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Biologie moléculaire et cellulaire > Biologie moléculaire > Flashcards

Biologie moléculaire Flashcards

1
Q

ARN ribosomal : double ou simple ?

A

Double

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Q

ADN est plus stable que l’ARN :

A

a) absence d’hydroxyle en 2’ du sucre

b) Thymine

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3
Q

Désamination spontanée de

A

la cytosine en uracile

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4
Q

Polymérases d’ADN ont besoin de

A

amorce

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Q

Transcriptase inverse : amorce de

A

ARN

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6
Q

Polymérases d’ARN : pas

A

d’amorce

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7
Q

Pour la PCR il faut seulement connaitre

A

la séquence des amorces

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8
Q

RT-PCR

A

rétro-transcription produit ADN complémentaire qui est amplifié par PCR

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9
Q

Possibilités de la PCR

A

a) détecter un organisme
b) détecter un gène
c) détecter ARNm (activité d’un gène)

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10
Q

Barcoding moléculaire

A

identification des espèces présentes grâce aux séquences conservées qui différent d’un organisme à l’autre

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11
Q

Méta-barcoding

A

barcoding de l’ADN d’un échantillon pour produire un catalogue des espèces présentes

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12
Q

Méthylation protége de

A

enzymes de restriction

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13
Q

Enzymes de restriction

A

coupent séquences précises de l’ADN

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14
Q

DNA ligase

A

coller bouts cohésifs après l’action des enzymes de restriction

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15
Q

Vecteurs plasmides

A

permettent multiplier et exprimer l’ADN recombinant

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16
Q

ADN recombinant : éléments

A

a) origine de réplication
b) marqueur de séléction : un gène d’intérêt
c) site d’insertion : où coupent les enzymes de restriction

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17
Q

plasmides vecteurs d’expression, sites d’insertion sont

A

en aval du promoteur

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18
Q

le séquencage selon Sanger utilise des

A

didésoxynucléotides

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19
Q

Le didésoxynucléotides provoquent

A

différentes tailles de fragments d’ADN

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20
Q

Premier génération de séquencage

A

séquencage selon Sanger

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21
Q

Deuxième génération de séquencage

A

séquencage parallèle massif de fragments assez courts

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22
Q

Troisième géneration de séquencage

A

séquencage de longs fragments individuels

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23
Q

Métagénomique

A

séquencage et analyse d’ADN sans séparation des porganismes présents dans l’échantillon

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24
Q

Bactériophages (ou phages)

A

virus de bactéries

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25
viroides
composés seulement d'un brin d'ARN circulaire (attaquent les plantes)
26
prions
composés seulement des feuillets B
27
Génomes de virus à ADN : repliqués dans
noyau
28
Génomes de virus à ARN : repliqués dans
cytoplasme
29
réplicase
polymérase de virus à ARN, synthétise brin ARN complémentaire
30
transposase réconnait
séquences inverses répétées autour un transposone
31
Transposones autonomes
codent leur propre transposase
32
gène env
code enveloppe virale
33
gènes gag et pol
codent protéines nécessaires aux rétrovirus et rétrotransposons (ex. transcriptase inverse)
34
Rétrovirus endogènes
incapables de former particules infectieuses, sont devenus rétrotranposons
35
transposons causent mutations par :
a) insertion ou b) cicatrice laissée
36
Cartes génétiques
ordre de marqueurs génétiques sur chaque chromosome grâce au déséquilibre de liaison entre eux
37
Marquers génétiques moléculaires
a) microsatellites | b) SNP
38
PCR-RFLP
amplifier un fragment par PCR et le digérer avec une enzyme de restriction pour trouver des différences de séquence
39
Courtes séquences répétées plusieurs fois en tandem
Mini- et microsatellites
40
Comment détécter les mini- et microsatellites ?
PCR avec amorces de séquences non-répétées qui les flanquent
41
SNP
mutations ponctuelles d'un seul nucléotide
42
Plus fréquent SNP
changement de C par un T
43
On peut utiliser les SNP pour
identifier un gène responsable d'un phénotype
44
Mutagénèse induite
faire traitements chimiques et après croisser la plante avec une autre non-mutagénisée
45
Limitations des méthodes de mutagénèse induite
Quelques mutations n'ont pas un effet immédiatement visible, mutations qu'on peut pas "effacer" par croissement
46
Transfert horizontal de gènes
gènes recus par un autre organisme, de fois pas de la même spèce
47
Transferts horizontaux les plus fréquents
a) transposons b) rétroéléments c) rétrovirus
48
(Transferts artificiels de gènes) Transgénèse
gènes introduits pour corriger des mutations pathogéniques
49
On peut utiliser les agrobactéries pour
faire un transfert artificiel (transgenèse) de gènes aux plantes
50
Biolistique
projecter de partciules métaliques enrobées d'ADN pour introducire des gènes dans des tissus
51
Génétique inverse
on connaît le gène avant d'avoir détecté un phenptype de mutation
52
Mutagénèse ciblée par recombinaison homologue
échange d'une séquence contre une version modifié
53
FokI
une enzyme de restriction
54
Doigts de zinc
domaines répétitifs
55
Zinc Finger Nuclease (ZFN)
Enzyme de restriction programmée | FokI + doigts de zinc
56
Mutation aléatoire ciblée
l'ADN coupé en bous francs est réparé de manière imprécise
57
CRISPR
site spécialisé où les bactéries accumulent séquences de virus ayant tenté une infection
58
Système CRISPR-Cas
1) Site CRISPR est transcrit et fragmenté 2) Fragments d'ARN-guide sont incorporés dans Cas 3) Ce séquence coupe toute ARN complémentaire 4) si on fournit une matrice de réparation, on peut faire une édition génomique
59
Cas
une endonucléase
60
Euchromatine
structure realtivemente ouverte et inclut la majorité de gènes
61
Hétérochromatine
très compacte et inclut régiones riches en transposons et séquences répetitives
62
Empreintes parentales
causent une expression différente d'un même gène sselon qu'il est hérité du père ou de la mère
63
Co-supression
Silencage d'un transgène et d'un gène endogène
64
Silencage
La traduction d'un gène est empêché épigénétiquement
65
RNAi (intérferance par ARN)
complexe siRNA-AGO recrute une endonucléase pour dégrader l'ARN-cible
66
AGO (Argonaute)
une protéine
67
micro-ARNs
accélerent la dégradation de l'ARNm : contribuent à une régulation post-transcriptionnelle
68
Exemple de silencage co-transcriptionnelle
compactation de la chromatine grace aux siRNAs
69
siRNA
"petit ARN intérferant" | Clive ARNm pour empêcher l'expression de gènes

Biologie moléculaire et cellulaire (1 decks)

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