Chapitre 6 Flashcards
Quelle est la particularité des gènes pour la transcription des eucaryotes?
Beaucoup d’espace entre les gènes et les gènes sont monocistroniques (Se dit d’un ARNm ne possédant qu’un seul cistron et qui donc code une seule chaîne polypeptidique.)
La transcription se fait pas quelles ARN polymérases?
Les ARN polymérase I, II et III
Quelles sont les particularités de l’ARN polymérase I et III? (2)
peu de variétés dans les ARN, mais nombre de transcrits
très abondants (>100000 copies par cellule)
Quelle est la différence entre l’ARN pol I et l’ARN pol III?
- ARN pol I : les ARNr 28S, 18S et 5,8S
- ARN pol III : ARNt , ARNr 5S et ARN 7S SRP
Quelles sont les particularités de l’ARN pol II? (2)
> 20000 transcrits ARNm différents par cellule.
L’abondance relative de ces transcrits varie de quelques copies à >10000. Nécessite reconnaissance de promoteurs + efficacité de transcription variable d’un promoteur à l’autre
Quelles sont les caractéristiques structurelles de l’ARN polymérase II? (2)
*Forme générale en “pince de crabe” avec
le site catalytique vers le centre Similaire à l’ARN pol des procaryotes.
)Par contre , l’ARN pol II eucaryote possède 12 sous-unités, ce qui lui permet d’interagir avec différents facteurs de transcription. (12 sous unités protomères :
RPB1 2 3…12.)
*La sous unité RPB1 a une extension C terminale (CTD) qui accomplit plusieurs fonctions nouvelles comparativement à l’ARN pol procaryote.
Qu’est ce que le domaine carboxy-terminal (CTD)?
structure spécialisée retrouvée sur le grand protomère (RPB I) de l’ARN pol II, Répétitions en tandem de l’ heptapeptide Tyr Ser Pro ThrSer Pro Ser
Qu’elles sont les fonction du domaine carboxy-terminal (CTD)? (2)
- Le CTD P (Phosphorylé) est responsable du passage de l’étape d’initiation à celle d’élongation en recrutant les facteurs d’élongation.
- Impliqué dans le recrutement des facteurs de maturation des pré ARNm . Il pourrait donc être impliqué dans le couplage de la transcription
à la maturation.
Quelles sont les séquences conservées dans les promoteurs utilisés par l’ARN pol II?
- BRE (TFIIB recognition element )
- TATA
- Inr (initiator )
- DPE ( downstream promoter element ).
Quelle est la particularité des promoteurs pour les eucaryotes?
Ils sont composés d’au moins 3 des 4 séquences conservées dans les promoteurs
Qu’est-ce que sont les facteurs de transcription généraux (ex : TFIIB)?
reconnaissent ces séquences et jouent collectivement le même rôle que la sous unité σ de E. coli.
La formation du complexe de pré initiation survient à la boîte TATA lorsqu’elle est présente. L’élément Inr est le plus fréquent chez tous les promoteurs.
Quelle est la séquence consensus des promoteurs? (4)
- 37 à -21 (TFIIB) : BRE (GGG sur CCA, CGCCC)
-31 à -26 (TBP) : TATA (TATA A sur T, A , A sur T)
-2 à +4 (TFIID) : Inr (CC sur TT, AN, TCC sur ATT)
+ 28 à + 32 (TFIID) : DPE ( A sur G, g, A sur T, CGTG)
Qu’est ce que la boîte TATA?
La formation du complexe de pré initiation survient à la boîte TATA lorsqu’elle est présente.Les gènes
activement transcrits contiennent généralement un motif conservé positionné à ≈ 25/ 35 pb (TATA) Il détermine le site d’initiation de la transcription.
Qu’arrive-t-il s’il y a une mutation à l’intérieur de la boîte TATA?
Une seule mutation à l’intérieur de la boîte TATA diminue drastiquement la transcription, mais la séquence entre la boîte TATA et le site d’initiation peut
varier sans conséquence.
Qu’est-ce que permettent les facteurs de transcription généraux (GTF)? (2)
Permettent l’association de l’ARN polymérase au promoteur et l’initiation de la transcription ouverture de l’ADN + libération du promoteur.
Généralement des complexes protéiques multimériques : composés de plusieurs sous unités.
Désignés TFIIA, TFIIB, TFIIC…
Comment on nomme les facteurs de transcriptions?
Transcription F actor + numéro de la polymérase +
une lettre spécifique à chaque facteur
Quel facteur de transcription intéragit en premier avec le promoteur?
TFIID, c’est le plus grand
Que signifie TBP?
TATA biding protein
Que signifie TAF
TBP associated factor
Quelles sont les fonctions des TAF? (2)
Les TAF reconnaissent des éléments du
promoteur basal, mais TBP-TATA est plus
forte.
Ils régulent aussi l’association TBP-TATA
en cachant le site sur le TBP.
Qu’est ce qui initie la transcrption?
Le premier facteur de transcription à lier le promoteur est TFIID . In vitro, TBP (sous unité de TFIID) suffit pour initier la transcription.
Comment agit le TBP, soit la sous unité de TFIID?
Le domaine C terminal de TBP se replie comme une selle autour de l’ADN dans la région de la boîte TATA. Il établit un contact direct avec le sillon mineur de cette région et induit un repliement local de l’ADN
Comment les autres GTF sont recrutées pour la première étape de l’initiation de la transcription?
L’association TBP-TATA est une plateforme d’échafaudage nécessaire pour recruter les autres
GTF.
Que fait TFIIB?
TFIIB lie l’ADN et la TBP. Le domaine C
terminal de TFIIB établit un contact à la fois avec TBP, l’élément BRE et l’ADN situé après TATA .
Son domaine N terminal s’étend vers le site d’initiation et fait contact avec Pol II lorsqu’elle arrive.
