Chapitre 19 : régulation génétique chez les Eucaryotes Flashcards
Quelle est la différence entre les procaryotes et le eucaryotes concernant le nombre d’activateurs et de répresseur?
Le nombre est beaucoup plus élevé chez les eucaryotes.
Que sont les séquences régulatrices?
L’ensemble des sites de liaison aux régulateurs.
Que peuvent faire les amplificateurs (enhancers), ces derniers étant des sites de liaisons groupées?
Peuvent activer un gène à distance soit en amont ou en aval de ce dernier.
Vrai ou faux : tout comme chez les bactéries, l’étape la plus ciblée de la régulation chez les eucaryotes est l’élongation.
Faux, c’est l’initiation.
Quelle est la plus grande différence entre les eucaryotes et les procaryotes au niveau de la régulation transcriptionnelle?
En raison de la présence de nucléosomes, les eucaryotes requièrent souvent le recrutement de complexes de modification ou de remodelage (gene silencing).
Vrai ou faux : tout comme chez les bactéries, les activateurs des eucaryotes sont constitués de 2 domaines.
Vrai, le domaine d’activation (interagit avec d’autres complexes protéiques) et le domaine de liaison à l’ADN.
Nomme les 4 motifs structuraux rencontrés chez les activateurs eucaryotes.
- Motif hélice-coude-hélice
- Motif à doigt de zinc
- Motif de fermeture éclair à leucine (homo ou hétérodimères)
- Motif hélice-boucle-hélice (homo ou hétérodimères)
Quelle hélice fait contact dans le grand sillon?
Hélice alpha.
Vrai ou faux : les domaines d’activation n’ont pas de structures bien définies.
Vrai.
Quelles genre d’unités répétées sont communes dans les domaines d’activation eucaryotes?
Des unités contenant une petite séquence riche en acides aminés (GLU et ASP) et un caractère hydrophobe.
Chez les eucaryotes, les activateurs recrutent les complexes protéiques au niveau du …..?
Promoteur.
Vrai ou faux : Comme chez les bactéries, les activateurs eucaryotes se lient souvent directement à l’ARN polymérase.
Faux, très rare. Les activateurs vont la plupart du temps faire contact avec le médiateur ou TFIID au lieu de directement se lier à l’ARN polymérase.
Pourquoi les activateurs eucaryotes recrutent des complexes de modification ou de remodelage de la chromatine?
Pour rendre accessible le promoteur.
Quel est le rôle du médiateur?
Aide à rendre les promoteurs plus accessibles au niveau des complexes.
Certains activateurs eucaryotes lient des unités régulatrices (enhancers ; amplificateurs), qui sont localisées …..?
Très loin du promoteur, en amont ou en aval.
Que se produit-il au niveau du recrutement des complexes protéiques lorsque les activateurs lient des amplificateurs (à distance)?
Une courbature de l’ADN, via des protéines architecturales, est essentielle pour recruter les complexes protéiques.
Généralement, un amplificateur contrôle la transcription de combien de gènes?
1 seul.
Puisque l’amplificateur agit à distance, qu’est-ce qui brise les communications entre le promoteur et l’amplificateur?
Un isolateur (insulator).
VRAI OU FAUX : plusieurs activateurs différents peuvent être requis pour activer l’expression d’un gène.
Vrai.
Qu’est-ce que la synergie entre des activateurs?
La liaison de plusieurs activateurs a un effet lus grand que la somme de chacun d’entre eux.
De quoi peut résulter la synergie?
De la coopérativité entre activateurs pour faciliter leur liaison respective à l’ADN.
Nomme les étapes su signal transduction pathway.
- Réception du signal/stimuli
- Transduction (modification d’un activateur)
- Réponse
Pourquoi la transduction chez les procaryotes est beaucoup plus simple que chez les eucaryotes?
Car ils n’ont pas de noyau (ADN est dans le cytoplasme). Les eucaryotes ont besoin d’un récepteur qui va initier le pathway.
Quels sont les 4 modes de répression chez les eucaryotes?
- Compétition (répresseur a le même site de fixation que l’activateur).
- Inhibition (répresseur à proximité de l’activateur et interagit avec celui-ci).
- Répression directe
- Répression indirecte (histones altèrent les nucléosomes et inhibent la transcription).
Quelles sont les seules régions transcrit dans la chromatine?
Les régions d’euchromatine car c’est la forme relâchée.
Nomme une autre fonction des isolateurs.
Stopper la propagation de l’hétérochromatine.
Le silencing des gènes résultent de ….? C’est quoi, le silencing?
- Des modifications des histones et de l’ADN.
- C’est quand le gène peut être transcrit de l’un des 2 chromosomes parentaux, mais pas les deux ; la méthylation empêche la fixation des protéines au niveau de l’isolateur.
La méthylation de l’ADN joue un rôle important dans…?
La répression complète de gènes.