chapitre 6: régulation de la transcription chez les eucaryotes Flashcards
vrai ou faux: la transcription des eucaryotes est moins élaboré que celle des bactéries.
Faux, elle est plus élaboré.
La transcription par la Pol 2 est régulé par quoi?
Activateur (facilite l’initiation de la transcription)
Répresseurs (empêchent l’initiation de la transcription)
Quelle sont les caractéristiques des éléments régulateur chez les eucaryotes?
Site plus nombreux et sites plus éloignés
Comment se nomme la région à laquelle se lie la polymérase II.
Le promoteur
Qu’est ce qu’un enhancer?
plusieurs sites activateurs regroupés en une seule unité.
Que font intervenir les actions à distances (enhancers) ?
Des boucles d’ADN qui facilitent l’interaction entre protéines.
Vrai ou faux: un activateur lié à un enhancer peut contrôler plusieurs gènes.
vrai
Quelle est le rôle des isolateurs et éléments frontière?
lie des protéines qui ont pour but de bloquer l’activation d’un activateur lié à un enhancer. (Puisque qu’un Act. lié à un Enhan. peut contrôler plusieur gènes, besoin d’autres séquences régulatrice.)
Où sont situé les isolateurs?
entre enhancer et promoteur
Vrai ou faux: un activateur eucaryote possède un domaine de liaison à l’ADN?
Vrai, il possède un domaine de liaison à l’ADN qui permet à la protéine de se lier à l’ADN et un domaine d’activation.
Quelle activateur est responsable d’activer la transcription du gènes du galactose chez S cerevisiae?
Gal4
Vrai ou faux: Gal4 active la transcription de GAL1 en présence de galactose
vrai
Vrai ou faux: les domaines de liaison à l’ADN et d’activation de GAL4 ne sont pas distinct.
faux
De quel domaine (eucaryote, procaryote, bactérie) provient le DLA et le DA pour le site LexA?
DA = eucaryote
DLA = bactérien
C’est un gène hybride: le 3/4 C-terminaux de Gal4 est fusionné au DLA répresseur bactérien. Il active la transcription de lacZ portant un site de liaison LexA.
Vrai ou faux: Il y a une différence dans la façon dont le DLA lient l’ADN et reconnait les sites de liaison entre les procaryotes et les eucaryotes.
Faux, il n’y a pas de différence. C’est pourquoi qu’un DLA bactérien peut remplacer un DLA eucaryote. (GAL4 par LexA)
Sous quel forme la plupart des régulateur bactériens se lient à l’ADN?
Sous forme de dimère.
Vrai ou faux: Lors du liaison à l’ADN avec DLA bactérien, chaque monomère insère l’hélice a dans le petit sillon de l’ADN sur l’entièreté du site et détecte les arêtes des pb.
Faux, dans le grand sillon et sur la moitié du site, puisque l’autre monomère doit aussi se lier au site (dimère).
Sous quel motif est la plupart de protéine régulatrice bactérienne comme DLA?
Hélice-coude-hélice
vrai ou faux: le motif hélice-coude-hélice est composé de deux hélices a séparé par un court coude.
vrai
Comment le motif HCH s’insère t’il dans l’ADN?
La première hélice s’insère dans le grand sillon et reconnaît un pb spécifique. La deuxième hélice crée un contact avec le squelette de l’ADN.
Comment se nomme un DLA de type HCH chez les eucaryotes?
homéodomaine
Vrai ou faux: un homéodomaine contient une région de 60 AA très conservé.
vrai, la séquence consensus est TAATNN.
Quel est le DLA le plus commun?
Le domaine à doigts de Zn
De quoi est constitué le domaine à doigts de Zn?
D’environ 30 AA dans lequel se trouve 2 cystéine et 2 histidine.
Vrai ou faux: la structure de 30 AA d’un domaine en doigts de Zn se replie pour former 2 barreaux B antiparallèle suivis d’un hélice a.
Vrai
Vrai ou faux: l’activateur Sp1 est composé de 2 structure en doigts de Zn.
Faux, 3
Quel rôle joue une fermeture à glissière de leucines?
Elle combine les surfaces de dimérisation et de liaison à l’ADN dans une même unité structurale.
Quel est la charge globale nette d’une fermeture à glissière de leucines?
Chargé positivement, ce qui donne un avantage pour se lié à l’ADN qui est chargé négativement.
Vrai ou faux: une fermeture à glissière de leucines est suivie par une région contenant des leucines (4-6) séparées par des intervalles de 7 résidus.
Vrai, ce qui est essentielle à la dimérisation et la capacité à lier l’ADN.
Quelle est le rôle de l’hélice a dans la fermeture à glissière de leucines?
Un segment de cette hélice s’insère dans le grand sillon et un autre segment induit la dimérisation.
Vrai ou faux: C’est l’arrangement particulier des leucines du motif de fermeture à glissière de leucines qui crée les hélices a qui sont très hydrophobe.
vrai
Quelle structure est créé à partir de deux protéines avec un motif FGL?
coiled-coil
