Control de exp. génica Flashcards
¿Qué significa ‘El mismo ADN, diferente expresión’?
Diferentes células en un organismo multicelular pueden expresar grupos muy diversos de genes, aun cuando contienen el mismo ADN.
¿Qué determina el grupo de genes expresados en una célula?
El grupo de genes expresados en una célula determina el grupo de proteínas y de ARN funcionales que contiene.
¿Cómo responden las células diferentes a la misma señal extracelular?
Células diferentes responden de manera diferente a la misma señal extracelular.
¿Qué es una Perivascular Progenitor Cell?
Es un tipo de célula madre que puede diferenciarse en varios tipos celulares.
¿Qué es una Mesenchymal Stem Cell?
Es un tipo de célula madre que puede diferenciarse en varios tipos de tejidos, incluyendo hueso y cartílago.
¿Qué es un Myocyte?
Es una célula muscular que se encarga de la contracción del músculo.
¿Qué es un Adipocyte?
Es una célula que almacena grasa en el cuerpo.
¿Qué es un Osteoblasto?
Es una célula responsable de la formación de hueso.
¿Qué es una Neurona?
Es una célula del sistema nervioso que transmite impulsos eléctricos.
¿Qué es un Condrocito?
Es una célula que forma el cartílago.
¿Qué es la regulación génica?
La forma como una célula controla qué genes se expresan.
Menciona los tipos de control en la expresión génica.
- Control Transcripcional
- Control en el Procesamiento del RNA
- Control del Transporte y Localización del RNA
- Control Postraduccional
- Control en la Degradación del RNAm
- Control en la actividad proteíca
¿Qué controla el control transcripcional?
La activación o represión de la transcripción de genes.
¿Dónde se lleva a cabo el procesamiento del RNA?
En el núcleo celular.
Completa la frase: La _______ necesita estar bien empaquetada.
proteína
¿Qué se necesita para que el RNA sea leído?
Desamollado.
¿Cuál es el papel del RNA en la célula?
Llevar la información del ADN a la proteína.
¿Qué ocurre en el control de degradación del RNAm?
El mRNA inactivo es degradado.
¿Qué controla el transporte y localización del RNA?
La distribución del mRNA en la célula.
¿Qué se requiere para la actividad proteica?
El control postraduccional.
Verdadero o falso: La regulación génica solo ocurre en el núcleo.
Falso.
What is the role of general transcription factors?
They assist RNA polymerase II in the transcription process.
What is RNA polymerase II?
An enzyme responsible for synthesizing RNA from a DNA template.
What are DNA loops?
Structures that help bring distant regulatory elements into proximity with the promoter.
What is transcription?
The process of copying a segment of DNA into RNA.
What are regulators in transcription?
Proteins that influence the transcription of specific genes.
What are coactivators?
Proteins that increase gene expression by enhancing the activity of transcription factors.
What is the Mediator protein complex?
A multi-protein complex that serves as a bridge between transcription factors and RNA polymerase II.
What is gene X?
A specific gene that is being regulated in the transcription process.
What is ‘spacer’ DNA?
Non-coding DNA that separates functional elements within the genome.
What is TATA?
A cis-regulatory sequence that is part of the promoter region.
What is a promoter?
A region of DNA that initiates transcription of a particular gene.
What is the gene control region for gene X?
The specific DNA sequence that regulates the expression of gene X.
What is an RNA transcript?
The RNA molecule that is produced during transcription.
¿Qué es la regulación de la expresión genética a nivel transcripcional?
Es el proceso mediante el cual se controla la tasa de transcripción de un gen.
¿Qué son los elementos en cis en la regulación genética?
Son secuencias de nucleótidos que modifican la expresión de un gen, como potenciadores y silenciadores.
Define potenciadores en el contexto de la regulación genética.
Son secuencias contiguas a un gen que tienen un efecto regulador sobre la tasa de transcripción de ese gen.
Define silenciadores en el contexto de la regulación genética.
Son secuencias que disminuyen la tasa de transcripción de un gen.
¿Qué son los elementos en trans en la regulación genética?
Son proteínas que reconocen las secuencias en los potenciadores y silenciadores de transcripción.
