Chapitre 1 - La microbiologie et l'évolution des microorganismes

Question 0

Qu’est-ce que la théorie de la génération spontanée?

Answer 0

Ancienne théorie, à présent discréditée, proposant que les organismes vivants se développent au départ de manière non vivante.

Question 1

Qu’est-ce que l’analyse génomique?

Answer 1

l’approche de l’étude des organismes vivants qui implique la séquence de leurs génomes.

Question 2

Définissez un prion

Answer 2

C’est un agant infectieux, composés exclusivement de protéines, qui causent des encéphalopathies spongiques comme la tremblante du mouton ou de la chèvre.

Question 3

Définissez un virus, un virusoïde et un viroïde.

Answer 3

Le virus est un agent infectieux avec seulement un acide nucléique (ARN ou ADN). Ainsi pour ce reproduire, il doit avoir un hôte vivant. Ainsi, il est fondamentalement parasite.
Les viroïdes sont des virus propre aux plantes et les virusoïdes propre aux animaux.

Question 4

Comment définir si un être vivant est un microorganisme?

Answer 4

De taille environs inférieur à 1 mm de diamètre

Question 5

Dans quels domaines des pogrès énormes ont modifier la classification des microorganismes?

Answer 5

Étude détaillée de la structure cellulaire par microscopie électronique, la caractérisation physiologique et biochimique de nombreux miroorganismes, la comparaison des séquences d’acides nucléiques et de protéines d’une grande variété d’organismes

Question 6

Comment classe t-on les organismes microscopiques après la comparaison des ARN ribosomiques initié par Carl Woese dans les années 1970?

Answer 6

En trois groupes, soit Bactéria, Archaea, et Eucarya

Question 7

Définissez les bactéries:

Answer 7

Organisme normalement unicellulaire, parois contenant du peptoglycane, laplupart de type procaryote (sans noyau), sont abondantes dans le sol, l’eau et l’air et sont principaux habitants de notre peau, bouche, et intestins. Certaines peuvent vivre dans des conditions extrêmes (Température, pH, salinité extrême)

Question 8

Rôles des bactéries:

Answer 8

bien que certaines causent des maladies, servent au recyclage des éléments de la biosphère, la dégradation des matières végétales et animales, et la prodution de vitamines. Les cyanobactéries produisent d’importantes quantités d’oxigène.

Question 9

Qu’est-ce qu’un arché?

Answer 9

Sont dépourvue de peptidoglycane, ont des lipides membranaires particuliers, de nombreux habitent dans des conditions extrêmes ou ont des caractéristiques métaboliques inhabituelles (méthanogènes produisent du méthane, archées thermophiles vivent dant T etrêmes, archées halophile vivent dans salinité ext.)

Question 10

Quels sont les types majeurs de protises?

Answer 10

algues, protozoaires, myxomycètes, et moisissures aquatiques

Question 11

Définissez les algues

Answer 11

Ils sont des protistes photosynthétiques qui, avec les cyanobactéries, produisent environs 75% de l’O2 planétaire. Base de la chaîne alimentaire aquatique.

Question 12

Définissez les protozoaires:

Answer 12

protiste unicellulaire de type animal, habituellement mobile. Principaux chasseurs et brouteurs de monde microbien. Ingèrent les matières organiques et d’autres microorganismes. On les trouve dans de nombreux milieux et entre autre dans les tractus intestinale de certains animaux (facilite digestion comme cellulose)

Question 13

Myxomycète?

Answer 13

Sont des protistes se présentant comme des protozoaires à un stade de leur vie et comme des champignons à un autre stade.

Question 14

Moissisure aquatique?

Answer 14

Se trouve sur des sols humides et à la surface d’eau douce. Elles se nourrissent de matières végétales en décomposition sur les bûches et les paillis. On occasionné des infections végétales créant des famines

Question 15

Les champignons ou Fungi?

Answer 15

Groupe varié allant de levure unicellulaire à moisissure et champigons. Organisme multicellulaire qui produisent de fines structures filamenteuses (hyphes). Absorbent molécules organiques de leur envirronement pour en faire une source de carbone et d’énergie. Avec leur capacité métabolique, on fait la levé des pains, des antibiotiques, et font la décomposition des organismes morts.

