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BIO1101-Biologie Moléculaire > Chapitre 3 : La réplication de l'ADN > Flashcards

Chapitre 3 : La réplication de l'ADN Flashcards

1
Q

Combien y a-t-il de phases dans le cycle de division cellulaire chez les eucaryotes?

A

4

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Q

Les 3 premières phases du cycle de division cellulaire chez les eucaryotes se regroupent sous quel nom?

A

l’interphase

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3
Q

Quelle est le nom des 3 premières phases du division cellulaire chez les eucaryotes?

A

1 - Phase S
2 - G1
3 - G2
G1 et G2 sont des phases dites « gap » (trou)

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4
Q

Quel est le nom de la 4e phase de la division cellulaire chez les eucaryotes? Que regroupe-t-elle?

A

La phase M. Elle regroupe la mitose et la cytokinèse.

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5
Q

Que signifie CDC?

A

Cycle de Division Cellulaire

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6
Q

Que signifie Cdk?

A

Cycline dependant kinase (kinase dépendante à la cycline)

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7
Q

Quel est le rôle de la Cdk?

A

Elle phosphoryle différentes protéines nécessaires à la réplication de l’ADN

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8
Q

Que se passe-t-il pendant la phase S? De quoi la cellule doit-elle alors s’assurer?

A

C’est la réplication de l’ADN. Elle doit s’assurer d’avoir assez d’énergie.

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9
Q

Que signifie ORI?

A

Origine de réplication

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10
Q

VrAi oU fAuX. Les procaryotes et les eucaryotes peuvent avoir plusieurs origines de réplication.

A

fAuX. Seuls les eucaryotes peuvent en avoir plusieurs (ADN linéaire).

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11
Q

Les ORI se placent pendant quelle phase?

A

pendant la G1, mais ils restent inactifs jusqu’à la réplication.

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12
Q

VrAi oU fAuX. Les ORI ont une séquence qui peut être reconnue par n’importe quelle protéine dans la réplication.

A

fAuX. La protéine initiatrice est la seule protéine dans la réplication qui peut reconnaître la séquence spécifique de bases de l’ORI pour se lier à l’ADN.

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13
Q

VrAi oU fAuX. Les ORI possèdent une séquence riche en A:T.

A

VrAi. La séquence rend l’hélice plus facile à ouvrir.

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14
Q

Quelles sont les fonctions de la protéine initiatrice?

A
  • trouver et lier l’ORI
  • recruter d’autres protéines nécessaires à la réplication (formation d’un complexe d’initiation, hélicases)
  • chez certains procaryotes, elle ouvre la double hélice de l’ORI
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15
Q

La protéine initiatrice recrute combien d’hélicases?

A

2

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16
Q

Qu’est-ce que le réplicateur?

A

C’est l’ensemble complet des séquences suffisantes pour permettre l’initiation de la réplication.

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17
Q

Qu’est-ce que l’origine de réplication (ORI)? Quelles en sont les spécificités chez les procaryotes?

A

C’est le site spécifique où commence la séparation des 2 brins et la réplication. Contient une région riche en A:T.

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18
Q

VrAi oU fAuX. L’ORI fait partie du réplicateur.

A

VrAi.

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19
Q

Chez E. coli, qu’est-ce qu’un site 9-mères?

A

C’est le site de liaison de la protéine initiatrice (nommée DnaA chez E. coli).

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20
Q

Chez E. coli, qu’est-ce qu’un site 13-mères?

A

C’est l’endroit de la séparation initiale des brins. Ce sont des séquences riches en A:T.

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21
Q

Que signifie le chiffre dans 9-mères et 13-mères?

A

C’est le nombre de paires de bases contenues dans chaque séquence répétée (ex. dans une séquence répétée du 13-mères il y a 13 paires de bases, et toutes les séquences du 13-mères contiennent la même séquence de paires de bases.)

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22
Q

Qu’est-ce que DnaA chez E. coli?

A

C’est la protéine initiatrice. Elle lie spécifiquement les sites 9-mères, et, lorsqu’elle est liée à l’ATP, elle interagit avec un site 13-mères pour séparer la double hélice. Elle aide ensuite à positionner l’hélicase.

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23
Q

Qu’est-ce que ORC? À quoi est-ce équivalent?

