Cellens Byggstenar Flashcards
Vad menas med prefixet ”α” i glykosidbindning?
Vart OH gruppen sitter
”alpha” = pekar nedåt
”Beta” = uppåt
O-glykosidbindning mellan två monosackarider.
I ringstruktur binder dom vid OH-gruppen. Två H och en O faller bort och blir disackarid + H2O
Bildas av kondensation
Dom bryts av hydrolys
Kolhydrat bunden till en annan molekyl via kväver i en aminogrupp (NH3)
Bindningen?
Peptidbindning
Linjär form av glukos i vatten
Biter sig själv i svansen och blir ringstruktur. ”Alpha” eller ”beta”
Kemisk skillnad mellan mättad och omättad fett
Mättade = inga dubbel eller trippel bindningar. Linjär struktur
Omättad = en eller flera dubbel eller trippelbindningar, veckas struktur.
2 faktorer som resulterar i trögflytande fett.
Längden.
Formen. Linjär = trög. Veckad = lättflytande.
Tre olika lipider
Fosfolipider = i cellmembran. En hydrofob och en hydrofil del
Triacylglycerol = energireserv i frttdroppar i cytosolen
Kolesterol = i cellmembranen påverkar dess styvhet
Hur lagras fettsyror i cellen?
I fettdroppar i cytosolen
Skillnad och likhet mellan triacylglycerol och fosfolipider
Likhet: båda är lipider
Olikhet: fosfolipider har två fettsyror triacylglycerol har tre.
Uppbyggnad av cellmembran
Fosfolipider, proteiner som kanaler och kolesterol som stadgar upp.
Vad betyder det om delta G är negativ?
Energi är frigjort. Produkt - subtrat
Tre exempel som enzym interagera med substrat för lägre aktiveringsenergi
- kan binda och fördela substratet på fördelaktigt sätt
- påverka elektronens läge i substratet
- dra och bända substratet och tvinga den mot ett transitionstillstånd.
Icke- kompetativ och
Kompetatvi inhibition av enzym
Icke-kompetativ : binder inte till enzymets active site. —> enzymet tappar form och subtrat kan inte binda. Ingen reaktion.
Kompetativ: substratet och inhibitorn tävlar om active-site inhibitor kan sättas utvägen för substratet.
Alloster reglering
Alloster binder till en annanstans än active site
Positiv feedback: binder så att active site gör sig mer benäget att binda till substrat (tex syre till hemoglobin)
Negativ feedback: minskar produktionen
Ge exempel på två enzym
Pepsin: bryter ner proteiner till aminosyror
Amylas: bryter ner kolhydrater till monosackarider
Laktas: bryter ner socker (laktos)
Apoenzym
Proteindel av enzym som kräver att en kofaktor binder för aktivitet
2 faktorer som påverkar enzyms reaktionshastighet
Temperatur: hög =snabb låg =långsammare
pH: beroende på enzymers ideala miljö
Substratkoncentration: hastighet över till enzymer är slut
Zwitterjon
Aminosyror som både är positivt och negativt laddade
Grundstruktur för aminosyra
En amingrupp (NH2)
Karboxylgrupp (COOH)
En väte (H)
En sidokedja (R)
Tre hydrofoba aminosyror
Glycin, valin, fenylalanin
Beta-sheets uppbyggnad strukturellt
Sekvens av aminosyror i ett protein som staplas på varandra och bildar flak. Hålls genom vätebindningar.
Stabiliseras av vätebindningar.
Alpha-helix
En aminokedja som snurrar runt sin egen axel
Fyra icke-kovalenta krafter i tredimensionell struktur i ett protein.
Van der wals, vätebindningar, hydrofoba bindningar, jonbindning
Omgivningsfaktorer som påverkar struktur och stabilitet hos ett protein
Temperatur, saltkoncentration och pH
Domän (protein)
En del av protein som utgör en självständig funktionell enhet.
Subenhet (protein)
En polypeptidkedja som tillsammans med andra subenheter kombineras och bygger upp ett protein
Familj ( protein)
Evolutionärt besläktade, strukturellt lika och har en viss sekvenshomologi
Möjliga kombinationer av aminosyror i en sekvens av 20
20^20
Tre polära aminosyror
Serin, treunin, lecin
Tre laddade aminosyror
Arginin, lysin, glutamat
Primärstruktur. Protein
Linjär. Aminosyrasekvens
N-terminal och C-terminal
(Vilka aminosyror ett protein består utav)
Sekundärstruktur
Alfa-helix och beta-flak
Alfa helix är skruvade
Och beta flak ligger som plattor på varandra.
Tertiärstruktur
Komplett 3D- struktur av en peptidkedja. (Hur sekundärstrukturer ligger i 3D-strukturer till varandra.
Kvartärstruktur
3D-struktur av ett protein komplex, 3 st monomerer sammankopplade.
(Hur stora subenheter ligger till varandra)
Bindning mellan cysteinsidokedjor i ett protein
Disulfidbryggor. Stabiliserar proteinstrukturer hos extracellulära proteiner
Nukleosid
En kvävebas med en ribos (5-kantig sockermolekyl)
Nukleotid
En nukleosid + 1-3 fosfatgrupper
Vad menas med deoxy i en deoxyribonukleotid
Att en O-atom försvunnit. Detta minskar benägenheten att binda till andra ämnen
Kvävebaserna i DNA och RNA
DNA:
Adenine(A), Guanine (G), Cytosine(C), Thymine (T)
RNA
Samma fast Thymine finns inte utan utbytt mot Uracil (U)
Hur packas DNA i cellkärnan
DNA är lindade runt histoner, histonerna bildar sedan kromatin kromosomer.