Question 16

Quel est l’âge estimé de la terre?

Answer 16

4,5 à 4,6 milliards d’années

Question 17

Que doit posséder un organisme pour être considérer comme vivant?

Answer 17

-Cellule et organisation, -Énergie et métabolisme, -Réponse à des changements de l’environnement, régulation et homéostasie, croissance et développement, reproduction, évolution biologique.

Question 18

Avant que la terre n’abrite la vie, comment étaient les conditions?

Answer 18

chaud et anoxique, avec une atmosphère riche en gaz comme H, méthane, CO2, N, Ammoniac… Soupe de prébiotique de produits chimiques avec des réactions chimiques hasardeuse

Question 19

Que suppose-t-on que l’ARN était capable de faire dans les premiers êtres vivants? Et comment se serraient formées les premières membranes?Ainsi à ressemblaient-ils?

Answer 19

Emmagasiner, de copier et d’exprimer de l’information génétique et aussi de catalyser des réactions chimiques
Les lipides peuvent former spontanément des liposomes, vésicules bordées par une bicouche lipidique.
Ainsi les premiers êtres vivants= liposomes contenant ARN

Question 20

Énuméres les étapes de la soupe probiotique de la terre ancestral à la vie cellulaire.

Answer 20

Soupe -> liposome+ARN (probiote) -> ajout de protéine (probiote) -> vie cellulaire (ARN, ADN, et protéines)

Question 21

Pourquoi l’ARN aurrait donné naissance à l’ADN? Et quesqu’y appuit cette théorie?

Answer 21

ADN plus stable chimiquement que ARN.
Le fait que l’unité énergique de la vie (ATP) soit un ribonucléotide et la découverte que l’ARN pouvait réguler l’expression génétique

Question 22

Sur quoi est basé l’arbre phylogénétique universel?

Answer 22

Sur la comparaison des molécules de la plus petites sous-unités de l’ARNr (ARNr-PSU), c’est-à-dire l’ARNr trouvé dans le plus petite sous-unité des ribosomes.

Question 23

Qui est LUCA?

Answer 23

C’est théoriquement le premier être vivant, ancêtre de toutes vies sur terre bien que sont existence ne fût pas encore prouvée. On le considère à cause de la ressemble qu’ont les organismes entre autre dans le métabolisme (ATP)

Question 24

Qu’est ce que l’hypothèse de l’endosymbiose? Et l’hypothèse de l’hydrogène?

Answer 24

Que la mitochondrie et la chloroplasme serraient des bactéries ingérées par un protiste ancestrale qui aurait fini par faire une symbiose.
C’est une modification de l’hypothèse précèdente. que la mitochondrie-bactérie anaérobie produisant du H2 et du CO2. Le potiste serais devenu dépendant du H2. Et s’il n’a pas obtenu la capacité de respirer il aurait évolué en hydrogénosome (ATP par fermentation)

Question 25

Qui fût l’inventeur du microscope? Et comment était ce microscope?

Answer 25

Hans Janssen ou Galilée (~1550)

Courte distance focale, agrandissement limité, simple (une lentille)

Question 26

Comment les Égyptiens fesaient-ils de la microbiologie sans même sans rendre compte?

Answer 26

Utilisaient le levain (mycète microscopique) pour faire lever le pain, Fesait de la bière(microorganisme responcable de l’alcool), ils pouvaient faire des systèmes reproductibles (microbiologie appliquée)

Question 27

Quelle est l’histoire ancestrale du vin et pourquoi en consommer?

Answer 27

Découverte néolithique (région de Hajji Firuz, -7000)
Production égyptienne (-4000) et mésopotamienne.. on fait recette
Perfectionnement par les Grecs (levures et bactéries (reproductiblité, méthode uniformisée, production de masse)
–Conservation dû à l’alcool (bière et vin)

Question 28

Qu’avait de particulier la bière des nubiens (-2000 ans)?

