Biologia 5 Flashcards

1
Q

Mikrobi

A

Pieneliö, jonka näkemiseen tarvitaan mikroskooppi

  • Virukset, bakteerit, arkeonit, alkueläimet, yksisoluiset levät, homeet ja hiivat.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Geenitekniikka

A

Geenitekniikka on perintöaineksen eristämistä, analysoimista, muokkaamista ja siirtämistä muihin eliöihin tai soluihin.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Bakteeri

A

Bakteeri:
Tumattomiin kuuluva eliö, jolla yksinkertainen solurakenne.

  • Esim. tumakotelo ja kalvolliset soluelimet puuttuvat.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Arkeonit

A

Arkeonit samankaltaisia kuin bakteerit, mutta kuuluvat eri domeeniin. Toisaalta lähempänä tumallisia.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Eliökunnan kolme domeenia:

A

Tumalliset eliöt (alkueliöt)
Bakteerit
Arkeonit

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Miksi virukset eivät kuulu eliökunnan luokitukseen?

A

Ei solurakennetta

Ei aineenvaihduntaa

Ei pysty lisääntymään itsenäisesti

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Toksiini

A

Toksiini on jonkin eliön, kuten bakteerin, aineenvaihdunnan tuloksena syntynyt myrkyllinen aine.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Plasmidi

A

Plasmidi on pieni DNA-rengas.

  • Siinä on 1-10% bakteerin perimästä.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Omavaraiset bakteerit

A

yhteyttävät kemo- tai fotosynteesin avulla.

  • Fotosynteesin avulla glukoosia valmistavia bakteereja ovat syanobakteerit. Syanobakteerit valoisissa pintakerroksissa.
  • Kemosynteettiset bakteerit rikki-, typpi-, ja rautabakteerit ovat tärkeitä tuottajia merten pimeissä syvänteissä.
  • Ensimmäiset fotosynteesiin kykenevät eliöt syanobakteereja. Poisti myrkylliset kaasut kaasukehästä ja otsonikerros alkoi kehittyä.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Toisenvaraiset bakteerit

A

Toisenvaraiset bakteerit toimivat ekosysteemissä hajottajina tai elävät mutualistisessa eli molempia osapuolia hyödyntävässä suhteessa muiden eliöiden kanssa.

  • Esim. ihmiselimistön bakteerit.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Patogeeniset bakteerit

A

Ovat taudinaiheuttajia, vain pieni osa bakteereista. Patogeenisiä ominaisuuksia toksiinien lisäksi ovat mm.

  • Suojaava kapseli soluseinän ulkopuolella
  • Tehokas kiinnittyminen elottomaan tai elolliseen alustaan.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Mitkä osat bakteereilta puuttuu?

A

solulimakalvosto ja kalvolliset soluelimet, kuten mitokondriot ja viherhiukkaset.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Puhdasviljelmä

A

Puhdasviljelmä on yhdestä bakteerisolusta muodostettu bakteeriviljelmä, jossa kaikki bakteerit ovat samaa kantaa.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Opas-RNA

A

20 nukleotidin mittainen RNA-molekyyli, jonka avulla cas-entsyymin toiminta kohdistetaan juuri haluttuun kohtaan muokattavaa DNA-ketjua.

  • Opas-RNA liitetään cas-entsyymiin, jolloin ne yhdistyessään tunnistavat kohdegeenin ja katkaisevat sen, jolloin toiminta lakkaa.
  • Opas-RNA tuotetaan bakteerissa tai tehdään synteettisesti.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Merkkigeeni

A

Merkkigeeni on geeni, jonka avulla voidaan paikantaa tai tunnistaa siirretty geeni
Esim. solussa syntyvä proteiini hohtaa vihreänä UV-valossa.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Virusvektori

A

Virusvektorin perimää muokataan siten, että sen lisääntymistä ohjaavat geenit korvataan useilla kappaleilla siirrettävää geeniä.
Näin virus vie kohdesoluun vieraat geenit, mutta ei itse lisäänny.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Liposomi

A

Liposomi on fosfolipidikalvosta koostuva rakkula, jonka sisään voidaan pakata DNA:ta ja joka siirtää sitä solukalvon läpi eläin- tai kasvisoluun.

