Chapitre 6 Flashcards
Quelle est la particularité des gènes pour la transcription des eucaryotes?
Beaucoup d’espace entre les gènes et les gènes sont monocistroniques (Se dit d’un ARNm ne possédant qu’un seul cistron et qui donc code une seule chaîne polypeptidique.)
La transcription se fait pas quelles ARN polymérases?
Les ARN polymérase I, II et III
Quelles sont les particularités de l’ARN polymérase I et III? (2)
peu de variétés dans les ARN, mais nombre de transcrits
très abondants (>100000 copies par cellule)
Quelle est la différence entre l’ARN pol I et l’ARN pol III?
- ARN pol I : les ARNr 28S, 18S et 5,8S
- ARN pol III : ARNt , ARNr 5S et ARN 7S SRP
Quelles sont les particularités de l’ARN pol II? (2)
> 20000 transcrits ARNm différents par cellule.
L’abondance relative de ces transcrits varie de quelques copies à >10000. Nécessite reconnaissance de promoteurs + efficacité de transcription variable d’un promoteur à l’autre
Quelles sont les caractéristiques structurelles de l’ARN polymérase II? (2)
*Forme générale en “pince de crabe” avec
le site catalytique vers le centre Similaire à l’ARN pol des procaryotes.
)Par contre , l’ARN pol II eucaryote possède 12 sous-unités, ce qui lui permet d’interagir avec différents facteurs de transcription. (12 sous unités protomères :
RPB1 2 3…12.)
*La sous unité RPB1 a une extension C terminale (CTD) qui accomplit plusieurs fonctions nouvelles comparativement à l’ARN pol procaryote.
Qu’est ce que le domaine carboxy-terminal (CTD)?
structure spécialisée retrouvée sur le grand protomère (RPB I) de l’ARN pol II, Répétitions en tandem de l’ heptapeptide Tyr Ser Pro ThrSer Pro Ser
Qu’elles sont les fonction du domaine carboxy-terminal (CTD)? (2)
- Le CTD P (Phosphorylé) est responsable du passage de l’étape d’initiation à celle d’élongation en recrutant les facteurs d’élongation.
- Impliqué dans le recrutement des facteurs de maturation des pré ARNm . Il pourrait donc être impliqué dans le couplage de la transcription
à la maturation.
Quelles sont les séquences conservées dans les promoteurs utilisés par l’ARN pol II?
- BRE (TFIIB recognition element )
- TATA
- Inr (initiator )
- DPE ( downstream promoter element ).
Quelle est la particularité des promoteurs pour les eucaryotes?
Ils sont composés d’au moins 3 des 4 séquences conservées dans les promoteurs
Qu’est-ce que sont les facteurs de transcription généraux (ex : TFIIB)?
reconnaissent ces séquences et jouent collectivement le même rôle que la sous unité σ de E. coli.
La formation du complexe de pré initiation survient à la boîte TATA lorsqu’elle est présente. L’élément Inr est le plus fréquent chez tous les promoteurs.
Quelle est la séquence consensus des promoteurs? (4)
- 37 à -21 (TFIIB) : BRE (GGG sur CCA, CGCCC)
-31 à -26 (TBP) : TATA (TATA A sur T, A , A sur T)
-2 à +4 (TFIID) : Inr (CC sur TT, AN, TCC sur ATT)
+ 28 à + 32 (TFIID) : DPE ( A sur G, g, A sur T, CGTG)
Qu’est ce que la boîte TATA?
La formation du complexe de pré initiation survient à la boîte TATA lorsqu’elle est présente.Les gènes
activement transcrits contiennent généralement un motif conservé positionné à ≈ 25/ 35 pb (TATA) Il détermine le site d’initiation de la transcription.
Qu’arrive-t-il s’il y a une mutation à l’intérieur de la boîte TATA?
Une seule mutation à l’intérieur de la boîte TATA diminue drastiquement la transcription, mais la séquence entre la boîte TATA et le site d’initiation peut
varier sans conséquence.
Qu’est-ce que permettent les facteurs de transcription généraux (GTF)? (2)
Permettent l’association de l’ARN polymérase au promoteur et l’initiation de la transcription ouverture de l’ADN + libération du promoteur.
Généralement des complexes protéiques multimériques : composés de plusieurs sous unités.
Désignés TFIIA, TFIIB, TFIIC…
Comment on nomme les facteurs de transcriptions?
Transcription F actor + numéro de la polymérase +
une lettre spécifique à chaque facteur
Quel facteur de transcription intéragit en premier avec le promoteur?
TFIID, c’est le plus grand
Que signifie TBP?
TATA biding protein
Que signifie TAF
TBP associated factor
Quelles sont les fonctions des TAF? (2)
Les TAF reconnaissent des éléments du
promoteur basal, mais TBP-TATA est plus
forte.
Ils régulent aussi l’association TBP-TATA
en cachant le site sur le TBP.
Qu’est ce qui initie la transcrption?