¿Las secuencias reguladoras pueden modificar la velocidad de transcripción por sí solas?
No, necesitan de proteínas reguladoras.
¿Qué son los factores de transcripción?
Proteínas que regulan la transcripción de genes al unirse a secuencias específicas.
Completa la frase: La mayoría de las secuencias reguladoras no pueden, por sí solas, modificar la velocidad de transcripción. Necesitan de _______.
proteínas reguladoras.
¿Qué es un motivo de Leucine zipper?
Es una estructura de proteínas que consiste en 2 hélices alfa conectadas por una cadena corta de aminoácidos.
¿Cuál es la función del motivo helix-turn-helix?
Está involucrado en el desarrollo embriónico y consiste en dos hélices conectadas por un giro.
¿Qué son los motivos dedos de Zinc?
Estructuras que consisten en una hélice alfa unida a una hoja beta por un ion de zinc.
¿Cuál es la función principal de los dedos de Zinc?
Actúan como receptores de hormonas esteroides.
¿Qué caracteriza a la estructura de hélice asa hélice (HLH)?
Consiste en una hélice alfa conectada por un asa a otra hélice alfa.
¿Qué papel juegan estas estructuras en la regulación?
Forman parte de la regulación de la transcripción.
¿Qué ocurre cuando algo se dimeriza?
Se convierte en activo.
Completa la frase: El motivo zipper de Leucina está compuesto por _______.
2 hélices.
¿Qué se utiliza para identificar el surco mayor en proteínas?
Estructuras diseñadas para entrar por el surco mayor.
¿Qué es el control de la expresión génica?
Es el proceso mediante el cual se regula la transcripción de genes específicos.
¿Qué reconocen las proteínas en el DNA?
Reconocen la superficie del núcleo de histonas y el ácido nucleico.
¿Qué significa ‘breathing’ en el contexto del DNA?
Es el proceso por el cual las proteínas identifican la secuencia del DNA.
¿Qué es una secuencia cis-regulatoria?
Es una región del DNA que regula la transcripción de genes adyacentes.
¿Con qué afinidad se une un regulador típico de transcripción a su secuencia cis-regulatoria en la parte final de un nucleosoma?
Con 20 veces menor afinidad en comparación con el DNA desnudo.
¿Con qué afinidad se une un regulador típico de transcripción si su secuencia cis-regulatoria está en el medio de un nucleosoma?
Con aproximadamente 200 veces menos afinidad.
¿Dónde se reconoce mejor la secuencia en el DNA?
En el surco mayor del DNA.
¿Qué papel juega un regulador de transcripción en la estabilización de un nucleosoma?
Puede desestabilizar el nucleosoma, facilitando la unión de otro regulador.
Completa la frase: Un regulador de transcripción puede _______ el nucleosoma.
[desestabilizar]
¿Qué son los activadores en la regulación de la expresión génica?
Son elementos que actúan directamente con los factores de transcripción para regular la actividad de la RNA polimerasa.
¿Cuál es la función de los factores de transcripción específicos en relación con los potenciadores?
La unión de factores de transcripción específicos a los potenciadores controla la expresión génica.
Menciona tres procesos en los que los activadores están involucrados.
- Desarrollo
- Diferenciación
- Respuesta de las células a hormonas y factores de crecimiento.
¿Qué señal envían algunos activadores en el proceso de transcripción?
Envian la señal para que se dé el proceso de manera rápida.
Completa la frase: La unión de factores de transcripción específicos a los _______ son responsables del control de la expresión génica.
[potenciadores]
¿Qué se entiende por ‘NO TRANSCRIPTION’ en el contexto mencionado?
Indica un estado en el que no se está llevando a cabo la transcripción.
¿Qué representa ‘TATA’ en el contexto de la transcripción?
Es una secuencia que se relaciona con la iniciación de la transcripción.
¿Cuántas unidades de transcripción se mencionan en el texto?
Se mencionan 1, 2 y 100 unidades de transcripción.
¿Qué rol puede tomar un factor de transcripción?
Puede tomar el rol de actuador y represor.