  • Toimii koska solukalvo on myös fosfolipidiä, jolloin liposomi sulautuu solukalvoon.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Mikroinjektio

A

Mikroinjektio on geeninsiirtomenetelmä, jossa vieras geeni siirretään isäntäsolun tumaan ohuen lasiputken ja mikroskoopin avulla.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Geenin siirtäminen soluviljelmässä oleviin soluihin?

A

Sähköpulssi annetaan solujen kasvatusliuokseen.

Se tekee solukalvoon ja tumakoteloon hetkellisesti aukkoja, joiden kautta kasvatusliuokseen lisätty vieras DNA pääsee isäntäsolun tumaan.

Siirretty geeni liittyy solun omaan DNA:han ja siirtyy jakautumisen yhteydessä kromosomien mukana tytärsoluihin.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Keinotekoinen kromosomi

A

Keinotekoinen kromosomi on DNA:sta koostuva molekyyli, johon on liitetty isäntäsolun (esim. hiiva) kromosomeille tyypilliset setromeeti- ja telomeerikohdat.

  • Toimii solun jakautuessa samalla tavalla kuin normaalit kromosomit.
  • Voidaan käyttää vektoreina, johon voidaan liittää useiden miljoonien emäsparien verran DNA:ta
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Geenikirjasto

A

Geenikirjasto on esim. bakteeriviljelmään siirretty jonkin eliön perimä tai osa sitä.

  • Voi koostua koko genomista, joka on pätkitty katkaisuentsyymeillä.
  • Voi olla myös vastin-DNA kirjasto, jossa käänteiskopioijaentsyymin avulla poistettu intronit.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Vieraan geenin siirtäminen plasmidiin?

A

Sekä siirrettävä DNA, että plasmidi leikataan samoilla katkaisuentsyymeillä.

Plasmidiin syntyy kolo, johon siirrettävä DNA liitetään liittäjäentsyymin avulla.
Plasmidissa on valmiina antibioottiresistenssigeeni.

Plasmidivektorien ollessa valmiita, ne siirretään bakteeriviljelmään, jossa plasmideita siirtyy osaan bakteereista.

Sen jälkeen viljelmä bakteereja kasvatetaan antibioottimaljoilla, jolloin vain antibiootille resistentit siirtogeeniset bakteerit säilyvät hengissä.

Lopuksi eristetään ja puhdistetaan jatkokäyttöä varten.

23
Q

Vektori

A

kuljetin, jonka avulla siirrettävä geeni saadaan perille vastaanottavaan soluun.

  • Useimmiten vektoreina toimivat virukset ja bakteerien plasmidit. Voi olla myös bakteriofageja.
24
Q

Poistogeeninen eliö

A

solu tai eliö, jonka oma geeni on tehty toimintakyvyttömäksi.