Le premier facteur de transcription à lier le promoteur est TFIID . In vitro, TBP (sous unité de TFIID) suffit pour initier la transcription.
Comment agit le TBP, soit la sous unité de TFIID?
Le domaine C terminal de TBP se replie comme une selle autour de l’ADN dans la région de la boîte TATA. Il établit un contact direct avec le sillon mineur de cette région et induit un repliement local de l’ADN
Comment les autres GTF sont recrutées pour la première étape de l’initiation de la transcription?
L’association TBP-TATA est une plateforme d’échafaudage nécessaire pour recruter les autres
GTF.
Que fait TFIIB?
TFIIB lie l’ADN et la TBP. Le domaine C
terminal de TFIIB établit un contact à la fois avec TBP, l’élément BRE et l’ADN situé après TATA .
Son domaine N terminal s’étend vers le site d’initiation et fait contact avec Pol II lorsqu’elle arrive.
Comment la polymérase II se lie au site d’initiation?
Un complexe formé de TFIIF et de la Polymérasese lie au promoteur, Cette liaison stabilise l’agrégat ADN TBP
TFIIB.
Quels GTF complète le complexe d’initiation?
Les facteurs TFIIE et TFIIH
Quelles sont les activités enzymatiques du TFIIH? (3)
- hydrolyse de l’ATP (ATPase),
*hélicase
*phosphorylation de CTD (kinase)
Comment la polymérase II passe du complexe fermé en complexe ouvert?
Une des sous unités de TFIIH possède une activité hélicase qui lui permet de dérouler l’ADN en utilisant l’énergie obtenue par hydrolyse de l’ATP.
Le tout forme alors l’équivalent d’un complexe ouvert chez les bactéries et l’ADN du brin matrice au site d’initiation se lie au site actif de la polymérase. Si les nucléotides sont présents , la polymérase commence à synthétiser l’ARN.
Que se passe-t-il lorsque la polymérase d’éloigne du site d’initiation? (3)
1) Une autre sous unité de TFIIH phosphoryle le CTD de la polymérase
2) TBP demeure liée à la boîte TATA, mais les autres facteurs se dissocient
3) L’ARN polymérase échappe au promoteur.
Quelles sont les étapes résumées de l’initiation de la transcription eucaryote? (5)
1) TBP de TFIID: lie TATA + site pour TFIIB
2) TFIIB: donne de l’ancrage aux autres
3) Un complexe Pol II/TFIIF embarque
4) TFIIE: permet de recruter TFIIH
5) TFIIH (activité hélicase ): séparation de l’ADN
double brin et phosphorylation de la polymérase
(aa spécifique!.
Qu’est ce que le complexe médiateur? (3)
- Il s’associe avec l’ARN polymérase II et différents facteurs de transcription spécifiques
activateurs et inhibiteurs) et généraux . - Le complexe médiateur est un énorme complexe protéique qui contient des modificateurs de nucléosomes et des remodeleurs de la chromatine.
- Chaque sous unité du complexe médiateur assure l’interaction avec un sous groupe de facteurs de transcription.
Qu’apporte la phosphorylation de CTD?
La phosphorylation de CTD permet le recrutement des facteurs d’élongation . Une phosphorylation des
a.a . particuliers est nécessaire pour le recrutement de chaque facteur différent.
Que font les facteurs d’élongation? (3)
- Ces facteurs stimulent la polymérase et permettent une synthèse plus rapide de l’ARN.
- Certains d’entre eux aident à la correction.
*D’autres facteurs recrutés par CTD-P agiront pendant la maturation de l’ARN.
Qu,est ce que le complexe FACT et que permet-t-il?
Au cours de l’élongation, les nucléosomes sont modifiés par FACT ( facilitates chromatin transcription ) pour permettre le passage de l’ARN polymérase à travers l’ADN condensé. Le complexe FACT est capable
de retirer un dimère H2A H2B du coeur du nucléosome qui se trouve devant l’ARN polymérase. Ceci donne suffisamment d’espace à l’enzyme pour transcrire l’ADN enroulé.
Quand est-ce que la polymérisation s’arrête?
La polymérisation de l’ARN par l’ARN Pol II se poursuit jusqu’à ce que la séquence dictant le clivage et la polyadénylation (poly A signal) du pré ARNm
soit dépassée.
Que se passe-t-il lorsque le signal poly-A est transcrit?
Lorsque transcrit, Le complexe protéique responsable du clivage et de la polyadénylation qui s’attache en avance au CTD phosphorylé se déplace sur le signal . Il coupe l’ARNm et ajoute 200 adénines sur son bout 3’ ( poly A polymérase).
À quel endroit survient l’arrêt de la transcription?
La polymérase continue de transcrire , même si son ARN a été coupé. L’arrêt de la transcription survient n’importe où sur une région de 0,5 à 2 kb en aval (derrière) du site de poly A.
Qu’est ce que la protéine Rat1