Los factores de transcripción son proteínas que regulan la expresión génica al unirse a secuencias específicas en el ADN.
¿Qué es un represor en la regulación de la expresión génica?
Es una proteína que inhibe la transcripción al unirse a secuencias específicas en el ADN.
Los represores pueden bloquear la actividad de potenciadores y otros factores de transcripción.
¿Qué puede hacer un represor al unirse a un potenciador?
Puede tapar al potenciador y disminuir la capacidad de transcripción.
Esto puede afectar la fiabilidad de la expresión génica.
¿Qué es un activador en el contexto de la regulación génica?
Es una proteína que promueve la transcripción al unirse a secuencias específicas del ADN.
Los activadores ayudan a iniciar la expresión de genes específicos.
¿Dónde se unen los represores en el ADN?
Se unen a secuencias específicas dentro del ADN llamadas silenciadores.
Esta unión inhibe la transcripción de los genes.
¿Cómo pueden los represores afectar a otros factores de transcripción?
Pueden inhibir la unión de otros factores de transcripción al ADN.
Esto se puede lograr a través de la competencia por sitios de unión.
¿Cuál es una función importante de los represores?
Inhibir la expresión de genes específicos en tipos celulares inadecuados.
Esto es crucial para el desarrollo y la función adecuada de los tejidos.
¿Qué es el sitio de unión TATA?
Es un sitio específico en el ADN donde se unen factores de transcripción como el TFIID.
Este sitio es fundamental para la iniciación de la transcripción.
Complete la frase: Un represor puede _______ la superficie de activación.
enmascarar.
Esto impide que el activador realice su función en la transcripción.
¿Qué es la interacción directa con los factores generales de transcripción?
Es la forma en que los represores pueden afectar la transcripción al interactuar con los factores necesarios para iniciar la transcripción.
Esto puede implicar la inhibición de la actividad de TFIID.
En la regulación o represores, existen tres tipos, cuáles son?
Competencia del DNA para unirse(aquí el activador y el represor compiten para unirse al rnma)
Masking the activation surface (quién es el represor se pegan directamente)
Interacción directa con los factores de transcripción generales (aquí se unen a tfIId)
¿Qué son los activadores en la regulación de la expresión génica?
Son proteínas que aumentan la transcripción de genes eucariotas.
Los activadores interactúan con factores de transcripción generales y componentes de la maquinaria transcripcional.
¿Qué son los represores en la regulación de la expresión génica?
Son proteínas que disminuyen o inhiben la transcripción de genes eucariotas.
Los represores también interactúan con factores de transcripción y afectan la maquinaria transcripcional.
¿Cuál es el papel de los activadores y represores en la transcripción?
Controlan la expresión de los genes eucariotas.
Esto se logra mediante la interacción con factores de transcripción y cambios en la cromatina.
¿Cómo regulan los activadores y represores la transcripción?
Interactuando con factores de transcripción generales y modificando la estructura de la cromatina.
Esta regulación es crucial para el control de la expresión génica.
Completa la frase: Los activadores y represores modifican a las _______ para que pase o no.
histones
Verdadero o falso: La regulación de la transcripción es un mecanismo que solo involucra represores.
Falso
La regulación de la transcripción involucra tanto a activadores como a represores.
¿Qué obstáculo presenta el enrollamiento del ADN en un nucleosoma para la transcripción?
Afecta la capacidad de los factores de transcripción para unirse al ADN y la capacidad de la ARN polimerasa para transcribir.
Este enrollamiento genera una estructura que dificulta el acceso a las zonas del ADN necesarias para la transcripción.
¿Qué es la cromatina descompactada?
Es ADN que se puede leer, también conocida como eucromatina.
La eucromatina permite la transcripción activa debido a su menor condensación.
¿Qué tipo de cromatina se encuentra siempre compactada?
Heterocromatina.
La heterocromatina puede ser constitutiva, como en telómeros y centrómeros, o facultativa, que a veces se expresa y otras no.
¿Qué características tiene la eucromatina?
Regiones relativamente dispersas, poco condensadas, y ocupa la mayor parte del núcleo.
La eucromatina es la cromatina activa en la transcripción.
