Chapitre 2 Flashcards
Quels sont les types de micro-organismes en fonction de leur préférence de pH
Acidophile
Neutrophile
Alcalophile (basophile)
Responsabilités micro-organismes dans les sols
Directement ou indirectement
- Processus biochimiques
- Transfert d’énergie
- Disponibilité des nutriments
Quels sont les processus importants des micro-organismes
- Dégradation composées xénébiotiques (pesticides)
- Transformation inorganique du N et S (ammoni, nitri, déni, oxydation du S et réduction sulfates)
- Décomposition/minéralisation MO
- Production divers métabolites (hormones, antibiotiques, substances chélatantes)
2 groupes métabolismes
Catabolisme: processus de dégradation
Anabolisme: Processus de formation
Caractéristique des réaction qui fait la production ou utilisation d’énergie
Réaction:
endergonique = consommation d’énergie
exergonique = production d’énergie
Anabolisme avec ender
Cata avec exerg
3 caractéristiques pour classer les stratégies de croissance des micro-organismes (voies métabolique)
Acquisition d’énergie (phototrophie, chimiotrophie)
Donneur d’électrons (lithotrophie, organotrophie)
Source carbone (autotrophie, hétérotrophie)
Explications des caractéristiques des voies métabolique
Phototrophie: Énergie solaire
Chimiotrophie: Énergie en brisant liaison chimique
Lithotrophie: électrons source inorganique
Organotrophie: électrons source organique
Autotrophie: principalement CO2
Hétérotrophie: carbone source organique (production ATP)
Caractéristique de l’accepteur final d’électron
Respiration aérobie: O
Respiration anaérobie: autre
Fermentation: carbone
Texture sol
Sable/limon/argile
Influence la CEC
Structure sol
Rétention d’eau
Structure sol
Granulaire, prismatique, angulaire, massive, particulaire
Agrégation = différents milieu de vie
- À l’intérireur = anoxique
Micro-organismes à l’intérieur agrégats = protégé
Impact
- CEI
- rétention eau
Importance des ratios stochiométriques.
Quels sont les ratios pour bactéries, champi, micro-org. Quels sont les pertes
Rapport C/N/P/S: dicte minéralisation vs immobilisation
Immobilisation = dans le biote, production CO2
Minéralisation: le C et nutriments supplémentaire reste dans la solution et est dispo aux plantes
Bactéries: 8/1
Champignons: 12/1
Micro-org: 10/1
Pertes: 2/3
Incorporation: 1/3
Ratio stoechiométrique (exemple)
C/N: 30/1
C/P: 300/1
C/S: 200/1 à 400/1
En haut de ces ratios = immobilisation
En bas = minéralisation
Dispo max lorsque en bas
Facteurs agrégations
- Taille particules : surface spécifique, équilibre charge/densité
- Régime des eaux : cycle mouillage/séchage
- MO : substrat microbien et action cimentation
- Gestion du sol : dispersion de particules
- Micro-organismes : adhérence des particules et prod d’agents de cimentation
- Macro-organisme : agglomération de particules, canaux, drainage
- Racines fines : action mécanique qui favorise le rapprochement des particules et du mucigel
Porosité du sol
macropore: >30microns
méso: 10-30 microns
micro: <10 microns
Eau plus fortement retenu dans micropores, donc pas dispo au racines de plantes.
Les micro-organismes ont accès à toutes les formes d’eau
Qu’est-ce qu’un colloides?
Sert à quoi ?
Argiles vs colloides org
Petites particules soient minérales ou organiques. Elles possèdent une grande surface spécifique et possèdent des charges
Rétention eau
CEC
pH tampon
Argiles
- Adsorption produits métaboliques toxiques
- Protection physique micro-org
- adsorption antibiotique
Coll org
- Source nutriment
- Stabilisation exoenxymes
- Stimule chimiotaxie
Interaction racines et rhizobium
Par substances chimiotaxie
Substances chimiques qui attirent des organismes du rhizobiomes et permet par exemple la nodulation
pH et effets sur communauté microbienne et fonction
Les populations microbienne sont adaptés à une certaine plage de pH. Donc le pH favorise l’établissement d’une population microbienne. Lorsque le pH est modifié, certaines populations en sont affectés, et leur fonction sont réduits.
Fonctions et limitent pH
- 5.5: baisse nitrification, nodulation
- 4: baisse dénitrification, mycorhizes arbusculaire
- 3: baisse décomposition, ammonification, respiration du sol
pH et nutriments
pH influence grandement la disponibilité des nutriments, car ceux-ci sont plus dilué entre 6-7
Gaz du sol
Même composition que l’air
Plus de CO2, car peu de diffusion et beaucoup de respiration racines et micro-organismes
CO2
Racines 20 - 50%
Micro-organismes 50 - 80%
Rhizosphère ++ car combinaison des 2
Agrégats = milieu hétérogène, anoxique au centre
Potentiel redox
Quels sont les accepteurs d’électrons autres que O
Indique quels sont les éléments accepteur d’électrons. Si le milieu est réducteur ou oxydant
Redox élevé = Force réduction – = milieu oxydant = aérobie
Redox bas = Force réduction ++ = milieu réducteur = anaérobie (méthagénèse), accepteurs d’électrons, N, Mn, Fe, C
Température sol (impact)
Affecte:
- Réactions physiologiques des cellules
- Caractéristiques physico-chimiques de l’environnement
Ceux-ci influencent l’environnement microbien
Température optimale pour activité enzymatique
25 - 35°C
Gradient variation température dans le sol
En haut = plus variable
Se stabilise en profondeur
Types micro-organismes et température
Psychrophiles (-10 à 20)
Mésophiles (10 à 40)
thermophile (35 à 70)
Hyperthermophile (60 à 90)
MAT et MAP sur matière organique
MAT et MAP influence
- biomasse microbienne
- décomposition MO
- activité métabolique
Il y a accumulation lorsque la décomposition microbienne est inférieure à l’accumulation de litière.
Souvent associé aux climats frais, car activité métabolique plus faible
Eau des sols
- Distributions nutriments pour plantes et micro-organismes
- Communication plantes micro-orga (exsudats racinaires)
- Mouvement micro-organismes
- Cycle mouillage/séchage, gel/dégel, important pour libération des substrats et cellules mortes
Potentiel hydrique
- Osmotique: concentration sel élevé vers faible
- Matriciel: particules sol réactives
Matière organique (influencé par quoi, effets, substances humiques)
Influencée par:
- Pédoclimat
- Pratiques culturales
- Qualités intrants
- Micro-organismes
Effet de la MO
- Énergie pour micro-organismes
- stimulant croissance plante
- Effet tampon
- rétention eau
- CEC
- Nutriments
- Meilleure strucutre
Substances humiques:
- Acide fulvique
- Acide humique
- Humine
Croissant: polymérisation, poids moléculaire, stabilité
Décroissant: réactivité, CEC, solubilité