Chapitre 5 Flashcards
Les nucléotides sont des précurseurs de … ?
l’ADN et l’ARN
La GTP permet le déplacement de quel type de molécules ?
Les macromolécules.
Qu’est ce qu’un groupe prosthétique ?
Molécules organiques non protéique, maintenue dans une structure protéique au moyen de liaisons covalentes permanentes.
Vrai ou faux? Les acides nucléiques sont des groupements prosthétiques.
Vrai.
Quels sont les 2 types d’acide nucléique?
Acide désoxyribonucléique (ADN) et Acide Ribonucléique (ARN)
Les ARN composent quelle partie de la cellule ?
Le cytoplasme.
Les acides nucléiques sont constitués de 2 types de bases, soit les puriques et les pyrimidique. Quelles est la différence structurale entre ces deux types de base ?
Les bases puriques sont formés de 2 cycles, tandis que les bases pyrimidiques sont formés d’un cycle seulement.
Qu’est ce que confère sa structure hélicoïdale à l’ADN ?
La présence de ponts hydrogène entre les bases.
Quelles sont les deux bases puriques communes à l’ADN et à l’ARN?
Adénine (A) et Guanine (G).
Quelles sont les 3 bases pyrimidines ?
Cytosines (C) commune à ADN et ARN, Uracile (U) dans ARN et Thymine (T) dans ADN.
Quelle est la différence structurale entre le désoxy-2-ribose et le ribose ?
Le Ribose possède un OH sur sont 2e carbone, tandis que le désoxy-2-ribose n’en possède pas.
Qu’est ce qu’un nucléoside ?
Sucre (pentose) + base
Qu’est-ce qu’un nucléotide?
Nucléoside (sucre+base) + PO4
Quelles sont les 3 méthylxanthines alimentaires ?
Caféine, théophylline et Théobromine
Quelle est la conformation de polymère qui prédomine dans la nature ?
La forme anti.
Combien de gène compterait une cellule humaine selon une étude récente?
Entre 28 000 et 34 000.
Quelle pourcentage y a-t-il de différent entre les gènes de 2 êtres humains ?
Environ 0,1%
Qu’est-ce qu’un gène ?
Une séquence d’ADN qui spécifie la synthèse d’une chaîne de polypeptides ou d’un ARN fonctionnel.
L’ADN contient combien de nucléotides?
10^4-10^8 nucléotides.
L’ADN constitue quel pourcentage de la masse nucléaire ?
20%
Quel type de chromatine est la portion active, soit la portion impliquée dans la synthèse protéique ?
L’Euchromatine.
Quel type de chromatine est la portion inactive, soit la portion non impliquée dans la synthèse protéique ?
L’Hétérochromatine.
Quels sont les 2 types d’Hétérochromatine ?
Constitutive et facultative.
Quelle est la différence entre l’hétérochromatine constitutive et l’hétérochromatine facultative ?
L’hétérochromatine constitutive est toujours condensée donc inactive, tandis que l’hétérochromatine facultative est parfois condensée et parfois activement transcrite.
Quel type de chromosome chez le mammifère n’est presque jamais transcrit, puisqu’il est hétérochromatique ?
L’un des chromosome X (Corps de Barr)
Quel type de liaisons assure le lien entre 2 cycles consécutifs (du carbone 5’ au carbone 3’) ?
Liens phosphodiesters.
Quelles sont les 3 formes d’ADN possible (structure secondaire)?
Formes B,A et Z.
Quelle est la forme d’ADN la plus courante dans la nature ?
Forme B.
Quelles sont les caractéristiques de la forme B de l’ADN?
- 2 brins enroulés en hélice dans le sens horaire
- brins antiparallèles (liens 3’,5’ dans des directions opposées sur un brin par rapport à l’autre.
- Bases perpendiculaires à l’axe de l’hélice.
Quelles sont les caractéristiques de la forme A de l’ADN?
- Obtenue par déshydration de la forme B, plus compacte que B
- les bases dévient de 13 à 19° du plan perpendiculaire à l’axe de la double hélice.