¿Cuál es la función del retículo endoplásmico rugoso?
Participa en la síntesis de proteínas, donde se ensamblan los ribosomas.
Los ribosomas son fundamentales para la traducción del ARN mensajero a proteínas.
¿Qué estructuras forman la envoltura nuclear?
Está formada por dos membranas.
La envoltura nuclear separa el contenido del núcleo del citoplasma celular.
¿Qué son los poros nucleares?
Estructuras que permiten el transporte de moléculas entre el núcleo y el citoplasma.
Estos poros son cruciales para el intercambio de ARN y proteínas.
La ARN polimerasa es esencial para _______.
[la transcripción del ADN].
La ARN polimerasa sintetiza ARN a partir de una plantilla de ADN.
¿Qué son los factores de transcripción generales?
Son proteínas que ayudan a la ARN polimerasa a iniciar la transcripción.
Estos factores se unen a regiones específicas del ADN para facilitar la transcripción.
¿Qué es la heterocromatina?
Regiones de la cromatina densamente empaquetadas que son inactivas y no se expresan.
Abundante en los telómeros y centrómeros.
¿Cuáles son los tipos de heterocromatina?
Facultativa y constitutiva.
La facultativa se expresa durante el desarrollo y se silencia posteriormente, mientras que la constitutiva siempre permanece condensada y silenciada.
¿Qué es la eucromatina?
Regiones de la cromatina menos empaquetadas que están activamente expresadas.
A diferencia de la heterocromatina, la eucromatina permite el acceso a los genes para su transcripción.
¿Qué es la epigenética?
Procesos y mecanismos moleculares que afectan la regulación y expresión de los genes sin modificar la secuencia genética.
Estos procesos son heredables entre organismos.
¿Cuáles son los mecanismos de regulación epigenética más comunes en humanos?
Metilación del ADN y modificaciones post-traduccionales de histonas (fosforilación, metilación, acetilación).
Estas modificaciones influyen en la expresión génica sin alterar la secuencia del ADN.
¿Qué es la metilación del ADN?
Adición de un grupo metilo al carbono 5 de la citosina (5mC).
Ocurre principalmente en citosinas que siguen a una guanina.
¿Qué efecto tiene la metilación en la expresión génica?
La metilación reduce la expresión génica.
La metilación de un promotor o de secuencias reguladoras interfiere en el inicio de la transcripción.
¿Qué ocurre cada vez que se produce metilación?
Se apagan genes y hay metilaciones que son heredables.
Esto puede influir en la expresión génica en generaciones futuras.
¿Qué son las modificaciones post-traduccionales de histonas?
Cambios en las histonas que incluyen fosforilación, metilación y acetilación.
Estas modificaciones afectan la estructura de la cromatina y, por ende, la expresión génica.
¿Qué función cumplen los microARNs (miRNAs) en la regulación génica?
Regulan la expresión génica al interferir en la traducción de ARNm.
Los miRNAs pueden actuar como represores de genes específicos.
Verdadero o falso: La heterocromatina siempre se encuentra activa.
Falso.
La heterocromatina es inactiva y no se expresa.
Completa la frase: La metilación de un promotor impide la _______ de un gen.
transcripción.
Esto significa que el gen no puede ser leído y por lo tanto no se expresa.
¿Qué cambios estructurales provoca la metilación del ADN?
Compacta el ADN y confiere un cambio conformacional en la doble cadena de ADN.
Esto hace que el ADN sea menos accesible para la maquinaria de transcripción.
¿Qué es la metilación del DNA?
Es una modificación epigenética que afecta la expresión génica mediante la adición de grupos metilo a las secuencias de DNA.
Actúa en secuencias CG que están pareadas con una secuencia CG metilada.
¿Cuál es la función de las metiltransferasas?
Catalizan la adición de grupos metilo a las secuencias de DNA.
Actúan en secuencias CG metiladas durante la división celular.
¿Qué son las modificaciones de histonas?
Son cambios químicos en las proteínas histonas que afectan la estructura de la cromatina y la expresión génica.
Incluyen acetilación, fosforilación, y otras modificaciones.
¿Cuáles son los dos dominios de las histonas?
