Chapitre 1 : Analyse génétique Flashcards
Etape 1 : Définir le caractère étudié
Bien caractériser le phénotype de référence (SSR)
Etape 2 : “Phénotypes mutants”
Obtenir des variant phénotypiques => démarche génétique
Définir un crible (protocole expérimental) pour sélectionner les mutants d’intérêt recherchés
Etape 3 : “Mutagenèse”
Augmenter la fréquence de mutants
Appliquer le crible de sélection pour isoler les mutants recherchés
Etape 4 : “Récessivité et dominance”
Croisement SSR X mutant puis analyse des phénotypes en F1
Etape 5 : Déterminer le nombre de gènes mutés dans chaque souche mutante
Test de ségrégation 2/2
ou
Chez la drosophile => croisement F1 X F1 ou test cross = F1 X parent [récessif] puis analyse des phénotypes en F2
Etape 6 : Déterminer le nombre minimum de gènes impliqués dans l’élaboration du caractère étudié
Test de Complémentation Fonctionnelle (TCF)
Classement des mutants en groupes de complémentation
Etape 7 : Cartographie des mutations en jeu
Test de recombinaison génétique
Carte génétique
Etape 8 : Test d’interactions génétiques entre les différents gènes identifiés
a) Croisement entre des mutants de gènes différents identifiés
Analyse des phénotypes en F1
➤ interactions génétiques
Croisement entre 2 mutants de deux gènes différents
➤ Pas complémentation fonctionnelle !
Soit : Epistasie, Additivité ou Synergie
Etape 8 : Test d’interactions génétiques entre les différents gènes identifiés
b) Recherche de suppresseurs
Isolement de nouveaux gènes non sélectionnés par un crible direct.
Epistasie
Ex : 2 gènes différents participant à une même voie métabolique (ou 2voies avec un tronc commun)
Additivité
Ex : Cas de 2 gènes participant à des voies parallèles différentes (sans tronc commun)
Synergie
Ex : cas de 2 gènes codant des produits agissant ensemble
Suppresseur
Gène dont la mutation modifie (masque) le phénotype du mutant initial-> retour vers le phénotype sauvage
Mutation suppresseur
Mutation secondaire intragénique ou extragénique
TCF
Croisement mutant X mutant de phénotype récessif puis analyse des phénotypes en F1
La recombinaison génétique
Echange d’information génétique entre deux génomes différents ou bien entre deux chromosomes. Il s’agit en général d’un échange entre fragments d’ADN
Suppresseur intragénique
Effet d’une mutation de compensation à l’intérieur du gène muté, qui restaure son activité.
Suppresseur extragénique
Récupération d’une fonction perdue grâce à une seconde mutation localisée sur un autre gène que la mutation initiale.
Complémentation intra-génique ou complémentation inter-allélique
2 allèles mutants différents du même gène complémentent -> ex: le gène rosy, il n’y a pas de CF
