chemistry 2 Flashcards

1
Q

Kvaterna struktura odnosi se na

A

Kvaterna struktura odnosi se na proteine koji se sastoje od više od jednog polipeptidnog lanca pri čemu se svaki lanac naziva podjedinicom te na međusobni raspored podjedinica i prirodu njihovih interakcija. Podjedinice su povezane nekovalentnim vezama.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Značaj otkrivanja struktura proteina -

A

Značaj otkrivanja struktura proteina - slijed AK određuje trodimenzionalnu strukturu proteina, AK pokazuju afinitet za tvorbu pojedinih sekundarnih struktura, smatanje proteina je visoko kooperativan proces, proteini se smataju progresivnom stabilizacijom intermedijera, ne nasumice.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Hemoglobin je tetramer

A

Hemoglobin je tetramer građen od parova različitih polipeptidnih podjedinica , veže na sebe kisik (kapacitet za vezanje ovisi o hemu) ,transportira O2 iz pluća u periferno tkivo i CO2 i protone iz perifernog tkiva u pluća (protoni i CO2 potiču otpuštanje kisika - Bohrov učinak)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Hemoglobin se ponaša

A

Hemoglobin se ponaša po principima alosterije

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Mioglobin je

A

Mioglobin je hemoprotein u mišićnim stanicama, veže i transportira kisik u tikva , odnosno omogućava difuziju kisika prvenstveno u mišiće. Ima jednu prostetsku skupinu hema te veže jednu molekulu kisika.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Hem veže CO

A

Hem veže CO 25000 x jače nego kisik, ali ne dolazi do trovanja jer hem unutar mioglobina i hemoglobina ne može vezati CO u najpovoljniji položaj jer mu u tome smeta histidinski prsten.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Alosterički protein je

A

Alosterički protein je protein kod kojeg vezanje liganda ili modulatora na jedno mjesto utječe na svojstva vezanja liganda na drugim veznim mjestima tog istog proteina.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Interakcije između liganda i modulatora mogu biti

A

Interakcije između liganda i modulatora mogu biti homotropne (ligand i modulator su identične molekule) ili heterotropne (ligand i modulator različite molekule).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Dva modela kooperativnosti su

A

Dva modela kooperativnosti su zajednički model ( sve molekule hemoglobina su ili u T ili u R stanju, vezivanjem kisika uvijek postoji ravnoteža između R i T) i sekvencijski model ( vezanjem liganda na jednu podjedinicu dolazi do promjene konformacije podjedinice na koju se vezao kisik).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Građa hemoglobina - sastoji se

A

Građa hemoglobina - sastoji se od 4 podjedinice, dvije alfa i dvije beta podjedinice koje su homologne i imaju sličnu 3D strukturu te prostetske skupine hem.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

U normalnim uvjetima željezo je

A

U normalnim uvjetima željezo je dvovalnetno te može stvoriti dvije dodatne veze (peto i pesto koordinacijsko mjesto).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Kvaterna promjena strukture hemoglobina pri oksidaciji nastaje zbog a.

A

Kvaterna promjena strukture hemoglobina pri oksidaciji nastaje zbog zakretanja jednog para alfabeta podjedinica za 15 stupnjeva u odnosu na drugi što dovodi do zbijanja tetramera.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

2,3 bifosfoglicerat je

A

2,3 bifosfoglicerat je anion prisutan u eritrocitima u skoroj istoj koncentraciji kao i hemoglobin, veže se za džep unutar centra hemoglobinkog tetramera, prisutan samo u T obliku

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Fiziološki značaj 2,3 BPG-a -

A

Fiziološki značaj 2,3 BPG-a - povisuje afinitet fetalnog hemoglobina za kisik nasporam adultnog (majčinog) što omogućuje prijenos kisika s majčinih na djetetove crvene krvne stanice.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Strukturne sličnosti mioglobin-hemoglobin:

A

vStrukturne sličnosti mioglobin-hemoglobin: mioglobin i beta podjedinice hemoglobina imaju gotovo potpuno jednaku sekundarnu i tercijarnu strukturu, sličnost obuhvaća i položaj hema, 8 alfa uzvojnica i prisustvo AK sličnih svojstava na usporedivim mjestima.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Razlike u djelovanju mioglobin-hemoglobin: .

