Chapitre 6

Question 1

Quelle est la particularité des gènes pour la transcription des eucaryotes?

Answer 1

Beaucoup d’espace entre les gènes et les gènes sont monocistroniques (Se dit d’un ARNm ne possédant qu’un seul cistron et qui donc code une seule chaîne polypeptidique.)

Question 2

La transcription se fait pas quelles ARN polymérases?

Answer 2

Les ARN polymérase I, II et III

Question 3

Quelles sont les particularités de l’ARN polymérase I et III? (2)

Answer 3

peu de variétés dans les ARN, mais nombre de transcrits
très abondants (>100000 copies par cellule)

Question 4

Quelle est la différence entre l’ARN pol I et l’ARN pol III?

Answer 4

• ARN pol I : les ARNr 28S, 18S et 5,8S
• ARN pol III : ARNt , ARNr 5S et ARN 7S SRP

Question 5

Quelles sont les particularités de l’ARN pol II? (2)

Answer 5

> 20000 transcrits ARNm différents par cellule.

L’abondance relative de ces transcrits varie de quelques copies à >10000. Nécessite reconnaissance de promoteurs + efficacité de transcription variable d’un promoteur à l’autre

Question 6

Quelles sont les caractéristiques structurelles de l’ARN polymérase II? (2)

Answer 6

*Forme générale en “pince de crabe” avec
le site catalytique vers le centre Similaire à l’ARN pol des procaryotes.

)Par contre , l’ARN pol II eucaryote possède 12 sous-unités, ce qui lui permet d’interagir avec différents facteurs de transcription. (12 sous unités protomères :
RPB1 2 3…12.)

*La sous unité RPB1 a une extension C terminale (CTD) qui accomplit plusieurs fonctions nouvelles comparativement à l’ARN pol procaryote.

Question 7

Qu’est ce que le domaine carboxy-terminal (CTD)?

Answer 7

structure spécialisée retrouvée sur le grand protomère (RPB I) de l’ARN pol II, Répétitions en tandem de l’ heptapeptide Tyr Ser Pro ThrSer Pro Ser

Question 8

Qu’elles sont les fonction du domaine carboxy-terminal (CTD)? (2)

Answer 8

• Le CTD P (Phosphorylé) est responsable du passage de l’étape d’initiation à celle d’élongation en recrutant les facteurs d’élongation.
• Impliqué dans le recrutement des facteurs de maturation des pré ARNm . Il pourrait donc être impliqué dans le couplage de la transcription
  à la maturation.

Question 9

Quelles sont les séquences conservées dans les promoteurs utilisés par l’ARN pol II?

Answer 9

• BRE (TFIIB recognition element )
• TATA
• Inr (initiator )
• DPE ( downstream promoter element ).

Question 10

Quelle est la particularité des promoteurs pour les eucaryotes?

Answer 10

Ils sont composés d’au moins 3 des 4 séquences conservées dans les promoteurs

Question 11

Qu’est-ce que sont les facteurs de transcription généraux (ex : TFIIB)?

Answer 11

reconnaissent ces séquences et jouent collectivement le même rôle que la sous unité σ de E. coli.

La formation du complexe de pré initiation survient à la boîte TATA lorsqu’elle est présente. L’élément Inr est le plus fréquent chez tous les promoteurs.

Question 12

Quelle est la séquence consensus des promoteurs? (4)

Answer 12

• 37 à -21 (TFIIB) : BRE (GGG sur CCA, CGCCC)
  -31 à -26 (TBP) : TATA (TATA A sur T, A , A sur T)
  -2 à +4 (TFIID) : Inr (CC sur TT, AN, TCC sur ATT)
  + 28 à + 32 (TFIID) : DPE ( A sur G, g, A sur T, CGTG)

Question 13

Qu’est ce que la boîte TATA?

Answer 13

La formation du complexe de pré initiation survient à la boîte TATA lorsqu’elle est présente.Les gènes
activement transcrits contiennent généralement un motif conservé positionné à ≈ 25/ 35 pb (TATA) Il détermine le site d’initiation de la transcription.

Question 14

Qu’arrive-t-il s’il y a une mutation à l’intérieur de la boîte TATA?

Answer 14

Une seule mutation à l’intérieur de la boîte TATA diminue drastiquement la transcription, mais la séquence entre la boîte TATA et le site d’initiation peut
varier sans conséquence.

Question 15

Qu’est-ce que permettent les facteurs de transcription généraux (GTF)? (2)

Answer 15

Permettent l’association de l’ARN polymérase au promoteur et l’initiation de la transcription ouverture de l’ADN + libération du promoteur.

Généralement des complexes protéiques multimériques : composés de plusieurs sous unités.
Désignés TFIIA, TFIIB, TFIIC…

Question 16

Comment on nomme les facteurs de transcriptions?

Answer 16

Transcription F actor + numéro de la polymérase +
une lettre spécifique à chaque facteur

Question 17

Quel facteur de transcription intéragit en premier avec le promoteur?

Answer 17

TFIID, c’est le plus grand

Question 18

Que signifie TBP?

Answer 18

TATA biding protein

Question 19

Que signifie TAF

Answer 19

TBP associated factor

Question 20

Quelles sont les fonctions des TAF? (2)

Answer 20

Les TAF reconnaissent des éléments du
promoteur basal, mais TBP-TATA est plus
forte.
Ils régulent aussi l’association TBP-TATA
en cachant le site sur le TBP.

