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MCB 2979 > CHAP 1 > Flashcards

CHAP 1 Flashcards

1
Q

Quel est le pourcentage de contribution de bactérie a la biomasse (%)

A

13%

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2
Q

nombre de cellules humaine et nombre de bactérie dans notre corps

A

cellules humaine : 30x10^12
bactérie sur/dans le corps : 38x10^12

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3
Q

ordre d’apparition de ces bactéries
LUCA bactéries/archées humain animaux ARN eucaryotes

A

ARN - LUCA - bactéries/archées - eucaryotes - animaux - humain

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4
Q

trois domaine de la vie

A

archées
bactéries
eucaryotes

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5
Q

caractéristiques de la croissance d’E. Coli

A
  • se divise tout les > 20 min
  • maintient sa forme (diametre, forme des bâtonnet)
  • reproduction de tout le contenu et de la structure cellulaire
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6
Q

2 types important de microscope électronique(savoir les reconnaître)

A

microscope électrique a transmission
microscope a cryotomographie électrique

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7
Q

épaisseur de E.coli

A

1 um(-6)

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8
Q

caractéristique du contenu de E.coli

A

contiente bcp macromolecule (20-30$ du volume)
-proteine (>50% , 2-10 million)
-ARN (20%, majo. - ARNr)
-ADN (3%)
-Paroi de peptidoglycane, membranes
-Structures extra cellulaire : flagellae, pili/fimbrae

distance entre les proteine : environ 2 nm

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9
Q

normalement la forme d’une bactérie est rigide, quels sont les exceptions

A

1- la spirochetes et spiroplasma (motilite)
1- mycoplasma (aucune paroi)

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10
Q

plus une bacterie est petite, plus sont rapport est ____________
pourquoi ?

A

grand
surface/volume = (4pir^2)/(4/3pir^3)

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11
Q

pourquoi la taille typique d’une bactérie est de 1 um ?

A

Les bactéries dépendent de la diffusion(mvt. aléatoire des molécules) pour le transport cellulaire
t = d^2/6D
Donc plus elle est petite, plus elle se déplacera bien

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12
Q

pourquoi, contrairement a E.coli, pas tout les bactéries sont petites

A

plusieurs facteurs peuvent affecter cela :
- taille et nombre de ADN chromosomique
- bcp de proteine
- taille de stockage des nutriments
-etc

ce n’est pas vrm clair

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13
Q

facteur affectant la diversité des bactéries

A

morphologie
metabolisme
environnement
mode de motilité
formation de virulence
etc

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14
Q

combien connaissont nous de Phyla présent aujoud’hui

A

90 phyla
au debut (1987) les résultats étaient base sur le sequencage de l’ARNr
mais en 2015, le séquençage des génomes des bactéries non-cultivables a augmente le nombre de phyla

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15
Q

quel est l’estimation d’espace inconnu sur la terre
et combien sont caractérisé

A

10^6 - 10^12
slm 10k caractérisé (4 phylactères continent 90% de bactéries cultivables)

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16
Q

sur quoi est basé la taxonomie

A

mixtures des phenotypes, morphologie et similarité génétique

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17
Q

qu’est ce qu’une espèce
qu’est ce qu’un genre
qu’est ce qu’un phylum

A

bactérie ayant des similarité génomique et phénotypique
un seul ancêtre et une similarité au niveau de leurs séquence 16S ARNr 95%
similarité génétique entre phyla 65%

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18
Q

que contiennent toutes les bactéries

A

membrane plasmique
ribosomes
cytoplasme
nucleotide

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19
Q

2 types de proteine dans la membrane plasmique et ces associations

A

proteine intrinseques
proteine peripherique
-lie a la membrane
-lie aux lipides
-intégré un lipide

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20
Q

forme typique de proteine dans la membrane plasmique

A

helice alpha

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21
Q

distance typique des proteine dans la membrane plasmique

A

0 - 10 nm

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22
Q

quel est le modele classique de la membrane plasmique

A

les protéines et les lipides sont bien mélangés

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23
Q

quel est l’exception du modele classique de la membrane plasmique

A

des petites regions de moins de 200nm ont une composition lipide/protéine différente et ces régions favorisent la localisation et les interactions entre certaines protéines transmembranaires

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24
Q

comment est ce que les proteine et lipides ce diffusent ?