A

Razlike u djelovanju mioglobin-hemoglobin: hemoglobin je alosterički protein, mioglobin nije, vezanje kisika na hemoglobin je kooperativno, na mioglobin nije. Afinitet vezanja kisika za hb ovisi o PH i koncentraciji O2, kod mb ne, afinitet vezanja kisika za hb ovisi o koncentraciji 2,3 BPG-a, mb ne ovisi.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Enzimi su

A

Enzimi su katalizatori bioloških sistema koji ubrzavaju i usmjeravaju kemijske reakcije, posreduju u tranformaciji jednog ili više spojeva u drugi ili više novih spojeva te u transformaciji energije.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Kataliza se odvija na

A

Kataliza se odvija na specifičnom mjestu enzima koje se naziva aktivno mjesto.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Specifičnost enzima odnosi se na

A

Specifičnost enzima odnosi se na reakcije koje kataliziraju i na njihov izbor reaktanata (supstrata).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Za aktivnost enzima potrebni su

A

Za aktivnost enzima potrebni su kofaktori.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Kofaktori su

A

Kofaktori su male molekule koje utječu na katalitičku aktivnost enzima, apoenzimi su enzimi bez kofaktora, a haloenzimi su kompletni, katalitički aktivni enzimi.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Koenzimi su

A

Koenzimi su kofaktori male organske molekule, često potječu iz vitamina, a prostetske grupe čine koenzimi i enzim povezani čvrstom vezom.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

Primjer transformacije jednog oblika energije u drugi-

A

Primjer transformacije jednog oblika energije u drugi- fotosinteza ( svjetlosna energija u energiju kemijske veze) i mitohondrij ( slobodna energija malih molekula iz hrane se pretvara u slobodnu energiju putem ionskog gradijenta te potom u slobobodnu energiju ATP-a- enzim miozin transformira slobodnu energiju ATP-a mehaničku energiju za mišićnu kontrakciju).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Klasifikacija enzima

A

Klasifikacija enzima- oksidoreduktaze (kataliziraju oksidoredukcijske reakcije u stanicama), transferaze (prenošenje kemijskih grupa sa donora na akceptor), hidrolaze ( razlaganje organskih tvari uz H2O), liaze ( kataliziraju odvajanje neke kem. grupe od supstrata ili omogućuju pripajanje), izomeraze ( stvaranje izomera), ligaze (stvaranje kem.veza između kisika i ugljika, ugljika i dušika/sumpora uz utrošak kem. energije ATP,GTP…)

25
Q

Enzimi utječu na ali ne i na

A

Enzimi utječu na brzinu reakcije, ali ne i na ravnitežu.

26
Q

. Dva osnovna termodinamička pojma kem. reakcija:

A

. Dva osnovna termodinamička pojma kem. reakcija: promjena slobodne energije između produkta i reaktanta te energija potrebna da započne konverzija iz reaktanata u produkte.

27
Q

Enzim kompleks suspstrat je

A

Enzim kompleks suspstrat je prvi korak u enzimskoj katalizi , katabolička sposobnost enzima uvjetovana je najviše sposobnošću enzima da orijentira supstrat u povoljan položaj.

