Chapitre 8 (Régulation de la transcription chez les eucaryotes) Flashcards
Vrai ou faux : L’enhancer est un séquence d’ADN qui fixe des facteurs régulateurs de transcription qui à pour conséquence d’augmenter ou d’inhiber la transcription des gènes.
Faux, l’enhancer est une séquence amplificatrice seulement.
Qu’est-ce qu’un gène rapporteur ?
C’est un gène codant une protéine dont la présence se mesure facilement. Il permet de visualiser l’expression d’un gène d’intérêt.
Quels sont les 3 critères pour qu’un gène soit considéré comme étant “rapporteur” ?
1- Le gène doit être étranger au génome de l’organisme modifié;
2- Le produit doit permettre une visualisation précise de l’expression dans les tissus;
3- Le résultat doit être quantifiable afin de mesure l’activité du promoteur.
Pourquoi les facteurs de régulation des eucaryotes sont dit “modulaires” ?
Les facteurs de régulations nécessitent un domaine liant l’ADN et un domaine d’activation ou d’inhibition.
Quels sont les 4 types de domaines de liaison à l’ADN ?
1- Homéodomaine (Domaine qui comporte plusieurs hélices et qui forme habituellement un hétérodimère);
2- Doigt de Zinc (Domaine utilisant un atome de Zinc pour se stabiliser);
3- Agraffe à Leucine (Formé de 2 hélices a associés par interactions hydrophobes et de résidus de Leucine);
4- Hélice-Coude-Hélice (similaire à l’agraffe à Leucine mais composé de 4 hélices a reliées par une boucle).
Vrai ou faux : Les activateurs agissent rarement directement avec l’ARN Polymérase.
Vrai, ils peuvent recruter indirectement l’ARN Polymérase à travers le complexe médiateur ou à travers des facteurs modificateurs généraux.
Quels sont les différents (3) modes d’action des domaines répresseurs ?
1- Par interférence avec les activateurs;
2- Par interaction avec le complexe d’initiation pour ensuite inhiber la transcription;
3- En compactant la chromatine rendant les gènes inaccessibles.
Qu’est-ce qu’un élément isolateur ?
C’est un protéine de liaison à l’ADN qui participe à l’organisation du génome.
Quels sont les 2 types d’isolateurs ?
1- De type barrière à l’hétérochromatine (protège les domaines chromosomiques de la condensation);
2- De type bloqueur de l’action des amplificateurs (empêche l’interaction entre les éléments régulateurs et différents domaines de la chromatine).
Vrai ou faux : La modification des histones régule la transcription.
Vrai, l’ajout d’un CH3 provoque une répression de la transcription. L’ajout d’acétyle ou de phosphate neutralise la charge (+) de l’histone interagissant moins bien avec l’ADN.
Quel processus de modification de l’ADN joue un rôle important dans le phénomène d’empreinte génétique ?
La méthylation de l’ADN (les nucléotides méthylés sont habituellement des cytosines contenus dans des régions riches en CG).
Le gène Igf2 n’est pas exprimé au niveau du chromosome maternel mais est cependant exprimé au niveau du chromosome paternel. Pourquoi ?
Le site où l’élément isolateur se lie normalement est méthylée au niveau du chromosome paternel l’empêchant ainsi d’interférer avec l’enhancer (amplificateur).
Qu’est-ce que le contrôle combinatoire ?
Plusieurs gène sous l’emprise d’un même facteur.
Qu’est-ce qu’une chaîne régulatrice ?
Plusieurs gène sont sous le contrôle de plus d’un activateur de transcription agissant ensemble.
La liaison du TGFB à son récepteur provoque une série de réactions en utilisant plusieurs voies de signalisation. Quels sont les étapes de ce mécanisme ?
1- La liaison du TFGB provoque l’agrégation de ses récepteurs (RI, RII, RIII). Ces derniers sont des kinases et se phosphorylent lors de l’activation.
2- Les récepteurs-P phosphorylent des protéines Smad3.
3- Smad3 change de configuration : Elle se lie avec Smad4 et révèle un signal d’importation nucléaire (NLS).
4- Le complexe est ensuite importé au noyau, où il agira comme activateur de la transcription de gènes.