A

C’est le complexe de reconnaissance de l’origine de réplication chez les eucaryotes. C’est un complexe de 6 protéines, équivalent à la protéine initiatrice des procaryotes.

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24
Q

VrAi oU fAuX. La liaison d’ORC au réplicateur aboutit à la dénaturation de l’ADN adjacent.

A

fAuX.

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25
Q

VrAi oU fAuX. La liaison de DnaA au réplicateur aboutit à la dénaturation de l’ADN adjacent.

A

VrAi.

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26
Q

Par quoi est marqué le passage de la phase G1 à la phase S chez les eucaryotes?

A

Par l’activation des CdK (elles deviennent actives par la liaison à la cycline). Le niveau de complexe Cdk-cycline augmente

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27
Q

VrAi oU fAuX. Cdk est toujours présent dans le noyau en forme active et inactive.

A

fAuX. Il est présent dans le noyau seulement sous la forme inactive.

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28
Q

VrAi oU fAuX. Lors de la phase G1, le niveau de Cdk-cycline est élevé.

A

fAuX. Le fait que le niveau du complexe actif de Cdk-cycline soit bas permet la formation du pré-RC (complexe pré-réplicatif)

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29
Q

Que signifie pré-RC?

A

complexe pré-réplicatif

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30
Q

De quoi est formé le complexe pré-réplicatif?

A
  • ORC
  • Cdc6 et Cdt1 (colle ORC et hélicases ensemble)
  • 2 hélicases
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31
Q

L’activation de complexes Cdk-cycline engendre quelles modifications dans le pré-RC?

A
  • La cycline active la Cdk, puis la Cdk (c’est une kinase) phosphoryle Cdc6 et Cdt1 du pré-RC. La phosphorylation de ces protéines les fait « décoller » du complexe, ce qui fait partir ORC en même temps. Donc, l’activation de complexes Cdk-cycline assurent la transformation du pré-RC (complexe pré-réplicatif) en un complexe actif.
  • cela empêche aussi la formation de nouveaux complexes pré-réplicatif au niveau des réplicateurs
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32
Q

VrAi oU fAuX. Chez les eucaryotes, l’ORI passe toujours par une séquence spécifiquement reconnue.

A

FaUx. Ils passent par des motifs structurels impliquant :

  • des séquences riches en A:T ou en ilots CpG
  • une structure d’ADN particulière
  • des régions libres de nucléosomes
  • des régions impliquées dans l’initiation de la transcription
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33
Q

Qu’est-ce qu’un ilot CpG?

A

une séquence d’ADN d’au moins 500 paires de bases dont le bases CG s’alternent constituent au moins 55% de la séquence

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34
Q

VrAi oU fAuX. Chez les eucaryotes, les ORI ne sont pas « activées » en même temps. Expliquer.

A

vRaI. En fonction du développement et du stress, elles sont « activées » à différents moments. Par exemple, si la cellule vit un stress, la cellule doit ralentir son processus, donc elle va bloquer les complexes pré-réplicatifs qui ne sont pas encore activés.

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35
Q

Qu’est-ce que l’hélicase? De quoi est-ce formé?

A

C’est une enzyme hexamérique (6 sous-unités, qu’on appelle « boucles ») en forme d’anneau qui entoure l’ADN simple brin. Son trou n’est assez grand que pour un seul brin d’ADN (simple brin).

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36
Q

Quelle est la fonction de l’hélicase? Comment procède-t-elle?

A
  • Son déplacement rapide le long de la chaîne d’ADN entraîne la séparation des 2 brins.
  • Son déplacement nécessite l’hydrolyse de l’ATP: on peut l’imaginer comme si elles avaient 6 mains, chacune ayant un ATP accroché. À tour de rôle, les mains agrippent l’ADN pour l’obliger à passer dans le pore central de l’hélicase.
  • l’hélicase a une haute processivité (ouvre beaucoup d’ADN avant de se détacher)
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37
Q

Les boucles (sous-unités) de l’hélicase s’agrippe à quoi sur l’ADN?

A

à la charpente (aux groupements phosphate)

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38
Q

Qu’est-ce qu’une protéine SSB?