28
Q
  1. i 2. Dokaz postojanja ES kompleksa
A
  1. Dokaz postojanja ES kompleksa- pri konstantnoj koncentraciji enzima brzina reakcije se povećava s povećanjem koncentracije supstrata dok se ne dostigne maksimalna brzina (reakcije katalizirane enzimima pokazuju učinak zasićenja). 2 dokaz kristalografija zrakama.
29
Q

Aktivno mjesto enzima (karakteristike) je

A

Aktivno mjesto enzima (karakteristike) je područje enzima koje veže supstrat, aktivno mjesto sadrži AK ostatke koji su direktno uključeni u stvaranje i pucanje veza, koji se nazivaju katalitički ostatci. Interakcija enzima i supstrata na akt.mjestu promovira nastanak prijelaznog stanja pri čemu aktivno mjesto najviše ujteče na snižavanje rekacije >G što pospješuje brzinu reakcije.

30
Q

Zajednička obilježja aktivnih mjesta-

A

Zajednička obilježja aktivnih mjesta- aktivno mjesto je trodimenzionalan prostor koji je građen od skupina koje pripadaju različitim dijelovima aminokiselinskog slijeda, aktivna mjesta zauzimaju mali dio ukupnog volumena enzima, aktivna mjesta su pukotine, supstrati su vezani za enzime brojnim slabim vezama, specifičnost vezanja ovisi o precizno definiranom rasporedu atoma u aktivnom mjestu.

31
Q

Princip ključ i brava (Fischnerov model) - .

A

Princip ključ i brava (Fischnerov model) - oblik supstrata odgovara obliku aktivnog mjesta nevezanog enzima.

32
Q

Koshlandov model je

A

Koshlandov model je dinamički model u kojem su enzimi fleksibilni te dolazi do prostornog prilagođavanja aktivnog mjesta nakon vezanja supstrata.

33
Q

Pretpostavka Michaelis-

A

Pretpostavka Michaelis- Menten modela je kako supstrat može biti preveden u produkt samo ako dođe u funkcionalni dodir s enzimom stvarajući kompleks enzim-supstrat.

34
Q

. Alosterični enzimi ne slijede

A

. Alosterični enzimi ne slijede Michaelis- Menten-ovu kinetiku jer se sastoje od više podjedinica i aktivnih mjesta.

35
Q

Početna brzina kemijske reakcije mjeri se kada je povratna reakcija zanemariva,u praksi nakon postizanja ravnotežnog stanja ES kompleksa.

A

Početna brzina kemijske reakcije mjeri se kada je povratna reakcija zanemariva,u praksi nakon postizanja ravnotežnog stanja ES kompleksa.

36
Q

Michaelisova konstanta numerički izražava
definira se kao
ovisi o

A

Michaelisova konstanta numerički izražava afinitet enzima prema supstratu, definira se kao ona koncentracija supstrata kod koje je brzina reakcije jednaka polovici maksimalne brzine , a ovisi o supstratu te o uvjetim okoline kao što su PH i temperatura.

37
Q

Kooperativno vezanje

A

Kooperativno vezanje jer interakcija između podjedinica, vezanje supstrata na jedno aktivno mjesto enzima pospješuje vezanje supstrata na druga aktivna mjesta.

38
Q

Alosteriči enzimi su .

A

Alosteriči enzimi su glavni regulatori metaboličkih procesa u organizmu, aktivnost tih enzima može se mijenjati regulatornim molekulama koje se reverzibilno vežu na specifična mjesta.

39
Q

Inhibicija enzimske reakcije služi kao

A

Inhibicija enzimske reakcije služi kao glavni kontrolni mehanizam u biološkim sustavima.

40
Q

Inhibitori mogu biti

A

Inhibitori mogu biti kometicijski ( veže se na aktivno mjesto enzima te je kompetitivan sa supstratom za proces vezivanja na slobodni enzim), nekompeticijski ( veže se na enzim na mjesto različito od aktivnog mjesta te mijenja strukturu enzima) i akompeticijski (ne veže se na slobodan enzim nego na neki drugi oblik te posljedično smanjuje vrijednost Km i Vm.

41
Q

Vitamini su

A

Vitamini su organske molekule potrebne u malim količinama u prehrani sisavaca, djele se na one topive u vodi ili nepolarnim otapalima (masti).

