Chapitre 1: Les enzymes Flashcards
Def proteine
Polymère d’aa reliées par des liasons peptidiques. Structure en 3D
4 niveaux de structure d’une enzyme
- primaire
- secondaire
- tertiaire
- quaternaire
Qu’est-ce que la structure primaire ?
La séquence d’aa bout à bout
Qu’est-ce que la structure secondaire?
Les arrangements en hélice (alpha) ou en marche d’escaliers (beta).
Les aa se repoussent ou s’attirent à cause des charges ou de l’acidité. C’est cette interaction des chaînes latérales qui causent la structure secondaire.
Qu’est-ce que la structure tertiaire?
C’est le repliement de la protéine pour former, ce qui lui rend un aspect 3D.
Qu’est-ce que la structure quaternaire?
L’association de plusieurs chaines polypeptidiques.
Comment peut-on rendre une protéine non fonctionnelle?
En changeant un aa ou en changeant le pH, les interactions entre les chaines latérales peuvent changer (polarité change) et affecter l’activité de la protéine.
Def enzyme
protéine capable d’être un catalyseur de réaction. Il accélère la transformation du substrat en produit en en abaissant l’énergie d’activation de la réaction.
Comment les liaisons enzymes-substrats se forment-elles et comment influencent-elles la vitesse d’une réaction?
Les chaines latérales des aa, localisées dans le site catalytique de l’enzyme forment des liaisons avec les molécules de substrat. Les mol de substrats sont dans la bonne orientation pour réagir ensemble et font moins de rencontres avec l’extérieur. Les liaisons enzymes-substrats créent un nouveau intermédiaire et imposent des tensions électroniques aux mol de substrats (affaiblir les liens du substrats) ce qui se transforment en produits plus rapidement.
Distinction entre les types d’ezymes
- Simples: Constituée seulement d’aa.
- Holoenzyme: nécessite un cofacteur pour être active.
- Apoenzyme: Holoenzyme sans cofacteur (inative)
Effet du temps sur la vitesse de réaction. [enzyme] est constante.
Début: Vitesse de formation est constante. Les molécules d’enzymes sont saturées par le substrat.
Avec le temps, vitesse diminue, il ne reste plus assez de substrats (bcp de produits formés).
Effet de la variation de la concentration de substrat sur la vitesse initiale de réaction. [enzyme] est constante.
Faible [substrat]: vitesse est presque directement proportionnelle à la [substrat].
Forte [substrat]: vitesse est maximale, car toutes le mol d’enzyme sont saturés de substrat
Km? constante de michaelis
- [substrat] pour atteindre ½ Vmax
- inversement proportionnel à l’affinité de l’enzyme pour le substrat. Petit Km= réaction plus rapide (grande affinité)
- spécifique à chaque enzyme
Est-ce que Vmax dépend de la [substrat]?
Non, Vmax est mesurée quand toutes les mol d’enzymes sont saturées de substrat.
Quelles sont les conditions qui permettent d’affirmer que quand la qté d’enzymes augmentes, la vitesse maximale augmente?
- On doit travailler en solution saturante de substrat.
- On doit mesuer Vmax très tôt dans le temps.
Si on attend trop, la quantité de substrat diminue et elle peut être insuffisante pour saturer les molécules d’enzyme. Cela causerait une sous-estimation de l’activité enzymatique.