Cour 1 biomol Flashcards
Qu’est-ce qu’une liaison covalente ?
Un partage une ou plusieurs PAIRES d’électrons entre deux atomes
Qu’est-ce qu’une liaison covalente non polaire, donne moi des exemples
Lorsque les paires d’électrons sont réparties également entre les deux atomes comme le CH4 ou le O2
Comment se forme les liaisons hydrogènes ?
elle survient lorsqu’un atome d’hydrogène déjà lié par une liaison covalente à un atome plus électronégatif se voit attirer par un autre atome électronégatif
Dit moi du plus grand au plus petit l’énergie libre des différent type de liaisons
Covalente non polaire Covalente polaire Ionique Liaison H Force de van der wall
La liaison phosphodiester est une liaison de quel type ?
du type le plus fort, soit une liaison covalente de chaque coté C3’-O-P-O-C5’
Quelles sont les trois composantes d’un nucléotide ?
Un sucre de 5 carbone
un groupement phosphate
une base azoté
purine ?
Adénine et Guanine
Pyrimidine ?
Cytosine et thymine
Qu’est ce que la structure secondaire ?
Lorsque les liens hydrogène viennent réunir les deux partie de l’ADN
Qu’est ce qui ets libéré lors de la polymérisation du brin d’ADN ?
un pyrophosphate
Pourquoi la libération d’un pyrophosphate est-elle nécessaire pour la polymérisatin d’un brin d’ADN ?
Parce que c’est de là que prvient l’énergie nécessaire à l’assemblage des nucléotides
D’où vient L’aspect acide de l’acide désoxyribonucléique et qu’est ce que cela implique ?
Du O- accroché sur les groupements phosphate de l’ADN. L’ADN est donc de charge négative
Quels sont les 3 autres fonctions des nucléotides à part la formation de l’ADN ?
Énergie (ATP)
Coenzyme (CoA)
AMP cyclique (signalisation)
Quels sont les deux conditions à la formation du brin D’ADN ?
Bases Azotés qui sont complémentaires
Orientation anti-parallèle
Les liaisons H ne se formeront que si ?
L’orientation est antiparallèle
Dans quel sens se lit l’ADN ?
5’ vers 3’
Vers quel côté tourne l’ADN ?
vers la droite
Comment arrivent-on à distinguer les nucléotide de l’ADN par le sillon mineur ?
Grâce aux profil d’atome (Accepteur, donneur, hydrogène) et la forme atomique exposée
Comment peut-on dénaturer l’ADN ?
Avec la température ou le pH de la solution (+ alcaline)
Quels sont les techniques d’hybridation sur filtre ?
Southern and northern
Qu’est ce qui permet une visualisation direct de certaines séquences d’ADN ?
L’immunocytochimie
Est-ce que southern and northern nous permettent de savoir où se situe une séquence d’ADN ?
NON, ils nous permettent seulement de savoir s’ils existent, northern nous permet par contre se savoir si c’est traduit
Snow drop ?
Southern - DNA
Northern - RNA
Western - Protein
Dans la cellule végétale, qui possède de l’ADN à part le noyau
Les chloroplastes et les mitochondries
Qu’est ce qu’un gène ?
Un caractère transmissible (héréditaire) et porté par l’ADN.
Un ensemble de segments d’acides nucléiques contenant l’information nécessaire pour produire un ARN fonctionnel de façon contrôlée.
Parle moi des gêne procaryotes
Ils sont transcrit en OPÉRONS (petit bout avec plusieurs gènes dedans) qui codent pour plusieurs protéine différentes qui sont impliquées dans le même métabolisme
C’est quoi la densité génique ?
le nombre de gènes par mégabase(Mb) d’ADN
Quel est le pourcentage d’introns dans l’ADN transcrit en ARN ?
95%
Les télomère, les centromères et les microsatéllite font partie de quel type de séquence dans le génome
Ils font partie des séquences hautement répétitives de l’ADN intergénique
Quel est le pourcentage d’ADN codant
1,5%
Qu’est-ce que le nucléoïde ?
Empaqueté dans une structure appelée nucléoïde située directement dans le cytoplasme, pas de membrane.
Pourquoi dit-on que le nucléoïde est dynamique
PArce que ses boucles peuvent se défait pour libérer l’ADN empaqueté et le message quelle contient
Qui est le plus condensé ? chromosome ou chromatine?
Chromosome
À quelle phase de la réplication l’ADN est-il en chromatine ?
À l’interphase
Sous quelle forme est l’ADN durant la mitose ?
chromosome
La moitier du poid de l’ADN provient de ?
Des histones (protéines)
Quelles sont les formes de la chromatines et quelle taille ont-elles ?
Hétérochromatine: fibres condensées30 nm
Euchromatine: fibres étendues10 nm (régionsactives)
1er niveau de condensation de l’ADN ?
Nucléosome
de quoi est fait le noyau du nucléosome ?
8 histones
Quel est la charge (+ ou - ) des nucléosomes ?
+ comme ça ils s’attachent à l’ADN (-)
quel sillon est retourné sur les nucléosomes ?
le sillon mineur
À quoi servent les histones H2A, H2B, H3 et H4
Le tétramère H3-H4 se lie à l’ADN en premier. Il induit une courbure dans l’ADN et l’enroule.
Les deux dimères H2A-H2B se joignent ensuite au complexe et le stabilisent
Quel type de liaison entour l’ADN autour des nucléosomes ?
40 liaisons H
Qu’est ce qui maintient l’ADN enroulé en chromosome ?
Les queues N des histones qui forment les nucléosomes.
qui est ce qui ressert les nucléosomes ?
L’histone H1
qui sont les protéines de l’échafaudage nucléaire
•les topoisomérases II: participent au maintien de la structure et s’assurent que les boucles demeurent séparées l’une de l’autre
•les protéines SMC:
participent au maintien
(les mêmes protéines
sont impliquées dans l’agence ment de deux chromatides soeurs en
1 chromosome)
À quoi servent les complexes remodelant
À rendre l’ADN enrouler dans les nucléosomes accessible ou non
PAr qui sont recruté les complexes remodelants ?
les facteurs de transcription
les queues N-terminalesdes histones
qui ets le complex médiateur et à quoi sert-il ?
Énorme complexe protéique qui contient des modificateurs de nucléosomes et des remodeleursde la chromatine.
Il s’associe avec l’ARN polymérase II et différents facteurs de transcription spécifiques
À quoi sert le complex FACT ?
Le complexe FACT est capable d’enlever un dimère H2A-H2B du coeur du nucléosome qui se trouve devant l’ARN pol. Cela donne suffisamment d’espace à l’enzyme pour transcrire l’ADN enroulé.
replace le ensuite
qu’est-ce qu’on peut ajouter au queues dhistone quand les nucléosome sont enrouler et à quoi cela sert-il ?
L’ajout du CH3provoque une répression de la transcription. La queue méthylée recrute des protéines responsables de la formation d’hétérochromatine.
L’ajout d’acetyl ou du P neutralise la charge (+)de l’histone et elle interagit moins bien avec l’ADN→ l’ADNpeut être dé roulé plus facilement.
Comment l’accessibilité à l’ADN est-elle possible ? (3)
=complexes de modifications post-traductionnelles des queues d’histones
=le positionnement de variants d’histones
=complexes remodelants
