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Biologie moléculaire et cellulaire > Biologie moléculaire > Flashcards

Biologie moléculaire Flashcards

1
Q

ARN ribosomal : double ou simple ?

A

Double

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Q

ADN est plus stable que l’ARN :

A

a) absence d’hydroxyle en 2’ du sucre

b) Thymine

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3
Q

Désamination spontanée de

A

la cytosine en uracile

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4
Q

Polymérases d’ADN ont besoin de

A

amorce

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Q

Transcriptase inverse : amorce de

A

ARN

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6
Q

Polymérases d’ARN : pas

A

d’amorce

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7
Q

Pour la PCR il faut seulement connaitre

A

la séquence des amorces

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8
Q

RT-PCR

A

rétro-transcription produit ADN complémentaire qui est amplifié par PCR

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9
Q

Possibilités de la PCR

A

a) détecter un organisme
b) détecter un gène
c) détecter ARNm (activité d’un gène)

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10
Q

Barcoding moléculaire

A

identification des espèces présentes grâce aux séquences conservées qui différent d’un organisme à l’autre

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11
Q

Méta-barcoding

A

barcoding de l’ADN d’un échantillon pour produire un catalogue des espèces présentes

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12
Q

Méthylation protége de

A

enzymes de restriction

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13
Q

Enzymes de restriction

A

coupent séquences précises de l’ADN

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14
Q

DNA ligase

A

coller bouts cohésifs après l’action des enzymes de restriction

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15
Q

Vecteurs plasmides

A

permettent multiplier et exprimer l’ADN recombinant

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16
Q

ADN recombinant : éléments

A

a) origine de réplication
b) marqueur de séléction : un gène d’intérêt
c) site d’insertion : où coupent les enzymes de restriction

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17
Q

plasmides vecteurs d’expression, sites d’insertion sont

A

en aval du promoteur

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18
Q

le séquencage selon Sanger utilise des

A

didésoxynucléotides

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19
Q

Le didésoxynucléotides provoquent

A

différentes tailles de fragments d’ADN

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20
Q

Premier génération de séquencage

A

séquencage selon Sanger

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21
Q

Deuxième génération de séquencage

A

séquencage parallèle massif de fragments assez courts

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22
Q

Troisième géneration de séquencage

A

séquencage de longs fragments individuels

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23
Q

Métagénomique

A

séquencage et analyse d’ADN sans séparation des porganismes présents dans l’échantillon

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24
Q

Bactériophages (ou phages)

A

virus de bactéries

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25
Q

viroides

A

composés seulement d’un brin d’ARN circulaire (attaquent les plantes)

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26
Q

prions

A

composés seulement des feuillets B

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27
Q

Génomes de virus à ADN : repliqués dans

A

noyau

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28
Q

Génomes de virus à ARN : repliqués dans

A

cytoplasme

29
Q

réplicase

A

polymérase de virus à ARN, synthétise brin ARN complémentaire

30
Q

transposase réconnait

A

séquences inverses répétées autour un transposone

31
Q

Transposones autonomes

A

codent leur propre transposase

32
Q

gène env

A

code enveloppe virale

33
Q

gènes gag et pol

A

codent protéines nécessaires aux rétrovirus et rétrotransposons (ex. transcriptase inverse)

34
Q

Rétrovirus endogènes

A

incapables de former particules infectieuses, sont devenus rétrotranposons

35
Q

transposons causent mutations par :

A

a) insertion
ou
b) cicatrice laissée

36
Q

Cartes génétiques

A

ordre de marqueurs génétiques sur chaque chromosome grâce au déséquilibre de liaison entre eux

37
Q

Marquers génétiques moléculaires

A

a) microsatellites

b) SNP

38
Q

PCR-RFLP

A

amplifier un fragment par PCR et le digérer avec une enzyme de restriction pour trouver des différences de séquence

39
Q

Courtes séquences répétées plusieurs fois en tandem

A

Mini- et microsatellites

40
Q

Comment détécter les mini- et microsatellites ?

A

PCR avec amorces de séquences non-répétées qui les flanquent

41
Q

SNP

A

mutations ponctuelles d’un seul nucléotide

42
Q

Plus fréquent SNP

A

changement de C par un T

43
Q

On peut utiliser les SNP pour

A

identifier un gène responsable d’un phénotype

44
Q

Mutagénèse induite

A

faire traitements chimiques et après croisser la plante avec une autre non-mutagénisée

45
Q

Limitations des méthodes de mutagénèse induite

A

Quelques mutations n’ont pas un effet immédiatement visible, mutations qu’on peut pas “effacer” par croissement

46
Q

Transfert horizontal de gènes

A

gènes recus par un autre organisme, de fois pas de la même spèce

47
Q

Transferts horizontaux les plus fréquents

A

a) transposons
b) rétroéléments
c) rétrovirus

48
Q

(Transferts artificiels de gènes) Transgénèse

A

gènes introduits pour corriger des mutations pathogéniques

49
Q

On peut utiliser les agrobactéries pour

A

faire un transfert artificiel (transgenèse) de gènes aux plantes

50
Q

Biolistique

A

projecter de partciules métaliques enrobées d’ADN pour introducire des gènes dans des tissus

51
Q

Génétique inverse

A

on connaît le gène avant d’avoir détecté un phenptype de mutation

52
Q

Mutagénèse ciblée par recombinaison homologue

A

échange d’une séquence contre une version modifié

53
Q

FokI

A

une enzyme de restriction

54
Q

Doigts de zinc

A

domaines répétitifs

55
Q

Zinc Finger Nuclease (ZFN)

A

Enzyme de restriction programmée

FokI + doigts de zinc

56
Q

Mutation aléatoire ciblée

A

l’ADN coupé en bous francs est réparé de manière imprécise

57
Q

CRISPR

A

site spécialisé où les bactéries accumulent séquences de virus ayant tenté une infection

58
Q

Système CRISPR-Cas

A

1) Site CRISPR est transcrit et fragmenté
2) Fragments d’ARN-guide sont incorporés dans Cas
3) Ce séquence coupe toute ARN complémentaire
4) si on fournit une matrice de réparation, on peut faire une édition génomique

59
Q

Cas

A

une endonucléase

60
Q

Euchromatine

A

structure realtivemente ouverte et inclut la majorité de gènes

61
Q

Hétérochromatine

A

très compacte et inclut régiones riches en transposons et séquences répetitives

62
Q

Empreintes parentales

A

causent une expression différente d’un même gène sselon qu’il est hérité du père ou de la mère

63
Q

Co-supression

A

Silencage d’un transgène et d’un gène endogène

64
Q

Silencage

A

La traduction d’un gène est empêché épigénétiquement

65
Q

RNAi (intérferance par ARN)

A

complexe siRNA-AGO recrute une endonucléase pour dégrader l’ARN-cible

66
Q

AGO (Argonaute)

A

une protéine

67
Q

micro-ARNs

A

accélerent la dégradation de l’ARNm : contribuent à une régulation post-transcriptionnelle

68
Q

Exemple de silencage co-transcriptionnelle

A

compactation de la chromatine grace aux siRNAs

69
Q

siRNA

A

“petit ARN intérferant”

Clive ARNm pour empêcher l’expression de gènes

Biologie moléculaire et cellulaire (1 decks)

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