A

C’est une protéine Single-Strand Binding, c’est-à-dire qu’elle s’attache sur l’ADN monocaténaire (simple brin) en faisant des liens avec d’autres SSB, comme si elles faisaient un collier de perle « à travers » l’ADN (les perles, c’est les SSB).

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39
Q

Que signifie du cooperative binding? Quelles protéines de la réplication l’utilise6

A

C’est le fait de former des liens entre plusieurs protéines identiques, c’est de la consolidation. Les protéines SSB se basent sur ce principe pour fonctionner.

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40
Q

À quoi servent les SSB?

A
  • Elles stabilisent les 2 brins séparés de l’ADN jusqu’à la synthèse de nouveaux brins.
  • Elles empêchent la formation d’épingles par appariement de nucléotides complémentaires dans le même brin d’ADN (ces épingles bloqueraient la réplication)
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41
Q

Quel type de liens se forment entre les SSB et l’ADN?

A

Des liens relativement faibles, soient des ponts H et des liaisons ioniques. Si les liens sont trop forts (comme des covalents), les SSB ne pourraient pas se détacher de l’ADN. Il faut quand même que les liens soient plus fort que des interactions de Van der Waals, car il faut que les SSB protègent l’ADN des nucléases qui dégradent l’ADN.

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42
Q

L’hélice d’ADN fait un tour aux combiens de paires de bases?

A

Un tour par 10 paires de bases.

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43
Q

Qu’est-ce qu’un supercoil?

A
  • Lorsque l’hélicase travaille et avance rapidement sur la chaîne d’ADN, les tours d’hélice d’ADN s’accumulent devant elles, ce qui crée de l’enroulement supplémentaire d’ADN, comme lorsqu’on essaie de démêler un fil d’écouteurs en tirant dessus : ça ne fait que le mêler davantage.
  • Les supercoils créent une source de tension.
44
Q

Qu’est-ce qu’une topoisomérase? Quel est son rôle?

A

C’est une enzyme qui s’occupe de couper et de ressouder le double brin d’ADN pour enlever les supercoils.

45
Q

VrAi oU fAuX. La topoisomérase est placée en « avant » de l’hélicase, soit sur le double lien que l’hélicase n’a pas encore déroulé.

A

VrAi!

46
Q

Quelle est la différence entre la topoisomérase I (1) et la topoisomérase II (2)?

A

La topoisomérase I (1) ne coupe qu’un seul brin d’ADN, et la topoisomérase II (2) coupent les deux brins.
Attention, dans les 2 cas, la coupure se passe lorsque l’ADN est bicaténaire (2 brins), mais il se peut qu’il ne soit nécessaire de couper qu’un seul brin pour résoudre le supercoil.

47
Q

Lorsqu’une topoisomérase coupe, que coupe-t-elle? Où se fait la coupure?

A

Elle coupe les liens phosphodiester (le lien entre 2 nucléotides) de la charpente sucre-phosphate

48
Q

Qu’est-ce qu’une fourche de réplication? Où se trouve-t-elle?

A

C’est le siège de l’élongation des nouveaux brins d’ADN (là où il y a l’hélicase et etc.). On en trouve une à chaque extrémité d’un oeil de réplication.

49
Q

De quoi a besoin une ADN polymérase pour commencer son travail?

A

D’une amorce présentant un 3’-OH libre.

50
Q

Quelle enzyme est responsable de créer l’amorce? Comment fait-elle?

A

L’ARN polymérase (aussi appelée primase). Elle ajoute de courtes séquences d’ARN (environ 10 ribonucléotides) sur le brin matrice.

51
Q

Les SSB ont un 2e rôle lors de la réplication. Quel est-il?

A

Lors de la synthèse de l’amorce, ils s’occupent de garder le brin d’ADN sortant de l’hélicase dans un axe assez droit et plus table pour éviter que l’ADN ne s’enroule ou ne s’égare.

52
Q

VrAi oU fAuX. Pour faire l’amorce sur le brin discontinu, la primase n’a pas besoin d’être « liée » à l’hélicase.

A

fAuX. La primase du brin discontinu doit rester collée à l’amorce pour ajouter les ribonucléotides.

53
Q

Quel est le rôle du-clamp-loader?

A

Il reconnaît les amorces d’ARN et y installe un anneau (clamp) sur lequel une ADN polymérase viendra s’installer ensuite.

