Chapitre 2 Flashcards
La réplication de l’ADN repose sur : (4)
1)La complémentarité des base azotées
2)Elle est possible grace à la machinerie qui assure fidélité, vitesse et perfection
3)Se fait en plusieurs étapes
4) le nouveau brin est synthétisé dans le sens 3’ vers 5’; c’est la direction sur le brin matrice qui est de 5’ vers 3’
Quelle lien se forme entre les nucléotides lors de la réplication
Lien phosphodiestère et un pyrophosphate est expulsé, le pyrophosphate est transformé en 2 phosphate
La réplication commence ou
À l’origine de réplication, une séquence plus ou moins précise
1 seul rigide de réplication pour les procaryotes
Différence entre les procaryotyes et les eukaryotes en matière d’origine de réplication
Procaryotes : 1
Eucaryotes: entre 30000-50000 à chaque cycle cellulaire
Origine de réplication
L’origine de réploication est le site spécifique ou commence la réplication.Celui-ci à pour caractéristique de contenir bcp de A:T
Quelle est la différence entre l’origine de réplication et le réplicateur
Le réplicateur est l’ensemble des séquences nécessaire pour entamer la réplication,
L’origine de réplication fait partie du réplicateur
Les sites 9-mère et 13-mère font aussi partie du réplicateur
Site 9 fonctions
Les proteines initiatrices lie la séquence spécifique du site 9-mère
Est le socle pour l’assemblage du complexe d’initiation
Site 13-mère fonctions
Lieu de séparation des brin, séquence riche en A:T
À quoi fait référence le #-mère
Relatif à la longueur de la séquence
Quelles sont les fonctions des proteines initiatrices(3)
1)reconnaissance et liaison de ori
2) recrutement des protienes nécessaire à la réplication
3)chez les PROCARYOTES: ouvrir la double hélice
Fonction de DnaA chez les procaryote
La proteine lie les sites 9-mères
Quand celle-ci lie l’atp, elle interagit avec le site 13-mère et permet la séparation des 2 brins
Est-ce que la liaison de ORC aboutit directement à la dénaturation de l’ADN
Non
La reconnaissance de l’ORI est séquence spécifique (vrai ou faux)
Faux, elle se base sur les motifs structurels de l’ADN
Caractéristiques des motifs structurels(4)
Séquences riches en A:T
Une structure particulière d’ADN
Région libre de nucléosomes
Région impliqué dans l’initiation de la trasncription
Toute les ORI se déclenche en meme temps (vrai ou faux)
Faux, les ORI ne sont pas déclenchée en meme temps
Fonction de la topoisomérase
Enzyme qui lie adn double brin devant la fourche de réplication et réduit la tension
Helicase fonction
Enzyme en forme d’anneau qui entraine la séparation des brins en brisant les liaison H et utiliser l’ATP
Les proteines fixatrices fonction
Elle stabilise les 2 brins séparés de l’ADN matrice jusqu’à la synthèse de brins complémentaires, empêchant ainsi la formation d’épingle de nucléotide entre les brins complémentaires(formation d’épingle bloque la réplication)
Quels sont les deux problèmes répertoriés lors de la réplication
1)probleme de réappariement des nucléotides
2)problèmes de tension
Hélice caractéristiques physiques
Enzyme hexamerique forme d’anneau, fixe adn simple brin, se déplace rapidement
Fonction hélicase
Hydrolyse L’ATP pour se déplacer
Elle entraine la séparation des
Fonction hélicase
Hydrolyse L’ATP pour se déplacer
Elle entraine la séparation des Deux brins
Haute processitité(adn dénaturer avant de se détacher)
Adn passe par le pore central de celle-ci
Proteines fixatrices d’ADN monécaténaire
Empêche la formation des liens hydrogènes entre les bases complémentaires
Stabilise les 2 brins jusqu’à ce que le nouveau brin complémentaire soit synthétisé
Empêche la formation d’épingle dans le meme brin
Topoisomérases 1 et 2 différence
1: coupe et ressoude un des brins d’ADN
2: coupe et ressoude les deux brins d’ADN
De quoi ont besoin les ADN pol. Pour fonctionner
Elles ont besoin d’une amorce 3’-OH pour entamer la synthèse de novo
C’est quoi une primase
ARN pol. Qui synthétise des amorce D’arn en face d’un brin mono caténaire matrice
Les ribonucléotides seront ensuite remplacé par des dntp
Poseur d’anneau fonction
Reconnaît l’amorce d’ARN
Installe un anneau coulissant et recrute une adn pol.