Question 21

Qu’est ce qui initie la transcrption?

Answer 21

Le premier facteur de transcription à lier le promoteur est TFIID . In vitro, TBP (sous unité de TFIID) suffit pour initier la transcription.

Question 22

Comment agit le TBP, soit la sous unité de TFIID?

Answer 22

Le domaine C terminal de TBP se replie comme une selle autour de l’ADN dans la région de la boîte TATA. Il établit un contact direct avec le sillon mineur de cette région et induit un repliement local de l’ADN

Question 23

Comment les autres GTF sont recrutées pour la première étape de l’initiation de la transcription?

Answer 23

L’association TBP-TATA est une plateforme d’échafaudage nécessaire pour recruter les autres
GTF.

Question 24

Que fait TFIIB?

Answer 24

TFIIB lie l’ADN et la TBP. Le domaine C
terminal de TFIIB établit un contact à la fois avec TBP, l’élément BRE et l’ADN situé après TATA .
Son domaine N terminal s’étend vers le site d’initiation et fait contact avec Pol II lorsqu’elle arrive.

Question 25

Comment la polymérase II se lie au site d’initiation?

Answer 25

Un complexe formé de TFIIF et de la Polymérasese lie au promoteur, Cette liaison stabilise l’agrégat ADN TBP
TFIIB.

Question 26

Quels GTF complète le complexe d’initiation?

Answer 26

Les facteurs TFIIE et TFIIH

Question 27

Quelles sont les activités enzymatiques du TFIIH? (3)

Answer 27

• hydrolyse de l’ATP (ATPase),
  *hélicase
  *phosphorylation de CTD (kinase)

Question 28

Comment la polymérase II passe du complexe fermé en complexe ouvert?

Answer 28

Une des sous unités de TFIIH possède une activité hélicase qui lui permet de dérouler l’ADN en utilisant l’énergie obtenue par hydrolyse de l’ATP.

Le tout forme alors l’équivalent d’un complexe ouvert chez les bactéries et l’ADN du brin matrice au site d’initiation se lie au site actif de la polymérase. Si les nucléotides sont présents , la polymérase commence à synthétiser l’ARN.

Question 29

Que se passe-t-il lorsque la polymérase d’éloigne du site d’initiation? (3)

Answer 29

1) Une autre sous unité de TFIIH phosphoryle le CTD de la polymérase
2) TBP demeure liée à la boîte TATA, mais les autres facteurs se dissocient
3) L’ARN polymérase échappe au promoteur.

Question 30

Quelles sont les étapes résumées de l’initiation de la transcription eucaryote? (5)

Answer 30

1) TBP de TFIID: lie TATA + site pour TFIIB
2) TFIIB: donne de l’ancrage aux autres
3) Un complexe Pol II/TFIIF embarque
4) TFIIE: permet de recruter TFIIH
5) TFIIH (activité hélicase ): séparation de l’ADN
double brin et phosphorylation de la polymérase
(aa spécifique!.

Question 31

Qu’est ce que le complexe médiateur? (3)

Answer 31

• Il s’associe avec l’ARN polymérase II et différents facteurs de transcription spécifiques
  activateurs et inhibiteurs) et généraux .
• Le complexe médiateur est un énorme complexe protéique qui contient des modificateurs de nucléosomes et des remodeleurs de la chromatine.
• Chaque sous unité du complexe médiateur assure l’interaction avec un sous groupe de facteurs de transcription.

Question 32

Qu’apporte la phosphorylation de CTD?

Answer 32

La phosphorylation de CTD permet le recrutement des facteurs d’élongation . Une phosphorylation des
a.a . particuliers est nécessaire pour le recrutement de chaque facteur différent.

Question 33

Que font les facteurs d’élongation? (3)

Answer 33

• Ces facteurs stimulent la polymérase et permettent une synthèse plus rapide de l’ARN.
• Certains d’entre eux aident à la correction.
  *D’autres facteurs recrutés par CTD-P agiront pendant la maturation de l’ARN.

Question 34

Qu,est ce que le complexe FACT et que permet-t-il?

Answer 34

Au cours de l’élongation, les nucléosomes sont modifiés par FACT ( facilitates chromatin transcription ) pour permettre le passage de l’ARN polymérase à travers l’ADN condensé. Le complexe FACT est capable
de retirer un dimère H2A H2B du coeur du nucléosome qui se trouve devant l’ARN polymérase. Ceci donne suffisamment d’espace à l’enzyme pour transcrire l’ADN enroulé.

Question 35

Quand est-ce que la polymérisation s’arrête?

Answer 35

La polymérisation de l’ARN par l’ARN Pol II se poursuit jusqu’à ce que la séquence dictant le clivage et la polyadénylation (poly A signal) du pré ARNm
soit dépassée.

Question 36

Que se passe-t-il lorsque le signal poly-A est transcrit?

Answer 36

Lorsque transcrit, Le complexe protéique responsable du clivage et de la polyadénylation qui s’attache en avance au CTD phosphorylé se déplace sur le signal . Il coupe l’ARNm et ajoute 200 adénines sur son bout 3’ ( poly A polymérase).

Question 37

À quel endroit survient l’arrêt de la transcription?

Answer 37

La polymérase continue de transcrire , même si son ARN a été coupé. L’arrêt de la transcription survient n’importe où sur une région de 0,5 à 2 kb en aval (derrière) du site de poly A.

Question 38

Qu’est ce que la protéine Rat1