Blok A Flashcards
Gibbs fri energi, definition
Mængden af energi til stede under en reaktion ved konstant tryk og temperatur
Gibbs fri energi, formel
ΔG = ΔH - TΔS eller ΔG = -RTln(K)
ΔG < 0
Reaktionen frigiver energi, exergon og spontan reaktion.
ΔG > 0
Reaktionen kræver energi. Endergon. Skal kobles til en exergon reaktion for at kunne ske.
ΔG = 0
Systemet er i ligevægt
Entropi, definition
Entropi (S) er uorden i et system. Desto større uorden desto større entropi,
ΔS<0
Hvis ΔS er mindre end 0 betyder det at ordnen øges i systemet mens reaktionen foregår. Det vil sige at vi går fra en uordnet til en ordnet tilstand, hvor produkterne er mere komplekse og ordnede end reaktanterne.
ΔS>0
Hvis ΔS er større end 0 betyder det at uordnene øges med reaktionen. Det vil sige at vi går fra en ordnet til uordnet tilstand, og reaktanterne da var mere komplekse end produkterne.
Metabolisme
Summen af kemiske processer i cellen, dvs. energiomsætningen i systemet.
Indebærer katabolisme og anabolisme
Katabolisme
Nedbryder molekyler, frigiver energi
Anabolisme
Opbygger molekyler, dvs. binder (optager) energi
Van der Waal
hydrofobe og londonkræfter. Mellem inducerede dipoler.
Uspecifik binding mellem atom og molekyler.
svage og kortrækkende, additive og derfor vigtige for interaktioner og proteinstabilitet.
Svovlbroer
Binding mellem cysteinrester som deler elektronpar
Hydrogenbinding
Interaktion mellem permamente dipoler. Dvs. dipol-dipol vekselvirkning.
Er en svag binding, brydes og dannes nemt - gør dem gode ved funktionelle molekyler.
Ionbinding/saltbro
Binding mellem ladninger. Langtrækkende. Opstår pga. ladningsforskelle.
Proteinfoldning medfører?
fald i entropi, idet det bliver mere ordnet.
Intermolekylære kræfter
Mellem molekylerne (proteiner)
Intramolekylære kræfter
i molekylerne, i et protein
Primær struktur
Aminosyresekvens
Sekundær struktur
Bestemte foldede og stabile områder af polypeptidkæden. F.eks. alphahelix, beta-sheet, turns og loops
Alphahelix specs
i + 4, dvs. hydrogenbinding ml. hver 4. aminosyre
omdrejning = 5,4 Å, indeholder 3,6 AA.