Chap 6; transcription eucaryote Flashcards
dans la transcription eucaryotes, les gènes sont __
monocistroniques
c’est quoi la régulation extensive de la transcription?
'’un tel gène, dans une telle cellule , à un tel moment’’
Combien ya-t-il d’ARN pol dans la transcription eucaryote?
3
y a-t-il bcp d’espace entre les gènes d’eucaryote?
oui
quels sont les transcrits de l’ARN pol 1?
ARNr 28s, 18s et 5,8s
quels sont les transcrits de l’ARN pol 3?
les ARNt, ARNr 5s et ARN 7s ( le SRP)
quels sont les transcrits de l’ARN pol 2?
des ARNm ( plus de 20k transcrits ARNm différents par cellule)
L’abondance relative de transcrits varie de qq copies à plus de 10k selon (2)
- la reconnaissance du promoteur
2. efficacité de transcription variable
en quoi l’ARN pol 2 ressemble à l’ARN pol des procaryotes?
elle est en forme de pince de crabe et possède un site catalytique
en quoi l’ARN pol2 est différente de l’ARN pol des procaryotes?
elle possède + de sous-unités en périphérie donc permet d’interagir avec différents facteurs de transcription.
combien l’ARN pol2 possède-t-elle de sous-unités? et comment s’appellent-elles? quelle est celle qui a une extension C-terminale (carboxyl-terminal) aka CTD?
- 12 (RPB1,2,3…12)
- protomères
- RPB1
de quoi est constitué le domaine CTD de RBP1?
de répétitions en tandem de l’hepapeptide ‘‘tyr-ser-pro-thr-ser-pro-ser’’
quelle sont les 2 fcts du domaine CTD de RPB1, une sous-unité de ARN pol 2?
- phosphorylation de ses aa: le CTD phosphorylé est responsable du passe de l’étape d’initiation à élongation
- est impliqué dans le recrutement de facteurs de maturation du pré-ARNm. (couplage transcription à la maturation)
quels sont les 4 séquences conservées du promoteur basal utilisé par l’ARN pol 2?
- BRE
- TATA
- Inr
- DPE
Outre ARN pol 2, qui reconnait les séquences conservés du promoteur basal? et ils jouent le mm role que qui?
des GTF (facteurs de transcription généraux). les GTF jouent le mm role que la sous-unité sigma de E.coli.
Où se passe la formation du complexe de pré-initiation?
à la boite TATA
Quel est l’élément le plus fréquent chez tous les promoteurs?
l’élément Inr
La boite TATA contient généralement un motif conservé positionné__? La boite TATA sont-ils des gènes activement transcrits? Une mutation à l’intérieur de la boite TATA entraine quoi? Une mutation entre la boite TATA et le site d’initiation entraine quoi?
-25/-35pb
oui!
Diminution drastique de la transcription.
Rien, ces séquences entre peuvent varier sans conséquence dans la transcription.
Qui permettent l’association de ARN pol 2 au promoteur?
Ils sont généralement des complexes protéiques ___
les GTF (facteurs de transcription généraux) multimériques donc composés de plusieurs sous-unités
quel est le GTF le plus grand et le 1er à interagir avec le promoteur? Il contient quoi et interagissent avec quoi? quelle est l’interaction la plus forte? Qui régulent l’association TBP-TATA et comment?
TFIID
Un TPB qui lie TATA et 13 TAF qui lient Inr et DPE
TBP-TATA est l’interaction la plus forte.
les TAF en cachant le site sur TBP.
quelle est la première étape d’assemblage du complexe d’initiation de transcription? Comment ca se passe?
TFIID lie le promoteur.
le domaine C-terminal de TFB, une composante de TFIID, se replie autour de l’ADN dans al région de la boite TATA. ce qui permet:
- contact direct avec sillon mineur
- repliement local de l’ADN
Quelle est l’association qui est la plateforme nécessaire pour recruter d’autres GTF lorsque TFIID lie le promoteur?
association TBP-TATA
quelle est le deuxième étape d’assemblage du complexe d’initiation de transcription? 2 domaines sont impliqués, explique:
TFIIA et TFIIB lie ADN et TBP.
- le domaine C-terminal de TFIIB fait contact avec TBP’ BRE et l’ADN situé près de TATA.
- le domaine N-terminal de TFIIB s’étend vers le site d’initiation et fait contact avec ARN pol 2 quand elle arrive
quelle est la troisième étape d’assemblage du complexe d’initiation de la transcription?
le complexe TFIIE et ARN pol 2 se lie au promoteur, ce qui stabilise l’agrégat ADN-TBP-TFIIB