Cladismo

Question 1

que es el cladismo:

Answer 1

Se utiliza para clasificar organismos según su historia evolutiva y sus relaciones de parentesco. solo hace uso de homologias.

Question 2

que es un cladograma:

Answer 2

diagrama en forma de árbol que representa las diferentes relaciones entre especies o grupos de especies.

Question 3

Grupos hermanos que son:

Answer 3

son cada uno de los clados definidos a partir de un nodo.

Question 4

clado que es:

Answer 4

es cada subarbol, independientemente del numero de elementos que contenga.

Question 5

raiz que es:

Answer 5

nodo que conecta todos los clados

Question 6

nodo que es:

Answer 6

punto donde una rama se bifurca en 2 ramas distintas

Question 7

rama que es:

Answer 7

representación de un linaje que conduce hasta un taxón terminal o hasta un clado.

Question 8

taxón terminal que es:

Answer 8

unidades taxonómicas menos inclusivas que están contempladas en el estudio.

Question 9

grupo monifiletico que es:

Answer 9

conjunto de organismos que incluye a un ancestro común

Question 10

Métodos que utilizan la distancia evolutiva (Solo utilizan el modelo evolutivo para calcular distancias):

Answer 10

• UPGMA
• Fitch – Margoliash
• Neighbor Joining

Question 11

Métodos que utilizan directamente el AMS (hacen uso del modelo evolutivo durante todo el proceso de creación del árbol filogenético):

Answer 11

máxima parsimonia y máxima probabilidad.

Question 12

parsimonia que es:

Answer 12

También conocida como Navaja de Ockham se refiere a la preferencia por la explicación más simple que pueda explicar un conjunto de datos.

Question 13

máxima verosimilitud que es:

Answer 13

Emplea modelos probabilísticos para seleccionar el mejor árbol que tenga la mas alta probabilidad de reflejar el proceso evolutivo real

Question 14

Modelo Jukes – Cantor (para secuencias de ADN):

Answer 14

Asume que todos los nucleótidos son substituidos con igual probabilidad, emplea función logarítmica para derivar las diferencias evolutivas que incluyen cambios ocultos.

Question 15

Modelos evolutivos más complejos, usados:

Answer 15

TN93, HKY Y GTR (estos modelos toman en cuenta más parámetros para realizar cálculos, no se usan en la práctica)

Question 16

para que sirve JModelTest:

Answer 16

para llevar a cabo la selección estadística de los mejores modelos de ajuste de la sustitución de nucleótidos.

Question 17

Inferencia Bayesiana que es:

Answer 17

La filogenia con IB se basa en el calculo de la probabilidad posterior de un árbol, la probabilidad de que el árbol sea correcto dados unos datos y un modelo evolutivo

Question 18

De acuerdo con el teorema bayesiano:

Answer 18

La probabilidad posterior para una hipótesis es proporcional a la verosimilitud multiplicada por la probabilidad previa de la hipótesis.

Question 19

Que combina el teorema para producir una probabilidad posterior:

Answer 19

Combina la probabilidad previa de un árbol con la verosimilitud.

Question 20

Cadena de Markov Monte Carlo:

Answer 20

El IB utiliza la MCMC en ligar de modelos de sustitución nucleotídica como la utiliza el ML, ya que implementarlos seria analíticamente complejo.