- Unirse a otras histonas y unirse al DNA
- Amino terminal que sufre modificaciones
El dominio amino terminal se encuentra fuera del DNA.
¿Qué efecto tiene la acetilación de histonas?
Añade cargas negativas a las histonas, promoviendo la transcripción.
Implica la acción de acetiltransferasas de histonas (HAT).
¿Qué son las deacetilasas de histonas (HDAC)?
Enzimas que eliminan grupos acetilo de las histonas, actuando como represores transcripcionales.
Su actividad puede inhibir la transcripción génica.
¿Qué aminoácidos son afectados por la fosforilación de histonas?
- Serinas
- Treoninas
- Tirosinas
La fosforilación incrementa la carga negativa de las histonas.
¿Cuál es el papel de las quinasas y fosfatasas en la regulación de histonas?
- Quinasas añaden grupos fosfato
- Fosfatasas eliminan grupos fosfato
Estas modificaciones afectan la transcripción génica.
¿Qué efecto tiene la fosforilación en la transcripción?
Favorece la transcripción al incrementar la carga negativa de la histona.
Esto permite que el DNA se abra para la interacción con proteínas efectores.
¿Qué es la regulación de la expresión génica?
Es el proceso que controla cuándo y cómo se expresan los genes.
Incluye modificaciones de DNA y proteínas asociadas como histonas.
¿Cómo afecta la carga de las histonas a la interacción con el DNA?
Una carga positiva en las histonas puede favorecer la unión al DNA, mientras que una carga negativa puede inhibirla.
Esto se relaciona con las modificaciones químicas que sufren las histonas.
¿Qué son las metiltransferasas de lisina?
Enzimas que añaden grupos metilo a las lisinas en histonas
Pueden tener efectos activadores o represores sobre la transcripción dependiendo de las modificaciones
¿Cuál es el efecto de la metilación de histonas en la regulación de la expresión génica?
Puede activar o reprimir la transcripción
Depende de la ubicación y el tipo de metilación
¿Qué función tienen las demetilasas de histonas?
Eliminan grupos metilo de las histonas, permitiendo la activación transcripcional
Facilitan la descompactación de la cromatina
¿Qué efecto tiene la acetilación de histonas en la cromatina?
Añade carga negativa a las histonas y facilita el acoplamiento de los factores de transcripción
Resulta en descompactación de la cromatina
¿Qué son las HDAC?
Deacetilasas de histonas que provocan la compactación del ADN
Inhiben la transcripción al remover grupos acetilo
¿Qué tipo de cáncer está asociado con HDAC1?
Cáncer de próstata y colon
También implicado en displasia cervical
¿Qué tipo de cáncer está asociado con HDAC2?
Carcinoma gástrico y cáncer de cuello uterino
También se relaciona con carcinoma colorrectal
¿Qué rol desempeña la proteína p53?
Regula la respuesta celular al daño del ADN y controla el ciclo celular
Su expresión aberrante está relacionada con varios tipos de cáncer
¿Qué inhibidores de HDAC se mencionan?
Vorinostat, Romidepsin, Belinostat, Panobinostat
Utilizados en tratamientos oncológicos
¿Qué función tienen las HDAC de clase III?
Formación de memoria y represión de la transcripción
También implicadas en regulación epigenética
¿Qué efecto tienen los inhibidores de HDAC sobre la expresión de p53?
Inhiben la expresión de p53
Pueden revertir la represión ejercida por las HDAC
Completa la frase: Las acetiltransferasas _______ la carga de las histonas.
aumentan
¿Qué consecuencias tiene la expresión aberrante de HDAC?
Asociada a varios tipos de cáncer como neuroblastoma y glioma
Refuerza la importancia de la regulación epigenética en la oncología
¿Qué efectos tiene la regulación epigenética en el tráfico de proteínas?
Regula la adhesión y movilidad celular
Parte integral de la dinámica celular en procesos como la metástasis
Qué provocan las deacetilasas?
La compactación del ADN
Cuál es la función del gen 53
Las deacetilasas de histonas(HDAC), incrementa la carga positiva
Verdadero
HDAC
P53 en regulación
