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Chapitre 2 Flashcards

1
Q

transcrit

A

lors la transcription A,G,C,T devient A,G,C,U

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2
Q

traduit

A

lors la synthèse protéique 4 bases d’ADN&ARN devient des protéines

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3
Q

brin antisens/matrice

A

sert à la synthèse du nouveau brin polynucléotidique et directe l’ordre de l’incorporation de rNTP lors la polymérisation d’une chaine d’ARN

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4
Q

ARN polymérase (ARN Pol)

A

catalyse l’appariement complémentaire de rNTP sur la chaine de polymérisation

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5
Q

ARN polymérase 1 et 3

A

spécialisée dans la transcription à de quantités importantes d’ARNr & ARN stables et abondants de petite taille nécessaire à la synthèse protéique

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6
Q

ARN polymérase 2

A

synthétise plusieurs types d’ARNm
quelques à 10 000 copies d’ARNm/cellule
reconnait milliers de promoteurs différents
transcrit des quantités fixes par le milieu extracellulaire

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7
Q

types d’ARN polymérase des eucaryotes

A

1: nucléole - ARNr, 5.8S. 28S
2: nucléoplasme - ARNm, snRNA, microARN
3: nucléoplasme - ARNt, autres petits ARNr

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8
Q

Opéron

A

arrangement de gènes qui opère comme un unité à partir d’un seul promoteur

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9
Q

réprimée

A

ARNm codé est synthétisé à de faibles concentrations lors de la transcription

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10
Q

activée

A

ARNm est produit à de hautes concentrations lors de la transcription

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11
Q

opéron bactérien

A

transcrit en 1 ARNm à partir d’un site de début de la transcription, la régulation des gènes est coordonnée (activés/réprimés de même façon)

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12
Q

expression constitutive

A

expression en tout temp de protéines nécessaires à la survie et croissance
servent à la synthèse ADN & ARN & protéines, transport d’ions, enzymes métaboliques

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13
Q

expression inductible

A

expression sous contrôle positif ou négatif causée par un stress environnemental
régulation hormonale & métabolique (source d’électrons)

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14
Q

séquences de reconnaissance

A

séquences ciblées par l’ARN pol bactérien pour la transcription

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15
Q

promoteur

A

région de séquences spécifiques de désoxyribonucléotides permettant la liaison de la polymérase

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16
Q

région de régulation transcriptionnelle

A

segments ADN qui contrôlent l’expression des gènes (initiation, intensité, temporalité) lors de la transcription

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17
Q

Boite TATA / Pribnow (TATAAT)

A

signaux de démarrage à base de hexanucléotide qui sont situées en amont de -10 à -35 nucléotides en avant

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18
Q

site d’initiation de la transcription

A

endroit précis de l’ADN qui commence la synthèse de l’ARNm grâce à l’ARN polymérase. Début de région transcrite du gène.

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19
Q

séquences consensus

A

séquences retrouvées dans de nombreux gènes

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20
Q

facteurs s

A

initie la transcription en guidant l’ARN polymérase vers les promoteurs spécifiques de l’ADN

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21
Q

motifs de reconnaissance

A

reconnaissance & association de facteurs S à de séquences spécifiques de l’ADN

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22
Q

aval

A

séquence en voie de synthèse lors de la transcription ou traduction

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23
Q

amont

A

séquence devant un point de repère

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24
Q

transcription étapes (3)

