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Biomol > Chapitre 2 > Flashcards

Chapitre 2 Flashcards

1
Q

La réplication de l’ADN repose sur : (4)

A

1)La complémentarité des base azotées
2)Elle est possible grace à la machinerie qui assure fidélité, vitesse et perfection
3)Se fait en plusieurs étapes
4) le nouveau brin est synthétisé dans le sens 3’ vers 5’; c’est la direction sur le brin matrice qui est de 5’ vers 3’

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Q

Quelle lien se forme entre les nucléotides lors de la réplication

A

Lien phosphodiestère et un pyrophosphate est expulsé, le pyrophosphate est transformé en 2 phosphate

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3
Q

La réplication commence ou

A

À l’origine de réplication, une séquence plus ou moins précise
1 seul rigide de réplication pour les procaryotes

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4
Q

Différence entre les procaryotyes et les eukaryotes en matière d’origine de réplication

A

Procaryotes : 1
Eucaryotes: entre 30000-50000 à chaque cycle cellulaire

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5
Q

Origine de réplication

A

L’origine de réploication est le site spécifique ou commence la réplication.Celui-ci à pour caractéristique de contenir bcp de A:T

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6
Q

Quelle est la différence entre l’origine de réplication et le réplicateur

A

Le réplicateur est l’ensemble des séquences nécessaire pour entamer la réplication,
L’origine de réplication fait partie du réplicateur
Les sites 9-mère et 13-mère font aussi partie du réplicateur

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7
Q

Site 9 fonctions

A

Les proteines initiatrices lie la séquence spécifique du site 9-mère
Est le socle pour l’assemblage du complexe d’initiation

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8
Q

Site 13-mère fonctions

A

Lieu de séparation des brin, séquence riche en A:T

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9
Q

À quoi fait référence le #-mère

A

Relatif à la longueur de la séquence

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10
Q

Quelles sont les fonctions des proteines initiatrices(3)

A

1)reconnaissance et liaison de ori
2) recrutement des protienes nécessaire à la réplication
3)chez les PROCARYOTES: ouvrir la double hélice

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11
Q

Fonction de DnaA chez les procaryote

A

La proteine lie les sites 9-mères
Quand celle-ci lie l’atp, elle interagit avec le site 13-mère et permet la séparation des 2 brins

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12
Q

Est-ce que la liaison de ORC aboutit directement à la dénaturation de l’ADN

A

Non

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13
Q

La reconnaissance de l’ORI est séquence spécifique (vrai ou faux)

A

Faux, elle se base sur les motifs structurels de l’ADN

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14
Q

Caractéristiques des motifs structurels(4)

A

Séquences riches en A:T
Une structure particulière d’ADN
Région libre de nucléosomes
Région impliqué dans l’initiation de la trasncription

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15
Q

Toute les ORI se déclenche en meme temps (vrai ou faux)

A

Faux, les ORI ne sont pas déclenchée en meme temps

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16
Q

Fonction de la topoisomérase

A

Enzyme qui lie adn double brin devant la fourche de réplication et réduit la tension

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17
Q

Helicase fonction

A

Enzyme en forme d’anneau qui entraine la séparation des brins en brisant les liaison H et utiliser l’ATP

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18
Q

Les proteines fixatrices fonction

A

Elle stabilise les 2 brins séparés de l’ADN matrice jusqu’à la synthèse de brins complémentaires, empêchant ainsi la formation d’épingle de nucléotide entre les brins complémentaires(formation d’épingle bloque la réplication)

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19
Q

Quels sont les deux problèmes répertoriés lors de la réplication

A

1)probleme de réappariement des nucléotides
2)problèmes de tension

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20
Q

Hélice caractéristiques physiques

A

Enzyme hexamerique forme d’anneau, fixe adn simple brin, se déplace rapidement

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21
Q

Fonction hélicase

A

Hydrolyse L’ATP pour se déplacer
Elle entraine la séparation des

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21
Q

Fonction hélicase

A

Hydrolyse L’ATP pour se déplacer
Elle entraine la séparation des Deux brins
Haute processitité(adn dénaturer avant de se détacher)
Adn passe par le pore central de celle-ci

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22
Q

Proteines fixatrices d’ADN monécaténaire

A

Empêche la formation des liens hydrogènes entre les bases complémentaires
Stabilise les 2 brins jusqu’à ce que le nouveau brin complémentaire soit synthétisé
Empêche la formation d’épingle dans le meme brin

