Bm16 Flashcards

1
Q

A quel stade se fait souvent la régulation de la transcription chez la bactérie ?

A

au stade de l’initiation

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2
Q

PAr quoi sont transmis les signaux extracellulaires ?

A

Par des proteines activatrice de régulation

activatrice ou inhibitrice

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3
Q

que font faire les proteines activatrice de transcription ?

A

elles vont se lier à coté du promoteur

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4
Q

que font faire les proteines inhibitrice de transcription ?

A

elles vont se lier sur le promotteur = encombrement sterique = empêche polymerase de se lier au facteur sigma

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5
Q

Sans proteine activatrice, est ce que les liason entre l’ARN polymerase aux regions promotrices sont rares ou fréquente

A

Rare = promoteur faible

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6
Q

Qu’est ce qui definit si un promotteur est fort ou non

A

Si il a une similarité max avec une séquence consensus

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7
Q

en cas d’un promoteur fort, est ce qu’il y aura 100% de liaison entre lui et l’ARN ?

A

non, il y a toujours le principe de compétition à avec le represseur. Il se peut qu’il gagne par moment

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8
Q

Si la proteine inhibitrice se lie à l’operateur avant sigma, que se passe-til ?

A

Il gagne la compétition , empêche le promoteur d’agir ( même si il est fort)

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9
Q

Que fera la proteine activatrice dans l’initiation

A

AIDE l’ARN polymerase à se lier efficacement au promotteur
+ favorise ouverture du complexe ARN-POL /ADN ( = isomerisation)
Transition de complexe fermé à ouvert

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10
Q

Expliquez le principe de L’allosterie?

Que sera l’effet dans le cas de l’initiation à la transcription

A

changement de conformation d’une proteine enzymatique par la liaison d’une autre molécule

L’induction allostérique d’une protéine enzymatique peut activer ou inhiber la formation du complexe enzyme substrat

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11
Q

Quel est le rôle des boucles d’ADN ?

quelles proteines cela implique ?

A

rapproche une molécule activatrice qui a un site de liaison situé à plusieurs centaines de bases de la région promotrice

-rapproche aussi deux proteine de liaison –> permet interaction prot prot

Cela implique des proteine qui favorise la courbure de l’ADN et une proteine activatrice

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12
Q

Quel est le rôle principal de l’opéron Lactose

A

COntroler le recrutement de L’ARN polymerase

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13
Q

Que régule l’opéron Lac?
Que synthétise -il

Quand est ce qu’il est activé ?

A

Le métabolisme du lactose

  • B galactosidase
  • Perméase
  • Transacétylase

Activé quand bcp de lactose ET très peu de glucose

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14
Q

Quel est le l’activateur de L’opéron lac et le répresseur

A

activateur : CAP

Represseur = REP lac
se lie à l’operateur lac et couvre une partie du promoteur –>empêche ARN polymerase de se lier au promoteur

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15
Q

sans inhibiteur et sans activateur, Est ce que le promoteur de l’opéron lac est faible ou fort ?
Pourquoi ?

qu’elle est le niveau d’expression (sans inhibiteur)

A

Basale

il ne possède pas d’élément Up et sa séquence -35 n’est pas conservé

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16
Q

Comment va fonctionner l’Activateur de l’opéron lac ?

comment sera le niveau d’expresion ?

A

CAP se lie à son site ADN , se lie également à l’ARN polymérase
–>recrute ARN polymerase à son promoteur, lui donne un site de liaison supplémentaire

  • a une région activatrice qui va se lier au domaine alpha CTD

Niveau expression maximal de l’opéron lac

17
Q

Dans l’opéron lactose, à quoi va se lier la queue alpha carboxytermial de l’ARN polymerase

A

Va se lier au site à l’élément Up ( si présent, pas le cas pour opéron lac ) et cap

18
Q

Que sont les propriétés qu’utilisent les facteurs protéiques de liaison à ADN

A
  • Les homodimères se lient à des sits avec des séquences répétées et inversées

2-Chacun des 2 monomères forment un motif helice alpha coude elice
qui se lie a un 1/2 site symetriquement par rapport au centre du site de liaison

3-Chacune des deux helices de reconnaissance se loge dans le sillon majeur
= taille d’une hélice alpha

4- Les contacts entre les helice R (reconnaissance) de CAP et le sommet des bases de son site de liaison se font pas pon H

helise S (stabilisatrice ) interagit avex exosquelette adn et stabilisse Helice R

19
Q

Comment est produit l’allolactose ?

Quel est son rôle ?

A

C’est du lactose transformé par la B-galactosidase

Se lie à REP lac, change sa conformation ( = allosterie)
Rep lac ne peut plus se lier à l’opérateur

20
Q

est il possible d’avoir une initiation de l’opéron lactose sans cap ?

A

oui , mais faible ( résiduelle si Rep lac est là ), ARN polymerase gagne la compétiton contre Rep lac même si promotteur faible

exff alors que si cap est là = expression maximale

21
Q

Que sont les différent niveau d’epression?

Dans quel situation sont ils là

A

residuelle >basale >normale/maximal

résiduelle : des fois polymerase gagne contre Rep lac
basale: pas rep lac mais polymerase quand même faible

maximal : quand cap est là

22
Q

Qu’est ce qui desactive Allolactose

A

REP-lac

23
Q

où se fait la liaison allolactose + rep lac

A

En dehors de son site de liaison à l’opérateur