Avec de atp, il rompt les sous unité de l’anneau pour qu’il puisse lier la polymérase
Si l’anneau lie la polymérase, peut-t’il lier à nouveau le poseur d’anneau
Non
Différence avec un anneau coulissant et sans anneau coulissant
Sans: adn pol. Se détache au bout de 20 à 100 pb et s’éloigne
Avec: adn pol. Se détache encore mais l’anneau l’empêche de s’éloigner
Adn pol. Fonction
Ajoute des dntp à l’extrémité 3’-OH d’un brin déjà former selon la complémentarité des bases azotés
Elle a besoin d’une amorce d’ARN
Adn pol. Chez les procaryotes
Adn pol1 : substitution des amorces d’arn, réparation de l’ADN, fonction d’exonucléase 5’
Adn pol3: réplicationn du chromosome
Adn pol chez les eucaryotes
Adn pol. Delta: synthèse du brin discontinue, réparation(NER) et BER
Adn pol epsilon: synthèse du brin continue, NER et BER
Adn pol alpha :synthèse des amorces d’ADN
Quelle est la différence entre les primases et les adn pol alpha
Primase= amorce d’arn
Adn pol alpha: amorce adn
Que permet le site actif de l’ADN pol.
La sélectivité cinétique est un concept important en chimie, mais il est également pertinent en biologie moléculaire. L’ADN polymérase est une enzyme qui joue un rôle crucial dans la réplication de l’ADN, en catalysant la synthèse de nouveaux brins d’ADN à partir de brins existants. La sélectivité cinétique de l’ADN polymérase est importante car elle permet à l’enzyme de sélectionner les bons nucléotides pour former les nouveaux brins d’ADN.
Lors de la réplication de l’ADN, l’ADN polymérase doit sélectionner les nucléotides corrects pour former des liaisons covalentes avec les brins d’ADN existants. Si l’enzyme sélectionne le mauvais nucléotide, cela peut entraîner des erreurs de réplication et des mutations dans l’ADN. La sélectivité cinétique de l’ADN polymérase permet d’éviter ces erreurs en favorisant la formation de liaisons covalentes entre les nucléotides appropriés. En conséquence, la sélectivité cinétique de l’ADN polymérase est essentielle pour la stabilité et l’intégrité du génome.
Comment l’ADN pol est capable de distinguer le rntp du dntp
Cette discrimination est possible grace à l’exclusion stérique (présence d’un OH en position 2’ du ribose)
Comment le dntp apporte de l’énergie
1)la rupture du lien P
2) la rupture du lien p entre les phosphate du pyrophosphate
La réaction est irréversible
L’ADN pol possède 3 domaines, lesquels sont-ils
1)paume: site catalytique et de vérification de l’appartement via le sillon mineur , contient un ion métallique qui favorise l’interaction entre l’amorce et le nouveau Nt
2) doigts: plient l’ADN matrice pour exposer les nucléotides un à la fois, se referme lorsque le bon appariement fut effectué
3)pouce: aide à maintenir le tout ensemble, joue un role dans la processivité de l’enzyme
Le réplisome avance dans quel sens
Avance dans le sens de la fourche
L’interaction des adn pol aux réplisome leur permet de travailler dans des sens opposé, mais dans la meme direction
Chaque fourche de réplication synthétise 2 brins, lesquels sont-ils
Le brin continu et le brin discontinu
Brin continu
Avance dans la meme direction que la fourche de réplication , nécessite une seule amorce , brin synthétisé en continu par la adn pol
Le brin discontinue
L’ADN pol s’éloigne de la fourche de réplication en synthétisant de court fragment d’okazaki
Au fur et à mesure que de l’œil de réplication s’agrandit la synthèse de nouveau fragment démarre
Nécessite plusieurs amorce
Tailles dès fragment chez les eucaryotes vs procaryotes
P: 100-200
E:1000-2000
Chez procaryotes nombre adn pol. Actif sur un brin
2-3 sur le brin continu et discontinu
Présente dans un complexe multiproteiques appelé adn pol 3 holoenzyme
