Chapitre 1 : Analyse génétique Flashcards
Etape 1 : Définir le caractère étudié
Bien caractériser le phénotype de référence (SSR)
Etape 2 : “Phénotypes mutants”
Obtenir des variant phénotypiques => démarche génétique
Définir un crible (protocole expérimental) pour sélectionner les mutants d’intérêt recherchés
Etape 3 : “Mutagenèse”
Augmenter la fréquence de mutants
Appliquer le crible de sélection pour isoler les mutants recherchés
Etape 4 : “Récessivité et dominance”
Croisement SSR X mutant puis analyse des phénotypes en F1
Etape 5 : Déterminer le nombre de gènes mutés dans chaque souche mutante
Test de ségrégation 2/2
ou
Chez la drosophile => croisement F1 X F1 ou test cross = F1 X parent [récessif] puis analyse des phénotypes en F2
Etape 6 : Déterminer le nombre minimum de gènes impliqués dans l’élaboration du caractère étudié
Test de Complémentation Fonctionnelle (TCF)
Classement des mutants en groupes de complémentation
Etape 7 : Cartographie des mutations en jeu
Test de recombinaison génétique
Carte génétique
Etape 8 : Test d’interactions génétiques entre les différents gènes identifiés
a) Croisement entre des mutants de gènes différents identifiés
Analyse des phénotypes en F1
➤ interactions génétiques
Croisement entre 2 mutants de deux gènes différents
➤ Pas complémentation fonctionnelle !
Soit : Epistasie, Additivité ou Synergie
Etape 8 : Test d’interactions génétiques entre les différents gènes identifiés
b) Recherche de suppresseurs
Isolement de nouveaux gènes non sélectionnés par un crible direct.
Epistasie
Ex : 2 gènes différents participant à une même voie métabolique (ou 2voies avec un tronc commun)
Additivité
Ex : Cas de 2 gènes participant à des voies parallèles différentes (sans tronc commun)
Synergie
Ex : cas de 2 gènes codant des produits agissant ensemble
Suppresseur
Gène dont la mutation modifie (masque) le phénotype du mutant initial-> retour vers le phénotype sauvage
Mutation suppresseur
Mutation secondaire intragénique ou extragénique
TCF
Croisement mutant X mutant de phénotype récessif puis analyse des phénotypes en F1