54
Q

VrAi oU fAuX. Le clamp loader et l’ADN polymérase compétitionnent pour le même site de liaison.

A

VrAi. Une fois la polymérase liée au clamp, le clamp loader ne peut plus lier le clamp.

55
Q

VrAi oU fAuX. Le trou central du clamp est assez gros pour n’entourer qu’un seul brin d’ADN.

A

faux, le trou est assez gros pour entourer la double hélice sans y toucher.

56
Q

Comment fonctionne un clamp?

A
  • en premier, il se lie à l’ADN au niveau de l’amorce, puis il s’associe ensuite avec la polymérase et glisse avec elle
57
Q

Quel est le rôle du clamp?

A

Il permet de maintenir l’ADN polymérase sur le brin matrice. Il empêche l’ADN polymérase de s’éloigner, donc augmente la processivité de l’ADN polymérase.

58
Q

VrAi oU fAuX. L’ADN polymérase ajoute des nucléotides à partir de l’extrémité 5’.

A

faux, c’est à partir de l’extrémité 3’ (OH).

59
Q

Quel groupe trouve-t-on à l’extrémité 5’ d’un nucléotide?

A

Un groupement phosphate.

60
Q

D’où provient l’énergie nécessaire pour ajouter un nucléotide à la chaîne? Il y a 2 façons.

A
  • provient de la rupture du lien avec le premier P du nouveau nucléotide pour former le lien phosphodiester avec la chaîne (ça libère un pyrophosphate - 2 P ensemble, il n’en reste qu’un sur le nucléotide)
  • provient de la rupture du lien entre les 2 phosphates du pyrophosphate, le lien est brisé par la pyrophosphatase
61
Q

VrAi oU fAuX. L’ajout d’un nouveau nucléotide est un processus dit « couplé » et c’est une réaction irréversible.

A

VrAi!

62
Q

VrAi oU fAuX. C’est l’ADN polymérase qui peut distinguer un rNTP (ribonucléotide triphosphate) d’un dNTP (désoxyribonucléotide triphosphate).

A

VrAi. L’ADN polymérase discrimine les rNTP (ribonucléotide triphosphate), la base de l’ARN, à cause de leur groupement OH supplémentaire sur le carbone 2. Ce groupement OH supplémentaire crée de l’encombrement stérique. Le site actif de l’ADN polymérase fait donc de l’exclusion stérique avec ce groupement (ça fit pas).

63
Q

Comment l’ADN polymérase fait pour choisir le bon nucléotide à ajouter?

A

Avec la sélectivité cinétique : seul le nucléotide qui réussit à faire un bon appariement avec le nucléotide de la matrice est dans une bonne position pour permettre la catalyse : le groupement phosphate du nouveau nucléotide est adjacent à l’extrémité 3’ du nucléotide précédent (le rapprochement est nécessaire pour générer l’énergie nécessaire à l’ajout du nucléotide)

64
Q

Quels sont les 3 domaines de l’ADN polymérase? Quelles sont les fonctions de chaque domaine?

A

On la voir comme une main :

  • la paume : site catalytique et vérification du bon appariement de nucléotides dans le sillon mineur (il y a un ralentissement en cas d’erreur)
  • les doigts : ils plient l’ADN matrice pour n’exposer qu’un nucléotide à la fois et ils se « referment » si c’est le bon nucléotide (vérifié par la paume) pour stabiliser l’hélice
  • le pouce : aide à tout retenir ensemble en s’attachant à la charpente sucre-phosphate de l’hélice (ça joue un rôle aussi dans la processivité de la polymérase)
65
Q

De quoi est formé le site catalytique de la paume?

A

Il est formé d’ions métalliques (Mg2+, Zn2+) qui permettent :

  • de favoriser l’interaction entre l’amorce et le nouveau nucléotide en préparant l’extrémité 3’ (OH) du nucléotide précédant pour l’attaque du groupement phosphate du nouveau nucléotide
  • de stabiliser le pyrophosphate produit en neutralisant les charges négatives du pyrophosphate
66
Q

VrAi oU fAuX. La processivité des ADN polymérase est toujours la même.