Answer 28

Propriétés thérapeutiques:
On récupérait une sorte de gruau (bière avec moins d’eau) pour faire des cataplasme pour blessure (x infection), on la buvait et on accumulait de l’antibiotique dans les os.

Question 29

Comment luttaient nos ancêtres contre la détérioration des aliments?

Answer 29

D’abors en utilisant inconciement les microorganismes qui vont entre autre générer des vitamines dans leur croissance.
Ils ont fait des séchages, salage, fumigation,
Ainsi, ils diminue l’eau libre et inhibent certains microorganismes.

Question 30

Que permet la fermentation des aliments? exemple? et première apparition de fermentation?

Answer 30

Augmente le temps de conservation et même les apports nutritionels. ex: la choucroute a même diminuer le scorbut à cause que la bactérie produisait de la vitamine C à partir de la fermentation du chou.
Fosile d’igname australien (comme patate)

Question 31

Qui fût le premier à observer, décrire et publier sur les microorganisme (protozoaires, bactéries, levures, micro-algues) et que l’on considère comme le père de la microbiologie?
Qui lui permis de l’être et comment?

Answer 31

Antoine van Leeuwenhoek (AvL)

Christian Huygens lui remit des microscopes que AvL modifia pour obtenir des grossissements de 50 à 300x

Question 32

Qui définit le mot cellule et publia les travaux de AvL?

Answer 32

Robert Hooke

Question 33

Quesque la théorie de la génération spontanée (abiogénèse) par rapport à la biogénèse?

Answer 33

La génération spontanée stipule que le vivant peut prendre vie du non vivant avec de l’énergie vitale. Et la biogénèse stipule qu’un être vivant ne peut provenir qu’un d’un autre être vivant.

Question 34

Comment fût détruit la théorie de la génération spontanée, nommez ceux qui ont fait les expériences et leurs expériences ainsi que pourquoi on pouvait en tirer la conclusion que la théorie était discalifiée?

Answer 34

Il y a eu l’experience des mouches avec Francesco Redi (1650)
Puis le bouillon fermentant après ébullition John Needham(1750)
Le facon sans air et chauffé sans fermentation Lazaro Spallanzani
Filtration de l’air par ouate sans trouble Schröder et von Dusch(18)
Chambre sans poussière (intera.vers)sans trouble John Tyndall
Flacon à col de cygne (final) Louis Pasteur (1850)

Question 35

Qu’a fait Pasteur mise à part détruire la théorie de la spontanéité et le progrès qu’il permit au niveau médical?

Answer 35

Il a élaboré le principe de la pasteurisation (en étudiant la maladie du vin et qu’il y avait les mauvais organismes dans le mauvais vins)-chauffé 62,8 celsius 30min et surtout utilisé sur le lait (73celsius, 15s), aussi l’anaérobiose (qu’il y avait de la vie sans O2-fermentation butyrique-où l’O2 est même toxique)

Question 36

Définissez l’épidemie de la Peste en 1317

Answer 36

4,2 x 10e7 morts en Europe (1/3 de la population)

Venant de la Chine ou il y a eu 6,5 x 10e7 morts

Question 37

Décriver les évènements en ordre chronologique qui on amené à relier les microorganismes aux maladies

Answer 37

Fracastoro relie sans preuve que maladie=petits organismes
von Plenciz dit sans preuve diffé.malad.=diff.microorganisme
Bassi démontre que la maladie du vers à soie=champignon se trouvait sur la feuille des muriers mangés par les vers(1er demo)
Robert Koch réussit à isoler en culture pure de bacillus anthracis causant l’Anthrax et prouve qu’il cause la maladie et émet des postula

Question 38

Quels sont les postulats de Koch?

Answer 38

1. Le microorganisme doit être présent dans tous les animaux malades et absent des animaux sains
2. Le microorganisme doit être cultivé en culture pure à l’extérieur des animaux malades.
3. Un animal sain inoculé avec cette culture pure doit développer la maladie avec tous ses symptômes
4. Le microorganisme isolé de cet animal doit être identique à celui précèdement utilisé

Question 39

Quels sont les restrictions des postulats de Koch?

