Blok A Flashcards

1
Q

Gibbs fri energi, definition

A

Mængden af energi til stede under en reaktion ved konstant tryk og temperatur

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Gibbs fri energi, formel

A

ΔG = ΔH - TΔS eller ΔG = -RTln(K)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

ΔG < 0

A

Reaktionen frigiver energi, exergon og spontan reaktion.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

ΔG > 0

A

Reaktionen kræver energi. Endergon. Skal kobles til en exergon reaktion for at kunne ske.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

ΔG = 0

A

Systemet er i ligevægt

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Entropi, definition

A

Entropi (S) er uorden i et system. Desto større uorden desto større entropi,

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

ΔS<0

A

Hvis ΔS er mindre end 0 betyder det at ordnen øges i systemet mens reaktionen foregår. Det vil sige at vi går fra en uordnet til en ordnet tilstand, hvor produkterne er mere komplekse og ordnede end reaktanterne.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

ΔS>0

A

Hvis ΔS er større end 0 betyder det at uordnene øges med reaktionen. Det vil sige at vi går fra en ordnet til uordnet tilstand, og reaktanterne da var mere komplekse end produkterne.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Metabolisme

A

Summen af kemiske processer i cellen, dvs. energiomsætningen i systemet.
Indebærer katabolisme og anabolisme

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Katabolisme

A

Nedbryder molekyler, frigiver energi

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Anabolisme

A

Opbygger molekyler, dvs. binder (optager) energi

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Van der Waal

A

hydrofobe og londonkræfter. Mellem inducerede dipoler.
Uspecifik binding mellem atom og molekyler.
svage og kortrækkende, additive og derfor vigtige for interaktioner og proteinstabilitet.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Svovlbroer

A

Binding mellem cysteinrester som deler elektronpar

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Hydrogenbinding

A

Interaktion mellem permamente dipoler. Dvs. dipol-dipol vekselvirkning.
Er en svag binding, brydes og dannes nemt - gør dem gode ved funktionelle molekyler.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Ionbinding/saltbro

A

Binding mellem ladninger. Langtrækkende. Opstår pga. ladningsforskelle.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Proteinfoldning medfører?

A

fald i entropi, idet det bliver mere ordnet.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Intermolekylære kræfter

A

Mellem molekylerne (proteiner)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Intramolekylære kræfter

A

i molekylerne, i et protein

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Primær struktur

A

Aminosyresekvens

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Sekundær struktur

A

Bestemte foldede og stabile områder af polypeptidkæden. F.eks. alphahelix, beta-sheet, turns og loops

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Alphahelix specs

A

i + 4, dvs. hydrogenbinding ml. hver 4. aminosyre

omdrejning = 5,4 Å, indeholder 3,6 AA.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Coiled coil

A

Samling af alpha-helixer, viklet om hinanden.

23
Q

Tertiær struktur

A

Tredimensionel foldning af et protein bestående af en polypeptidkæde, og skabes af de sekundære strukturer der forekommer heri. Skabes af de intermolekylære kræfter mellem aminosyrernes sidekæder.

24
Q

Kvarternær struktur

A

Den overordnede struktur, multimere sammensætning af subunits. Arrangering af tertiære strukturer danner en funktionel enhed. Kan indeholder ikke-proteine komponenter, bl.a. jern.

25
Q

Domæne

A

Selvstændigt foldet del af en proteinsekvens, har en funktion.

26
Q

Subunit

A

En polypeptidkæde i et protein bestående af flere polypeptidkæder.

27
Q

Allosterisk regulering

A

Noget binder tili proteinet og medfører en ændring i strukturen et andet sted på proteiner. Kan enten aktivere eller inaktivere enzymet.

28
Q

PTM’er formål:

A

Regulere enzymatisk funktion, ved at påsætte biokemisk funktionelle grupper

29
Q

N-glykosylering

A

I ER. På Asparagin

30
Q

O-glykosylering

A

I golgi. Sjælden glykosylering på serin eller threonin. På O.

31
Q

Phosphorylering

A

Hyppigste modifkation. Proteinkinase påsætter phosphat på OH-gruppe dvs. i serin, threonin, tyr.

32
Q

Acetylering

A

Addition af acetyl, sker på Lys

33
Q

Methylering

A

Methylgruppe sættes på Lys eller Arg

34
Q

Cryo-EM, formål

A

Bestemme 3D struktur

35
Q

NMR

A

bestemmer 3D struktur på dynamisk protein

36
Q

Røntgenstruktur

A

Aflæser 3D proteinstruktur på krystalliseret protein.

37
Q

Massespektrometri

A

bruges til at bestemme aminosyresammensætning, molekylmasse, molekylvægt og PTMer.

38
Q

Antigen

A

Protein som udløser immunrespons

39
Q

Antistof

A

kroppens forsvar mod antigener

40
Q

Monoklonalt antistof

A

En B-lymfocyt inficeres med et antigen => dannelse af antistof. Monoklonalt fordi kun et genom.

41
Q

Polyklonalt antistof

A

Lavet ud fra flere forskellige immunceller, så de er rettet mod forskellige epitoper på antigenet. Dette giver kraftigere men mindre specifik respons

42
Q

Flippase

A

I golgis membran. Katalyserer diffusion af membranproteiner fra ydre til indre leaflet. Bruger ATP

43
Q

Floppase

A

golgis membran. Katalyserer diffusion af membranproteiner fra indre til ydre leaflet. ATP.

44
Q

Scramblase

A

Transportprotein som fordeler nysyntetiserede membranlipider tilfældigt i ERs membran. Bruger ikke ATP, aktiveres af stigning i [Ca2+]

45
Q

Lateral diffusion

A

Diffusion af proteiner og lipider i samme leaflet. hurtigt og frit.

46
Q

Lipidmolekyle undergår fleksion, hvad sker der?

A

Lipidmolekylets hale kontraherer.

47
Q

Osmolaritet

A

Den totale koncentration af opløst stof (solutkoncentration).

48
Q

Hyperton opløsning

A

Højere osmolaritet ind intracellulærvæsken => vandtransport fra cellen og ud, så den skrumper

49
Q

Hypoton

A

Lavere osmolaritet i intracellulærvæsken => vandtransport ind i cellen => cellen svulmer

50
Q

konduktans, G

A

En membrans permeabilitet for forskellige molekyler

51
Q

Membranpotentialet (vm)

A

Ladningsforskelle over membranen, afhænger af konduktansen og ligevægtspotentialet for de forskellige ioner. Det samlede vægtede gennemsnit af de permeable ioners ligevægtspotentiale.

52
Q

Ligevægtspotentialet, E

A

Er den potentielle elektriske forskel, hvor der ingen nettostrømning er af den enkelte ion over en membran. Udregnes med nernst

53
Q

Nernst ligning

A

Veq = (61,5/z) - log (Co/Ci)