A

ils ne se diffusent pas latéralement, après une experiece de de lipide/proteine fluorescentes dans le membrane, elles se sont dispersés

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25
Q

qu’elle est la formule de diffusion en 2D et en 3D

A

3D : t = d^2 / 6D
2D : t = d^2 / 4D

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26
Q

comment marquons nous une protéine

A
  • a l’aide de la protéine GFP où sont gène peut se fusionne au gène d’une autre protéine
  • une autre façon, single molécule tracking, qui exige un microscope sensitif et des laser d’illumniation
    (avantage = possibilite de distinguer des différentes population)
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27
Q

quelle sont les caractéristiques qui font varier les acides gras

A

-longueur(nombre pair, 16 ou 18)
-insaturation(nombre de double liaisons)

les lipides saturés sont plus stables que les lipides insaturés.
Les acides gras saturés ne contiennent pas de doubles liaisons dans leur chaîne carbonée, ce qui les rend plus rigides. Les liaisons simples entre les atomes de carbone sont plus fortes et plus difficiles à rompre que les liaisons doubles présentes dans les acides gras insaturés.

28
Q

nommez 3 fonctions importante de la membrane plasmique et leurs fonction

A

barrière semi-perméable - une bicouche perméable pour l’eau, mais pas pour les ions et métabolites
porteur des protéines importantes - canaux et transporteurs, chaine de transports, récepteur de la chimiotaxie
réservoir d’énergie - la force proton motrice

29
Q

qu’est ce que la membrane plasmique n’a pas

A

des sterols, sauf la mycoplasma

30
Q

import des nutriments a travers la membrane plasmique (3 nom et exemple)

A

macronutriments - C, S, N, P, Fe, Ca+, K+, Mg2+)
micronutriments - le reste
facteur de croissance - vitamines, acide amines, purine/pyrimidines)

31
Q

3 type de diffusion des substances a travers la membrane plasmique

A

diffusion simple - a travers la bicouche de lipides (O2, C02)
diffusion facilité - Avec un canal membranaire (ions)
- avec un transporteur (monosaccharides, acide aminé, bases azote, vitamines)
osmose - a travers la bicouche de lipides et a travers une aquaporine (eau)

32
Q

nomme 3 type de transport actif avec ce qu’ils transportent

A
  • transport actif primaire - un seul sens (ATP, ions, acide aminés, glucides, peptides, protéines)
  • transport actif secondaire - dans les deux sens (ions, glucides, acide aminés)
  • translocation de groupe - glucides avec le système phosphotransferase
33
Q

couleur de gram positif et négatif

A

gram - violet
gram + rose

34
Q

étapes pour arriver au couleur des gram + et gram -

A

violet de crystal - application de iode - lavage a l’acetone - application de la safranine

35
Q

quelles sont les sous -unite du peptidoglycane

A

des di-sucre (NAM-NAG) connecte a un peptide de 3-4 acide aminé

36
Q

comment sont connecte les sous unité de peptides des peptidoglycane

A

ils seront tjr fait par des liens d’alanine, mais de deux façon :
-les liaisons de D-Ala se font par de liaisons directe
-les liaisons de D-Ala et de L-Ala se font par des liaisons des pont interpeptidique (gly-gly-gly-…)

37
Q

épaisseur de gram + et de gram -

A

gram + 20-80 nm
gram - 3-6 nm

38
Q

comment sont charge les acides teichoiches et quelle sont leurs fonctions principales

A

elles sont chargé négativement et leur fonction principale et de attirer des cation qui attribuent a la flexibilité mécanique

39
Q

quel est une caractéristique au paroi des gram +

A

ces parois sont désordonnées, on y retrouve de grand trous

40
Q

quelle est la taille approximative des glycanes et peptides

A

glycanes : 1-100 nm
peptides : 2 nm

41
Q

quelle est la résistant atmosphérique de la paroi cellulaire

A

1-20 atm

42
Q

3 types de changement de forme de la bactérie et ces 3 types de croissance

A

types :
-divison
-elongation
-division + elongation (tout est fait de manière égale en gardant sa forme des deux cote)

categorie :
-croissance dispersée
-croissance zonale (millieu)
-croissance polaire (plus d’un coté que l’autre)

43
Q

qu’est c que le FtsZ

A

un homologue de la tubuline qui forme un anneau au centre d’une cellule en division et elle est requise pour constituer le septum

44
Q

qu’est ce que le MreB

A

un homologue de actin conserve dans bcp de bâtonnet et essentiel pour la forme

45
Q

Caractéristiques de la MreB

A
  • elle constitue des polymères associé a la membrane cytoplasmique
  • elle est essentielle pour la forme des bâtonnets
  • elle peuvent être montre par la GFP
  • elle tournent autour de la cellule pendant 2-5 min
  • les polymères sont physiquement liées aux enzymes, qui créent le peptidoglycane
  • les polymère de MreB sont courbées, car ils préfèrent s’orienter perpendiculairement par rapport a l’axe long, ce qui fait que la direction des insertions des glycanes et de la for des battonet est stabilisé
46
Q

en quoi est ce que l’asymétrie des couches est bénéfique pour la membrane externes chez les gram - (4)