42
Q

Vitamini topivi u vodi su

A

Vitamini topivi u vodi su vitamin C ( redukcijsko sredstvo) i vitamini B kompleksa (prekuzori brojnih konezima).

43
Q

Vitamini topivi u masima su

A

Vitamini topivi u masima su A (prekuzor retinala), D (regulator kalcija i fosfora u membranama), E (antioksidans u membranama) i K (čimbenik u karbiksilaciji glutamata).

44
Q

Mehanizmi katalize su

A

Mehanizmi katalize su kataliza približavanjem ( enzim vezivanjem molekula supstrata stvara usko područje visoke konc. supstrata), kiselinsko- bazna kataliza ( reakcija katalizirana kiselinom ili bazom), kataliza naprezanjem ( stabilizacija prijelaznog stanja - naprezanje ili savijanje kemijske veze koja slabi i postaje podložna kidanju), kovalentna kataliza (stvaranje kovalentne veze između enzima i jednog ili više supstrata pri čemu modificirani enzim postaje reaktant).

45
Q

Enzimi koriste

A

Enzimi koriste različite kombinacije četiriju općih mehanizma katalize.

46
Q

Ping -pong mehanizam-

A

Ping -pong mehanizam- veže se supstrat te dolazi do otpuštanja prvog produkta prije vezivanja drugog supstrata (dolazi do stvaranja prijelaznog intermedijera).

47
Q

Izoenzimi su

A

Izoenzimi su različiti enzimski oblici koji kataliziraju istu kemijsku reakciju.

48
Q

3 izoenzima kreatin kinaze (CK) su

A

3 izoenzima kreatin kinaze (CK) su CK1 (BB)-prisutan u mozgu i glatkim mišičima, nema ga u serumu, CK2 (MB)- u skeletnim mišićima i srcu ,CK3 (MM)- u mišićju i srcu,čini večinu serumskog CK.

49
Q

Razlika između kompeticijskog i nekompeticijskog inhibitora-

A

Razlika između kompeticijskog i nekompeticijskog inhibitora- komp. se vezuje na aktivno mjesto enzima i time spriječava vezanje supstrata, nekomp. inhibitor ne spriječava vezanje supstrata.

50
Q

Najčešća polisaharida –

A

Glikogen, Celuloza i Škrob

51
Q

Škrob se javlja u obliku, razgrađuju ih

A
  1. Škrob se javlja u obliku Amiloze I Amilopektina, razgrađuju ih enzim a-amilaza
52
Q

Količina škroba koju će enzim razgraditi ovisi o

A
  1. Količina škroba koju će enzim razgraditi ovisi o strukturi škroba, stupnju kristalizacije ili hidratacije te o tome da li je ugrađen u neprobavljive ili intaktne biljne stanične stijenke
53
Q
  1. Glikemijski indeks je
A
  1. Glikemijski indeks je mjera probavljivosti škrobne hrane, temelji se na određivanju koliko neka hrana povećava koncentraciju glukoze u krvi
54
Q
  1. Celuloza se sastoji, enzim koji razgrađuje –
A
  1. Celuloza se sastoji od nerazgranatih polimera glukoze, enzim koji razgrađuje – Celulaza
55
Q
  1. Lipidi su

Uloga u organizmu je

A
  1. Lipidi su heterogena skupina spojeva kojima je jedino zajedničko svojstvo das u netopljivi u void a topljivi u organskim otapalima. Uloga u organizmu je pohrana energije
56
Q
  1. Masne kiseline su
A
  1. Masne kiseline su esterski vezane uz masti I ulja. Mogu biti zasićene I nezasićene
57
Q
  1. Osnova građa zasićenih MK-
A
  1. Osnova građa zasićenih MK- octena kiselina kojoj se progresivno dodaje CH2 skupina između CH3 I COOH
58
Q
  1. Nezasićene se dijele na
A
  1. Nezasićene se dijele na mono/poli nezasićene I eikozanoide