Contrôle de l'expression chez les eucaryotes Flashcards
Qu’est-ce qui différencie les cellules d’un organisme?
Le degré d’expression des gènes.
Comment peut-on quantifier le degré d’expression d’un gène?
En mesurant l’abondance des transcrits de ce gène dans une cellule (transcriptome).
La majorité des gènes sont exprimés spécifiquement dans une cellule.
Faux. Seulement 10%.
La majorité des gènes sont exprimés dans presque toutes les cellules.
Expliquer la technique de puces à ADN.
Synthèse d’oligos spécifiques à tous les gènes présents dans le génome.
Hybridation des ARNm isolés d’un tissu à la puce.
Rouge = diminution
Blanc = inchangé
Bleu = augmentation
Ne permet pas de quantifier le niveau relatif d’expression.
Les régions condensées des chromosomes sont transcriptionnellement inactives.
Vrai. L’ADN de ces régions n’est pas disponible pour la transcription.
L’euchromatine est transcrite dans son intégralité.
Pas nécessairement. L’expression des gènes dépend de plusieurs facteurs autres que l’accession à l’ADN.
Qu’est-ce que le corpuscule de Barr?
Le chromosome X inactif chez la femelle.
Il est condensé et visible à l’interphase.
Qu’est-ce qui confirme expérimentalement que l’ADN transcrit est sous forme décondensée?
La chromatine est plus facilement digérée par la DNAse dans les régions où un gène est transcrit.
Exemple: gènes de globine sont dégradés mais pas ovalbumine.
Que sont les HMG?
High mobility group proteins.
Très basiques: elles peuvent interagir facilement avec l’ADN.
Elles sont capables de lier l’ADN et d’en modifier l’architecture, ce qui permet la fixation de protéines régulatrices de la transcription.
Quelle technique permet d’identifier les régions de la chromatine décondensées?
Technique FAIRE de pontage au formaldéhyde:
cross-link chromatin + formaldehyde
phenol-chloroform extract
les résidus sont les séquences qui correspondent aux sites d’hypersensibilité à la DNAse, aux sites de début de transcription et aux promoteurs actifs.
Qu’est-ce que l’immunoprécipitation de la chromatine (ChIP)?
Une technique permettant d’identifier in vivo les protéines associées à une région précise de la chromatine.
Après pontage in vivo, la chromatine est fragmentée puis immunoprécipitée à l’aide d’un anticorps ciblant la protéine d’intérêt.
L’ADN est ensuite isolé et identifié.
À quoi servent les régions de contrôle d’un locus (LCR)?
Ce sont des sites super-hypersensibles qui contrôlent étroitement l’expression d’un groupe de gènes.
Ils recrutent des protéines qui induisent une restructuration et permettent l’expression des gènes associés.
