biotechnologia/mutacje Flashcards

1
Q

biotechnologia tradycyjna

A

wykorzystuje naturalnie występujące w przyrodzie organizmy lub produkowane przez nie substancje
dobór na drodze selekcji sztucznej - człowiek decyduje kto sie z kim skrzyżuje
naturalny mechanizm krzyżowania - bez ingerencji w genom

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

gdzie używamy biotechnologii tradycyjnej

A

przy procesach warzenia piwa
produkcji wina
wypiekania chleba
kiszenia kapusty i ogórków
zakwaszania mleka na jogurty kefiry

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

biotechnologia molekularna

A

umożliwia zmienianie genomów organizmów by otrzymać organizm o pożądanych cechach

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

co to są enzymy restrykcyjne

A

endonukleazy {enzymy mogące przecinać DNA} przecinają DNA w miescu wyznaczonym przez specyficzną sekwencje DNA
Enzymy restrykcyjne rozpoznają sekwencje palindrome o tępych lub lepkich końcach

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

co to są metylazy

A

modyfikują DNA po replikacji. enzymy dodają grupe metylową do jednej lub wielu zasad w każdym miejscy restrykcyjnym co sprawia ze enzymy restrykcyjne nie rozpoznaja DNA i nie tną tych miejsc.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Po co są ligazy?

A

łączą fragmenty DNA przecięte wcześniej przez enzymy restrykcyjne. pomaga w tworzeniu wiązań fosfodiestrowych między dwoma fragmentami DNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

polimeraza DNA

A

powiela fragmenty DNA dubudowywuje nukleotydy komplementarne do nici matrycowej

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

co to są sekwencje polindromowe?

A

ok 4-8 pr zasad azotowych które sa rozpoznawane przez enzymy restrykcyjne. Sekwencja zasad jednej nici jest taka sama jak nici komplementarnej jeżeli obie są odczytywane w kierunku 5’ do 3’

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

co to sa końce lepkie sekwencji palindromowych

A

zakończone są jednoniciowym fragmentem - posiadają wolne nukleotydy które łatwiej mogą sie przłączyć do innego lepkiego końca

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Co to jest sonda molekularna?

A

jest to krótki sztucznie utworzony fragment kwasu nukleinowego. znakowany jest związkiem fluorescencyjnym aby był łatwy do zlokalizowania

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

po co jest hybrydyzacja DNA

A

pomaga nam znaleść określony gen w całym genomie
wykorzystywany często w diagnostyce chorób genetycznych

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

co to są biblioteki genomowe?

A

to zbió komórek bakterii które zawierają różne fragmenty genomu jednego organizmu

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

jakie sa rodzaje bibliotek genomowych?

A
  1. cDNA cząsteczki DNA bez intronów każda cząsteczka posiada sekwencje kodujące jednego genu
  2. biblioteka cDNA
    najpierw jest odwrotna transkrypcja mRNA wyizolowanego z komórek. dane cDNA jest wstawiane do wketora
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

jak zachodzi klonowanie DNA

A
  1. plazmid i DNA pochodzące z innego organizmu są cietę tym samm enzymem restrykcyjny. Dzieki temu uzyskujemy cząsteczki o komplementarnych końcach
  2. Cząsteczki obu rodzajów są mieszane w wyniku czego ich lepkie końce łączą się parami. Ligaza DNA spaja fragmenty DNA
  3. plazmid obcym genem wprowadza się do komórki bakteryjnej - działanie prądem lub substancją chemiczną na ściane komórki bakteryjnej
  4. Plazmid ulega replikacji i dostaje się do komórek potomnych podczas podziaów komórkowych
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

co to łańcuchowa reakcja polimerazy PCR

A

jest to podstawowa technika biologii molekularnej która umożliwia powielenie określonego fragmentu DNA in vitro - poza organizmem

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

na czym polega łańcuchowa reakcja polimerazy - PCR

A
  1. Denaturacja DNA w ok 95 stopniach
  2. przyłączenie starterów ok 40-60 stopni
  3. Synteza komplementarnych nici DNA ok 70 stopni przy udziale termostabilnej polimerazy DNA
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Termostabilna polimeraza DNA - jak powstaje?

A

jes to wyizolowana polimeraza od bakterii żyjących w bardzo wysokich temperaturach dlatego ich białka są odporne na denaturacje

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

jak zachodzi PCR?

A

zachodzi w cyklach ok 20-30 podczas kolejnych cykli liczba produktów wzrasta wykładniczo - 2 do potęgi n

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

jakie są zalety i wady PCR?

A

zalety
umożliwia szybkie i tanie powielenie bardzo małej ilości materiału genetycznego
wady
jest bardzo czułe - nawet nieiwelka ilość niepożądanego DNA może zostać powielona jeżeli zawiera sekwencje komplementarne do starterów i zaciemnić wynik

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

na czym polega elektroforeza?

A

mieszaniny makrocząstecze - biaałek polipepetydów, fragmentów DNA czy RNA mozę być rozdzielone
dzieki obecności łądunku elektrycznego mogą migrować w polu elektrycznym

21
Q

Elektroforeza DNA

A

DNA posiada ujemnie naładowane reszty fosforanowe dlatego w żelu kieruje się w stronĘ elektrody dodatniej.
szybkość przechodzenia zależy od wielkości cząsteczki - większe przechodzą wolnieJ

22
Q

Rodzaje transformacji genetycznej

A
  1. metody pośrednie - przy uzyciu wektorów - sztuczne chromosomy plazmidy wirusy czy bakterie
  2. metody bezpośrednie - mamy bezpośrednią ingerencje w komórki gospodarza w celu wprowadzenia materiału genetycznego
23
Q

Co to jest GMO?