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23
Q

Topoisomérases 1 et 2 différence

A

1: coupe et ressoude un des brins d’ADN
2: coupe et ressoude les deux brins d’ADN

24
Q

De quoi ont besoin les ADN pol. Pour fonctionner

A

Elles ont besoin d’une amorce 3’-OH pour entamer la synthèse de novo

25
Q

C’est quoi une primase

A

ARN pol. Qui synthétise des amorce D’arn en face d’un brin mono caténaire matrice
Les ribonucléotides seront ensuite remplacé par des dntp

26
Q

Poseur d’anneau fonction

A

Reconnaît l’amorce d’ARN
Installe un anneau coulissant et recrute une adn pol.
Avec de atp, il rompt les sous unité de l’anneau pour qu’il puisse lier la polymérase

27
Q

Si l’anneau lie la polymérase, peut-t’il lier à nouveau le poseur d’anneau

A

Non

28
Q

Différence avec un anneau coulissant et sans anneau coulissant

A

Sans: adn pol. Se détache au bout de 20 à 100 pb et s’éloigne
Avec: adn pol. Se détache encore mais l’anneau l’empêche de s’éloigner

29
Q

Adn pol. Fonction

A

Ajoute des dntp à l’extrémité 3’-OH d’un brin déjà former selon la complémentarité des bases azotés
Elle a besoin d’une amorce d’ARN

30
Q

Adn pol. Chez les procaryotes

A

Adn pol1 : substitution des amorces d’arn, réparation de l’ADN, fonction d’exonucléase 5’
Adn pol3: réplicationn du chromosome

31
Q

Adn pol chez les eucaryotes

A

Adn pol. Delta: synthèse du brin discontinue, réparation(NER) et BER
Adn pol epsilon: synthèse du brin continue, NER et BER
Adn pol alpha :synthèse des amorces d’ADN

32
Q

Quelle est la différence entre les primases et les adn pol alpha

A

Primase= amorce d’arn
Adn pol alpha: amorce adn

33
Q

Que permet le site actif de l’ADN pol.

A

La sélectivité cinétique est un concept important en chimie, mais il est également pertinent en biologie moléculaire. L’ADN polymérase est une enzyme qui joue un rôle crucial dans la réplication de l’ADN, en catalysant la synthèse de nouveaux brins d’ADN à partir de brins existants. La sélectivité cinétique de l’ADN polymérase est importante car elle permet à l’enzyme de sélectionner les bons nucléotides pour former les nouveaux brins d’ADN.

Lors de la réplication de l’ADN, l’ADN polymérase doit sélectionner les nucléotides corrects pour former des liaisons covalentes avec les brins d’ADN existants. Si l’enzyme sélectionne le mauvais nucléotide, cela peut entraîner des erreurs de réplication et des mutations dans l’ADN. La sélectivité cinétique de l’ADN polymérase permet d’éviter ces erreurs en favorisant la formation de liaisons covalentes entre les nucléotides appropriés. En conséquence, la sélectivité cinétique de l’ADN polymérase est essentielle pour la stabilité et l’intégrité du génome.

34
Q

Comment l’ADN pol est capable de distinguer le rntp du dntp

A

Cette discrimination est possible grace à l’exclusion stérique (présence d’un OH en position 2’ du ribose)

35
Q

Comment le dntp apporte de l’énergie

A

1)la rupture du lien P
2) la rupture du lien p entre les phosphate du pyrophosphate
La réaction est irréversible

36
Q

L’ADN pol possède 3 domaines, lesquels sont-ils

A

1)paume: site catalytique et de vérification de l’appartement via le sillon mineur , contient un ion métallique qui favorise l’interaction entre l’amorce et le nouveau Nt
2) doigts: plient l’ADN matrice pour exposer les nucléotides un à la fois, se referme lorsque le bon appariement fut effectué
3)pouce: aide à maintenir le tout ensemble, joue un role dans la processivité de l’enzyme

37
Q

Le réplisome avance dans quel sens

A

Avance dans le sens de la fourche
L’interaction des adn pol aux réplisome leur permet de travailler dans des sens opposé, mais dans la meme direction

38
Q

Chaque fourche de réplication synthétise 2 brins, lesquels sont-ils

A

Le brin continu et le brin discontinu

39
Q

Brin continu

A

Avance dans la meme direction que la fourche de réplication , nécessite une seule amorce , brin synthétisé en continu par la adn pol

40
Q

Le brin discontinue

A

L’ADN pol s’éloigne de la fourche de réplication en synthétisant de court fragment d’okazaki
Au fur et à mesure que de l’œil de réplication s’agrandit la synthèse de nouveau fragment démarre
Nécessite plusieurs amorce

