Biologia 5 Flashcards
Mikrobi
Pieneliö, jonka näkemiseen tarvitaan mikroskooppi
- Virukset, bakteerit, arkeonit, alkueläimet, yksisoluiset levät, homeet ja hiivat.
Geenitekniikka
Geenitekniikka on perintöaineksen eristämistä, analysoimista, muokkaamista ja siirtämistä muihin eliöihin tai soluihin.
Bakteeri
Bakteeri:
Tumattomiin kuuluva eliö, jolla yksinkertainen solurakenne.
- Esim. tumakotelo ja kalvolliset soluelimet puuttuvat.
Arkeonit
Arkeonit samankaltaisia kuin bakteerit, mutta kuuluvat eri domeeniin. Toisaalta lähempänä tumallisia.
Eliökunnan kolme domeenia:
Tumalliset eliöt (alkueliöt)
Bakteerit
Arkeonit
Miksi virukset eivät kuulu eliökunnan luokitukseen?
Ei solurakennetta
Ei aineenvaihduntaa
Ei pysty lisääntymään itsenäisesti
Toksiini
Toksiini on jonkin eliön, kuten bakteerin, aineenvaihdunnan tuloksena syntynyt myrkyllinen aine.
Plasmidi
Plasmidi on pieni DNA-rengas.
- Siinä on 1-10% bakteerin perimästä.
Omavaraiset bakteerit
yhteyttävät kemo- tai fotosynteesin avulla.
- Fotosynteesin avulla glukoosia valmistavia bakteereja ovat syanobakteerit. Syanobakteerit valoisissa pintakerroksissa.
- Kemosynteettiset bakteerit rikki-, typpi-, ja rautabakteerit ovat tärkeitä tuottajia merten pimeissä syvänteissä.
- Ensimmäiset fotosynteesiin kykenevät eliöt syanobakteereja. Poisti myrkylliset kaasut kaasukehästä ja otsonikerros alkoi kehittyä.
Toisenvaraiset bakteerit
Toisenvaraiset bakteerit toimivat ekosysteemissä hajottajina tai elävät mutualistisessa eli molempia osapuolia hyödyntävässä suhteessa muiden eliöiden kanssa.
- Esim. ihmiselimistön bakteerit.
Patogeeniset bakteerit
Ovat taudinaiheuttajia, vain pieni osa bakteereista. Patogeenisiä ominaisuuksia toksiinien lisäksi ovat mm.
- Suojaava kapseli soluseinän ulkopuolella
- Tehokas kiinnittyminen elottomaan tai elolliseen alustaan.
Mitkä osat bakteereilta puuttuu?
solulimakalvosto ja kalvolliset soluelimet, kuten mitokondriot ja viherhiukkaset.
Puhdasviljelmä
Puhdasviljelmä on yhdestä bakteerisolusta muodostettu bakteeriviljelmä, jossa kaikki bakteerit ovat samaa kantaa.
Opas-RNA
20 nukleotidin mittainen RNA-molekyyli, jonka avulla cas-entsyymin toiminta kohdistetaan juuri haluttuun kohtaan muokattavaa DNA-ketjua.
- Opas-RNA liitetään cas-entsyymiin, jolloin ne yhdistyessään tunnistavat kohdegeenin ja katkaisevat sen, jolloin toiminta lakkaa.
- Opas-RNA tuotetaan bakteerissa tai tehdään synteettisesti.
Merkkigeeni
Merkkigeeni on geeni, jonka avulla voidaan paikantaa tai tunnistaa siirretty geeni
Esim. solussa syntyvä proteiini hohtaa vihreänä UV-valossa.
Virusvektori
Virusvektorin perimää muokataan siten, että sen lisääntymistä ohjaavat geenit korvataan useilla kappaleilla siirrettävää geeniä.
Näin virus vie kohdesoluun vieraat geenit, mutta ei itse lisäänny.
Liposomi
Liposomi on fosfolipidikalvosta koostuva rakkula, jonka sisään voidaan pakata DNA:ta ja joka siirtää sitä solukalvon läpi eläin- tai kasvisoluun.
- Toimii koska solukalvo on myös fosfolipidiä, jolloin liposomi sulautuu solukalvoon.
Mikroinjektio
Mikroinjektio on geeninsiirtomenetelmä, jossa vieras geeni siirretään isäntäsolun tumaan ohuen lasiputken ja mikroskoopin avulla.
Geenin siirtäminen soluviljelmässä oleviin soluihin?
Sähköpulssi annetaan solujen kasvatusliuokseen.
Se tekee solukalvoon ja tumakoteloon hetkellisesti aukkoja, joiden kautta kasvatusliuokseen lisätty vieras DNA pääsee isäntäsolun tumaan.
Siirretty geeni liittyy solun omaan DNA:han ja siirtyy jakautumisen yhteydessä kromosomien mukana tytärsoluihin.
Keinotekoinen kromosomi
Keinotekoinen kromosomi on DNA:sta koostuva molekyyli, johon on liitetty isäntäsolun (esim. hiiva) kromosomeille tyypilliset setromeeti- ja telomeerikohdat.
- Toimii solun jakautuessa samalla tavalla kuin normaalit kromosomit.
- Voidaan käyttää vektoreina, johon voidaan liittää useiden miljoonien emäsparien verran DNA:ta
Geenikirjasto
Geenikirjasto on esim. bakteeriviljelmään siirretty jonkin eliön perimä tai osa sitä.
- Voi koostua koko genomista, joka on pätkitty katkaisuentsyymeillä.
- Voi olla myös vastin-DNA kirjasto, jossa käänteiskopioijaentsyymin avulla poistettu intronit.
Vieraan geenin siirtäminen plasmidiin?
Sekä siirrettävä DNA, että plasmidi leikataan samoilla katkaisuentsyymeillä.
Plasmidiin syntyy kolo, johon siirrettävä DNA liitetään liittäjäentsyymin avulla.
Plasmidissa on valmiina antibioottiresistenssigeeni.
Plasmidivektorien ollessa valmiita, ne siirretään bakteeriviljelmään, jossa plasmideita siirtyy osaan bakteereista.
Sen jälkeen viljelmä bakteereja kasvatetaan antibioottimaljoilla, jolloin vain antibiootille resistentit siirtogeeniset bakteerit säilyvät hengissä.
Lopuksi eristetään ja puhdistetaan jatkokäyttöä varten.
Vektori
kuljetin, jonka avulla siirrettävä geeni saadaan perille vastaanottavaan soluun.
- Useimmiten vektoreina toimivat virukset ja bakteerien plasmidit. Voi olla myös bakteriofageja.
Poistogeeninen eliö
solu tai eliö, jonka oma geeni on tehty toimintakyvyttömäksi.
- Geeni tehdään toimintakyvyttömäksi siten, että alkion kantasoluista tehtyyn viljelmään laitetaan geeniä muistuttavia keinotekoisia geenejä, jotka eivät ilmene normaalisti.
- Ne korvaavat viljelmän soluissa olevat vastaavat toimivat geenit.