Bm16 Flashcards
A quel stade se fait souvent la régulation de la transcription chez la bactérie ?
au stade de l’initiation
PAr quoi sont transmis les signaux extracellulaires ?
Par des proteines activatrice de régulation
activatrice ou inhibitrice
que font faire les proteines activatrice de transcription ?
elles vont se lier à coté du promoteur
que font faire les proteines inhibitrice de transcription ?
elles vont se lier sur le promotteur = encombrement sterique = empêche polymerase de se lier au facteur sigma
Sans proteine activatrice, est ce que les liason entre l’ARN polymerase aux regions promotrices sont rares ou fréquente
Rare = promoteur faible
Qu’est ce qui definit si un promotteur est fort ou non
Si il a une similarité max avec une séquence consensus
en cas d’un promoteur fort, est ce qu’il y aura 100% de liaison entre lui et l’ARN ?
non, il y a toujours le principe de compétition à avec le represseur. Il se peut qu’il gagne par moment
Si la proteine inhibitrice se lie à l’operateur avant sigma, que se passe-til ?
Il gagne la compétition , empêche le promoteur d’agir ( même si il est fort)
Que fera la proteine activatrice dans l’initiation
AIDE l’ARN polymerase à se lier efficacement au promotteur
+ favorise ouverture du complexe ARN-POL /ADN ( = isomerisation)
Transition de complexe fermé à ouvert
Expliquez le principe de L’allosterie?
Que sera l’effet dans le cas de l’initiation à la transcription
changement de conformation d’une proteine enzymatique par la liaison d’une autre molécule
L’induction allostérique d’une protéine enzymatique peut activer ou inhiber la formation du complexe enzyme substrat
Quel est le rôle des boucles d’ADN ?
quelles proteines cela implique ?
rapproche une molécule activatrice qui a un site de liaison situé à plusieurs centaines de bases de la région promotrice
-rapproche aussi deux proteine de liaison –> permet interaction prot prot
Cela implique des proteine qui favorise la courbure de l’ADN et une proteine activatrice
Quel est le rôle principal de l’opéron Lactose
COntroler le recrutement de L’ARN polymerase
Que régule l’opéron Lac?
Que synthétise -il
Quand est ce qu’il est activé ?
Le métabolisme du lactose
- B galactosidase
- Perméase
- Transacétylase
Activé quand bcp de lactose ET très peu de glucose
Quel est le l’activateur de L’opéron lac et le répresseur
activateur : CAP
Represseur = REP lac
se lie à l’operateur lac et couvre une partie du promoteur –>empêche ARN polymerase de se lier au promoteur
sans inhibiteur et sans activateur, Est ce que le promoteur de l’opéron lac est faible ou fort ?
Pourquoi ?
qu’elle est le niveau d’expression (sans inhibiteur)
Basale
il ne possède pas d’élément Up et sa séquence -35 n’est pas conservé
Comment va fonctionner l’Activateur de l’opéron lac ?
comment sera le niveau d’expresion ?
CAP se lie à son site ADN , se lie également à l’ARN polymérase
–>recrute ARN polymerase à son promoteur, lui donne un site de liaison supplémentaire
- a une région activatrice qui va se lier au domaine alpha CTD
Niveau expression maximal de l’opéron lac
Dans l’opéron lactose, à quoi va se lier la queue alpha carboxytermial de l’ARN polymerase
Va se lier au site à l’élément Up ( si présent, pas le cas pour opéron lac ) et cap
Que sont les propriétés qu’utilisent les facteurs protéiques de liaison à ADN
- Les homodimères se lient à des sits avec des séquences répétées et inversées
2-Chacun des 2 monomères forment un motif helice alpha coude elice
qui se lie a un 1/2 site symetriquement par rapport au centre du site de liaison
3-Chacune des deux helices de reconnaissance se loge dans le sillon majeur
= taille d’une hélice alpha
4- Les contacts entre les helice R (reconnaissance) de CAP et le sommet des bases de son site de liaison se font pas pon H
helise S (stabilisatrice ) interagit avex exosquelette adn et stabilisse Helice R
Comment est produit l’allolactose ?
Quel est son rôle ?
C’est du lactose transformé par la B-galactosidase
Se lie à REP lac, change sa conformation ( = allosterie)
Rep lac ne peut plus se lier à l’opérateur
est il possible d’avoir une initiation de l’opéron lactose sans cap ?
oui , mais faible ( résiduelle si Rep lac est là ), ARN polymerase gagne la compétiton contre Rep lac même si promotteur faible
exff alors que si cap est là = expression maximale
Que sont les différent niveau d’epression?
Dans quel situation sont ils là
residuelle >basale >normale/maximal
résiduelle : des fois polymerase gagne contre Rep lac
basale: pas rep lac mais polymerase quand même faible
maximal : quand cap est là
Qu’est ce qui desactive Allolactose
REP-lac
où se fait la liaison allolactose + rep lac
En dehors de son site de liaison à l’opérateur