A

to organizmy zmodyfikowane genetycznie - organizm którego cechy dziedziczone zostały zmienione wskutek ingerencji w jego materiał genetyczny np zmiana aktywności genu lub wstawienie dodatkowej kopii

24
Q

co to są organizmy transgeniczne?

A

to organizmy zmodyfikowane genetycznie który ma w swoim genomie gen pochodzenia innego gatunku

25
Q

jak otrzymujemy mikroorganizmy GMO?

A

poprzez transformacje genetyczną z wprowadzeniem prazmidu z obcym genem lub przez wstawienie obcego genu w chromosom bakteryjny lub DNA jądrowy w przypadku grzybów przez wektor

26
Q

jakie jest zastosowanie mikroorganizmów GMO?

A
  1. medycyna - synteza insuliny produkcja fragmentów szczepionek
  2. przemysł spożywczy - produkcja enzymów czy dodatkowej żywności
  3. ochrona środowiska - usuwanie zanieczyszczeń
27
Q

co to jest agroinfekcja?

A

wykorzystuje naturalną zdolność wnikania plazmidów bakterii Agrobacterium do komórek roślin.

28
Q

po co są zwierzęta zmodyfikowane genetycznie?

A

tworzy się poprzez wprowadzenie zmian w genomach komórek zarodkowych poprzez zmodyfikowane wirusy zwierzęce i przez bezpośrednią metodę mikroiniekcji

29
Q

co to jest mysz chimeryczna?

A

mysz zawierająca zarówno komorki zmodyfikowane genetycznie jak i komórki niezmodyfikowane

30
Q

gdzie występują klony w naturze?

A
  1. przy rozmnażaniu bezpłciowym poprzez podział np bakterie
  2. przy rozmnażaniu wegetatywnym przez fragmentacje roślin
  3. u organizmów powstałych z poliembrionii - wielozarodkowości - bliźniaki jednojajowe
  4. u organizmów powstałych z pączkowania
31
Q

co to jest mikrorozmnażanie?

A

to otrzymywanie wielu identycznych roślin z fragmentów rośliny macierzystej

32
Q

jak zachodzi mikrorozmnażanie?

A

pobieramy frangment i umieszcamy na podłożu w którym tkanki stałej odzywskują zdolność do podziału - powstaje kallus
tkanka kallusowa tworzy nowe komórki i organy
przeniesienie powstałych sadzonek na podłoże zbliżone do naturalnego

33
Q

jakie są metody diagnostyki molekularnej?

A
  • PCR
  • hybrydyzacja DNA
  • sekwencjonowanie DNA
34
Q

w czym używa się diagnostyki molekularnej?

A

*przy chorobach genetycznych - jednogenowych lub chromosowych - zwłaszcza w tych w których nastąpiła zmiana struktury chromosomu
*przy chorobach zakaźnych - zakażenie wirusami lub bakteriami - wykrywany zostaje materiał patogenu
*przy chorobach chorób nowotworowych - wykrywa się charakterystyczne mutacje, badanie poziomu ekspresji wielu genów
*przy chorobach wieloczynnikowych - badanie DNA i mRNA wielu genów jednocześnie co pozwala na określenie stopnia zaawansowania choroby i rokowania

35
Q

po co są stosowane przeciwciała nomoklonanlne?

A

są to przeciwciała o wysokiej swoistości - łączą się z konkretnym antygenem. używane przy leczeniu chorób autoimmunologicznych czy terapii nowotworowej

36
Q

jakie zastosowania ma biotechnologia w medycynie sądowej?

A

przy ustalaniu ojcostwa
przy ustalaniu tożsamości osoby podejrzanej o przestępstwo czy osób poszukiwanych

37
Q

po co są badania ewolucyjne

A

ustalanie pokrewieństwa między wymarłymi a współczęsnie żyjącymi gatunkami
ustalanie przebiegu zdarzeń ewolucyjnych

38
Q

jakie są rodzaje zmienności?

A
  1. środowiskowa - niedziedziczona
  2. genetyczna - rekobinacyjne [pożadana przez nas], mutacyjna - może mięć negatywne konsekwencje
39
Q

zmienność genetyczna u prokariota

A
  1. pionowy transfer genów - przekazywanie informacji genetycznej podczas rozmnażania czyli z pokolenia na pokolenie
  2. poziomy transfer genów - przekazywanie podczas koniugacji tranduckji i transformacji - może zachodzić między osobnikami należacymi do różnych szczepów
40
Q

rodzaje zmniennosci genetycznej?

A
  1. ciągła - dotycząca cech ilościowych geny kumulatywne
  2. nieciagła - dotyczy cech jakościowych - geny pojedyńcze
41
Q

kiedy zachodzi zmienność rekombinacyjna?

A

podczas procesu crossing-over
podczas losowej segregacji chromosomów do gamej podczas mejozy
ppodczas losowego łączenia się gamet podczas zapłodnienia

42
Q

rodzaje zmienności mutacyjnej

A
  1. mutacje spontaniczne
  2. mutacje indukowane
43
Q

charakterystyka mutacji spontanicznej

A

powstaje w wyniku błędów pojawiających się podczas replikacji DNA

44
Q

charakterystyka mutacji indukowanych

A

przez czynniki mutagenne - UV kwas azotowy 3 wirus opryszczki zapalenie wątroby HPV

45
Q

charakterystyka mutacji genowej - substytucji

A

punktowa zmiana jednego nukleotydu na inny
- tranzycja - puryna na puryne pirymidyna na pirymidę
transwersja - zamiana puryny na pirymidyne

46
Q

mutacje genowe - delecja

A

utrata jednego lub kilkunastu nukleotydów

47
Q

mutacje genowe insercja

A

polega na wstawieniu jendego lub kilku nukleotydów

48
Q
A