  • Geeni tehdään toimintakyvyttömäksi siten, että alkion kantasoluista tehtyyn viljelmään laitetaan geeniä muistuttavia keinotekoisia geenejä, jotka eivät ilmene normaalisti.
  • Ne korvaavat viljelmän soluissa olevat vastaavat toimivat geenit.
25
Siirtogeeninen eliö
muuntogeeninen eliö, johon on geeniteknisesti siirretty vieras geeni. - Siirrettävä geeni voi olla peräisin saman lajin toisesta yksilöstä tai toisesta lajista (jopa eri eliökunta) - Siirtogeeni voi olla myös synteettisesti tuotettu. - Yksilön omia geenejä voidaan myös muokata, jolloin geeniin lisätään tai siitä poistetaan osia.
26
Sekvensointi
Sekvensointi on nukleiinihappojen emäsjärjestyksen tai proteiinien aminohappojärjestyksen selvittämistä.
27
DNA-sirut
DNA-sirut ovat pieniä, ohuita lasi- tai muovilevyjä, joiden pinnalla on säännöllisissä riveissä jopa kymmeniä tuhansia erilaisia yksijuosteisia DNA-koettimia. - DNA-siruja käytetään, kun halutaan tietää, onko ihmisellä esim. jokin tietty sairautta aiheuttava geenimutaatio perimässään tai mitkä geenit toimivat syöpäsoluissa.
28
Hybridisaatio
DNA- tai RNA-juosteiden taipumusta muodostaa emästen välisiä sidoksia ja liittyä niiden avulla toisiinsa.
29
Koetin
Koetin on lyhyehkö merkkiaineella varustettu DNA- tai RNA-jakso, jonka avulla voidaan löytää tietty emäsjärjestys perimästä. - Koetin tarttuu emäspariperiaatteen mukaan kohtiin, joissa on vastaava emäsjärjestys. - Koettimen toiminta perustuu nukleiinihappojen hybridisaatioon.
30
Alleelin eristämisen kaksi eri tapaa?
1. Alleeli tunnistetaan koettimeksi tai geenitunnisitmeksi kutsutun DNA-molekyylin avulla. 2. Alleeli tunnistetaan PCR:n ja elektroforeesin avulla.
31
Alleelit
Alleelit ovat mutaation tuloksena syntyneitä geenin vaihtoehtoisia muotoja.
32
Elektroforreesi
Elektroforeesi on laboratoriomenetelmä, jossa erotellaan erikokoisia molekyylejä sähkövirran avulla. - DNA- ja RNA-molekyylien erottelu perustuu palasten liikkumisnopeuteen agaroosigeelissä.
33
Aluke
Aluke on lyhyt yksijuosteinen DNA-jakso, joka tarvitaan aloittamaan koeputkessa DNA-polymeraasin toiminta ja DNA:n kahdentaminen.
34
PCR-tekniikka
PCR-tekniikka (polymeraasiketjureaktio) on menetelmä, jonka avulla DNA-molekyyliä voidaan monistaa nopeasti koeputkessa:
35
DNA:n monistaminen bakteerien avulla?
Aluksi liitetään haluttu DNA-jakso bakteerin plasmidiin yhdistelmä-DNA-tekniikan avulla. Plasmidit ja siirrettävä DNA leikataan samoilla katkaisuentsyymeillä Siirrettävä DNA kiinnitetään plasmidiin liittäjäentsyymeillä Plasmidiin siirretään yleensä myös antibioottiresistenssin aikaansaava geeni, jonka avulla onnistunut siirto tunnistetaan. Muokatut plasmidit siirtyvät bakteereihin, kun plasmideja lisätään bakteeriviljelmään. Kaikkiin ei kuitenkaan siirry plasmideja. Antibioottivalinnalla seulotut bakteerit laitetaan kasvamaan sopiviin kasvuolosuhteisiin. Koska bakteeripopulaation kasvu on eksponentiaalista, monistuu siirretty DNA-pala hyvin nopeasti. DNA eristetään bakteereista jatkokäyttöä varten.
36
Eksonit
Eksonit ovat koodaavalla alueella informaatiota sisältäviä jaksoja
37
Intronit
Intronit ovat informaatiota sisältämättömiä jaksoja
38
Vastin-DNA eli cDNA