- Hélice A, plus large que B
Quelles sont les caractéristiques de la forme Z de l’ADN?
- En zig-zag
- double hélice de sens ANTI horaire
- Stabilisé par méthylation des bases
- Pourrait avoir une importance physiologique puisque la méthylation des bases de produit dans les gènes inactifs.
Quelle est l’utilité de la dénaturation?
Elle est utilisée pour analyser la structure de l’ADN
Quels sont les deux facteurs qui causent la dénaturation ?
- augmentation de la température
- diminution de la concentration de sel.
Quelles sont les conséquences de la dénaturation ?
- séparation des 2 hélices
- Désempilement des bases tout en restant collé au polymère.
- Augmentation de la densité optique des bases (hyperchromicité)
Quelle est la différence entre l’hybridation et la renaturation ?
L’hybridation c’est l’appariement de deux hélices n’étant pas ensemble préalablement (ADN ou ARN), tandis que la renaturation c’est le rappariement de deux hélices préalablement dénaturés (ADN seulement).
Que signifie hybridation ?
Appariement des bases.
Quelle est l’utilité de l’hybridation ?
Utilisée pour localiser des séquences spécifiques d’acide nucléique au sein d’une longue séquence.
Qu’est-ce que la stringence de l’hybridation ?
C’est les conditions physiques. (elles peuvent êtres variées pour et servir de sonde pour son partenaire complémentaire).
Quelles sont les conditions très stringentes ?
T élevée et faible concentration de sel.
Quel est le comportement de la séquence sonde dans des conditions très stringentes ?
La séquence sonde ne s’hybride qu’à la séquence parfaitement complémentaire.
Quel est le comportement de la séquence sonde dans des conditions moins stringentes ?
Les mésappariements entre les bases sont tolérés, donc les séquences sont partiellement similaires, mais non identiques.
Quel est le comportement de la séquence sonde dans des conditions de stringence trop basse ?
Les acides nucléiques s’hybrident sur des régions très courtes, donc perte de spécificité.
Quelle technique d’hybridation permet d’identifier des fragments d’ADN renfermant la séquence cible complémentaire ?
Southern transfert
Le gène affecté causant la maladie de Chorée Huntington se situe sur quel chromosome ?
Le chromosome 4.
Le gène affecté causant la mucoviscidose (fibrose kystique) se situe sur quel chromosome ?
Le chromosome 7.
Le gène affecté causant la maladie des reins polykystiques se situe sur quel chromosome ?
Le chromosome 16.
Le gène affecté causant la dystrophie musculaire de Duchenne se situe sur quel chromosome ?
Le chromosome X
Quelles applications biomédicales sont rendues possible grâce à l’hybridation ?
- Production d’un gène synthétique et l’exprimer dans un vecteur approprié, permettant de rétablir la fonction.
- Production d’un anticorps dirigé contre le PEPTIDE que ce gène est sensé coder et voir si ce peptide est exprimé chez des individus sains ou s’il est absent chez les individus malades.
Quelles sont les conséquences de la maladie de Chorée Huntington ?
Manque de contrôle des mouvements volontaires et désinhibition.
Quelles sont les conséquences de la dystrophie musculaire de Duchenne ?
Diminution dystrophine qui joue un rôle dans le maintient de la structure du sarcomère.
Quelles sont les conséquences de la mucoviscidose ?
Accumulation de mucus dans les voies respiratoire et réduction du transport du chlore.
Quel est le rôle des snARN ?
Maturation de l’ARN et architecture cellulaire.
Qu’est-ce que les hnARN ?
Ce sont des ARN produits directement dans le noyau et qui sortent dans le cytosol sous forme d’ARNm après maturation.
Quelle enzyme transcrit l’ARN des rétrovirus en ADN ?
La transcriptase inverse.
Quelle est l’utilité pour un rétrovirus que sont ARN soit transcrit en ADN ?
Pour s’intégrer dans le génome de la cellule hôte.
Quelle est la structure d’ordre supérieur de la chromatine ?
Structure en collier de perles.