Answer 39

1. Plusieurs microo. peuvent causer une même maladie (ruhme)
2. Certains microo. pathogène ne sont pas cultivable (lèpre)
3. Un microo. peut causer plus d’une maladie (herpès bucal, génital ou encore conjonctivite)

Question 40

Quels sont les principaux évènements qui on permis de lutter contre les infections et par qui ils ont été initié?

Answer 40

Jenner protège les enfants en angleterre contre la variole en mettant en contact pustule variole bovine et protège (vaccin)
M. Semmelweis (1847) observe la fièvre puerpèrale (accouchement) et relie le nb de cas avec les mesures d’hygiènes
Joseph Lister (1880) amène l’asepsie dans les salles opératoires et nd décès post-opé. aller de 45% de mort 15% (on vaporise du phénol sur la plaie et on stérélise les instruments)
Pasteur découvre que des vielles cultures ont perdue et leur caractère pathogène et va même protéger (choléra aviaire)
Théobald Smith va créer une protection de la diphtérie en dénaturant la toxine.

Question 41

Qui réalisa une grande percé en immunologie en étudiant une larve d’étoile de mer? Quelle fut sa découverte? Et quelle fut sa découverte sur la longévité?

Answer 41

Elie Metchnikoff
découvre les phagocytes qui mangent tout corps étrangés. Ils sont la 1ere ligne de défense.
Il trouva la notion de probiotique qui favorise la longévité

Question 42

Qui fut l’auteur de la révolution en Biogéochimie (impact microorganismes sur la biosphère) et quelle fut sa découverte?

Answer 42

Willem Beijerinck et Sergei Winogradsky (1900)
Découverte du caractère essentiel de certaines bactéries à certaines étapes du cycle C, N, P, O, S
(ex:ensemble de l’azote dans matières organiques fixé par bactéries: Azobacter, Rhizobium)

Question 43

Comment fut découvert les virus?

Answer 43

C.E Chamberland avait créer un filtre en porcelaine pouvait retirer les microorganismes (aida pour la fièvre typhoïde pour rendre l’eau potable) mais pas les virus de la mosaïque du tabac.

Question 44

Vrai ou Faux

Les virus se reproduisent seulement en présence de la machinerie métabolique d’un hôte

Answer 44

Faux, ils se RÉPLIQUENT

Question 45

Qui permit de guérir les plantes du virus de la mosaïque et comment?

Answer 45

Stanley et Northrup

Ils cristallisent le virus car solide il n’a plus plus de métabolisme (virus)

Question 46

Premier antibiotique et par qui?

Answer 46

Par Alexander Fleming (1928)
Alors qu’il étudie une bactérie(staphylococcus aureus) il contamine son échantillon avec du penicillium et découvre pénicilline

Question 47

Qu’amena comme inconvénient l’utilisation constante et même non thérapeutique (bétail) des antibiotiques?

Answer 47

Résistance aux antibiotiques des bactéries

Question 48

Que découvre A.J.Kluyver et quelle conclusion en tire-t-il?

Answer 48

Que le métabolisme de tout les êtres vivants est semblables et ainsi qu’il doit y avoir un ancêtre commun (LUCA)

Question 49

Qui découvrit que l’ADN transportait l’informations génétiques et comment?

Answer 49

Avery McCleod et McCarthy (1944)
Alors qu’on pensait que c’était les protéines le transfert de l’info se même sans eux mais si on coupe L’ADN il n’y a plus de transfert.

Question 50

Nommez trois événements clefs de l’ère génomique du vivant.

Answer 50

1955: détermination complète de la séquence du génome de Haemopilus influenzae par C.Venter
2000: génome humain
2010: transfert d’un ADN a un autre organisme (tout deux levures) bactéries synthétiques

Question 51

Quel est l’impact de la microbio sur la science?

Answer 51

1/3 des Prix Nobel au 20ieme siècles

Question 52

Que dit Carl Woese? (résumé)

Answer 52

Sans vie microbiene, plus de vie mais le contraire les microbes n’en sont que peut influencés