A

fAuX. Elle varie de quelques nucléotides à 50 000 nucléotides selon le type de polymérase.

67
Q

Qu’est-ce que la processivité d’une processivité des ADN polymérase?

A

C’est le nombre de nucléotides qu’elle ajoute avant de se détacher.

68
Q

Si un mauvais appariement de nucléotides survient dans l’processivité des ADN polymérase, comment fait-elle pour arranger ça?

A

Dans la paume de l’ADN polymérase, se passe une activité exonucléase. La paume ralentit la catalyse (fait de moins bonnes interactions avec le sillon mineur), la polymérase clive le mauvais lien et retire le nucléotide.

69
Q

Qu’est-ce qu’une exonucléase?

A

C’est une nucléase (enzyme) qui ne peut dégrader l’ADN qu’à partir d’une extrémité.

70
Q

Qu’est-ce qu’une endonucléase?

A

C’est une nucléase (enzyme) qui peut dégrader l’ADN au milieu d’une chaîne.

71
Q

Qu’est-ce que le brin continu? Combien nécessite-t-il d’amorces? L’ADN polymérase avance à quel rythme et dans quel sens?

A

C’est le brin qui est synthétisé en continu par l’ADN polymérase. Ne nécessite qu’une seule amorce. L’ADN polymérase avance en même temps et dans la même direction que la fourche de réplication.

72
Q

Qu’est-ce que le brin discontinu? Combien nécessite-t-il d’amorces? L’ADN polymérase avance à quel rythme et dans quel sens?

A

C’est le brin qui est synthétisé en courts fragments par l’ADN polymérase. Il nécessite plusieurs amorces, une par nouveau fragment. L’ADN polymérase se déplace dans le sens contraire de la fourche de réplication (mais toujours en suivant le sens 3’ –> 5’).

73
Q

Comment s’appellent les fragments synthétisés sur le brin discontinu?

A

Les fragments d’Okazaki.

74
Q

VrAi oU fAuX. Les fragments d’Okazaki des procaryotes sont plus courts que ceux des eucaryotes. (pas nécessaire de connaître les nombres exacts)

A

FaUx. Ceux des eucaryotes varient de 100 à 200 nucléotides, tandis que ceux des procaryotes varient de 1 000 à 2 000 nucléotides.

75
Q

L’hélicase se déplace sur quel brin? Le continu ou le discontinu?

A

Le discontinu, car la primase du brin discontinu doit être reliée à l’hélicase pour commencer son amorce.

76
Q

VrAi oU fAuX. L’amorce est faite d’ADN.

A

fAuX. Elle est faite d’ARN.

77
Q

Quelles sont les étapes pour que l’amorce soit remplacée par de l’ADN?

A

1 - la RNase H dégrade les hybrides ARN/ADN. Elle retire tous les nucléotides de l’amorce, sauf le dernier, car elle ne peut couper que le lien entre 2 ribonucléotides. (truc pour s’en rappeler : RNase H, le H est pour hybride)
2 - Une exonucléase retire le dernier nucléotide (celui qui fait le lien avec un désoxyribonucléotide), donc brise le lien ARN-ADN
3 - l’ADN polymérase I comble le trou (synthétise le brin complémentaire à la matrice)
4 - l’ADN ligase attache ensemble les 2 fragments d’ADN en formant une liaison phosphodiester entre les 2 nucléotides adjacents

78
Q

Est-ce que l’ADN polymérase qui fait la synthèse du bout d’ADN pour remplir le trou entre 2 fragments d’Okazaki a besoin d’un anneau? Expliquer.

A
  • Non, car le poseur d’anneau (clamp loader) ne reconnaît que les petites séquences d’ARN que sont les amorces. Ici, l’amorce est enlevée avant l’arrivée de l’ADN polymérase, donc le clamp loader ne pourrait tout simplement par reconnaître l’endroit.
  • Aussi, l’anneau n’est nécessaire que lorsque la séquence à synthétisé est relativement longue, et la longueur d’une amorce est assez courte, soir environ 10 nucléotides.
79
Q

Qu’est-ce qu’une holoenzyme?

A

C’est un terme général décrivant un complexe multiprotéique dans lequel une enzyme « noyau » est associée à des partenaires qui renforcent son activité.

80
Q

Qu’est-ce qu’un réplisome?