Qu’est-ce qu’un nucléosome ?
Des histones (prot. basiques) qui se combine à l’ADN.
Qu’est-ce que la réplication semi-conservatoire ou semi-conservative?
C’est la réplication qui donne deux duplex contenant chacun une chaîne parentale et une chaîne nouvellement synthétisé.
Dans la réplication de l’ADN, quelle polymérase est confinées aux mitochondries ?
La polymérase gamma.
Quel est le rôle des polymérases bêta ?
La polymérase bêta est active dans les cellules en mitose ou non, elle répare l’ADN endommagé.
Quelles polymérases sont les plus actives pendant la mitose ?
Alpha, delta et epsilon.
Quels sont les 4 constituants de la fourche de réplication de l’ADN de E.coli ?
AND hélicase (désenroulement duplex parental), ADN primase (synthèse d’ADN amorce), ADN polymérase (débute synthèse du brin soeur) et les SSB (empêche réassociation des brins)
Quelle est la différence entre le brin précoce et le brin tardif lors de la synthèse d’ADN chez E.coli?
Le brin précoce est synthétisé en continue, tandis que le brin tardif est synthétisé en courts fragments (fragments D’Okasaki)
Q’u’est-ce que la processivité ?
Correspond au nombre de nucléotides ajoutés avant le détachement de la polymérase de la matrice.
Quel est le rôle de la polymérase I?
Complète la synthèse des chaînes entre les fragments d’Okasaki (brin tardif)
Quel est le rôle de la polymérase II?
Lecture + correction de épreuves
Quel est la caractéristique de la polymérase III?
Plus grande processivité
Comment la réplication intégrale du génome des mammifères est possible en 9h?
Grâce à de nombreuses origines de réplication en forme de bulle.
Quelle enzyme joint les extrémités des segments d’Okasaki?
L’ADN ligase.
Vrai ou faux ? L’holoenzyme polymérase III est aussi une exonucléase (3’–>5’) qui corrige les mésappariements.
Vrai.
Quel est le taux d’erreur net de la réplication de l’ADN chez E.coli?
10^-8
Quel est le rôle des AND hélicases?
Séparation des brins d’ADN.
Quelle polymérase à une activité primase pour synthétiser des amorces d’ARN ?
Polymérase alpha.
Quelle protéine se charge de déplacer la polymérase alpha pour attiré un PCNA, suite à l’ajout d’un segment (environ 20 nucléotides) à l’amorce ?
RFC (replication factor C)
La polymérase delta à une activité exonucléase, donc elle…
… peut réaliser la relecture (3’ vers 5’) avec la correction de l’ADN répliqué.
Quel est le taux d’erreur net final de la réplication de l’ADN chez les mammifères ?
10^-9 à 10^-11
Quel est le rôle de la télomérase ?
Elle est capable de réparer les télomères, donc rend la cellule immortelle, puisqu’elle ne perd pas de télomère et sa division reste toujours possible (cellules cancéreuses et cellules souches)
Qu’est-ce qui cause des dimères de thymine qui distordent le brin matrice ?
Les rayons UV?
Quels sont les 3 types de réparation possible ?
Réparation sur l’épreuve (ADN polymérase), réparation par excision de nucléotides et réparation par excision de bases.
Quel acide aminé remplace la valine à la position 67 de la chaîne bêta dans l’hémoglobine Milwaukee ?
Le Glutamate
Quel type de mutation à subi l’Hb Milwaukee ?
Mutation par substitution d’une base n’ayant aucun effet.
Quelle mutation d’a.a. à subi l’Hb Hikari?
Changement de la lysine pour l’asparagine en position 61 de la chaîne bêta.
L’hémoglobine bristol à une mutation par substitution d’une base qui n’a aucun effet décelable, quel est ce changement ?
La position 67 de la chaîne bêta est occupé par l’acide aspartique.
Quel acide aminé remplace le glutamate dans l’hémoglobine S?
La Valine.
Quel est le problème qui rend non-acceptable l’Hb M ?
Il oxyde le Fe2+ en Fe3+
