chap 18 Flashcards
la demande pour les différents produits varient selon
- les conditions
- le stade de développement
- le type de cellule
la régulation permet quoi
de produire seulement ce qui est nécéssaire
quelle est l’étape la plus régulée
la transcription, surtout l’initiation
la séquence du promoteur définit quoi (2 choses)
- la force du promoteur
- la niveau basal d’expression
quelle expression est toujours présente
l’expression constitutive, elle est non régulée, à des niveaux constants
ils existent trois types de protéine régulatrice pour les procaryotes, c’est lesquelles
- facteur sigma
- répresseurs
- activateurs
les facteurs sigma modifient quoi
modifient la spécificité de l’ARN pol
les répresseurs font quoi
empêchent l’accès de l’ARN pol au promoteur
les activateurs font quoi
améliore l’interaction ARN pol-promoteur
Vrai ou faux
l’ordre d’expression des facteurs sigma est soigneusement contrôlée
vrai
que ce passe-t-il lorsque le site opérateur est lié par un répresseur
l’inhibition de la transcription
régulation négative
que ce passe-t-il lorsque le site de liaison à un activateur est lié par un activateur
stimulation de la transcription
régulation positif
si le répresseur et l’activateur sont présents et fonctionnels, lequel l’emporte habituellement
le répresseur
qu’est ce qu’un effecteur
c’est une petite molécule qui peut se lier à un répresseur ou à un activateur
quel est le rôle de l’effecteur
changer la conformation de la protéine régulatrice
modifie l’affinité
quels sont les deux effecteurs qui se lient au répresseur
l’inducteur (dissociation de l’opérateur) et le co-répresseur (parfois appelé inhibiteur)
quels sont les deux effecteurs qui se lient à l’activateur
l’inducteur (association au site d’activation) (aussi appelé co-activateur) et inhibiteur
les sites de liaisons à l’activateur peuvent être localisé à deux endroits
les sites sont soit localisé près l’un de l’autre ou plus éloigné et nécessite une courbe pour s’associer
que font les protéines architecturales
elles facilitent les contacts à distances entre les activateurs et l’ARN pol
qu’est ce que l’ARNm polycistronique
contient la séquence codante pour plusieurs protéines
quel est l’activateur dans la régulation de l’opéron lac
CAP
quel est l’effecteur pour CAP
AMPc
quel est le répresseur dans la régulation de l’opéron lac
Lacl
que fait Lacl
empêche l’ARN pol de se lier au promoteur
effecteur pour Lacl
allolactose
la liaison de CAP ou du répresseur Lacl se fait par quel motif
motif hélice-coude-hélice dans le sillon majeur
quel est le site opérateur que l’on considère principal
celui qui qui chevauche le site promoteur ce qui empêche l’ARN pol de se lier au promoteur
CAP est constitué de deux domaines distincts
un domaine de liaison à l’ADN et un domaine d’activation qui interagit avec d’autres protéines
présence de glucose et absence de lactose
aucune transcription
absence de glucose et absence de lactose
aucune transcription
présence de glucose et présence de lactose
transcription au niveau de base
absence de glucose et présence de lactose
niveau de transcription élevé
quel est le co-répresseur du répresseur trp
tryptophane
c’est quoi l’atténuation
arrêt prématuré de la transcription du à une structure particulière dans l’ARNm
quel est le rôle de la région leader TRPL
rôle purement régulateur, pas d’activité catalytique
que ce passe-t-il lorsque le trp est limitant
antiterminaison, le ribosome peut continuer et transcrire les gènes trp voulus
que ce passe-t-il lorsque le trp est abondant
terminaison de type rho indépendant (épingle à cheveyc) avant la transcription des genes trp (attenuation)
pour quel opéron l’atténuation est le seul mécanisme de régulation
l’opéron His et Leu
les riboswitchs sont présents dans quelle région et mesure combien de nucléotides
la région 5’-UTR (la partie non traduite de l’ARN)
entre 50 et 250 nts
les riboswitchs sont composées de quoi
aptamer et plateforme d’expression
qu’est ce que le CRISPR
répétitions palindromiques courtes, group.es, régulièrement espacées
les répétitions sont _______ spécifique et mesure combien de pb
espèce spécifique
20-50 pb
les espaceurs sont _______ spécifiques et mesurent combien de pb.
souche spécifique
17-84 pb
les CRISPR sont utiles pour quoi
trouver une souche lors d’une épidémie
qu’est ce qui permet au bactérie de reconnaitre et de se défendre contre des envahisseurs étrangers (phages)
la mémoire des attaques précédentes données par les espaceurs
où se situe l’espaceur
dans la souche bactérienne
où se situe le proto-espaceur
dans le phage ou le plasmide
où se situe le PAM
uniquement dans l’ADN étranger (pas dans le génome)
quelles sont les 3 étapes du mécanisme CRISPR
- acquisition
- biogénèse et maturation des ARNcr
- interférence
quels sont les rôles du PAM
- diriger l’acquisition des espaceurs
- différencier l’ADN étranger de l’ADN bactérien
le PAM est essentiel à quoi
à la reconnaissance de la bonne séquence d’ADN