A

C’est la combinaison de l’holoenzyme avec l’ensemble des autres protéines essentielles à la machinerie de réplication. On l’appelle aussi le complexe de réplication.

81
Q

Dans quel sens avance le réplisome?

A

Dans le même sens que la fourche de réplication.

82
Q

Comment se passe la coordination des événements de réplication chez E. coli?

A

2 ADN polymérases sont liées entre elles et forment un large complexe protéique nommé ADN polymérase III holoenzyme.
Le brin discontinu est plié en boucle pour respecter la lecture de 3’ vers 5’ (synthèse de 5’ vers 3’).

83
Q

Chez E. coli, qu’est-ce qui détermine la longueur des fragments d’Okazaki?

A

L’interactions plus ou moins forte de l’hélicase avec la primase. Si les interactions sont fortes, alors la primase fait beaucoup d’amorces et donc les brins d’Okazaki sont plus courts (et vice-versa).

84
Q

Chez E. coli, pourquoi l’holoenzyme a de légères interactions avec l’hélicase?

A

pour augmenter la vitesse de l’hélicase, donc augmenter son efficacité

85
Q

Sur le brin discontinu de E. coli, qu’arrive-t-il une fois qu’un fragment est complété par la polymérase?

A
  • la polymérase se détache du clamp, le laissant libre
  • le clamp libre accueille ensuite la RNase H (pour enlever l’amorce), puis les autres enzymes
  • une fois que le fragment d’Okazaki est ressoudé, le clamp loader enlève le clamp de l’ADN
86
Q

Chez E. coli sur le brin discontinu, pourquoi est-ce que l’ADN polymérase reste toujours attachée au réplisome?

A

Pour qu’elle puisse commencer un nouveau fragment rapidement.

87
Q

VrAi oU fAuX. Chez les eucaryotes, le réplisome fonctionne/est fait de la même façon que chez les procaryotes.

A

VrAi eT fAuX. Les mêmes fonctions sont remplies, mais c’est fait par une plus grande variété de protéines et de complexes. Aussi, les modification post-traductionnelles qui dépendent du cycle cellulaire (Cdk et cycline) assurent l’assemblage du réplisome.

88
Q

Eucaryotes. VrAi oU fAuX. Il faut attendre que la réplication soit entièrement complétée avant de voir les nucléosomes s’assembler sur l’ADN.

A

fAuX. Dès que de nouveaux brins sont créés, les nucléosomes s’assemblent sur ces nouveaux brins.

89
Q

Eucaryotes. Que veut dire une « distributive inheritence » lorsqu’on parle des nucléosomes?

A

Cela veut dire que les vieux nucléosomes sont partagés entre les 2 nouveaux brins, donc que ce n’est pas un seul brin qui « hérite » de tous les anciens nucléosomes.

90
Q

Eucaryotes. Comment sont recrutés les nouveaux nucléosomes? Est-ce la même façon que pour les anciens?

A

C’est la clamp qui recrutent les nouveaux. Les anciens, quant à eux, restent attachés en quelque sorte sur l’ADN, donc ils n’ont pas besoin d’être « recrutés », les nouveaux viennent s’assembler entre les vieux.

91
Q

Pourquoi est-il important que les anciens nucléosomes restent aux mêmes endroits sur les 2 nouveaux brins d’ADN?

A

Les anciens nucléosomes se distribuent sur les nouveaux brins tout en restant sur la même séquence sur laquelle ils étaient sur le brin matrice. Cela permet de conserver les mêmes gènes actifs (il est important que les 2 nouveaux brins soient identiques entre eux et identiques au brin matrice).

92
Q

Eucaryotes. Comment se réassemblent les anciens nucléosomes sur les nouveaux brins d’ADN?

A
  • Les tétramères H3-H4 restent attachés, puis se transfèrent sur un nouveau brin après la réplication. Ils peuvent être distribués de manière aléatoire ou conservatrice, les 2 cas ont été observés.
  • Les dimères H2A-H2B quittent complètement, puis se réassemblent après la réplication. Ils compétitionnent avec les nouveaux.
93
Q

Quand on dit que les tétramères H3-H4 restent « attachés » pendant la réplication, ils sont attachés à quoi?