Vastin-DNA eli cDNA on lähetti-RNA:n emäsjärjestyksen perusteella kopioitu DNA (cDNA). - Sisältää vain geenin eksonit
39
Käänteiskopioijaentsyymi
entsyymi, jonka avulla yksijuosteinen lähetti-RNA saadaan käännettyä vastin DNA:ksi (kompementaariseksi eli cDNA:ksi) - Käytetään bioteknologiassa esim. silloin kun halutaan siirtää tumallisen eliön geeni bakteeriin.
40
Cas-entsyymi
bakteerien entsyymi, joka vastaa bakteerien immunologisesta muistista bakteriofageja vastaan. Tunnistaa virus-DNA:n ja pilkkoo sen palasiksi, minkä seurauksena viruksen lisääntyminen estyy. - Bakteeri tallentaa palan viruksen DNA:ta omaan perimäänsä ja käyttää tätä informaatiota myöhemmin puolustautuessaan vastaavia viruksia vastaan.
41
Crispr-tekniikka
Geeninmuokkaustekniikka, jossa cas-entsyymin avulla leikataan DNA:n kaksoisjuoste tarkasti tietyn emäsjärjestyksen kohdalta.
42
Liittäjäentsyymi (ligaasi)
entsyymi, joka katalysoi kahden molekyylin liittämistä toisiinsa. Ligaaseja ovat mm. ne entsyymit, jotka liittävät DNA:n paloja yhteen.
43
Katkaisuentsyymit (restriktioentsyymit)
entsyymejä, jotka katkaisevat DNA:n kaksoisjuosteen.
44
Proteaasit
proteiineja pilkkovia entsyymejä.
45
DNA-polymeraasi
DNA:n kaksoisjuosteen syntetisoiva eli rakentava entsyymi. Se rakentaa DNA-juosteet eri suuntiin. - Entsyymi liittää oikean nukleotidin aina edellisen nukleotidin sokeriosan OH-päähän, joten molemmat puolet kopioidaan vastakkaisiin suuntiin. - DNA-polymeraasi voi kiinnittyä kaksoisjuosteeseen. Tarvitsee alukkeen, joka solussa on pätkä DNA:ta.
46
DNA:n kahdentuminen
Perustuu emäspariperiaatteeseen. Uutta DNA:ta rakennetaan nukleotidi nukleotidilta siten, että vastinemäkset sitoutuvat toisiinsa (A-T ja G-C). Solussa DNA:n kahdentumiseen osallistuu monia entsyymeitä, jotka aukaisevat kaksoisjuosteen, lukevat DNA:ta, liittävät oikeita nukleotideja syntyvään juosteeseen ja liittävät DNA:n kappaleita yhteen.
47
Geenit
DNA-molekyylin toiminnallisia jaksoja, jotka sisältävän solun toimintaan tarvittavan informaation. - Geeneissä kolmen emäksen jakso vastaa yhtä aminohappoa (proteiinin rakenneosa) - Geenien sisältämän informaation perusteella rakentuu lähetti-RNA, joka välittää ohjeen proteiinin rakentamiseen.
48
DNA
ainutlaatuinen molekyyli, johon perinnöllinen informaatio on tallentuneena neljän erilaisen emäksen avulla.
49
Säätelyalue
luennan aloittamiseen ja luennan säätelyyn osallistuva alue, joka sijaistee ennen geenin koodaavaa aluetta. Sisältää tehostajajaksoja ja promoottorin.
50
Alkoholikäyminen
Alkoholikäyminen on reaktio, jossa glukoosista syntyy etanolia, vettä ja hiilidioksidia. Sen lisäksi energiaa vapautuu vähäinen määrä.
51
Transposoni
DNA:n jakso, jolla on kyky siirtyä kromosomistossa paikasta toiseen. - Usein alunperin viruksen mukana siirtynyt geeni, joka on liittynyt osaksi isäntälajin perimää.
52
Bakteriofagi
Bakteriofagi on bakteerissa lisääntyvä virus.
53
Retrovirus
Virus, jonka perintöaines on yksijuosteista RNA:ta. Sitä ympäröi isäntäsolulta varastettu vaippa. - Lisääntymiseen retrovirus tarvitsee käänteiskopioijaentsyymin.
54
Käänteiskopioijaentsyymi
Käänteiskopioijaentsyymi on entsyymi, jonka avulla yksijuosteinen lähetti-RNA kopioidaan kaksijuosteiseksi DNA:ksi.