Chapitre 1.5

Question 1

Niveaux organisationnels

Answer 1

Structure primaire: Acides aminés

Structure secondaire: Empilement en
feuillet β et Hélice α

Structure
tertiaire

Structure
quaternaire

Question 2

Structure primaire

Answer 2

▪ Séquence d’acides aminés (AA) composants la protéine
▪ Ne donne aucune information sur sa forme tridimensionnelle
▪ Mais permet de savoir les interactions possibles (structures IIaires, IIIaires et IVaires)

Question 3

Structure secondaire

Answer 3

▪ Repliement local de la protéine due aux liens amides
▪ Angles dièdres et ponts H

▪ Fonction amide planaire dû à la résonance
▪ Lien C-N partiellement sp2
▪ Rotation limitée autour du lien (cis)

▪ Organisation en structures rigides
▪ Plus communs : feuillets β et hélices α
▪ Liés à l’existence de ponts H entre AA proches
▪ Carbonyle : accepteur de pont-H
▪ NH : excellent donneur de pont-H

Question 4

Structure tertiaire

Answer 4

▪ Repliement de la protéine lié aux liaisons entre les chaînes latérales des AA :

1) Interactions ioniques
▪ Liaison ionique entre AA basiques
(His, Lys, Arg) – charge positive –
et AA acides (Asp, Glu)
▪ Ponts salins : complexation d’ion métallique par un AA acide

2) Interactions de Van der Waals
3) Interactions hydrophobes entre parties non polaires

4) Interactions aromatiques: empilement- π (π-stacking)
▪ A.a. aromatiques (Trp , Tyr, Phe)
▪ Interaction des orbitales moléculaires
des systèmes π conjugués

5) Ponts H
▪ Entre AA donneurs de ponts H
(fonctions O-H de Ser, Thr et Tyr,
fonction N-H de Trp, fonction S-H
de Cys [faible]) et AA accepteurs
(fonctions acides, squelette)

6) Ponts disulfures
▪ Lien covalent S-S entre deux chaînes de cystéine
▪ Bris et formation lors d’une permanente
▪ Exemple de pont disulfure dans l’ocytocine
(hormone de l’attachement émotionnel) :

Question 5

Structure quaternaire

Answer 5

▪ Assemblage de plusieurs sous-unités peptidiques
▪ Retenues ensemble par les mêmes forces que celles vues dans la structure tertiaire
▪ Exemple : hémoglobine
▪ deux unités α et deux unités β avec 4 hèmes

Question 6

Membrane cellulaire

Answer 6

Phospholipides
Interaction entre têtes polaire du phosphates avec l’eau (Pont-H)
Interaction entre les chaines carbonées (Van der Waals)