A

initiation
élongation
terminaison

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25
initiation étapes (3)
1) formation du complexe fermé avec l'ARN polymérase & facteur S et se fixe au promoteur 2) formation du complexe ouvert avec l'ARN polymérase qui sépare les 2 brins d'ADN sur 14 paires de bases et forme une bulle de transcription. Brin matrice exposé sert comme modèle 3) initiation de la synthèse d'ARN avec l'ARN polymérase qui assemble les premiers nucléotides d'ARN et formation de liaison phosphodiester entre les rNTP (fin initiation)
26
élongation (4)
1) avancement de l'ARN polymérase sur le brin matrice (antisens) de 3' à 5' 2) appariement ADN-ARN avec 8 nucléotides du 3' de l' ARN qui restent appariés au brin matrice de l'ADN 3) polymérisation continue avec ARN polymérase qui ajoute rNTP au 3' de l'ARN et forme des liaisons phosphodiesters 4) ré hybridation de l'ADN double hélice qui se referme automatiquement après la transcription (derrière ARN polymérase)
27
terminaison (4)
1) signal de terminaison grâce à l'ARN polymérase qui reconnait une séquence spécifique de l'ADN (indique la fin) 2) formation de structure de terminaison de l'épingle à cheveux se forme dans l'ARN naissant (provoque l'arrêt) 3) libération de l'ARN (transcrit primaire) par l'ARN polymérase qui se détache de l'ADN 4) recyclage de l'ARN polymérase pour recommencer la transcription
28
3 facteurs de terminaison de E.coli
Rho Tau NusA
29
terminaison Rho(p) dépendante (5)
1) tige boucle de l'ARN n'est pas suivie de segment répétitif poly-U 2) inutile si l'ARN produit n'est pas en cours de traduction (0 ribosomes) 3) c'est une ATPase ARN dépendante qui hydrolyse l'ATP avec l'ARN 4) c'est une hélicase ARN-ADN (protéine hexamère) qui déroule ce duplex 5) un site de pause est nécessaire
30
opérateur
motifs de liaison et de reconnaissance
31
activateur
stimuler l'initiation de la transcription avec un facteur de transcription
32
répresseur
inhiber la transcription avec un facteur de transcription
33
facteur de transcription
protéines de régulation transcriptionnelle
34
effecteurs
petites molécules qui affecte l'affinité avec l'opérateur
35
effecteurs exemple (2)
1) inducteur 2) corépresseur
36
inducteur
diminue l'affinité de liaison du répresseur sur l'opérateur
37
corépresseur
augmente l'affinité de liaison du répresseur sur l'opérateur
38
facteurs de transcription exemple (2)
1) répresseur 2) activateur
39
opéron lac
région de régulation transcriptionnelle avec des sites capables de lier des facteur positifs ou négatifs
40
région de l'opéron lac (3)
1) opérateur lac 2) promoteur lac 3) site CAP
41
opérateur lac
séquence liant le répresseur lac codé par lacl
42
promoteur lac
séquence liant l'ARN polymérase & facteur s70
43
site CAP
séquence liant la protéine activatrice des catabolites / CAP
44
le premier gène codé par l'opéron lac est...
lacZ (b-galactosidase)
45
lacZ
encode b-galactosidase qui décompose le lactose
46
lacY
encode la galactosidase perméase (protéine de transport au lactose)
47
lacA
encode la thiogalactoside acétyltransférase (essentiel mais rôle incertain)
48
lacI
sous le contrôle de son propre promoteur encode un répresseur bloquant la transcription de l'opéron lac
49
Sans lactose...
la liaison du répresseur lac qui est codée par lacI à la séquence opérateur lac bloque l'initiation de la transcription par l'ARN polymérase
50
avec lactose
le lactose se fixe aux sites spécifiques de liaison dans tous les unités du répresseur lac tétramérique et mène au changement conformationnel de celui-ci. le complexe répresseur-lactose se dissocie de l'opérateur, afin que l'ARN polymérase initie la transcription de l'opéron lac
51
avec lactose ET glucose
mène au même processus que le lactose mais à un taux de transcription très faible (# copies d'ARNm/minutes)
52
protéine cap
système de surveillance de glucose bactérien (énergie) qui catalyse la synthèse d'AMPc à partir de l'ATP grâce à l'adénylate cyclase
53
répression catabolique de l'opéron lactose
glucose réprime la transcription de l'opéron lac, alors aucune synthèse d'AMPc...aucun AMPc disponible pour lier au CAP
54
facteurs de transcription généraux
protéines essentielles à l'initiation de la transcription des eucaryotes
55
facteurs de transcription généraux (utilité)
permettent ARN polymérase 2 de se fixer au promoteur du gène et débuter la synthèse d'ARN
56
éléments importants à l'initiation transcriptionnelle (2)
1) éléments initiateurs riches en pyrimidine situés en proximité du site de démarrage de la transcription 2) # variable de boîtes CCAAT ou GC en amont de la boîte TATA
57
facteurs de transcription généraux exemples (3)
1) protéine de liaison à la boite TATA 2) facteurs associés à TBP 3) facteurs de transcription 2
58
facteurs de transcription spécifiques (utilité)
régule sélectivement l'expression des gènes
59
facteurs de transcription spécifiques
groupe de protéines variées qui reconnaissent et associent l'ADNdb sur des sites conscensus régulateurs du site d'initiation
60
éléments importants de la régulation transcriptionnelle (2)
1) une part des séquences déterminées d'ADN doivent fixer des facteurs de transcription spécifiques 2) une part ces régulateurs transcriptionnels interagissent avec le complexe de démarrage
61
facteurs de transcription spécifiques exemples de familles (4)
1) hélice boucle hélice 2) hélice tour hélice 3) doigt de zinc 4) glissière de leucine
62
gel à retardement
technique qui étudie les interactions ARN-protéine ou ADN-protéine en détectant si une protéine se lie à une séquence spécifique de ARN ou ADN, Ceci est noté par un ralentissement de la migration sur gel d'électrophorèse
63
organisation des gènes eucaryotes
formé de fragments de séquences codantes (exons) et non codantes (introns) préARNm subissent des modifications post transcriptionnelles lors la maturation de l'ARN
64
maturation d'ARNm des eucaryotes
traduction = cytoplasme transcription & maturation = noyau préARNm subissent des modifications avant le transport hors du noyau au cytoplasme
65
modification 5'
quand l'extrémité 5' de la chaine ARNm atteint la surface de l'ARN polymérase, l'extrémité 5' est protégée par une modification = coiffe méthylée 5' (ajout d'un 7-méthyl-guanylate)
66
modification 5' (processus)
la guanylate transférase ajoute un GTP à bout 5' de l'ARNm, suivi d'une méthylation par une méthylase. Cette coiffe 5' protège l'ARNm de la dégradation et facilite sa reconnaissance par les ribosomes
67
modification 3'
le signal de clivage de l'ARNm (signal de polyadénylation 5' AAUAAA 3') communique à l'endonucléase CPSF qui couple 1-3 nucléotides en aval du signal
68
modification 3' (processus)
CPSF recrute la queue poly(A) polymérase, ajoutant une queue poly(A) stabilisé par la PABP, protégeant l'ARNm et facilitant son export cytoplasmique
69
épissage
excision des régions introniques et rétablie la jonction entre 2 régions exoniques flanquantes....effectué par complexes protéiques spécialisés (particules ribonucléoprotéiques hétérogènes nucléaires = hnRNP)
70
épissosome (spliceosome)
complexe d'ARN primaire, hnRNP, snARN et petite protéines reconnaissant snARN pour former une activité nucléase
71

Biologie Moléculaire (3 decks)

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