citronsyracykeln

Question 1

vad händer i citronsyracykeln?

Answer 1

vid närvaro av syre: piruvat → acetyl coA → komplett oxidation i citronsyracykeln.

Question 2

var sker citronsyracykeln?

Answer 2

i mitokondriens matrix

Question 3

vilka byggstenar kan gå in i citronsyracykeln?

Answer 3

karbohydrater, fettsyror, aminosyror – alla tre kan gå genom att omvandlas till acetyl coA.

Question 4

vad är syftet med csc? beskriv processen från csc till oxidativ fosforilering sammanfattat.

Answer 4

1. csc tar bort elektroner från acetyl coa.
2. csc använder elektroner för att reducera NAD+ och FAD till NADH och FADH2.
3. elektronerna släpps ifrån NADH och FADH2 när de rexoderas till NAD+ och FAD.
4. elektronerna används i elektrontranportkedjan för att skapa en protongradient.
5. protonerna används för att skapa ATP, ADP och Pi = oxidativ forsforilering.

Question 5

1. hur är mitokondrier uppbyggda?

Answer 5

mitokondrien har en matrix, en inre mitolkondrial membran och en inre mitokondrial membran.

Question 6

2. vilka metabola vägar finns i mitokondrier?

Answer 6

elektrontransportkedjan, oxidativ fosforylering, citroncyracykeln. samt en del av glukoneogenesen.

Question 7

3. vad gör att acetyl coA kan bilda en energirik bindning?

Answer 7

acetyl coA har en reaktiv sulfhydrilgrupp som sitter fast via en thoestherbindning till acetyl-gruppen, vilket innebär att hydrolys av acetyl coA → mycket negativ ΔG → fördelaktig reaktion. förflyttning av acetyl-gruppen är därför exergonisk.

Question 8

4. i vilka metabola vägar förekommer acetyl-CoA?

Answer 8

citronsyracykeln, betaoxidation och fettsyrasyntes.

Question 9

5. vad gör pyruvatdehydrogenaskomplexet?

Answer 9

omvandlar piruvat till coA genom följande formel:

pyruvate + coA + NAD+ → acetyl coA + CO2 + NADH + H+

Question 10

6. var finns pyruvatdehydrogenaskomplexet?

Answer 10

i mitokondriens matrix.

Question 11

7. vilka prostetiska grupper finns i pyruvatdehydrogenaskomplexet?

Answer 11

TTP (tyaminpyrofosfat), lipoamid (från lyponsyra) och FAD.

Question 12

vilka är de fyra stegen från piruvat till acetyl coA?

Answer 12

dekarboxylering, oxidation, överföring och regenerering. processen sker genom tre steg, men ett fjärde sista steg krävs för att återanvända enzymet.

Question 13

beskriv steg 1 i PHD-komplexet.

Answer 13

dekarboxylering:
piruvat + TTP + 2H+ → hydroxyethyl-TTP + CO2
TTP sätts på piruvatet.
enzymet E1 katalyserar reaktionen.

Question 14

beskriv steg 2 i PHD-komplexet.

Answer 14

oxidation:
hydroxyethyl-TTP + lipoamid → karbanjon av TTP + acetyllipoamid
TTP oxideras till en acetylgrupp samtidigt som den överförs till lipoamiden för att bilda en acetyllipoamid. det bildas en energirik thioester bindning mellan acetyl-gruppen och lipoamiden.
enzymet E1 katalyserar reaktionen.

Question 15

beskriv steg 3 i PHD-komplexet.

Answer 15

överföring:
coA + acetyllipoamid → acetyl coA + dhihydrolipoamid
den energirika thioesterbindningen bevaras då acetylgruppen förflyttas till coA.
enzymet E2 katalyserar reaktionen.

Question 16

beskriv steg 4 i PHD-komplexet.

Answer 16

regenerering:
dihidrolipoamid + FAD → lipoamid + FADH2
dihidrolipoamiden oxideras av FAD.
enzymet E3 katalyserar reaktionen.

Question 17

extra step: vad händer med den reducerade FADH2 efter att acetyl coA har bildats?

Answer 17

FADH2 + NAD+ → FAD + NADH + H+
FAD ger bort sina elektrioner till NAD+

Question 18

8. hur regleras pyruvatdehydrogenaskomplexet?

Answer 18

• energikvot: ATP inhiberar, ADP stimulerar
• feedbackinhibering genom acetylCoA och NADH
• feedbackaktivering genom pyruvat

Question 19

9. vad händer med pyruvatdehydrogenaskomplexet vid arsenik och kvicksilverförgiftning?

Answer 19

arsenik och kvicksilver kan binda till sulfidgrupperna på dihydrolipoamiden → inhibering av E3 → PDH-komplexet kan inte regenereras för återanvändning.

Question 20

10. vilka är intermediärerna i citronsyracykeln?

Answer 20

oxalacetat →citrat → isocitrat → α-ketoglutarat → succinyl coA → succinat →fumarat → malat → oxalacetat.

Question 21

13. vad innebär dekarboxylering?

Answer 21

oxidation av kol. det avges koldioxid.

Question 22

13. vad innebär dekarboxylering?

Answer 22

oxidation av kol. det avges koldioxid.

Question 23

14. vad innebär dehydrogenering?

Answer 23

det avges väte.

Question 24

15. vilken är citronsyracykelns summaformel?

Answer 24

acetylCoA + 3NAD+ + FAD + ADP + Pi + H2O → CoA + 2CO2 + 3NADH + FADH2 + ATP + 2H+

(detta är per pyruvat så gånger två per glukos)

Question 25

16. hur många varv i citronsyracykeln behövs för att fullständigt oxidera en glukosmolekyl?

Answer 25

två varv.

Question 26

17. hur många varv i citronsyracykeln behövs för att fullständigt oxidera en fettsyra?

Answer 26

en varv/glycerol.

Question 27

18. hur regleras citronsyracykeln?

Answer 27

(titta på tabell – kan du den?)

Question 28

19. varför behövs syre för att citronsyracykeln ska kunna vara verksam? nämn två anledningar.

Answer 28

• NAD+ och FAD reduceras under citronsyracykeln. reduktion måste alltid följas av oxidation för att de ska kunna användas igen, vilket sker i elektrontransportkedjan. om detta inte sker stoppas citronsyracykeln.
• mycket NADH inhiberar många av enzymerna i citronsyracykeln. NADH måste därför oxideras

Question 29

20. vilken två funktioner har HIF-1 och hur regleras den?

Answer 29

HIF-1 kan aktiveras av cancerceller eller vid anaerobisk träning.
två funktioner:
1. stimulerar enzymer och transportörer i glykolysen → mer förmåga att bilda ATP anaerobiskt!
2. aktiverar även VEGF = vascular endothelial growth factor → mer blodkärl åt folket!
HIF-1 aktiveras av hypoxia och hydrolyseras av prolyl hydroxylas 2 vid närvaro av syre.

Question 30

21. när kan succinat och fumarat påverka nivåerna av HIF-1 och hur sker det?

Answer 30

både succinat och fumarat är kompetitiva inhibitorer av prolyl hydroxylas 2 → stabiliserar HIF-1.