A
  • apporte de la stabilité mécanique
  • barriere de perméabilité (grâce aux porcines qui laissent passer des molécules moins de 600Da)
  • toxique pour l’hôte
  • perdu au cours de l’évolution chez les firmicutes
47
Q

qu’est ce que la couche S

A

une couche protéique crystalinne qui entoure la cellule

48
Q

qu’elle est la fonction de la couche S

A
  • peut protéger contre l’attaque par certaines enzyme lithiques, qui dégradent la paroi et par certains prédateurs qui reconnaissent la paroi
  • peut protéger contre des hautes concentrations de ions dans le millieu
  • adhérer des cellules de surfaces
49
Q

Qu’est c que la glycocalyx

A

une substance composée de polysaccharides et des protéines sécrétées qui enveloppe la cellule
- capsule : si la substance est organisée et fixée a la paroi
- couche visqueuse : moins organisée

50
Q

fonction du glycocalyx

A

-protection de la cellule
-adhesion de la cellule a d’autres cellules et aux autres surfaces

51
Q

resume de fonction:
- membrane plasmiques
- paroi cellulaire
- cytosquelette
- peptidoglycane

A
  • membrane plasmiques : essentielle comme barrière et source d’énergie
  • paroi cellulaire : responsable pour la stabilité des bactéries
  • cytosquelette : fonction importante pour la forme des bactéries
  • peptidoglycane : polimere NAG et NAM lie ensemble par des courts peptides
52
Q

fonction des inclusions

A

les inclusions servent de depots de reserve
- granule de polysaccharides
- inclusion de lipides
- granules de souffres (métabolisme)
- carboxysomes (important pour photosynthese)

53
Q

Qu’est c qu’une vacuole gazeuses

A

une bactéries aquatique qui nagent a un profondeur déterminée

54
Q

Qu’est c que la magnetosome

A

compartiments des cristaux de fer, aligné par des polymères cytosquelettiques

55
Q

3 structures externes a la paroi bactérienne

A

pili
flagelles
fimbriae

56
Q

roles des fimbriae et du pili

A

fimbriae - adhérence, 100-1000x/cellule. important pour la formation de biofilms
pili - conjugaison, 1 a 4 par cellule, il est implique dans le transfert d’une plasmide de 100kb, certaine sont impliqué dans le mvt bactérien(type 4) (ex: F attire une cellule receveuse F- vers elle)

57
Q

comment se fait le mvt par pite (type 4)

A

polymérisation/dépolymérisation des pilins dépendant de la hydrolyse de l’ATP est responsable de la force de rétraction et de la motilité

58
Q

4 types de flagelles et leur longueur et epaisseur moyenne

A

pertriche - partout
monotriche - polaire et slm un
lophotriche - polaire et bcp d’une seule place
ampitriche - polaire et un sur les deux cote

longueur : 10-20 nm
épaisseur : 5-20 um

59
Q

les 3 segment de la flagelle et sa fonction

A

fonction : responsable pour la mobilité de nager

3 segment :
-filament
-crochet
-corps basal de 30-40 parties différentes

60
Q

caractéristique e la flagelle

A
  • rotation d’environ 1000x/secondes
  • 2-4 anneaux attache a un corps centrale, qui tournent ensemble
  • les protéine sont responsable de la rotation
    (flux de proteine a travers la membrane - 1200H/rotation - H descendent le gradient de proton entre le periplasme et cytoplasme)
61
Q

le moteur de flagella tourne dans quel sens

A

il peut tourner dans les deux sens
- rotation sens antihorlogique - course(CCW)
- rotation sens horlogique - culbute (CW)

la modulation du sens de rotation permet de biaiser le mvt

62
Q

caractéristiques des flagelles polaires

A
  • par exemple, de ccw a cw, donc de sens droite a sens gauche, normal
  • par exemple, de cw a cw, avec angle 90, arrêt entre les deux avant
63
Q

Qu’est c qu’un filaments axiaux (end-flagelles) et ou sont t-ils retrouve

A
  • ce sont des filaments entre la paroi et la membrane externe
  • ils sont retrouve chez les spirochètes et les spiroplasma
64
Q

explication de chmiotaxie et chimiotactisme

A

fréquence de culbute diminue quand la bactérie s’approche a la solution attractive plus concentrée
du a l’interaction entre récepteurs et molécule attractive (sensibilité max : 10^-8)

chimiotactisme- adaptation pour être sensitive a travers une grande échelle de concentration (10^-8 a 1M)
experience : avec l’ajout de stimulas, fréquence diminue et après 10min, fréquence augmente et réouvre au niveau initial

de-sensibilation a cause de recruteur de methylation

65
Q

5 types de receptor E.coli

A

trg
-positif pour galactose et ribose

tap
-positif pour les dipeptides

tar
-positif pour l’aspartate, maltose
-négatif pour nickel et cobalt

tsr
-positif pour serine
-négatif pour benzoate et acétate

aer
-positif pour l’oxygène

MCB 2979 (1 decks)

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