A

Au réplisome, et non à l’ADN directement.

94
Q

Qu’est-ce qui s’occupe des histones pendant la réplication?

A

Les protéines chaperonnes d’histones (Asf1, FACT). Ces protéines s’associent à l’hélicase, puis elles gardent les histones le temps que la machinerie de réplication passe. Ensuite, elles les transfèrent sur un des 2 nouveaux brins.

95
Q

Quel est le nom plus « protéique » de l’hélicase chez les eucaryotes?

A

MCM

96
Q

Comment se passe la « fin » de la réplication chez les procaryotes?

A

Lorsque la réplication du chromosome circulaire est terminés, les 2 molécules filles restent liées comme 2 maillons d’une chaîne. Alors, une topoisomérase II vient les séparer en coupant l’ADN double brin d’une des 2 molécules et en passant l’autre à travers, elle peut ensuite réparer celle qu’elle a coupé.

97
Q

Eucaryotes. Quelle est la 2e fonction des topoisomérases?

A

La convergence des fourches de réplication l’une vers l’autre crée des caténanes (genre d’emmêlement) qui sont coupées, puis ressoudées par les topoisomérases.

98
Q

Qu’est-ce qu’une télomérase? Quel problème peut-elle régler?

A

La télomérase est une polymérase qui peut allonger l’extrémité 3’ du brin matrice.
Puisque l’ADN polymérase a besoin d’une amorce, l’extrémité 3’ d’un chromosome linéaire ne peut pas être répliqué, ce qui résulterait en un raccourcissement des chromosomes à chaque nouvelle génération cellulaire. Les télomérases vont alors allonger le brin matrice pour permettre de créer l’amorce nécessaire pour que le chromosome ne raccourcisse pas à chaque nouvelle réplication.

99
Q

VrAi oU fAuX. Le problème de raccourcissement des chromosomes se retrouve autant chez les procaryotes que chez le eucaryotes.

A

fAuX. Seulement chez les eucaryotes. Les procaryotes n’ont pas ce problème puisque leur ADN est circulaire.

100
Q

Eucaryotes. VrAi oU fAuX. Les télomérases doivent agir sur le brin discontinu et le brin continu.

A

VrAi. Le problème de raccourcissement se retrouve sur les 2 brins.

101
Q

Qu’est-ce que la boucle ce rétrocontrôle négatif de la télomérase?

A

Plus le télomère est long, moins la télomérase est active (elle se fatigue), donc elle finit par se décrocher.

102
Q

Comment la télomérase peut-elle allonger les extrémités 3’ des brins d’ADN?

A
  • Elle contient une séquence d’ARN répétitif (TTAGGG) qui sert de « brin matrice » pour l’allongement du vrai brin matrice. Donc elle ne fait qu’ajouter des séquences répétées grâce à sa propre matrice faite d’ARN. Cette séquence répétée est appelée télomère.
  • Ensuite, le complexe réplicatif continue son travail sur le télomère.
103
Q

Chez l’humain. Comment se « ferme » un double brin d’ADN fraîchement répliqué (donc la fin d’un chromosome)?

A
  • La séquence double brin du télomère (séquence répétée) est reconnue par la protéine TRF2. Cette protéine va alors assurer le positionnement du complexe shelterin (shelter-in, donc abris à l’intérieur).
  • La fin du télomère (synthétisé par la télomérase), soit environ 50 à 300 nucléotides, reste simple brin. La protéine protectrice des télomères (POT1) lie cette séquence simple brin.
  • La fin du simple brin forme alors une boucle, appelée T-Loop, sur laquelle se trouve le complexe shelterin
  • Quand la boucle « revient sur elle-même », le simple brin passe à travers le double brin, et cette ouverture est appelée D-Loop
104
Q

À quoi sert la T-Loop de la fin d’un brin d’ADN?

A

Elle permet de faire la différence avec un bris d’ADN, donc évite les réparations à cet endroit.

105
Q

D’où proviennent les télomérases? Où sont-elles acitves?

A

Elles proviennent des cellules souches et des cellules germinales. Leur activité est programmées et change au cours du développement, ce qui crée un vieillissement cellulaire (les cellules souches ont une limite de multiplication au-delà de laquelle les télomérases sont désactivés).

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