désoxyribonucléique et qu’est ce que cela implique ?

A

Du O- accroché sur les groupements phosphate de l’ADN. L’ADN est donc de charge négative

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13
Q

Quels sont les 3 autres fonctions des nucléotides à part la formation de l’ADN ?

A

Énergie (ATP)
Coenzyme (CoA)
AMP cyclique (signalisation)

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14
Q

Quels sont les deux conditions à la formation du brin D’ADN ?

A

Bases Azotés qui sont complémentaires

Orientation anti-parallèle

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15
Q

Les liaisons H ne se formeront que si ?

A

L’orientation est antiparallèle

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16
Q

Dans quel sens se lit l’ADN ?

A

5’ vers 3’

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17
Q

Vers quel côté tourne l’ADN ?

A

vers la droite

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18
Q

Comment arrivent-on à distinguer les nucléotide de l’ADN par le sillon mineur ?

A

Grâce aux profil d’atome (Accepteur, donneur, hydrogène) et la forme atomique exposée

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19
Q

Comment peut-on dénaturer l’ADN ?

A

Avec la température ou le pH de la solution (+ alcaline)

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20
Q

Quels sont les techniques d’hybridation sur filtre ?

A

Southern and northern

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21
Q

Qu’est ce qui permet une visualisation direct de certaines séquences d’ADN ?

A

L’immunocytochimie

22
Q

Est-ce que southern and northern nous permettent de savoir où se situe une séquence d’ADN ?

A

NON, ils nous permettent seulement de savoir s’ils existent, northern nous permet par contre se savoir si c’est traduit

23
Q

Snow drop ?

A

Southern - DNA
Northern - RNA
Western - Protein

24
Q

Dans la cellule végétale, qui possède de l’ADN à part le noyau

A

Les chloroplastes et les mitochondries

25
Q

Qu’est ce qu’un gène ?

A

Un caractère transmissible (héréditaire) et porté par l’ADN.
Un ensemble de segments d’acides nucléiques contenant l’information nécessaire pour produire un ARN fonctionnel de façon contrôlée.

26
Q

Parle moi des gêne procaryotes

A

Ils sont transcrit en OPÉRONS (petit bout avec plusieurs gènes dedans) qui codent pour plusieurs protéine différentes qui sont impliquées dans le même métabolisme

27
Q

C’est quoi la densité génique ?

A

le nombre de gènes par mégabase(Mb) d’ADN

28
Q

Quel est le pourcentage d’introns dans l’ADN transcrit en ARN ?

A

95%

29
Q

Les télomère, les centromères et les microsatéllite font partie de quel type de séquence dans le génome

A

Ils font partie des séquences hautement répétitives de l’ADN intergénique

30
Q

Quel est le pourcentage d’ADN codant

A

1,5%

31
Q

Qu’est-ce que le nucléoïde ?

A

Empaqueté dans une structure appelée nucléoïde située directement dans le cytoplasme, pas de membrane.

32
Q

Pourquoi dit-on que le nucléoïde est dynamique

A

PArce que ses boucles peuvent se défait pour libérer l’ADN empaqueté et le message quelle contient

33
Q

Qui est le plus condensé ? chromosome ou chromatine?

A

Chromosome

34
Q

À quelle phase de la réplication l’ADN est-il en chromatine ?

A

À l’interphase

35
Q

Sous quelle forme est l’ADN durant la mitose ?

A

chromosome

36
Q

La moitier du poid de l’ADN provient de ?

A

Des histones (protéines)

37
Q

Quelles sont les formes de la chromatines et quelle taille ont-elles ?

A

Hétérochromatine: fibres condensées30 nm

Euchromatine: fibres étendues10 nm (régionsactives)

38
Q

1er niveau de condensation de l’ADN ?

A

Nucléosome

39
Q

de quoi est fait le noyau du nucléosome ?

A

8 histones

40
Q

Quel est la charge (+ ou - ) des nucléosomes ?

A

+ comme ça ils s’attachent à l’ADN (-)

41
Q

quel sillon est retourné sur les nucléosomes ?

A

le sillon mineur

42
Q

À quoi servent les histones H2A, H2B, H3 et H4

A

Le tétramère H3-H4 se lie à l’ADN en premier. Il induit une courbure dans l’ADN et l’enroule.
Les deux dimères H2A-H2B se joignent ensuite au complexe et le stabilisent

43
Q

Quel type de liaison entour l’ADN autour des nucléosomes ?

A

40 liaisons H

44
Q

Qu’est ce qui maintient l’ADN enroulé en chromosome ?

A

Les queues N des histones qui forment les nucléosomes.

45
Q

qui est ce qui ressert les nucléosomes ?

A

L’histone H1

46
Q

qui sont les protéines de l’échafaudage nucléaire

A

•les topoisomérases II: participent au maintien de la structure et s’assurent que les boucles demeurent séparées l’une de l’autre
•les protéines SMC:
participent au maintien
(les mêmes protéines
sont impliquées dans l’agence ment de deux chromatides soeurs en
1 chromosome)

47
Q

À quoi servent les complexes remodelant

A

À rendre l’ADN enrouler dans les nucléosomes accessible ou non

48
Q

PAr qui sont recruté les complexes remodelants ?

A

les facteurs de transcription

les queues N-terminalesdes histones

49
Q

qui ets le complex médiateur et à quoi sert-il ?

A

Énorme complexe protéique qui contient des modificateurs de nucléosomes et des remodeleursde la chromatine.
Il s’associe avec l’ARN polymérase II et différents facteurs de transcription spécifiques

50
Q

À quoi sert le complex FACT ?

A

Le complexe FACT est capable d’enlever un dimère H2A-H2B du coeur du nucléosome qui se trouve devant l’ARN pol. Cela donne suffisamment d’espace à l’enzyme pour transcrire l’ADN enroulé.
replace le ensuite

51
Q

qu’est-ce qu’on peut ajouter au queues dhistone quand les nucléosome sont enrouler et à quoi cela sert-il ?

A

L’ajout du CH3provoque une répression de la transcription. La queue méthylée recrute des protéines responsables de la formation d’hétérochromatine.
L’ajout d’acetyl ou du P neutralise la charge (+)de l’histone et elle interagit moins bien avec l’ADN→ l’ADNpeut être dé roulé plus facilement.

52
Q

Comment l’accessibilité à l’ADN est-elle possible ? (3)

A

=complexes de modifications post-traductionnelles des queues d’histones
=le positionnement de variants d’histones
=complexes remodelants