41
Q

Tailles dès fragment chez les eucaryotes vs procaryotes

A

P: 100-200
E:1000-2000

42
Q

Chez procaryotes nombre adn pol. Actif sur un brin

A

2-3 sur le brin continu et discontinu
Présente dans un complexe multiproteiques appelé adn pol 3 holoenzyme
Holoenzyme: complexe protéique dans lequel une enzyme est associé à des partenaires qui renforce son activité

43
Q

Qu’est-ce qu’un réplisome

A

Holoenzyme+autres proteines essentielles à la machinerie de réplication

44
Q

Le brin discontinu lors de la réplication

A

Forme une boucle d’ADNsb
Quand adn pol finit la synthèse d’un brin d’okazaki, elle se détache du brin mais reste associé au réplisome pour commencer la synthèse d’un nouveau brin

45
Q

Quels sont les éléments que l’on retrouve dans un réplisomes(Procaryote)

A

Les pol. Le poseur d’anneau, l’anneau coulissant
Liaison de l’hélice se à l’ADN pol 3, ce qui augmente la vitesse de séparation des deux brins
Faible interaction entre l’hélicase et les primase(la force d’interaction entre elles détermine la longueur du fragment d’okazaki, plus l’interaction est forte plus le fragment est petit)
Ensemble de protienes participant à la fourche de réplication définisse le réplisome)

46
Q

Quels sont les éléments que l’on retrouve dans un réplisomes(Eucaryotes)

A

Adn pol alpha, delta et epsilon
Complexe protéique distinct du poseur d’anneaux assurant le maintien du réplisome
Poseur d’anneau est éjecté suite à l’association de celui-ci avec l’ADN
Modifications post traductionnelle dépendante du cycle cellulaire et assurent l’assemblage du réplisome

47
Q

Retrait des amorces étapes

A

1) rnase H dégrade l’hybride ADN-ARN, retire tous les nucléotide à l’exception du dernier
2) exonucléase 5’ retire le dernier nucléotide
3) adn pol 1(pour les procaryotes) comble la brèche
4) adn ligase: attache le fragment en réformant des liaison phosphodiester entre les deux nucléotides adjacents

48
Q

Aptitudes de correction des adn pol.

A

L’activité exonucléase permet d’éditer les séquence d’ADN
L’ajout incorrecte d’un nt induit un ralentissement de la catalyse, la pol clive ce lien et retire le mauvais nucléotide , ce qui permet de réduire le taux d’erreur final

49
Q

Quelle est la différence entre une exonucléase et une endonucléase

A

Exonucléase: qui dégrade à partir de l’extrémité
Endonucléase: qui coupe un brin d’ADN en cours de chaine

50
Q

Comment appelle-t-on la distribution aléatoire de histones entre les deux brins lors de la réplication

A

Distributive inheritance

51
Q

Les nucléosomes lors de la synthèse du nouveau brin(4)

A

Maintien de H3-H4 au réplisome
Recrutement par les anneaux coulissant
Assemblage avec de nouveau H2A-H2B
Transfert des marqueurs post traductionnel sur les histones

52
Q

Les télomérases sont la solution à un problème, lequel ?

A

Elle referche la brèche faite par le retrait de la dernière amorce du brin discontinu , si celle-ci ne sont pas présentes, il y a un raccourcissement

53
Q

Fonctionnement de la télomérase

A

Une partie de l’arn est utilisé comme matrice pour allongé le brin matrice(parental)
Ajoute tjrs la meme séquence soit: 5’GGTTAG3’, recommence jusqu’à ce que le brin soit assez long pour que l’enzyme arrête sont activé
Cette élongation du brin parental serra utilisé comme matrice pour le brin néosynthétisé

54
Q

À quel moment la télomérase est active

A

Pendant le devellopement des cellules germinales

55
Q

Après le travail des télomérases, il reste tjrs 50-300 nucléotides simples brins sur le brin parental, comment éviter les bris

A

Les séquences sont reconnues par des proteines protectrice et permettent la formation d’une boucle

56
Q

Par quel protéine la séparation des chromosome circulaire est assurée

A

La topoisomérase 2, car elles ont la capacité de couper les d’adndb et de passer à travers cette coupure la deuxième molécule ‘adndb

57
Q

La fonctions des topoisomérase chez les eucaryotes lors de la terminaison de la réplication

A

Les caténanes due à la convergence des fourche doivent etre résolues

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