Chapitre 5 Flashcards
Quelle est la différence au niveau du sucre entre l’ARN et l’ADN?
L’ARN possède un groupement OH en 2’
Qu’est ce que le groupement hydroxyle permet à l’ARN? (2)
Rend plus sensible à l’hydrolyse alcaline
Rend possible la cyclisation du phosphate provoquant une coupure ribose-phosphate
Quel est l’avantage de l’uracile?
Moins couteuse, 1 CH3 en moins
Pourquoi l’uracile n’est pas utilisée dans l’ADN?
Parce qu’elle pourrait être confondue avec une mutation spontanée fréquente de désamination de la cytosine et être ensuite éliminée par uracil DNA glycosylase
Comment se forment les structures secondaires de l’ARN?
Appariement des bases, A avec U, C avec G mais aussi U avec G
Quelle est la structure tertiaire de l’ARN?
Les différents appariements d’un seul brin qui donnent une structure 3D, donnent une stabilité et propriétés enzymatiques
Comment se déroule la transcription de l’ADN en ARN?
ARN polymérase ADN dépendante s’associe au promoteur, ouvre le double brin, synthétise sur le OH-3’ de l’ADN matrice, ADN se referme derrière, hélice déroulée 1 tour à la fois
Qu’est ce que le brin codant?
Brin avec la même séquence que le brin transcrit (complémentaire à la matrice)
Quelle est la structure de l’ARN pol?
Pince de crabe, structure interne (site catalytique) très constant, périphérie très variable
Combien d’entrées-sorties possède l’ARN pol?
5
De quoi est composée l’ARN pol?
Deux ions métalliques qui interviennent dans le site catalytique (feuillets B) de l’addition de 2 nucléotides
Combien d’ARN pol ont les bactéries vs eucaryotes?
Bactérie : 1
Eucaryotes : 3
pol II : séquences codants protéines
pol I et III : séquence autre ARN
Est ce qu’une amorce est nécessaire dans la polymérisation?
Non, adhérence très forte avec le premier nucléotide, souvent adénine chez procaryotes.
Quelle est la différence entre la réplication et la transcription?
La réplication est quand on copie tout le génome (1 fois par cycle cellulaire) la transcription est quand on copie juste une séquence précise du génome
Quelles sont les différences entre la réplication et la transcription?
Transcription : ARN au lieu d’ADN, se détache plus vite, plus d’erreur (1/10 000), pas besoin d’amorce ni hélicase
Comment se déroule l’initiation de la transcription?
ARN pol se lie au promoteur (complexe fermé)
La double hélice s’ouvre sur 14 nucléotides (complexe ouvert)
Les 10 premiers rNTPs sont ajoutés de manière inefficace (complexe de transcription inital)
Qu’est-il possible de dire sur le promoteur?
En amont du gène à transcrire, détermine le brin matrice et le sens de la transcription
Quels sont les 3 facteurs qui indiquent la force d’un promoteur?
Sa capacité à se lier avec l’ARN pol, une isomérisation efficace (passé de fermé à ouvert) et rapidité de l’ARN pol d’échapper au promoteur
Qu’est ce que l’étape d’élongation?
Complexe ternaire stable (après les 10 premiers nd), ajout des rNTPs en continu jusqu’à la fin
Comment se déroule la terminaison?
Signal fait décrocher ARN pol et lâche ARN
Pourquoi l’ARN pol se lie uniquement sur les promoteurs chez les procaryotes?
Car ARN pol + sous-unité o = holoenzyme, chez E.coli c’est sous-unité o70 qui reconnait -35 et -10. Plusieurs sous-unités possibles dans une même espèce
Existerait-il une séquence consensus chez les procaryotes?
Oui, et plus la séquence en est proche plus l’adhérence est optimale
Que sont de possibles ajouts sur le promoteur?
Élément UP devant -35
Discriminateur après -10
Extension avant -10 (remplace -35)
Comment la sous-unité o se lie au promoteur?
Sous-unité o (N-1-2-3-4-C)
1 : se lie au discriminateur (isomérisation)
2 : se lie à -10 et ouvre le brin
3 : se lie à l’extension
4 : reconnait -35 avec helix-turn-helix