Holoenzyme: complexe protéique dans lequel une enzyme est associé à des partenaires qui renforce son activité
Qu’est-ce qu’un réplisome
Holoenzyme+autres proteines essentielles à la machinerie de réplication
Le brin discontinu lors de la réplication
Forme une boucle d’ADNsb
Quand adn pol finit la synthèse d’un brin d’okazaki, elle se détache du brin mais reste associé au réplisome pour commencer la synthèse d’un nouveau brin
Quels sont les éléments que l’on retrouve dans un réplisomes(Procaryote)
Les pol. Le poseur d’anneau, l’anneau coulissant
Liaison de l’hélice se à l’ADN pol 3, ce qui augmente la vitesse de séparation des deux brins
Faible interaction entre l’hélicase et les primase(la force d’interaction entre elles détermine la longueur du fragment d’okazaki, plus l’interaction est forte plus le fragment est petit)
Ensemble de protienes participant à la fourche de réplication définisse le réplisome)
Quels sont les éléments que l’on retrouve dans un réplisomes(Eucaryotes)
Adn pol alpha, delta et epsilon
Complexe protéique distinct du poseur d’anneaux assurant le maintien du réplisome
Poseur d’anneau est éjecté suite à l’association de celui-ci avec l’ADN
Modifications post traductionnelle dépendante du cycle cellulaire et assurent l’assemblage du réplisome
Retrait des amorces étapes
1) rnase H dégrade l’hybride ADN-ARN, retire tous les nucléotide à l’exception du dernier
2) exonucléase 5’ retire le dernier nucléotide
3) adn pol 1(pour les procaryotes) comble la brèche
4) adn ligase: attache le fragment en réformant des liaison phosphodiester entre les deux nucléotides adjacents
Aptitudes de correction des adn pol.
L’activité exonucléase permet d’éditer les séquence d’ADN
L’ajout incorrecte d’un nt induit un ralentissement de la catalyse, la pol clive ce lien et retire le mauvais nucléotide , ce qui permet de réduire le taux d’erreur final
Quelle est la différence entre une exonucléase et une endonucléase
Exonucléase: qui dégrade à partir de l’extrémité
Endonucléase: qui coupe un brin d’ADN en cours de chaine
Comment appelle-t-on la distribution aléatoire de histones entre les deux brins lors de la réplication
Distributive inheritance
Les nucléosomes lors de la synthèse du nouveau brin(4)
Maintien de H3-H4 au réplisome
Recrutement par les anneaux coulissant
Assemblage avec de nouveau H2A-H2B
Transfert des marqueurs post traductionnel sur les histones
Les télomérases sont la solution à un problème, lequel ?
Elle referche la brèche faite par le retrait de la dernière amorce du brin discontinu , si celle-ci ne sont pas présentes, il y a un raccourcissement
Fonctionnement de la télomérase
Une partie de l’arn est utilisé comme matrice pour allongé le brin matrice(parental)
Ajoute tjrs la meme séquence soit: 5’GGTTAG3’, recommence jusqu’à ce que le brin soit assez long pour que l’enzyme arrête sont activé
Cette élongation du brin parental serra utilisé comme matrice pour le brin néosynthétisé
À quel moment la télomérase est active
Pendant le devellopement des cellules germinales
Après le travail des télomérases, il reste tjrs 50-300 nucléotides simples brins sur le brin parental, comment éviter les bris
Les séquences sont reconnues par des proteines protectrice et permettent la formation d’une boucle
Par quel protéine la séparation des chromosome circulaire est assurée
La topoisomérase 2, car elles ont la capacité de couper les d’adndb et de passer à travers cette coupure la deuxième molécule ‘adndb
La fonctions des topoisomérase chez les eucaryotes lors de la terminaison de la réplication
Les caténanes due à la convergence des fourche doivent etre résolues
